MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 60445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_003212	ATA	2	6	2198823	2198828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801244
44503	NC_003212	TACTT	2	10	2198893	2198902	20 %	60 %	0 %	20 %	16801244
44504	NC_003212	CGG	2	6	2198932	2198937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16801244
44505	NC_003212	TAA	2	6	2199106	2199111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801244
44506	NC_003212	TGA	2	6	2199132	2199137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801244
44507	NC_003212	AC	3	6	2199157	2199162	50 %	0 %	0 %	50 %	16801244
44508	NC_003212	TGG	2	6	2199175	2199180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801244
44509	NC_003212	TCCGT	2	10	2199201	2199210	0 %	40 %	20 %	40 %	16801244
44510	NC_003212	AGA	2	6	2199235	2199240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801244
44511	NC_003212	CTCA	2	8	2199259	2199266	25 %	25 %	0 %	50 %	16801244
44512	NC_003212	GTG	2	6	2199267	2199272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801244
44513	NC_003212	A	6	6	2199276	2199281	100 %	0 %	0 %	0 %	16801244
44514	NC_003212	TTA	2	6	2199302	2199307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801244
44515	NC_003212	ACA	2	6	2199568	2199573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801244
44516	NC_003212	AGA	2	6	2199592	2199597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801244
44517	NC_003212	CTA	3	9	2199627	2199635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801244
44518	NC_003212	AGA	2	6	2199650	2199655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801244
44519	NC_003212	A	6	6	2199666	2199671	100 %	0 %	0 %	0 %	16801244
44520	NC_003212	CGA	2	6	2199697	2199702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801244
44521	NC_003212	CTT	2	6	2199881	2199886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801244
44522	NC_003212	CAA	2	6	2199988	2199993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801244
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44527	NC_003212	GTG	3	9	2200113	2200121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801244
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44529	NC_003212	TGA	2	6	2200180	2200185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801244
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44534	NC_003212	ATCGC	2	10	2200290	2200299	20 %	20 %	20 %	40 %	16801244
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44554	NC_003212	ATGA	2	8	2200856	2200863	50 %	25 %	25 %	0 %	16801245
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44620	NC_003212	TCG	2	6	2203857	2203862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801248
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44625	NC_003212	TTC	2	6	2204115	2204120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801249
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44710	NC_003212	AAAC	2	8	2208144	2208151	75 %	0 %	0 %	25 %	16801255
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44721	NC_003212	TTTTC	2	10	2209092	2209101	0 %	80 %	0 %	20 %	16801256
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44730	NC_003212	A	6	6	2209444	2209449	100 %	0 %	0 %	0 %	16801256
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44733	NC_003212	TTCT	2	8	2209539	2209546	0 %	75 %	0 %	25 %	16801256
44734	NC_003212	TTAA	2	8	2209568	2209575	50 %	50 %	0 %	0 %	16801256
44735	NC_003212	TAAT	2	8	2209631	2209638	50 %	50 %	0 %	0 %	16801256
44736	NC_003212	T	6	6	2209695	2209700	0 %	100 %	0 %	0 %	16801256
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44851	NC_003212	A	6	6	2215348	2215353	100 %	0 %	0 %	0 %	16801260
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44856	NC_003212	TTCTGA	2	12	2215505	2215516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16801261
44857	NC_003212	TCC	2	6	2215546	2215551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16801261
44858	NC_003212	AAG	2	6	2215717	2215722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801261
44859	NC_003212	ATT	2	6	2215734	2215739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801261
44860	NC_003212	GC	3	6	2215757	2215762	0 %	0 %	50 %	50 %	16801261
44861	NC_003212	AC	3	6	2215815	2215820	50 %	0 %	0 %	50 %	16801261
44862	NC_003212	CAT	2	6	2215851	2215856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801261
44863	NC_003212	TTA	2	6	2215857	2215862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801261
44864	NC_003212	AGA	2	6	2215901	2215906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801261
44865	NC_003212	GCG	2	6	2215944	2215949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16801261
44866	NC_003212	CTT	2	6	2215995	2216000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801261
44867	NC_003212	TAT	2	6	2216054	2216059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801261
44868	NC_003212	ATG	2	6	2216088	2216093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801261
44869	NC_003212	GAA	2	6	2216112	2216117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801261
44870	NC_003212	AATT	2	8	2216221	2216228	50 %	50 %	0 %	0 %	16801261
44871	NC_003212	CGCT	2	8	2216293	2216300	0 %	25 %	25 %	50 %	16801261
44872	NC_003212	TAA	2	6	2216303	2216308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801261
