MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 58890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_003210	CTA	2	6	2144962	2144967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804102
43002	NC_003210	TTC	2	6	2144968	2144973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804102
43003	NC_003210	TTCT	2	8	2144975	2144982	0 %	75 %	0 %	25 %	16804102
43004	NC_003210	TAT	3	9	2145002	2145010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804102
43005	NC_003210	A	7	7	2145130	2145136	100 %	0 %	0 %	0 %	16804103
43006	NC_003210	TAG	2	6	2145140	2145145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804103
43007	NC_003210	GCT	2	6	2145208	2145213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804103
43008	NC_003210	TAG	2	6	2145236	2145241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804103
43009	NC_003210	CAT	2	6	2145246	2145251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804103
43010	NC_003210	CTT	2	6	2145271	2145276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804103
43011	NC_003210	GGT	2	6	2145277	2145282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16804103
43012	NC_003210	ATC	3	9	2145364	2145372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804103
43013	NC_003210	TACT	2	8	2145401	2145408	25 %	50 %	0 %	25 %	16804103
43014	NC_003210	A	6	6	2145421	2145426	100 %	0 %	0 %	0 %	16804103
43015	NC_003210	GAA	2	6	2145439	2145444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804103
43016	NC_003210	TTA	2	6	2145490	2145495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804103
43017	NC_003210	AAC	2	6	2145500	2145505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804103
43018	NC_003210	T	7	7	2145664	2145670	0 %	100 %	0 %	0 %	16804104
43019	NC_003210	AAAT	2	8	2145726	2145733	75 %	25 %	0 %	0 %	16804104
43020	NC_003210	ATC	2	6	2145761	2145766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804104
43021	NC_003210	GCC	2	6	2145782	2145787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804104
43022	NC_003210	CTT	2	6	2145801	2145806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804104
43023	NC_003210	T	7	7	2145820	2145826	0 %	100 %	0 %	0 %	16804104
43024	NC_003210	TAAA	2	8	2145829	2145836	75 %	25 %	0 %	0 %	16804104
43025	NC_003210	GCT	2	6	2145842	2145847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804104
43026	NC_003210	AAT	2	6	2145854	2145859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804104
43027	NC_003210	CAA	2	6	2145861	2145866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804104
43028	NC_003210	AAT	2	6	2145894	2145899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804104
43029	NC_003210	CCA	2	6	2145947	2145952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804104
43030	NC_003210	CCA	2	6	2145977	2145982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804104
43031	NC_003210	TAT	2	6	2146012	2146017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804104
43032	NC_003210	TAC	2	6	2146020	2146025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804104
43033	NC_003210	TTC	2	6	2146103	2146108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804105
43034	NC_003210	T	7	7	2146115	2146121	0 %	100 %	0 %	0 %	16804105
43035	NC_003210	GCAAA	2	10	2146243	2146252	60 %	0 %	20 %	20 %	16804105
43036	NC_003210	AAT	2	6	2146266	2146271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804105
43037	NC_003210	AAT	2	6	2146278	2146283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804105
43038	NC_003210	TC	3	6	2146291	2146296	0 %	50 %	0 %	50 %	16804105
43039	NC_003210	CT	3	6	2146510	2146515	0 %	50 %	0 %	50 %	16804106
43040	NC_003210	TAA	3	9	2146570	2146578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804106
43041	NC_003210	AATA	2	8	2146607	2146614	75 %	25 %	0 %	0 %	16804106
43042	NC_003210	CCA	2	6	2146633	2146638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804106
43043	NC_003210	TGT	2	6	2146657	2146662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804106
43044	NC_003210	AGA	2	6	2146767	2146772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804106
43045	NC_003210	AATC	2	8	2146823	2146830	50 %	25 %	0 %	25 %	16804106
43046	NC_003210	ATT	2	6	2146842	2146847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804106
43047	NC_003210	TAAAT	2	10	2146884	2146893	60 %	40 %	0 %	0 %	16804106
43048	NC_003210	ATT	2	6	2146914	2146919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804106
43049	NC_003210	CA	3	6	2146965	2146970	50 %	0 %	0 %	50 %	16804106
43050	NC_003210	GATT	2	8	2147057	2147064	25 %	50 %	25 %	0 %	16804106
43051	NC_003210	TCT	2	6	2147076	2147081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804106
43052	NC_003210	CTT	2	6	2147084	2147089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804106
43053	NC_003210	CAG	2	6	2147258	2147263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804106
43054	NC_003210	AAC	2	6	2147337	2147342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804106
43055	NC_003210	CTT	2	6	2147348	2147353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804106
43056	NC_003210	TTCC	2	8	2147377	2147384	0 %	50 %	0 %	50 %	16804106
43057	NC_003210	CAT	2	6	2147687	2147692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804107
43058	NC_003210	GCC	2	6	2147693	2147698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804107
43059	NC_003210	GCT	2	6	2147727	2147732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804107
43060	NC_003210	GAT	2	6	2147796	2147801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804107
43061	NC_003210	ATCA	2	8	2147852	2147859	50 %	25 %	0 %	25 %	16804107
43062	NC_003210	TGC	2	6	2147879	2147884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804107
43063	NC_003210	ACCAAC	2	12	2147891	2147902	50 %	0 %	0 %	50 %	16804107
