MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 58890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_003210	TTTC	2	8	2243957	2243964	0 %	75 %	0 %	25 %	16804199
45002	NC_003210	AATT	2	8	2243973	2243980	50 %	50 %	0 %	0 %	16804199
45003	NC_003210	CAT	2	6	2244056	2244061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804199
45004	NC_003210	CATT	2	8	2244104	2244111	25 %	50 %	0 %	25 %	16804199
45005	NC_003210	CTT	3	9	2244161	2244169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804199
45006	NC_003210	GA	3	6	2244176	2244181	50 %	0 %	50 %	0 %	16804199
45007	NC_003210	TGC	2	6	2244255	2244260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804199
45008	NC_003210	TGA	2	6	2244292	2244297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804199
45009	NC_003210	TCC	2	6	2244309	2244314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16804199
45010	NC_003210	GCT	2	6	2244343	2244348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804199
45011	NC_003210	TCT	2	6	2244367	2244372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804199
45012	NC_003210	AAT	2	6	2244388	2244393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804199
45013	NC_003210	TCC	2	6	2244424	2244429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16804200
45014	NC_003210	T	6	6	2244433	2244438	0 %	100 %	0 %	0 %	16804200
45015	NC_003210	TGGT	2	8	2244443	2244450	0 %	50 %	50 %	0 %	16804200
45016	NC_003210	TTC	2	6	2244471	2244476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804200
45017	NC_003210	TAA	2	6	2244505	2244510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804200
45018	NC_003210	CGC	2	6	2244622	2244627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804200
45019	NC_003210	AACC	2	8	2244633	2244640	50 %	0 %	0 %	50 %	16804200
45020	NC_003210	TCA	2	6	2244654	2244659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804200
45021	NC_003210	TTC	2	6	2244692	2244697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804200
45022	NC_003210	GTA	2	6	2244850	2244855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804200
45023	NC_003210	AC	3	6	2244877	2244882	50 %	0 %	0 %	50 %	16804200
45024	NC_003210	CCA	2	6	2244938	2244943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804200
45025	NC_003210	CTT	2	6	2244970	2244975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804200
45026	NC_003210	CAT	2	6	2245090	2245095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804200
45027	NC_003210	CTT	2	6	2245096	2245101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804200
45028	NC_003210	TCC	2	6	2245150	2245155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16804201
45029	NC_003210	CTT	2	6	2245217	2245222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804201
45030	NC_003210	AAT	2	6	2245227	2245232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804201
45031	NC_003210	ATA	2	6	2245300	2245305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804201
45032	NC_003210	AAT	2	6	2245467	2245472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804201
45033	NC_003210	TTG	2	6	2245533	2245538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804201
45034	NC_003210	AAG	2	6	2245557	2245562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804201
45035	NC_003210	AAT	2	6	2245617	2245622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804201
45036	NC_003210	TAA	2	6	2245762	2245767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804201
45037	NC_003210	ATC	2	6	2245827	2245832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804201
45038	NC_003210	TTAA	2	8	2245899	2245906	50 %	50 %	0 %	0 %	16804202
45039	NC_003210	GAT	2	6	2245930	2245935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804202
45040	NC_003210	ACA	2	6	2245963	2245968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804202
45041	NC_003210	AAC	2	6	2245986	2245991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804202
45042	NC_003210	T	7	7	2246002	2246008	0 %	100 %	0 %	0 %	16804202
45043	NC_003210	ATC	2	6	2246049	2246054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804202
45044	NC_003210	CGT	2	6	2246063	2246068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804202
45045	NC_003210	TTTTC	2	10	2246099	2246108	0 %	80 %	0 %	20 %	16804202
45046	NC_003210	CGC	2	6	2246162	2246167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804202
45047	NC_003210	GT	3	6	2246210	2246215	0 %	50 %	50 %	0 %	16804202
45048	NC_003210	TCG	2	6	2246243	2246248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804202
45049	NC_003210	TCT	2	6	2246284	2246289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804202
45050	NC_003210	ATTT	2	8	2246297	2246304	25 %	75 %	0 %	0 %	16804202
45051	NC_003210	TGC	2	6	2246328	2246333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804202
45052	NC_003210	T	6	6	2246340	2246345	0 %	100 %	0 %	0 %	16804202
45053	NC_003210	CTA	2	6	2246369	2246374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804202
