MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005362	GGC	2	6	245109	245114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518298
5002	NC_005362	ACC	2	6	245136	245141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518298
5003	NC_005362	ATG	2	6	245160	245165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518298
5004	NC_005362	CTT	2	6	245293	245298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518298
5005	NC_005362	ATG	2	6	245351	245356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518298
5006	NC_005362	ATG	2	6	245381	245386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518298
5007	NC_005362	TAAA	2	8	245640	245647	75 %	25 %	0 %	0 %	42518298
5008	NC_005362	GTTAA	2	10	245654	245663	40 %	40 %	20 %	0 %	42518298
5009	NC_005362	GAAC	2	8	245693	245700	50 %	0 %	25 %	25 %	42518298
5010	NC_005362	CTA	2	6	245722	245727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518298
5011	NC_005362	CAG	2	6	245763	245768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518298
5012	NC_005362	TTGA	2	8	245816	245823	25 %	50 %	25 %	0 %	42518298
5013	NC_005362	AT	3	6	245836	245841	50 %	50 %	0 %	0 %	42518298
5014	NC_005362	ATG	3	9	245985	245993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518299
5015	NC_005362	GAG	2	6	246117	246122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518299
5016	NC_005362	AC	3	6	246136	246141	50 %	0 %	0 %	50 %	42518299
5017	NC_005362	GT	3	6	246163	246168	0 %	50 %	50 %	0 %	42518299
5018	NC_005362	GTT	2	6	246186	246191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518299
5019	NC_005362	TGG	2	6	246195	246200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518299
5020	NC_005362	ATTGGA	2	12	246252	246263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518299
5021	NC_005362	A	6	6	246280	246285	100 %	0 %	0 %	0 %	42518299
5022	NC_005362	TAAAG	2	10	246296	246305	60 %	20 %	20 %	0 %	42518299
5023	NC_005362	CTT	2	6	246345	246350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518299
5024	NC_005362	AAG	2	6	246353	246358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5025	NC_005362	ATTTGA	2	12	246392	246403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518299
5026	NC_005362	TTC	2	6	246409	246414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518299
5027	NC_005362	AAG	2	6	246427	246432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5028	NC_005362	GATT	2	8	246479	246486	25 %	50 %	25 %	0 %	42518299
5029	NC_005362	GTT	2	6	246510	246515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518299
5030	NC_005362	ATG	2	6	246532	246537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518299
5031	NC_005362	CTA	2	6	246685	246690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518299
5032	NC_005362	AAG	2	6	246691	246696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5033	NC_005362	TTG	2	6	246766	246771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518299
5034	NC_005362	GAA	2	6	246789	246794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5035	NC_005362	CAAG	2	8	246801	246808	50 %	0 %	25 %	25 %	42518299
5036	NC_005362	TCAA	2	8	246836	246843	50 %	25 %	0 %	25 %	42518299
5037	NC_005362	GAA	2	6	246852	246857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5038	NC_005362	CTG	2	6	246874	246879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518299
5039	NC_005362	GCA	3	9	246927	246935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518299
5040	NC_005362	TAC	2	6	246978	246983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518299
5041	NC_005362	GGT	2	6	247038	247043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518299
5042	NC_005362	CTT	2	6	247119	247124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518299
5043	NC_005362	GAA	2	6	247251	247256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5044	NC_005362	GAT	2	6	247314	247319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518299
5045	NC_005362	AAT	2	6	247449	247454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518299
5046	NC_005362	ATA	2	6	247459	247464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518299
5047	NC_005362	GAA	3	9	247563	247571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5048	NC_005362	TTG	2	6	247591	247596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518299
5049	NC_005362	ATCT	2	8	247602	247609	25 %	50 %	0 %	25 %	42518299
5050	NC_005362	AGA	2	6	247613	247618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5051	NC_005362	ACA	2	6	247640	247645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518299
5052	NC_005362	GAT	2	6	247647	247652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518299
5053	NC_005362	AAGC	2	8	247752	247759	50 %	0 %	25 %	25 %	42518299
5054	NC_005362	TTC	2	6	247782	247787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518299
5055	NC_005362	AAAAG	2	10	247811	247820	80 %	0 %	20 %	0 %	42518299
5056	NC_005362	GCT	2	6	247890	247895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518299
5057	NC_005362	GAAA	2	8	247903	247910	75 %	0 %	25 %	0 %	42518299
5058	NC_005362	ACA	2	6	247963	247968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518299
5059	NC_005362	TTAA	2	8	248133	248140	50 %	50 %	0 %	0 %	42518299