44873	NC_003212	AAG	2	6	2216317	2216322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801261
44874	NC_003212	AAG	2	6	2216326	2216331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801261
44875	NC_003212	AT	3	6	2216371	2216376	50 %	50 %	0 %	0 %	16801261
44876	NC_003212	GAA	2	6	2216421	2216426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801261
44877	NC_003212	A	6	6	2216478	2216483	100 %	0 %	0 %	0 %	16801261
44878	NC_003212	TTG	2	6	2216512	2216517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801261
44879	NC_003212	ATTT	2	8	2216550	2216557	25 %	75 %	0 %	0 %	16801261
44880	NC_003212	ATCC	2	8	2216589	2216596	25 %	25 %	0 %	50 %	16801261
44881	NC_003212	A	7	7	2216709	2216715	100 %	0 %	0 %	0 %	16801261
44882	NC_003212	A	6	6	2216885	2216890	100 %	0 %	0 %	0 %	16801262
44883	NC_003212	AACG	2	8	2216893	2216900	50 %	0 %	25 %	25 %	16801262
44884	NC_003212	TTTG	2	8	2216938	2216945	0 %	75 %	25 %	0 %	16801262
44885	NC_003212	T	6	6	2216950	2216955	0 %	100 %	0 %	0 %	16801262
44886	NC_003212	ACA	2	6	2216978	2216983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801262
44887	NC_003212	TAC	2	6	2217020	2217025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801262
44888	NC_003212	ATCATT	2	12	2217041	2217052	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16801262
44889	NC_003212	T	6	6	2217051	2217056	0 %	100 %	0 %	0 %	16801262
44890	NC_003212	TAA	2	6	2217127	2217132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801262
44891	NC_003212	TGT	2	6	2217147	2217152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801262
44892	NC_003212	GCT	2	6	2217191	2217196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801262
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44894	NC_003212	T	7	7	2217280	2217286	0 %	100 %	0 %	0 %	16801262
44895	NC_003212	TAA	2	6	2217372	2217377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801262
44896	NC_003212	CTTGGA	2	12	2217482	2217493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16801262
44897	NC_003212	ATTT	2	8	2217522	2217529	25 %	75 %	0 %	0 %	16801262
44898	NC_003212	AAC	2	6	2217539	2217544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801262
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44900	NC_003212	ATTGTC	2	12	2217566	2217577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16801262
44901	NC_003212	TTTTAT	2	12	2217582	2217593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	16801262
44902	NC_003212	TTA	2	6	2217629	2217634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
44903	NC_003212	TAT	2	6	2217703	2217708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
44904	NC_003212	ATT	2	6	2217735	2217740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
44905	NC_003212	GATT	2	8	2217802	2217809	25 %	50 %	25 %	0 %	16801262
44906	NC_003212	T	6	6	2217819	2217824	0 %	100 %	0 %	0 %	16801262
44907	NC_003212	TGG	2	6	2217833	2217838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801262
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44909	NC_003212	TTA	2	6	2217908	2217913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
44910	NC_003212	GTTA	2	8	2217934	2217941	25 %	50 %	25 %	0 %	16801262
44911	NC_003212	TGG	2	6	2217964	2217969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801262
44912	NC_003212	TAT	2	6	2218071	2218076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
44913	NC_003212	TTG	2	6	2218080	2218085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801262
44914	NC_003212	GAT	2	6	2218087	2218092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801262
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44918	NC_003212	CTT	2	6	2218232	2218237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801262
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44920	NC_003212	TGTT	2	8	2218326	2218333	0 %	75 %	25 %	0 %	16801262
44921	NC_003212	CCGA	2	8	2218372	2218379	25 %	0 %	25 %	50 %	16801262
44922	NC_003212	A	6	6	2218379	2218384	100 %	0 %	0 %	0 %	16801262
44923	NC_003212	TAA	2	6	2218403	2218408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801262
44924	NC_003212	CTC	2	6	2218653	2218658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16801263
44925	NC_003212	TAATT	2	10	2218666	2218675	40 %	60 %	0 %	0 %	16801263
44926	NC_003212	T	6	6	2218692	2218697	0 %	100 %	0 %	0 %	16801263
44927	NC_003212	CATAT	2	10	2218764	2218773	40 %	40 %	0 %	20 %	16801263
44928	NC_003212	ACA	2	6	2218798	2218803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801263
44929	NC_003212	TTTA	2	8	2218812	2218819	25 %	75 %	0 %	0 %	16801263
44930	NC_003212	TACG	2	8	2218868	2218875	25 %	25 %	25 %	25 %	16801263
44931	NC_003212	T	6	6	2218934	2218939	0 %	100 %	0 %	0 %	16801263
44932	NC_003212	GAA	2	6	2219012	2219017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801263
44933	NC_003212	TTC	2	6	2219078	2219083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801263
44934	NC_003212	ATT	2	6	2219103	2219108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801263
44935	NC_003212	CTA	2	6	2219114	2219119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801263
44936	NC_003212	TCA	2	6	2219162	2219167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801263
44937	NC_003212	ATA	3	9	2219179	2219187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801263
