MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 69179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_004342	TCC	2	6	1198048	1198053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24213892
19004	NC_004342	GTA	2	6	1198063	1198068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213892
19005	NC_004342	TGA	2	6	1198119	1198124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213892
19006	NC_004342	ACT	2	6	1198150	1198155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213892
19007	NC_004342	ATT	2	6	1198192	1198197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213892
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19009	NC_004342	TA	3	6	1198267	1198272	50 %	50 %	0 %	0 %	24213892
19010	NC_004342	CGC	2	6	1198294	1198299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24213892
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19014	NC_004342	T	6	6	1198572	1198577	0 %	100 %	0 %	0 %	24213892
19015	NC_004342	TAA	2	6	1198586	1198591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213892
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19242	NC_004342	TTC	2	6	1212213	1212218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213911
19243	NC_004342	GA	3	6	1212235	1212240	50 %	0 %	50 %	0 %	24213911
19244	NC_004342	CTTA	2	8	1212275	1212282	25 %	50 %	0 %	25 %	24213911
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19247	NC_004342	TCTT	2	8	1212382	1212389	0 %	75 %	0 %	25 %	24213911
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19251	NC_004342	T	6	6	1212440	1212445	0 %	100 %	0 %	0 %	24213911
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19255	NC_004342	ATCGT	2	10	1212651	1212660	20 %	40 %	20 %	20 %	24213911
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19348	NC_004342	A	7	7	1220291	1220297	100 %	0 %	0 %	0 %	294827819
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19355	NC_004342	GTGA	2	8	1220468	1220475	25 %	25 %	50 %	0 %	294827819
19356	NC_004342	ACT	2	6	1220583	1220588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827819
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19359	NC_004342	ATTT	2	8	1220870	1220877	25 %	75 %	0 %	0 %	24213920
19360	NC_004342	CCTA	2	8	1220886	1220893	25 %	25 %	0 %	50 %	24213920
19361	NC_004342	GTA	2	6	1220904	1220909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213920
19362	NC_004342	TAC	2	6	1220918	1220923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213920
19363	NC_004342	CT	3	6	1221039	1221044	0 %	50 %	0 %	50 %	24213920
19364	NC_004342	T	6	6	1221090	1221095	0 %	100 %	0 %	0 %	24213920
19365	NC_004342	ACA	2	6	1221170	1221175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24213920
19366	NC_004342	TTTGGA	2	12	1221254	1221265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24213920
19367	NC_004342	GGA	2	6	1221329	1221334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213920
19368	NC_004342	TATT	2	8	1221346	1221353	25 %	75 %	0 %	0 %	24213920
19369	NC_004342	GGA	2	6	1221380	1221385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213920
19370	NC_004342	T	7	7	1221413	1221419	0 %	100 %	0 %	0 %	24213920
19371	NC_004342	ACAT	2	8	1221491	1221498	50 %	25 %	0 %	25 %	24213920
19372	NC_004342	TCA	2	6	1221557	1221562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213920
19373	NC_004342	TTC	2	6	1221638	1221643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213920
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19375	NC_004342	AGG	2	6	1221745	1221750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213921
19376	NC_004342	T	8	8	1221753	1221760	0 %	100 %	0 %	0 %	24213921
19377	NC_004342	AGG	2	6	1221787	1221792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213921
19378	NC_004342	TGCT	2	8	1221804	1221811	0 %	50 %	25 %	25 %	24213921
19379	NC_004342	CTA	2	6	1221831	1221836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213921
19380	NC_004342	ACAA	2	8	1221882	1221889	75 %	0 %	0 %	25 %	24213921
19381	NC_004342	ACT	2	6	1221892	1221897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213921
19382	NC_004342	ATA	2	6	1221951	1221956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213921
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19384	NC_004342	GCA	2	6	1222057	1222062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24213921
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19386	NC_004342	ATTT	2	8	1222175	1222182	25 %	75 %	0 %	0 %	24213921
19387	NC_004342	TTAT	2	8	1222188	1222195	25 %	75 %	0 %	0 %	24213921
