MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_002662	A	7	7	2304011	2304017	100 %	0 %	0 %	0 %	15674204
44502	NC_002662	TAT	3	9	2304046	2304054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674204
44503	NC_002662	TTC	2	6	2304065	2304070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674204
44504	NC_002662	CAA	2	6	2304079	2304084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674204
44505	NC_002662	ACA	2	6	2304118	2304123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674204
44506	NC_002662	TGA	2	6	2304128	2304133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44507	NC_002662	ACA	2	6	2304141	2304146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674204
44508	NC_002662	ATG	2	6	2304215	2304220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44509	NC_002662	ATG	2	6	2304278	2304283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44510	NC_002662	ATG	2	6	2304341	2304346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44511	NC_002662	ATG	2	6	2304404	2304409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44512	NC_002662	ATG	2	6	2304448	2304453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44513	NC_002662	TTA	2	6	2304486	2304491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674204
44514	NC_002662	A	6	6	2304536	2304541	100 %	0 %	0 %	0 %	15674204
44515	NC_002662	TAT	2	6	2304577	2304582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674204
44516	NC_002662	CTC	2	6	2304586	2304591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674204
44517	NC_002662	CTG	2	6	2304593	2304598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674204
44518	NC_002662	AGT	2	6	2304642	2304647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44519	NC_002662	TA	3	6	2304653	2304658	50 %	50 %	0 %	0 %	15674204
44520	NC_002662	GATT	2	8	2304662	2304669	25 %	50 %	25 %	0 %	15674204
44521	NC_002662	CAA	2	6	2304700	2304705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674204
44522	NC_002662	CTG	2	6	2304773	2304778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674204
44523	NC_002662	TGC	2	6	2304843	2304848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674204
44524	NC_002662	GTC	2	6	2304908	2304913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674204
44525	NC_002662	TAT	2	6	2304970	2304975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674204
44526	NC_002662	GGT	2	6	2304976	2304981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674204
44527	NC_002662	TCTA	2	8	2305057	2305064	25 %	50 %	0 %	25 %	15674204
44528	NC_002662	GTA	2	6	2305093	2305098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674204
44529	NC_002662	TTA	2	6	2305104	2305109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674204
44530	NC_002662	TAA	2	6	2305113	2305118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674204
44531	NC_002662	ACT	2	6	2305128	2305133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674204
44532	NC_002662	TAATC	2	10	2305138	2305147	40 %	40 %	0 %	20 %	15674204
44533	NC_002662	TATTT	2	10	2305191	2305200	20 %	80 %	0 %	0 %	15674205
44534	NC_002662	TAC	2	6	2305204	2305209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44535	NC_002662	CAT	2	6	2305230	2305235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44536	NC_002662	ATC	2	6	2305237	2305242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44537	NC_002662	GATG	2	8	2305253	2305260	25 %	25 %	50 %	0 %	15674205
44538	NC_002662	ACA	2	6	2305349	2305354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674205
44539	NC_002662	GA	3	6	2305359	2305364	50 %	0 %	50 %	0 %	15674205
44540	NC_002662	CCATT	2	10	2305384	2305393	20 %	40 %	0 %	40 %	15674205
44541	NC_002662	TAA	2	6	2305428	2305433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674205
44542	NC_002662	TGT	2	6	2305444	2305449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674205
44543	NC_002662	GTA	2	6	2305471	2305476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674205
44544	NC_002662	CAG	2	6	2305489	2305494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674205
44545	NC_002662	TATT	2	8	2305538	2305545	25 %	75 %	0 %	0 %	15674205
44546	NC_002662	ATC	2	6	2305616	2305621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44547	NC_002662	TAT	2	6	2305767	2305772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674205
44548	NC_002662	TCCA	2	8	2305782	2305789	25 %	25 %	0 %	50 %	15674205
44549	NC_002662	ATA	2	6	2305816	2305821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674205
44550	NC_002662	CAT	2	6	2305855	2305860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44551	NC_002662	CAT	2	6	2305899	2305904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44552	NC_002662	AGA	2	6	2305930	2305935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674205
44553	NC_002662	CAT	2	6	2305962	2305967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44554	NC_002662	AGA	2	6	2305993	2305998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674205
44555	NC_002662	CAT	2	6	2306025	2306030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
44556	NC_002662	AGA	2	6	2306056	2306061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674205
