MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 60445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43003	NC_003212	AT	3	6	2125221	2125226	50 %	50 %	0 %	0 %	16801174
43004	NC_003212	GAAT	2	8	2125288	2125295	50 %	25 %	25 %	0 %	16801174
43005	NC_003212	TAT	2	6	2125335	2125340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801174
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43009	NC_003212	GAAC	2	8	2125576	2125583	50 %	0 %	25 %	25 %	16801174
43010	NC_003212	T	7	7	2125606	2125612	0 %	100 %	0 %	0 %	16801174
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43013	NC_003212	TAT	2	6	2125678	2125683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801175
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43015	NC_003212	AAAGC	2	10	2125794	2125803	60 %	0 %	20 %	20 %	16801175
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43051	NC_003212	TCTT	2	8	2127362	2127369	0 %	75 %	0 %	25 %	16801177
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43115	NC_003212	TGGT	2	8	2130393	2130400	0 %	50 %	50 %	0 %	16801180
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43119	NC_003212	AAG	2	6	2130574	2130579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801180
43120	NC_003212	TCT	2	6	2130583	2130588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801180
43121	NC_003212	CTA	2	6	2130626	2130631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801180
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43123	NC_003212	ACG	2	6	2130657	2130662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801180
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43126	NC_003212	GTTC	2	8	2130824	2130831	0 %	50 %	25 %	25 %	16801180
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43146	NC_003212	CAT	2	6	2131913	2131918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801181
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43149	NC_003212	ACT	2	6	2132104	2132109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801181
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43182	NC_003212	T	7	7	2134037	2134043	0 %	100 %	0 %	0 %	16801183
43183	NC_003212	TAGT	2	8	2134051	2134058	25 %	50 %	25 %	0 %	16801183
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43221	NC_003212	TTCG	2	8	2135684	2135691	0 %	50 %	25 %	25 %	16801184
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43231	NC_003212	TAA	2	6	2136226	2136231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801184
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43234	NC_003212	TCA	2	6	2136354	2136359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801184
43235	NC_003212	CTT	2	6	2136393	2136398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801184
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43237	NC_003212	TCG	2	6	2136509	2136514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801184
43238	NC_003212	CTA	2	6	2136516	2136521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801184
43239	NC_003212	TCC	2	6	2136546	2136551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16801185
43240	NC_003212	GTTT	2	8	2136647	2136654	0 %	75 %	25 %	0 %	16801185
43241	NC_003212	TCG	2	6	2136698	2136703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801185
43242	NC_003212	CTT	2	6	2136710	2136715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801185
43243	NC_003212	CCG	2	6	2136779	2136784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801185
43244	NC_003212	ACT	2	6	2136799	2136804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801185
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43246	NC_003212	TTC	2	6	2136975	2136980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801185
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43250	NC_003212	CATT	2	8	2137079	2137086	25 %	50 %	0 %	25 %	16801185
43251	NC_003212	TTC	2	6	2137161	2137166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801185
43252	NC_003212	CTT	2	6	2137185	2137190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801185
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43254	NC_003212	TTA	2	6	2137258	2137263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801185
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43258	NC_003212	GC	3	6	2137427	2137432	0 %	0 %	50 %	50 %	16801185
43259	NC_003212	ATC	2	6	2137434	2137439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801185
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43262	NC_003212	AGT	2	6	2137476	2137481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801185
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43264	NC_003212	TTA	2	6	2137513	2137518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801185
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43266	NC_003212	TAT	2	6	2137598	2137603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801185
43267	NC_003212	ATAG	2	8	2137676	2137683	50 %	25 %	25 %	0 %	16801185
43268	NC_003212	ATTTT	2	10	2137732	2137741	20 %	80 %	0 %	0 %	16801185
43269	NC_003212	TTC	2	6	2137788	2137793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801185
43270	NC_003212	TTTC	2	8	2137811	2137818	0 %	75 %	0 %	25 %	16801185
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43274	NC_003212	TAAT	2	8	2138066	2138073	50 %	50 %	0 %	0 %	16801185
43275	NC_003212	TGCT	2	8	2138104	2138111	0 %	50 %	25 %	25 %	16801185
43276	NC_003212	GC	3	6	2138125	2138130	0 %	0 %	50 %	50 %	16801185
43277	NC_003212	A	7	7	2138176	2138182	100 %	0 %	0 %	0 %	16801185
43278	NC_003212	A	6	6	2138216	2138221	100 %	0 %	0 %	0 %	16801185
43279	NC_003212	TAA	2	6	2138223	2138228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801185
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43283	NC_003212	TAT	2	6	2138900	2138905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801186