45054	NC_003210	CAT	2	6	2246397	2246402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804202
45055	NC_003210	CCG	2	6	2246449	2246454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804202
45056	NC_003210	CTT	2	6	2246462	2246467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804202
45057	NC_003210	AC	3	6	2246477	2246482	50 %	0 %	0 %	50 %	16804202
45058	NC_003210	ACG	3	9	2246499	2246507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804202
45059	NC_003210	GCTTTT	2	12	2246512	2246523	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16804202
45060	NC_003210	ATA	2	6	2246526	2246531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804202
45061	NC_003210	AAT	2	6	2246570	2246575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804202
45062	NC_003210	T	6	6	2246616	2246621	0 %	100 %	0 %	0 %	16804202
45063	NC_003210	CTT	2	6	2246657	2246662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804202
45064	NC_003210	GTT	2	6	2246665	2246670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804202
45065	NC_003210	CA	3	6	2246687	2246692	50 %	0 %	0 %	50 %	16804202
45066	NC_003210	TGC	2	6	2246715	2246720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804202
45067	NC_003210	AC	3	6	2246754	2246759	50 %	0 %	0 %	50 %	16804202
45068	NC_003210	TGC	2	6	2246841	2246846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804202
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45070	NC_003210	AAT	2	6	2246952	2246957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804202
45071	NC_003210	ATA	2	6	2246974	2246979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804202
45072	NC_003210	ATT	2	6	2247053	2247058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804203
45073	NC_003210	ATG	2	6	2247116	2247121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804203
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45079	NC_003210	TCT	2	6	2247402	2247407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804203
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45086	NC_003210	CTT	2	6	2247754	2247759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804203
45087	NC_003210	AATTG	2	10	2247762	2247771	40 %	40 %	20 %	0 %	16804203
45088	NC_003210	ATAA	2	8	2247812	2247819	75 %	25 %	0 %	0 %	16804203
45089	NC_003210	ACGA	2	8	2247874	2247881	50 %	0 %	25 %	25 %	16804203
45090	NC_003210	TTTA	2	8	2247893	2247900	25 %	75 %	0 %	0 %	16804203
45091	NC_003210	AAC	2	6	2248052	2248057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804204
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45095	NC_003210	CT	3	6	2248121	2248126	0 %	50 %	0 %	50 %	16804204
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45099	NC_003210	TTC	2	6	2248322	2248327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804204
45100	NC_003210	A	6	6	2248359	2248364	100 %	0 %	0 %	0 %	16804204
45101	NC_003210	TCTA	2	8	2248367	2248374	25 %	50 %	0 %	25 %	16804204
45102	NC_003210	TGA	2	6	2248381	2248386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804204
45103	NC_003210	TACA	2	8	2248459	2248466	50 %	25 %	0 %	25 %	16804204
45104	NC_003210	CAA	2	6	2248540	2248545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804204
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45108	NC_003210	TCG	2	6	2248989	2248994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804205
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45114	NC_003210	TTCT	2	8	2249168	2249175	0 %	75 %	0 %	25 %	16804205
45115	NC_003210	ATA	2	6	2249233	2249238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804205
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45118	NC_003210	TAA	2	6	2249353	2249358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804205
45119	NC_003210	AATTA	2	10	2249363	2249372	60 %	40 %	0 %	0 %	16804205
45120	NC_003210	TAA	2	6	2249398	2249403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804205
45121	NC_003210	CTA	2	6	2249455	2249460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804205
45122	NC_003210	ATT	2	6	2249483	2249488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804205
45123	NC_003210	AAT	2	6	2249513	2249518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804205
45124	NC_003210	AAT	2	6	2249530	2249535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804205
45125	NC_003210	T	7	7	2249552	2249558	0 %	100 %	0 %	0 %	16804205
45126	NC_003210	GTA	2	6	2249566	2249571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804205
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45128	NC_003210	T	6	6	2249679	2249684	0 %	100 %	0 %	0 %	16804206
45129	NC_003210	TCT	2	6	2249703	2249708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804206
45130	NC_003210	ATC	2	6	2249758	2249763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804206
45131	NC_003210	TTA	2	6	2249796	2249801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804206
45132	NC_003210	TA	3	6	2249820	2249825	50 %	50 %	0 %	0 %	16804206