5060	NC_005362	ATC	2	6	248152	248157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518299
5061	NC_005362	AAG	2	6	248214	248219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5062	NC_005362	AAG	2	6	248230	248235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518299
5063	NC_005362	AAT	2	6	248318	248323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518300
5064	NC_005362	TTAAC	2	10	248343	248352	40 %	40 %	0 %	20 %	42518300
5065	NC_005362	GAT	2	6	248354	248359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518300
5066	NC_005362	AGAAAA	2	12	248449	248460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42518300
5067	NC_005362	GCA	2	6	248465	248470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518300
5068	NC_005362	TTG	2	6	248487	248492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518300
5069	NC_005362	A	6	6	248502	248507	100 %	0 %	0 %	0 %	42518300
5070	NC_005362	CAG	2	6	248514	248519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518300
5071	NC_005362	ACT	2	6	248542	248547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518300
5072	NC_005362	A	6	6	248596	248601	100 %	0 %	0 %	0 %	42518300
5073	NC_005362	TTG	2	6	248652	248657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518300
5074	NC_005362	TCA	2	6	248671	248676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518300
5075	NC_005362	TCAA	2	8	248773	248780	50 %	25 %	0 %	25 %	42518300
5076	NC_005362	ACT	2	6	248855	248860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518300
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5078	NC_005362	A	6	6	248900	248905	100 %	0 %	0 %	0 %	42518300
5079	NC_005362	TTG	2	6	249035	249040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518301
5080	NC_005362	ACT	2	6	249064	249069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518301
5081	NC_005362	AGA	2	6	249090	249095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518301
5082	NC_005362	AATG	2	8	249132	249139	50 %	25 %	25 %	0 %	42518301
5083	NC_005362	ACA	2	6	249215	249220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518301
5084	NC_005362	AAGA	2	8	249250	249257	75 %	0 %	25 %	0 %	42518301
5085	NC_005362	GCA	2	6	249283	249288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518301
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5087	NC_005362	ACT	2	6	249487	249492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518301
5088	NC_005362	GTA	2	6	249544	249549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518301
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5090	NC_005362	TGTT	2	8	249617	249624	0 %	75 %	25 %	0 %	42518301
5091	NC_005362	CTT	2	6	249654	249659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518301
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5093	NC_005362	ATTC	2	8	249796	249803	25 %	50 %	0 %	25 %	42518301
5094	NC_005362	TTG	2	6	249839	249844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518301
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5098	NC_005362	A	6	6	250156	250161	100 %	0 %	0 %	0 %	42518302
5099	NC_005362	GTA	2	6	250211	250216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518302
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5103	NC_005362	AAG	2	6	250918	250923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518302
5104	NC_005362	CGG	2	6	250971	250976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518302
5105	NC_005362	GCA	2	6	251053	251058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518302
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5107	NC_005362	TTC	2	6	251216	251221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518302
5108	NC_005362	TCT	2	6	251246	251251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518302
5109	NC_005362	ATTA	2	8	251268	251275	50 %	50 %	0 %	0 %	42518302
5110	NC_005362	ACG	2	6	251285	251290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518302
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5112	NC_005362	AGA	2	6	251352	251357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518302
5113	NC_005362	ATTA	2	8	251391	251398	50 %	50 %	0 %	0 %	42518303
5114	NC_005362	A	6	6	251407	251412	100 %	0 %	0 %	0 %	42518303
5115	NC_005362	TTC	2	6	251479	251484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518303
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5117	NC_005362	CAA	2	6	251671	251676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518303
5118	NC_005362	TTG	2	6	251726	251731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518303
5119	NC_005362	TA	3	6	251739	251744	50 %	50 %	0 %	0 %	42518303
5120	NC_005362	TA	3	6	251747	251752	50 %	50 %	0 %	0 %	42518303
5121	NC_005362	TAA	2	6	251769	251774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518303
5122	NC_005362	TTA	2	6	251785	251790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518303
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5124	NC_005362	TTTG	2	8	251838	251845	0 %	75 %	25 %	0 %	42518303
5125	NC_005362	TGCA	2	8	251855	251862	25 %	25 %	25 %	25 %	42518303
5126	NC_005362	TGA	2	6	251867	251872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518303
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5129	NC_005362	GTG	2	6	252011	252016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518303