44938	NC_003212	ATT	2	6	2219193	2219198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801263
44939	NC_003212	TCCC	2	8	2219216	2219223	0 %	25 %	0 %	75 %	16801263
44940	NC_003212	GCA	2	6	2219224	2219229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801263
44941	NC_003212	TC	3	6	2219305	2219310	0 %	50 %	0 %	50 %	16801264
44942	NC_003212	TACT	2	8	2219325	2219332	25 %	50 %	0 %	25 %	16801264
44943	NC_003212	TTG	2	6	2219380	2219385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801264
44944	NC_003212	AAC	2	6	2219403	2219408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801264
44945	NC_003212	TTC	2	6	2219623	2219628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801264
44946	NC_003212	T	6	6	2219640	2219645	0 %	100 %	0 %	0 %	16801264
44947	NC_003212	CTTCAT	2	12	2219664	2219675	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16801264
44948	NC_003212	TAG	2	6	2219773	2219778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801264
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44952	NC_003212	T	6	6	2219851	2219856	0 %	100 %	0 %	0 %	16801264
44953	NC_003212	TTG	2	6	2219882	2219887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801264
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44956	NC_003212	TCA	2	6	2219939	2219944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801264
44957	NC_003212	GAC	2	6	2219950	2219955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801264
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44959	NC_003212	ATC	2	6	2220230	2220235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801264
44960	NC_003212	AGCT	2	8	2220257	2220264	25 %	25 %	25 %	25 %	16801265
44961	NC_003212	T	6	6	2220285	2220290	0 %	100 %	0 %	0 %	16801265
44962	NC_003212	CAT	2	6	2220291	2220296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801265
44963	NC_003212	TAA	2	6	2220315	2220320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
44964	NC_003212	AAAT	2	8	2220338	2220345	75 %	25 %	0 %	0 %	16801265
44965	NC_003212	TGT	2	6	2220421	2220426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801265
44966	NC_003212	ATAC	2	8	2220494	2220501	50 %	25 %	0 %	25 %	16801265
44967	NC_003212	AAG	2	6	2220502	2220507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801265
44968	NC_003212	AAT	2	6	2220531	2220536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
44969	NC_003212	CA	3	6	2220578	2220583	50 %	0 %	0 %	50 %	16801265
44970	NC_003212	GCT	3	9	2220838	2220846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801265
44971	NC_003212	CAT	2	6	2220875	2220880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801265
44972	NC_003212	CTG	2	6	2220884	2220889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801265
44973	NC_003212	ATA	2	6	2220910	2220915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
44974	NC_003212	TTC	2	6	2221000	2221005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801265
44975	NC_003212	CAAT	2	8	2221012	2221019	50 %	25 %	0 %	25 %	16801265
44976	NC_003212	ATC	2	6	2221042	2221047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801265
44977	NC_003212	GTTG	2	8	2221100	2221107	0 %	50 %	50 %	0 %	16801265
44978	NC_003212	AAT	2	6	2221185	2221190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
44979	NC_003212	TGA	2	6	2221256	2221261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801265
44980	NC_003212	ATA	2	6	2221267	2221272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
44981	NC_003212	TCCA	2	8	2221346	2221353	25 %	25 %	0 %	50 %	16801265
44982	NC_003212	GTTC	2	8	2221381	2221388	0 %	50 %	25 %	25 %	16801265
44983	NC_003212	TGC	2	6	2221401	2221406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801265
44984	NC_003212	AAT	3	9	2221521	2221529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
44985	NC_003212	T	6	6	2221601	2221606	0 %	100 %	0 %	0 %	16801265
44986	NC_003212	CCATGC	2	12	2221667	2221678	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16801266
44987	NC_003212	TTG	2	6	2221862	2221867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801266
44988	NC_003212	T	6	6	2221896	2221901	0 %	100 %	0 %	0 %	16801266
44989	NC_003212	T	7	7	2221925	2221931	0 %	100 %	0 %	0 %	16801267
44990	NC_003212	GCT	2	6	2221949	2221954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801267
44991	NC_003212	ATTT	2	8	2221958	2221965	25 %	75 %	0 %	0 %	16801267
44992	NC_003212	TAG	2	6	2222423	2222428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801268
44993	NC_003212	TAA	2	6	2222484	2222489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801268
44994	NC_003212	ATC	2	6	2222578	2222583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801268
44995	NC_003212	TTA	2	6	2222600	2222605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801268
44996	NC_003212	AAAT	2	8	2222632	2222639	75 %	25 %	0 %	0 %	16801268
44997	NC_003212	ATC	3	9	2222650	2222658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801268
44998	NC_003212	TTC	2	6	2222682	2222687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801268
44999	NC_003212	GCC	2	6	2222707	2222712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801268
45000	NC_003212	TGC	2	6	2222742	2222747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801268

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