45133	NC_003210	TAC	2	6	2249841	2249846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804206
45134	NC_003210	TCG	2	6	2249879	2249884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804206
45135	NC_003210	TAC	2	6	2249926	2249931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804206
45136	NC_003210	TATAT	2	10	2249950	2249959	40 %	60 %	0 %	0 %	16804206
45137	NC_003210	TGGAT	2	10	2250037	2250046	20 %	40 %	40 %	0 %	16804206
45138	NC_003210	TCT	2	6	2250104	2250109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804206
45139	NC_003210	TAA	2	6	2250142	2250147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804206
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45141	NC_003210	ATT	2	6	2250266	2250271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804206
45142	NC_003210	TACA	2	8	2250447	2250454	50 %	25 %	0 %	25 %	16804207
45143	NC_003210	A	6	6	2250466	2250471	100 %	0 %	0 %	0 %	16804207
45144	NC_003210	CGC	2	6	2250524	2250529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804207
45145	NC_003210	GAA	2	6	2250575	2250580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804207
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45147	NC_003210	ACGT	2	8	2250675	2250682	25 %	25 %	25 %	25 %	16804207
45148	NC_003210	TTA	2	6	2250686	2250691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804207
45149	NC_003210	AAG	2	6	2250702	2250707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804207
45150	NC_003210	TAT	2	6	2250758	2250763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804207
45151	NC_003210	TCA	2	6	2250937	2250942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804208
45152	NC_003210	TAC	2	6	2250952	2250957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804208
45153	NC_003210	TTAT	2	8	2250958	2250965	25 %	75 %	0 %	0 %	16804208
45154	NC_003210	TGG	2	6	2250970	2250975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16804208
45155	NC_003210	ATT	2	6	2251049	2251054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804209
45156	NC_003210	TTGC	2	8	2251066	2251073	0 %	50 %	25 %	25 %	16804209
45157	NC_003210	ATA	2	6	2251105	2251110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804209
45158	NC_003210	AG	3	6	2251204	2251209	50 %	0 %	50 %	0 %	16804209
45159	NC_003210	CGA	2	6	2251315	2251320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804209
45160	NC_003210	AGCT	2	8	2251370	2251377	25 %	25 %	25 %	25 %	16804209
45161	NC_003210	CAA	2	6	2251397	2251402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804209
45162	NC_003210	CTG	2	6	2251481	2251486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804209
45163	NC_003210	CTG	2	6	2251505	2251510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804209
45164	NC_003210	AAC	2	6	2251512	2251517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804209
45165	NC_003210	ACGA	2	8	2251521	2251528	50 %	0 %	25 %	25 %	16804209
45166	NC_003210	GTT	2	6	2251540	2251545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804209
45167	NC_003210	ACC	2	6	2251557	2251562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804209
45168	NC_003210	CAA	2	6	2251580	2251585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804209
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45170	NC_003210	GCT	2	6	2251660	2251665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804209
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45177	NC_003210	CTG	2	6	2251841	2251846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804209
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45181	NC_003210	TTTTC	2	10	2251979	2251988	0 %	80 %	0 %	20 %	16804209
45182	NC_003210	GTTG	2	8	2252017	2252024	0 %	50 %	50 %	0 %	16804210
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45184	NC_003210	TA	3	6	2252088	2252093	50 %	50 %	0 %	0 %	16804210
45185	NC_003210	TG	3	6	2252101	2252106	0 %	50 %	50 %	0 %	16804210
45186	NC_003210	AAG	2	6	2252155	2252160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804210
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45188	NC_003210	CAAAG	2	10	2252264	2252273	60 %	0 %	20 %	20 %	16804210
45189	NC_003210	CAA	2	6	2252303	2252308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804210
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45192	NC_003210	AATA	2	8	2252438	2252445	75 %	25 %	0 %	0 %	16804210
45193	NC_003210	AGC	3	9	2252454	2252462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804210
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45200	NC_003210	TAA	2	6	2252813	2252818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804210
45201	NC_003210	ATAAG	2	10	2252916	2252925	60 %	20 %	20 %	0 %	16804210
45202	NC_003210	CGC	2	6	2253063	2253068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804210
45203	NC_003210	GTTT	2	8	2253243	2253250	0 %	75 %	25 %	0 %	16804211
45204	NC_003210	AAT	2	6	2253254	2253259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804211
45205	NC_003210	GCC	2	6	2253269	2253274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804211