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5133	NC_005362	TCT	2	6	252089	252094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518303
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5230	NC_005362	TTAC	2	8	256448	256455	25 %	50 %	0 %	25 %	42518306
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5233	NC_005362	TGAA	2	8	256803	256810	50 %	25 %	25 %	0 %	42518307
5234	NC_005362	AAATTA	2	12	256836	256847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518307
5235	NC_005362	TCA	2	6	256858	256863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518307
5236	NC_005362	A	7	7	256947	256953	100 %	0 %	0 %	0 %	42518307
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5239	NC_005362	A	6	6	257061	257066	100 %	0 %	0 %	0 %	42518307
5240	NC_005362	TAA	2	6	257119	257124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518307
5241	NC_005362	TAG	2	6	257199	257204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518307
5242	NC_005362	ATA	2	6	257228	257233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518307
5243	NC_005362	GAT	2	6	257297	257302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518308
5244	NC_005362	GAA	2	6	257432	257437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518308
5245	NC_005362	TGA	2	6	257548	257553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518308
5246	NC_005362	AGA	2	6	257569	257574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518308
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5248	NC_005362	GAT	3	9	257639	257647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518308
5249	NC_005362	GAT	2	6	257666	257671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518308
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5251	NC_005362	GAA	2	6	257699	257704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518308
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5253	NC_005362	GAT	3	9	257729	257737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518308
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5291	NC_005362	CACCGT	2	12	259343	259354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	42518309
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5357	NC_005362	T	6	6	262121	262126	0 %	100 %	0 %	0 %	42518311
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5359	NC_005362	CA	3	6	262234	262239	50 %	0 %	0 %	50 %	42518311
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5362	NC_005362	TG	4	8	262386	262393	0 %	50 %	50 %	0 %	42518311
5363	NC_005362	TTC	2	6	262403	262408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518312
5364	NC_005362	ACACCA	2	12	262524	262535	50 %	0 %	0 %	50 %	42518312
5365	NC_005362	AAG	2	6	262599	262604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518312
5366	NC_005362	TCA	2	6	262605	262610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518312
5367	NC_005362	TAAT	2	8	262612	262619	50 %	50 %	0 %	0 %	42518312
5368	NC_005362	ACT	2	6	262631	262636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518312
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5370	NC_005362	T	6	6	262673	262678	0 %	100 %	0 %	0 %	42518312
5371	NC_005362	CAT	2	6	262711	262716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518312
5372	NC_005362	T	6	6	262730	262735	0 %	100 %	0 %	0 %	42518312
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5375	NC_005362	CAT	2	6	262871	262876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518312
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5378	NC_005362	T	6	6	263205	263210	0 %	100 %	0 %	0 %	42518313
5379	NC_005362	T	6	6	263212	263217	0 %	100 %	0 %	0 %	42518313
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5391	NC_005362	AAT	2	6	263598	263603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518313
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5483	NC_005362	A	6	6	269765	269770	100 %	0 %	0 %	0 %	42518321
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5486	NC_005362	TTAAT	2	10	269892	269901	40 %	60 %	0 %	0 %	42518322
5487	NC_005362	GAAG	2	8	269968	269975	50 %	0 %	50 %	0 %	42518322
5488	NC_005362	GTTCTT	2	12	270040	270051	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42518322
5489	NC_005362	GGATG	2	10	270057	270066	20 %	20 %	60 %	0 %	42518322
5490	NC_005362	GGTAA	2	10	270119	270128	40 %	20 %	40 %	0 %	42518322
5491	NC_005362	TAA	2	6	270136	270141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518322
5492	NC_005362	TGA	3	9	270220	270228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518322
5493	NC_005362	AGA	2	6	270244	270249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518322
5494	NC_005362	A	6	6	270254	270259	100 %	0 %	0 %	0 %	42518322
5495	NC_005362	TTGTC	2	10	270288	270297	0 %	60 %	20 %	20 %	42518322
5496	NC_005362	CTT	2	6	270408	270413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518322
5497	NC_005362	GAC	2	6	270481	270486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518322
5498	NC_005362	GGAA	2	8	270544	270551	50 %	0 %	50 %	0 %	42518322
5499	NC_005362	AGA	3	9	270648	270656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518322
5500	NC_005362	TTAA	2	8	270804	270811	50 %	50 %	0 %	0 %	42518323

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