MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

< Previous12...80818283848586878889909192Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_002662	AAC	2	6	2356594	2356599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674245
45502	NC_002662	GTT	2	6	2356628	2356633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674245
45503	NC_002662	CTG	3	9	2356650	2356658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674245
45504	NC_002662	CAACT	2	10	2356660	2356669	40 %	20 %	0 %	40 %	15674245
45505	NC_002662	TGA	2	6	2356692	2356697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674245
45506	NC_002662	A	7	7	2356737	2356743	100 %	0 %	0 %	0 %	15674245
45507	NC_002662	GAT	2	6	2356754	2356759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674245
45508	NC_002662	TGAT	2	8	2356776	2356783	25 %	50 %	25 %	0 %	15674245
45509	NC_002662	GAAAA	2	10	2356785	2356794	80 %	0 %	20 %	0 %	15674245
45510	NC_002662	GTT	2	6	2356832	2356837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674245
45511	NC_002662	A	6	6	2356896	2356901	100 %	0 %	0 %	0 %	15674245
45512	NC_002662	CTA	2	6	2356953	2356958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674245
45513	NC_002662	GTA	2	6	2357037	2357042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674245
45514	NC_002662	T	6	6	2357055	2357060	0 %	100 %	0 %	0 %	15674245
45515	NC_002662	T	6	6	2357253	2357258	0 %	100 %	0 %	0 %	15674246
45516	NC_002662	TTTTC	2	10	2357261	2357270	0 %	80 %	0 %	20 %	15674246
45517	NC_002662	TCC	2	6	2357286	2357291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674246
45518	NC_002662	CAG	2	6	2357345	2357350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674246
45519	NC_002662	CAA	2	6	2357399	2357404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674246
45520	NC_002662	CTT	2	6	2357621	2357626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674246
45521	NC_002662	CAA	2	6	2357627	2357632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674246
45522	NC_002662	TTTGT	2	10	2357717	2357726	0 %	80 %	20 %	0 %	15674246
45523	NC_002662	CCA	2	6	2357758	2357763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674246
45524	NC_002662	TGA	2	6	2357781	2357786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674246
45525	NC_002662	CCA	2	6	2357863	2357868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674246
45526	NC_002662	TGT	2	6	2357968	2357973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674246
45527	NC_002662	CAC	2	6	2357981	2357986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674246
45528	NC_002662	TTA	2	6	2357992	2357997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674246
45529	NC_002662	GAA	2	6	2358044	2358049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674246
45530	NC_002662	ATTT	2	8	2358183	2358190	25 %	75 %	0 %	0 %	15674247
45531	NC_002662	T	6	6	2358193	2358198	0 %	100 %	0 %	0 %	15674247
45532	NC_002662	GGC	2	6	2358216	2358221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15674247
45533	NC_002662	AAG	2	6	2358247	2358252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674247
45534	NC_002662	TAA	2	6	2358292	2358297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674247
45535	NC_002662	T	7	7	2358303	2358309	0 %	100 %	0 %	0 %	15674247
45536	NC_002662	C	6	6	2358318	2358323	0 %	0 %	0 %	100 %	15674247
45537	NC_002662	TAA	2	6	2358333	2358338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674247
45538	NC_002662	TTC	2	6	2358352	2358357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674247
45539	NC_002662	AACT	2	8	2358365	2358372	50 %	25 %	0 %	25 %	15674247
45540	NC_002662	GCT	2	6	2358465	2358470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674247
45541	NC_002662	GA	3	6	2358552	2358557	50 %	0 %	50 %	0 %	15674247
45542	NC_002662	T	7	7	2358558	2358564	0 %	100 %	0 %	0 %	15674247
45543	NC_002662	CAT	2	6	2358589	2358594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674247
45544	NC_002662	CTT	3	9	2358622	2358630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674247
45545	NC_002662	CCA	2	6	2358706	2358711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674247
45546	NC_002662	CAT	2	6	2358715	2358720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674247
45547	NC_002662	TGA	2	6	2358727	2358732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674247
45548	NC_002662	ATTT	2	8	2358774	2358781	25 %	75 %	0 %	0 %	15674247
45549	NC_002662	T	6	6	2359003	2359008	0 %	100 %	0 %	0 %	15674248
45550	NC_002662	AAT	2	6	2359026	2359031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674248
45551	NC_002662	ATC	2	6	2359084	2359089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674248
45552	NC_002662	TCA	2	6	2359181	2359186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674248
45553	NC_002662	CAT	2	6	2359254	2359259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674248
45554	NC_002662	TTC	2	6	2359386	2359391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674248
45555	NC_002662	AATC	2	8	2359412	2359419	50 %	25 %	0 %	25 %	15674248
45556	NC_002662	CGA	2	6	2359432	2359437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674248
45557	NC_002662	ACA	2	6	2359507	2359512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674248
45558	NC_002662	TGGT	2	8	2359515	2359522	0 %	50 %	50 %	0 %	15674248
45559	NC_002662	CT	3	6	2359542	2359547	0 %	50 %	0 %	50 %	15674248
45560	NC_002662	AT	3	6	2359597	2359602	50 %	50 %	0 %	0 %	15674248
45561	NC_002662	TTC	2	6	2359603	2359608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674248
45562	NC_002662	GCA	2	6	2359645	2359650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674248
45563	NC_002662	CCA	2	6	2359723	2359728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674248
45564	NC_002662	T	6	6	2359790	2359795	0 %	100 %	0 %	0 %	15674248
45565	NC_002662	ATTC	2	8	2359817	2359824	25 %	50 %	0 %	25 %	15674248

< Previous12...80818283848586878889909192Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.