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44562	NC_002662	CAT	2	6	2306236	2306241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674205
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44566	NC_002662	TAATA	2	10	2306313	2306322	60 %	40 %	0 %	0 %	15674205
44567	NC_002662	T	9	9	2306354	2306362	0 %	100 %	0 %	0 %	15674205
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44570	NC_002662	GTA	2	6	2306435	2306440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674205
44571	NC_002662	TGA	2	6	2306470	2306475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674205
44572	NC_002662	TGA	2	6	2306545	2306550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674205
44573	NC_002662	TAT	2	6	2306608	2306613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674205
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44575	NC_002662	T	6	6	2306629	2306634	0 %	100 %	0 %	0 %	15674205
44576	NC_002662	TTTA	2	8	2307230	2307237	25 %	75 %	0 %	0 %	15674206
44577	NC_002662	T	7	7	2307255	2307261	0 %	100 %	0 %	0 %	15674206
44578	NC_002662	CTT	2	6	2307311	2307316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674206
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44585	NC_002662	ACA	2	6	2307589	2307594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674206
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44588	NC_002662	CAG	2	6	2307674	2307679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674206
44589	NC_002662	GTG	2	6	2307809	2307814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674206
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44591	NC_002662	ACC	2	6	2307843	2307848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674206
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44593	NC_002662	TTC	2	6	2307915	2307920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674206
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44597	NC_002662	AT	3	6	2308058	2308063	50 %	50 %	0 %	0 %	15674206
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44601	NC_002662	GCCACC	2	12	2308128	2308139	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15674206
44602	NC_002662	GCC	2	6	2308143	2308148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15674206
44603	NC_002662	AGC	2	6	2308179	2308184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674206
44604	NC_002662	CTT	2	6	2308217	2308222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674206
44605	NC_002662	CTT	2	6	2308226	2308231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674206
44606	NC_002662	TTC	2	6	2308239	2308244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674206
44607	NC_002662	CTT	2	6	2308253	2308258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674206
44608	NC_002662	T	6	6	2308278	2308283	0 %	100 %	0 %	0 %	15674206
44609	NC_002662	T	7	7	2308302	2308308	0 %	100 %	0 %	0 %	15674206
44610	NC_002662	ATA	2	6	2308350	2308355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674206
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44612	NC_002662	CAAT	2	8	2308547	2308554	50 %	25 %	0 %	25 %	15674207
44613	NC_002662	TTTTC	2	10	2308591	2308600	0 %	80 %	0 %	20 %	15674207
44614	NC_002662	TAA	2	6	2308653	2308658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674207
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44616	NC_002662	AATC	2	8	2308687	2308694	50 %	25 %	0 %	25 %	15674207
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44618	NC_002662	TCA	2	6	2308801	2308806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674207
44619	NC_002662	ACC	2	6	2308832	2308837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674207
44620	NC_002662	TCA	2	6	2308851	2308856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674207
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44731	NC_002662	TGA	2	6	2313668	2313673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674211
44732	NC_002662	TGA	2	6	2313686	2313691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674211
44733	NC_002662	GCT	2	6	2313704	2313709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674211
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44974	NC_002662	AAG	2	6	2324012	2324017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674220
44975	NC_002662	ATG	2	6	2324026	2324031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674220
44976	NC_002662	TCA	2	6	2324084	2324089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674220
44977	NC_002662	ATC	2	6	2324149	2324154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674220
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44979	NC_002662	ATA	2	6	2324255	2324260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674220
44980	NC_002662	TCT	2	6	2324264	2324269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674220
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44997	NC_002662	TTCAA	2	10	2325480	2325489	40 %	40 %	0 %	20 %	15674221
44998	NC_002662	ACAA	2	8	2325545	2325552	75 %	0 %	0 %	25 %	15674221
44999	NC_002662	TTGA	2	8	2325568	2325575	25 %	50 %	25 %	0 %	15674221
45000	NC_002662	TAGC	2	8	2325584	2325591	25 %	25 %	25 %	25 %	15674221

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