43064	NC_003210	TTC	2	6	2147975	2147980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804107
43065	NC_003210	TGC	2	6	2148035	2148040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804107
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43068	NC_003210	AAC	2	6	2148182	2148187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804107
43069	NC_003210	AGT	2	6	2148248	2148253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804107
43070	NC_003210	TTC	2	6	2148254	2148259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804107
43071	NC_003210	TG	3	6	2148297	2148302	0 %	50 %	50 %	0 %	16804107
43072	NC_003210	TTG	2	6	2148325	2148330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804107
43073	NC_003210	ATC	2	6	2148332	2148337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804107
43074	NC_003210	ACT	2	6	2148348	2148353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804107
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43076	NC_003210	TCT	2	6	2148447	2148452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804107
43077	NC_003210	ACG	2	6	2148464	2148469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804107
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43079	NC_003210	GTTT	2	8	2148520	2148527	0 %	75 %	25 %	0 %	16804107
43080	NC_003210	GAC	2	6	2148583	2148588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804107
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43083	NC_003210	T	7	7	2148640	2148646	0 %	100 %	0 %	0 %	16804107
43084	NC_003210	CTA	2	6	2148748	2148753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804107
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43086	NC_003210	CGT	2	6	2148802	2148807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804107
43087	NC_003210	CTT	2	6	2148847	2148852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804107
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43090	NC_003210	TTC	2	6	2148926	2148931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804107
43091	NC_003210	T	6	6	2148999	2149004	0 %	100 %	0 %	0 %	16804107
43092	NC_003210	CTT	2	6	2149009	2149014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804107
43093	NC_003210	TTGC	2	8	2149021	2149028	0 %	50 %	25 %	25 %	16804107
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43101	NC_003210	ATT	2	6	2149347	2149352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804108
43102	NC_003210	CAA	2	6	2149512	2149517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804108
43103	NC_003210	T	6	6	2149575	2149580	0 %	100 %	0 %	0 %	16804108
43104	NC_003210	ACA	2	6	2149604	2149609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804108
43105	NC_003210	T	6	6	2149864	2149869	0 %	100 %	0 %	0 %	16804109
43106	NC_003210	TTA	2	6	2149907	2149912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804109
43107	NC_003210	T	6	6	2149914	2149919	0 %	100 %	0 %	0 %	16804109
43108	NC_003210	CTG	2	6	2149926	2149931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804109
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43114	NC_003210	A	6	6	2150100	2150105	100 %	0 %	0 %	0 %	16804109
43115	NC_003210	TTGT	2	8	2150169	2150176	0 %	75 %	25 %	0 %	16804109
43116	NC_003210	TAT	2	6	2150179	2150184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804109
43117	NC_003210	AGA	2	6	2150299	2150304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804109
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43119	NC_003210	TGA	2	6	2150346	2150351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804109
43120	NC_003210	TTA	2	6	2150370	2150375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804109
43121	NC_003210	TTTC	2	8	2150409	2150416	0 %	75 %	0 %	25 %	16804109
43122	NC_003210	TTAC	2	8	2150417	2150424	25 %	50 %	0 %	25 %	16804109
43123	NC_003210	AAAAC	2	10	2150465	2150474	80 %	0 %	0 %	20 %	16804109
43124	NC_003210	GC	3	6	2150493	2150498	0 %	0 %	50 %	50 %	16804109
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43128	NC_003210	TTGTAT	2	12	2150605	2150616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16804110
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43132	NC_003210	TGGCAT	2	12	2150696	2150707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16804110
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43134	NC_003210	AAGT	2	8	2150754	2150761	50 %	25 %	25 %	0 %	16804110
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43150	NC_003210	TTC	2	6	2151777	2151782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804112
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43154	NC_003210	CCAAA	2	10	2151925	2151934	60 %	0 %	0 %	40 %	16804112
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43226	NC_003210	A	6	6	2154678	2154683	100 %	0 %	0 %	0 %	16804113
43227	NC_003210	TA	3	6	2155224	2155229	50 %	50 %	0 %	0 %	161410729
43228	NC_003210	AAT	2	6	2155239	2155244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161410729
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43230	NC_003210	CGG	2	6	2155346	2155351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161410729
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43232	NC_003210	CTT	2	6	2155387	2155392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161410729
43233	NC_003210	CGC	2	6	2155421	2155426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161410729
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43235	NC_003210	GTT	2	6	2155447	2155452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161410729
43236	NC_003210	CAT	2	6	2155456	2155461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161410729
43237	NC_003210	TACT	2	8	2155486	2155493	25 %	50 %	0 %	25 %	161410729
43238	NC_003210	GCTT	2	8	2155508	2155515	0 %	50 %	25 %	25 %	161410729