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45208	NC_003210	TCGC	2	8	2253315	2253322	0 %	25 %	25 %	50 %	16804211
45209	NC_003210	AAT	2	6	2253323	2253328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804211
45210	NC_003210	AATC	2	8	2253367	2253374	50 %	25 %	0 %	25 %	16804211
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45212	NC_003210	CTT	2	6	2253526	2253531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804211
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45218	NC_003210	CCA	2	6	2253732	2253737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804211
45219	NC_003210	ATG	2	6	2253758	2253763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804211
45220	NC_003210	CTG	2	6	2253811	2253816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804211
45221	NC_003210	GTT	2	6	2253843	2253848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804211
45222	NC_003210	TCAC	2	8	2253861	2253868	25 %	25 %	0 %	50 %	16804211
45223	NC_003210	GCT	2	6	2253879	2253884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804211
45224	NC_003210	TTGT	2	8	2253928	2253935	0 %	75 %	25 %	0 %	16804211
45225	NC_003210	CTG	3	9	2253946	2253954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804211
45226	NC_003210	ACG	2	6	2253956	2253961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804211
45227	NC_003210	ATA	3	9	2254086	2254094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804211
45228	NC_003210	T	6	6	2254145	2254150	0 %	100 %	0 %	0 %	16804211
45229	NC_003210	CTT	2	6	2254234	2254239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804211
45230	NC_003210	AGTTA	2	10	2254247	2254256	40 %	40 %	20 %	0 %	16804211
45231	NC_003210	TTC	2	6	2254325	2254330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804211
45232	NC_003210	CTA	2	6	2254351	2254356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804211
45233	NC_003210	AGC	2	6	2254451	2254456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804211
45234	NC_003210	TAA	2	6	2254477	2254482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804211
45235	NC_003210	TCT	2	6	2254515	2254520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804211
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45237	NC_003210	CCA	2	6	2254560	2254565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804211
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45343	NC_003210	ATT	2	6	2259423	2259428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804216
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45352	NC_003210	A	6	6	2259685	2259690	100 %	0 %	0 %	0 %	16804216
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45475	NC_003210	TTG	2	6	2266082	2266087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804218
45476	NC_003210	CACT	2	8	2266094	2266101	25 %	25 %	0 %	50 %	16804218
45477	NC_003210	GT	3	6	2266163	2266168	0 %	50 %	50 %	0 %	16804218
45478	NC_003210	CTG	2	6	2266208	2266213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804218
45479	NC_003210	AGT	2	6	2266246	2266251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804218
45480	NC_003210	TAA	2	6	2266338	2266343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804218
45481	NC_003210	ATC	2	6	2266449	2266454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804218
45482	NC_003210	ATTT	2	8	2266478	2266485	25 %	75 %	0 %	0 %	16804218
45483	NC_003210	ATA	2	6	2266569	2266574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804218
45484	NC_003210	CTT	2	6	2266646	2266651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804218
45485	NC_003210	TGT	2	6	2266656	2266661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804218
45486	NC_003210	AAAG	2	8	2266662	2266669	75 %	0 %	25 %	0 %	16804218
45487	NC_003210	CAG	2	6	2266676	2266681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804218
45488	NC_003210	ATC	2	6	2266737	2266742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804218
45489	NC_003210	TCT	2	6	2266789	2266794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804218
45490	NC_003210	CAGT	2	8	2266807	2266814	25 %	25 %	25 %	25 %	16804218
45491	NC_003210	CAT	2	6	2266820	2266825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804218
45492	NC_003210	T	6	6	2266854	2266859	0 %	100 %	0 %	0 %	16804218
45493	NC_003210	TAAAA	2	10	2266895	2266904	80 %	20 %	0 %	0 %	16804218
45494	NC_003210	ATC	2	6	2266938	2266943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804218
45495	NC_003210	GTA	2	6	2266950	2266955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804218
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45498	NC_003210	TG	3	6	2267105	2267110	0 %	50 %	50 %	0 %	16804218
45499	NC_003210	CTGAAA	2	12	2267162	2267173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16804218
45500	NC_003210	GTT	2	6	2267224	2267229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804218

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