19388	NC_004342	ACTGG	2	10	1222211	1222220	20 %	20 %	40 %	20 %	24213921
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19390	NC_004342	CTT	2	6	1222283	1222288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213921
19391	NC_004342	ACG	2	6	1222422	1222427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24213921
19392	NC_004342	AATA	2	8	1222436	1222443	75 %	25 %	0 %	0 %	24213921
19393	NC_004342	TGT	2	6	1222450	1222455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213921
19394	NC_004342	TA	3	6	1222587	1222592	50 %	50 %	0 %	0 %	24213921
19395	NC_004342	A	6	6	1222649	1222654	100 %	0 %	0 %	0 %	24213921
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19401	NC_004342	A	6	6	1222912	1222917	100 %	0 %	0 %	0 %	24213921
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19455	NC_004342	A	6	6	1225964	1225969	100 %	0 %	0 %	0 %	24213923
19456	NC_004342	ATC	2	6	1225971	1225976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213923
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19463	NC_004342	GAA	3	9	1226463	1226471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213923
19464	NC_004342	CTT	2	6	1226490	1226495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213923
19465	NC_004342	AT	3	6	1226541	1226546	50 %	50 %	0 %	0 %	24213923
19466	NC_004342	GAA	3	9	1226580	1226588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213923
19467	NC_004342	A	7	7	1226697	1226703	100 %	0 %	0 %	0 %	24213923
19468	NC_004342	TGG	2	6	1226752	1226757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24213923
19469	NC_004342	AGA	2	6	1226795	1226800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213923
19470	NC_004342	AAG	2	6	1226807	1226812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213923
19471	NC_004342	AAG	2	6	1226848	1226853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213923
19472	NC_004342	CTC	2	6	1226960	1226965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24213924
19473	NC_004342	GAA	2	6	1226966	1226971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213924
19474	NC_004342	TCTT	2	8	1227023	1227030	0 %	75 %	0 %	25 %	24213924
19475	NC_004342	AAG	2	6	1227033	1227038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213924
19476	NC_004342	ATGGTA	2	12	1227078	1227089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213924
19477	NC_004342	CTT	2	6	1227105	1227110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213924
19478	NC_004342	GGC	2	6	1227124	1227129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24213924
19479	NC_004342	TCT	2	6	1227157	1227162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213924
19480	NC_004342	AGA	2	6	1227173	1227178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213924
19481	NC_004342	TGC	2	6	1227190	1227195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24213924
19482	NC_004342	AACCG	2	10	1227222	1227231	40 %	0 %	20 %	40 %	24213924
19483	NC_004342	ATA	2	6	1227255	1227260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213924
19484	NC_004342	TGT	2	6	1227283	1227288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213924
19485	NC_004342	ATG	2	6	1227390	1227395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213924
19486	NC_004342	AAGA	2	8	1227396	1227403	75 %	0 %	25 %	0 %	24213924
19487	NC_004342	A	7	7	1227414	1227420	100 %	0 %	0 %	0 %	24213924
19488	NC_004342	ATT	2	6	1227484	1227489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213924
19489	NC_004342	ATT	2	6	1227498	1227503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213924
19490	NC_004342	A	6	6	1227521	1227526	100 %	0 %	0 %	0 %	24213924
19491	NC_004342	A	7	7	1227536	1227542	100 %	0 %	0 %	0 %	24213924
19492	NC_004342	AGG	2	6	1227556	1227561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213924
19493	NC_004342	AGA	2	6	1227595	1227600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213924
19494	NC_004342	ATC	2	6	1227609	1227614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213924
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19496	NC_004342	A	6	6	1227717	1227722	100 %	0 %	0 %	0 %	24213924
19497	NC_004342	AAG	2	6	1227801	1227806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213924
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19499	NC_004342	AT	3	6	1227916	1227921	50 %	50 %	0 %	0 %	24213924
19500	NC_004342	GTT	2	6	1227965	1227970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213924

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