43239	NC_003210	CGC	2	6	2155523	2155528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161410729
43240	NC_003210	CTC	2	6	2155547	2155552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161410729
43241	NC_003210	TAA	2	6	2155582	2155587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161410729
43242	NC_003210	ACTAAA	2	12	2155604	2155615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	161410729
43243	NC_003210	CATC	2	8	2155630	2155637	25 %	25 %	0 %	50 %	161410729
43244	NC_003210	CGC	2	6	2155696	2155701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161410729
43245	NC_003210	GC	3	6	2155724	2155729	0 %	0 %	50 %	50 %	161410729
43246	NC_003210	CCG	2	6	2155824	2155829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161410729
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43253	NC_003210	CCAC	2	8	2156250	2156257	25 %	0 %	0 %	75 %	16804115
43254	NC_003210	TCT	2	6	2156270	2156275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804115
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43257	NC_003210	CAT	2	6	2156349	2156354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804115
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43259	NC_003210	TA	3	6	2156535	2156540	50 %	50 %	0 %	0 %	16804115
43260	NC_003210	ATA	2	6	2156551	2156556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804115
43261	NC_003210	TAA	3	9	2156568	2156576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804115
43262	NC_003210	ATTC	2	8	2156577	2156584	25 %	50 %	0 %	25 %	16804115
43263	NC_003210	GCT	2	6	2156591	2156596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804115
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43265	NC_003210	ATA	2	6	2156636	2156641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804115
43266	NC_003210	AGTC	2	8	2156649	2156656	25 %	25 %	25 %	25 %	16804115
43267	NC_003210	ATA	2	6	2156673	2156678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804115
43268	NC_003210	CTT	2	6	2156682	2156687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804115
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43273	NC_003210	AGTA	2	8	2156822	2156829	50 %	25 %	25 %	0 %	16804116
43274	NC_003210	CTGC	2	8	2156834	2156841	0 %	25 %	25 %	50 %	16804116
43275	NC_003210	CCGC	2	8	2156849	2156856	0 %	0 %	25 %	75 %	16804116
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43283	NC_003210	AGA	2	6	2157360	2157365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804116
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43293	NC_003210	GATT	2	8	2157943	2157950	25 %	50 %	25 %	0 %	16804118
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43334	NC_003210	GTTT	2	8	2159955	2159962	0 %	75 %	25 %	0 %	16804120
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43338	NC_003210	ATTAA	2	10	2160317	2160326	60 %	40 %	0 %	0 %	16804121
43339	NC_003210	CCA	2	6	2160356	2160361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804121
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43342	NC_003210	ATT	2	6	2160533	2160538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804122
43343	NC_003210	T	6	6	2160570	2160575	0 %	100 %	0 %	0 %	16804122
43344	NC_003210	AAAT	2	8	2160602	2160609	75 %	25 %	0 %	0 %	16804122
43345	NC_003210	GTG	2	6	2160613	2160618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16804122
43346	NC_003210	CTT	2	6	2160693	2160698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804122
43347	NC_003210	CAT	2	6	2160718	2160723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804122
43348	NC_003210	CA	3	6	2160727	2160732	50 %	0 %	0 %	50 %	16804122
43349	NC_003210	CTT	2	6	2160738	2160743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804122
43350	NC_003210	TCT	2	6	2160789	2160794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804122
43351	NC_003210	CTT	2	6	2160822	2160827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804122
43352	NC_003210	ACC	2	6	2160906	2160911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804122
43353	NC_003210	GCG	2	6	2160924	2160929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16804122
43354	NC_003210	ACA	2	6	2160932	2160937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16804122
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43477	NC_003210	TCCA	2	8	2167528	2167535	25 %	25 %	0 %	50 %	16804127
43478	NC_003210	TAAA	2	8	2167541	2167548	75 %	25 %	0 %	0 %	16804127
43479	NC_003210	GCA	2	6	2167571	2167576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804127
43480	NC_003210	CGTAA	2	10	2167634	2167643	40 %	20 %	20 %	20 %	16804127
43481	NC_003210	TCTGG	2	10	2167714	2167723	0 %	40 %	40 %	20 %	16804127
43482	NC_003210	GTA	2	6	2167752	2167757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804127
43483	NC_003210	ATC	2	6	2167803	2167808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804127
43484	NC_003210	TTC	2	6	2167840	2167845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804127
43485	NC_003210	CAC	2	6	2167851	2167856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16804127
43486	NC_003210	ATT	2	6	2167893	2167898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804127
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43489	NC_003210	ATTT	2	8	2168052	2168059	25 %	75 %	0 %	0 %	16804128
43490	NC_003210	TTC	2	6	2168060	2168065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804128
43491	NC_003210	TTC	2	6	2168184	2168189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804128
43492	NC_003210	CAG	2	6	2168227	2168232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804128
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43500	NC_003210	TCT	2	6	2168775	2168780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804128

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