MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 60445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	16799080
2	NC_003212	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	16799080
3	NC_003212	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799080
4	NC_003212	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
5	NC_003212	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799080
6	NC_003212	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
7	NC_003212	AC	3	6	491	496	50 %	0 %	0 %	50 %	16799080
8	NC_003212	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
9	NC_003212	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799080
10	NC_003212	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799080
11	NC_003212	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
12	NC_003212	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799080
13	NC_003212	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
14	NC_003212	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	16799080
15	NC_003212	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
16	NC_003212	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
17	NC_003212	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
18	NC_003212	AACAAA	2	12	1031	1042	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	16799080
19	NC_003212	TTA	2	6	1043	1048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
20	NC_003212	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	16799080
21	NC_003212	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799080
22	NC_003212	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	16799080
23	NC_003212	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
24	NC_003212	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799080
25	NC_003212	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799080
26	NC_003212	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
27	NC_003212	CGTT	2	8	1419	1426	0 %	50 %	25 %	25 %	16799080
28	NC_003212	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	16799080
29	NC_003212	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	16799080
30	NC_003212	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
31	NC_003212	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799080
32	NC_003212	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	16799080
33	NC_003212	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799080
34	NC_003212	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	16799080
35	NC_003212	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799081
36	NC_003212	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
37	NC_003212	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
38	NC_003212	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799081
39	NC_003212	TTC	2	6	2094	2099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799081
40	NC_003212	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799081
41	NC_003212	GAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799081
42	NC_003212	TAC	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799081
43	NC_003212	ATT	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
44	NC_003212	ATT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
45	NC_003212	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799081
46	NC_003212	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799081
47	NC_003212	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	16799081
48	NC_003212	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799081
49	NC_003212	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	16799081
50	NC_003212	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
51	NC_003212	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799081
52	NC_003212	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
53	NC_003212	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799081
54	NC_003212	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
55	NC_003212	GC	3	6	2884	2889	0 %	0 %	50 %	50 %	16799081
56	NC_003212	GAT	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
57	NC_003212	CTA	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799081
58	NC_003212	ATG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
59	NC_003212	ACA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799082
60	NC_003212	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
61	NC_003212	TGC	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799082
62	NC_003212	T	7	7	3295	3301	0 %	100 %	0 %	0 %	16799082
63	NC_003212	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799082
64	NC_003212	GTA	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
65	NC_003212	GGT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799082
66	NC_003212	T	6	6	3420	3425	0 %	100 %	0 %	0 %	16799082
67	NC_003212	CGG	2	6	3426	3431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799082
68	NC_003212	GAT	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
69	NC_003212	CTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799082
70	NC_003212	T	7	7	3618	3624	0 %	100 %	0 %	0 %	16799082
71	NC_003212	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	16799082
72	NC_003212	TGT	2	6	3667	3672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799082
73	NC_003212	TATGGG	2	12	3676	3687	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16799082
74	NC_003212	GCA	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799082
75	NC_003212	ACT	2	6	3814	3819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799082
76	NC_003212	CTTC	2	8	3842	3849	0 %	50 %	0 %	50 %	16799082
77	NC_003212	ATTT	2	8	3865	3872	25 %	75 %	0 %	0 %	16799082
78	NC_003212	TAAT	2	8	3900	3907	50 %	50 %	0 %	0 %	16799082
79	NC_003212	GTT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799082
80	NC_003212	CCT	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16799082
81	NC_003212	AGT	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
82	NC_003212	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799082
83	NC_003212	TTA	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799082
84	NC_003212	TTAC	2	8	4189	4196	25 %	50 %	0 %	25 %	16799082
85	NC_003212	CGT	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799082
86	NC_003212	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799082
87	NC_003212	AGTT	2	8	4302	4309	25 %	50 %	25 %	0 %	16799082
88	NC_003212	ATTT	2	8	4327	4334	25 %	75 %	0 %	0 %	16799082
89	NC_003212	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799082
90	NC_003212	CGA	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799082
91	NC_003212	A	7	7	4437	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	16799082
92	NC_003212	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799082
93	NC_003212	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	16799083
94	NC_003212	GGA	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16799083
95	NC_003212	ATA	2	6	4860	4865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799083
96	NC_003212	GA	3	6	4958	4963	50 %	0 %	50 %	0 %	16799084
97	NC_003212	AACC	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	16799084
98	NC_003212	TGCT	2	8	5003	5010	0 %	50 %	25 %	25 %	16799084
99	NC_003212	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799084
100	NC_003212	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799084
101	NC_003212	AGT	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
102	NC_003212	AGA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799084
103	NC_003212	ATTT	2	8	5302	5309	25 %	75 %	0 %	0 %	16799084
104	NC_003212	GCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799084
105	NC_003212	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799084
106	NC_003212	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	16799084
107	NC_003212	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	16799084
108	NC_003212	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799084
109	NC_003212	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
110	NC_003212	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799084
111	NC_003212	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
112	NC_003212	GAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
113	NC_003212	AAC	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799084
114	NC_003212	A	7	7	5970	5976	100 %	0 %	0 %	0 %	16799084
115	NC_003212	AGA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799085
116	NC_003212	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799085
117	NC_003212	TGAAAT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16799085
118	NC_003212	A	6	6	6311	6316	100 %	0 %	0 %	0 %	16799085
119	NC_003212	TTC	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799085
120	NC_003212	CGG	2	6	6360	6365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799085
121	NC_003212	CGG	4	12	6372	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799085
122	NC_003212	ACA	2	6	6595	6600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799085
123	NC_003212	TTTGAT	2	12	6604	6615	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16799085
124	NC_003212	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16799085
125	NC_003212	TAAA	2	8	6752	6759	75 %	25 %	0 %	0 %	16799085
126	NC_003212	CCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799085
127	NC_003212	ATTT	2	8	6787	6794	25 %	75 %	0 %	0 %	16799085
128	NC_003212	ATA	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799085
129	NC_003212	TCATT	2	10	6863	6872	20 %	60 %	0 %	20 %	16799085
130	NC_003212	AAT	2	6	6877	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799085
131	NC_003212	TTA	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799085
132	NC_003212	GC	3	6	6955	6960	0 %	0 %	50 %	50 %	16799085
133	NC_003212	AAAT	2	8	6963	6970	75 %	25 %	0 %	0 %	16799085
134	NC_003212	TGA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799085
135	NC_003212	TAT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799085
136	NC_003212	ACAA	2	8	7068	7075	75 %	0 %	0 %	25 %	16799085
137	NC_003212	TAAA	2	8	7136	7143	75 %	25 %	0 %	0 %	16799085
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261	NC_003212	GTGA	2	8	13357	13364	25 %	25 %	50 %	0 %	16799089
262	NC_003212	GTATG	2	10	13372	13381	20 %	40 %	40 %	0 %	16799089
263	NC_003212	A	7	7	13417	13423	100 %	0 %	0 %	0 %	16799089
264	NC_003212	GTA	2	6	13432	13437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799089
265	NC_003212	CCA	2	6	13530	13535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799089
266	NC_003212	TGC	2	6	13602	13607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799089
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269	NC_003212	A	6	6	13752	13757	100 %	0 %	0 %	0 %	16799089
270	NC_003212	CA	3	6	13863	13868	50 %	0 %	0 %	50 %	16799089
271	NC_003212	AGT	2	6	13931	13936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799090
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386	NC_003212	TTCA	2	8	20091	20098	25 %	50 %	0 %	25 %	16799095
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