MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 53441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004567	CGC	2	6	28618	28623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031123
502	NC_004567	AAG	2	6	28656	28661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031123
503	NC_004567	GCG	2	6	28748	28753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031123
504	NC_004567	CGC	2	6	28828	28833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031123
505	NC_004567	TGAT	2	8	28881	28888	25 %	50 %	25 %	0 %	380031123
506	NC_004567	ATG	2	6	28950	28955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031123
507	NC_004567	CAA	2	6	28994	28999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031123
508	NC_004567	CAG	2	6	29000	29005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031123
509	NC_004567	CAA	2	6	29039	29044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031123
510	NC_004567	ACGA	2	8	29133	29140	50 %	0 %	25 %	25 %	380031123
511	NC_004567	GATT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	380031124
512	NC_004567	ATG	2	6	29303	29308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031124
513	NC_004567	GAT	2	6	29317	29322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031124
514	NC_004567	CTA	2	6	29403	29408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031124
515	NC_004567	TTA	2	6	29439	29444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031124
516	NC_004567	TGG	2	6	29457	29462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
517	NC_004567	TGG	2	6	29466	29471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
518	NC_004567	TTG	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031124
519	NC_004567	AAT	2	6	29599	29604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031124
520	NC_004567	TTTA	2	8	29647	29654	25 %	75 %	0 %	0 %	380031124
521	NC_004567	CGTG	2	8	29682	29689	0 %	25 %	50 %	25 %	380031124
522	NC_004567	GGT	2	6	29725	29730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
523	NC_004567	ATT	2	6	29785	29790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031124
524	NC_004567	CAG	2	6	29814	29819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031124
525	NC_004567	ATC	2	6	29822	29827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031124
526	NC_004567	GTC	2	6	29863	29868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031124
527	NC_004567	TAC	2	6	30031	30036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031124
528	NC_004567	CATT	3	12	30047	30058	25 %	50 %	0 %	25 %	380031124
529	NC_004567	TGG	2	6	30079	30084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
530	NC_004567	TGGC	2	8	30192	30199	0 %	25 %	50 %	25 %	380031124
531	NC_004567	GGA	2	6	30297	30302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	380031124
532	NC_004567	ACT	2	6	30338	30343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031124
533	NC_004567	GCG	2	6	30350	30355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031124
534	NC_004567	TCCGC	2	10	30378	30387	0 %	20 %	20 %	60 %	380031124
535	NC_004567	ATT	2	6	30394	30399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031124
536	NC_004567	TGG	2	6	30433	30438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
537	NC_004567	ACG	2	6	30475	30480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031124
538	NC_004567	ACT	2	6	30576	30581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031124
539	NC_004567	TGA	2	6	30618	30623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031124
540	NC_004567	TGA	2	6	30629	30634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031124
541	NC_004567	G	7	7	30636	30642	0 %	0 %	100 %	0 %	380031124
542	NC_004567	ACT	2	6	30844	30849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031124
543	NC_004567	GTG	2	6	30887	30892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
544	NC_004567	TGC	2	6	30922	30927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031124
545	NC_004567	GTG	2	6	30947	30952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031124
546	NC_004567	AGT	2	6	31328	31333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031125
547	NC_004567	T	6	6	31335	31340	0 %	100 %	0 %	0 %	380031125
548	NC_004567	TGGA	2	8	31345	31352	25 %	25 %	50 %	0 %	380031125
549	NC_004567	CAG	2	6	31385	31390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031125
550	NC_004567	TGA	2	6	31474	31479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031125
551	NC_004567	ACG	2	6	31482	31487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031125
552	NC_004567	TTA	2	6	31622	31627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031125
553	NC_004567	TAA	2	6	31628	31633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031125
554	NC_004567	CAGA	2	8	31691	31698	50 %	0 %	25 %	25 %	380031125
555	NC_004567	CGCAC	2	10	31709	31718	20 %	0 %	20 %	60 %	380031125
556	NC_004567	GCG	2	6	31770	31775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031125
557	NC_004567	TAA	2	6	31817	31822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031125
558	NC_004567	CG	3	6	32012	32017	0 %	0 %	50 %	50 %	380031125
559	NC_004567	ACA	2	6	32032	32037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031125
560	NC_004567	CGG	2	6	32042	32047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031125
561	NC_004567	TGATT	2	10	32072	32081	20 %	60 %	20 %	0 %	380031125
562	NC_004567	TTAGT	2	10	32236	32245	20 %	60 %	20 %	0 %	380031126
563	NC_004567	GCC	2	6	32300	32305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031126
564	NC_004567	GCC	2	6	32372	32377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031126
565	NC_004567	AGT	2	6	32496	32501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031126
566	NC_004567	T	6	6	32537	32542	0 %	100 %	0 %	0 %	380031126
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570	NC_004567	TAGC	2	8	32670	32677	25 %	25 %	25 %	25 %	380031126
571	NC_004567	ATCC	2	8	32743	32750	25 %	25 %	0 %	50 %	380031126
572	NC_004567	TGC	2	6	32890	32895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031126
573	NC_004567	TGA	2	6	33028	33033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031127
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575	NC_004567	CA	3	6	33179	33184	50 %	0 %	0 %	50 %	380031127
576	NC_004567	GTC	2	6	33211	33216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031127
577	NC_004567	CGTCAT	2	12	33272	33283	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	380031127
578	NC_004567	GA	3	6	33322	33327	50 %	0 %	50 %	0 %	380031127
579	NC_004567	GC	3	6	33345	33350	0 %	0 %	50 %	50 %	380031127
580	NC_004567	T	6	6	33404	33409	0 %	100 %	0 %	0 %	380031127
581	NC_004567	AAT	2	6	33411	33416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031127
582	NC_004567	TGA	2	6	33640	33645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031127
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587	NC_004567	GTA	2	6	33975	33980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031127
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589	NC_004567	AGTG	2	8	34067	34074	25 %	25 %	50 %	0 %	380031127
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593	NC_004567	GCA	2	6	34333	34338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031127
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595	NC_004567	ACTGG	2	10	34467	34476	20 %	20 %	40 %	20 %	380031127
596	NC_004567	GAC	2	6	34536	34541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031127
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598	NC_004567	TAGT	2	8	34655	34662	25 %	50 %	25 %	0 %	380031127
599	NC_004567	TGA	2	6	34689	34694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031127
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602	NC_004567	ACG	2	6	34798	34803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031127
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609	NC_004567	ATT	2	6	35250	35255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031127
610	NC_004567	GTA	2	6	35277	35282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031127
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621	NC_004567	TTC	2	6	36345	36350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031128
622	NC_004567	GT	3	6	36472	36477	0 %	50 %	50 %	0 %	380031128
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625	NC_004567	GGTTT	2	10	36720	36729	0 %	60 %	40 %	0 %	380031129
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