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43292	NC_003212	CAT	2	6	2139408	2139413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801187
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43301	NC_003212	TTA	2	6	2139986	2139991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801187
43302	NC_003212	GAA	2	6	2140014	2140019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801187
43303	NC_003212	TTTG	2	8	2140025	2140032	0 %	75 %	25 %	0 %	16801187
43304	NC_003212	TCT	3	9	2140073	2140081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801187
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43315	NC_003212	T	6	6	2140554	2140559	0 %	100 %	0 %	0 %	16801188
43316	NC_003212	TGA	3	9	2140564	2140572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801188
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43320	NC_003212	TAC	2	6	2140897	2140902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801188
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43322	NC_003212	AGTT	2	8	2141005	2141012	25 %	50 %	25 %	0 %	16801188
43323	NC_003212	TTTA	2	8	2141023	2141030	25 %	75 %	0 %	0 %	16801188
43324	NC_003212	AGT	2	6	2141056	2141061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801188
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43326	NC_003212	CTG	2	6	2141472	2141477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801188
43327	NC_003212	TCC	2	6	2141597	2141602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16801188
43328	NC_003212	TCAAGT	2	12	2141702	2141713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16801188
43329	NC_003212	CAT	2	6	2141772	2141777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801188
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43332	NC_003212	GTT	2	6	2141831	2141836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801188
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43334	NC_003212	TAAC	2	8	2141963	2141970	50 %	25 %	0 %	25 %	16801188
43335	NC_003212	TAA	2	6	2142016	2142021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801188
43336	NC_003212	AAAT	2	8	2142050	2142057	75 %	25 %	0 %	0 %	16801188
43337	NC_003212	GAG	2	6	2142062	2142067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16801188
43338	NC_003212	ACCA	2	8	2142087	2142094	50 %	0 %	0 %	50 %	16801188
43339	NC_003212	TTG	2	6	2142100	2142105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801188
43340	NC_003212	AATC	2	8	2142198	2142205	50 %	25 %	0 %	25 %	16801188
43341	NC_003212	TGG	2	6	2142263	2142268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801188
43342	NC_003212	ATAA	2	8	2142281	2142288	75 %	25 %	0 %	0 %	16801188
43343	NC_003212	T	6	6	2142328	2142333	0 %	100 %	0 %	0 %	16801188
43344	NC_003212	TGC	2	6	2142349	2142354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801188
43345	NC_003212	TTA	2	6	2142488	2142493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801188
43346	NC_003212	AAC	2	6	2142523	2142528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801188
43347	NC_003212	T	6	6	2142603	2142608	0 %	100 %	0 %	0 %	16801188
43348	NC_003212	TTC	2	6	2142622	2142627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801188
43349	NC_003212	A	6	6	2142680	2142685	100 %	0 %	0 %	0 %	16801188
43350	NC_003212	GTT	2	6	2142738	2142743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801188
43351	NC_003212	T	6	6	2142747	2142752	0 %	100 %	0 %	0 %	16801188
43352	NC_003212	TCT	2	6	2142782	2142787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801188
43353	NC_003212	TCCA	2	8	2142802	2142809	25 %	25 %	0 %	50 %	16801188
43354	NC_003212	CTT	2	6	2142831	2142836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801188
43355	NC_003212	TCT	2	6	2142848	2142853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801188
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43477	NC_003212	CAAAC	2	10	2149872	2149881	60 %	0 %	0 %	40 %	16801193
43478	NC_003212	ATA	2	6	2149886	2149891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801193
43479	NC_003212	TAA	2	6	2149948	2149953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801193
43480	NC_003212	CAAAC	2	10	2149971	2149980	60 %	0 %	0 %	40 %	16801193
43481	NC_003212	CACG	2	8	2150084	2150091	25 %	0 %	25 %	50 %	16801193
43482	NC_003212	CGC	2	6	2150112	2150117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801193
43483	NC_003212	CAG	2	6	2150181	2150186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801193
43484	NC_003212	ATC	2	6	2150194	2150199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801193
43485	NC_003212	T	6	6	2150254	2150259	0 %	100 %	0 %	0 %	16801193
43486	NC_003212	AGTG	2	8	2150283	2150290	25 %	25 %	50 %	0 %	16801193
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43488	NC_003212	CTT	2	6	2150385	2150390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801193
43489	NC_003212	ATC	2	6	2150407	2150412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801193
43490	NC_003212	T	6	6	2150440	2150445	0 %	100 %	0 %	0 %	16801193
43491	NC_003212	CAG	2	6	2150508	2150513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801193
43492	NC_003212	AAC	2	6	2150605	2150610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801193
43493	NC_003212	ACA	2	6	2150666	2150671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801193
43494	NC_003212	TAC	2	6	2150695	2150700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801193
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43496	NC_003212	T	6	6	2150911	2150916	0 %	100 %	0 %	0 %	16801193
43497	NC_003212	T	6	6	2150935	2150940	0 %	100 %	0 %	0 %	16801193
43498	NC_003212	CA	3	6	2151081	2151086	50 %	0 %	0 %	50 %	16801193
43499	NC_003212	TTTC	2	8	2151111	2151118	0 %	75 %	0 %	25 %	16801193
43500	NC_003212	T	6	6	2151130	2151135	0 %	100 %	0 %	0 %	16801193

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