MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_002662	TGGAGA	2	12	213009	213020	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15672193
4003	NC_002662	TA	4	8	213038	213045	50 %	50 %	0 %	0 %	15672193
4004	NC_002662	ATT	2	6	213063	213068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672193
4005	NC_002662	TATC	2	8	213182	213189	25 %	50 %	0 %	25 %	15672193
4006	NC_002662	TGA	2	6	213195	213200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672193
4007	NC_002662	AAT	2	6	213320	213325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672193
4008	NC_002662	T	8	8	213349	213356	0 %	100 %	0 %	0 %	15672194
4009	NC_002662	TC	3	6	213410	213415	0 %	50 %	0 %	50 %	15672194
4010	NC_002662	TTC	2	6	213474	213479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672194
4011	NC_002662	ATC	2	6	213513	213518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672194
4012	NC_002662	CAAAA	2	10	213519	213528	80 %	0 %	0 %	20 %	15672194
4013	NC_002662	TGAA	2	8	213532	213539	50 %	25 %	25 %	0 %	15672194
4014	NC_002662	AAT	2	6	213551	213556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672194
4015	NC_002662	AAT	2	6	213617	213622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672194
4016	NC_002662	AT	4	8	213648	213655	50 %	50 %	0 %	0 %	15672194
4017	NC_002662	TAT	3	9	213680	213688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672194
4018	NC_002662	TGT	2	6	213848	213853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672194
4019	NC_002662	AGAT	2	8	213895	213902	50 %	25 %	25 %	0 %	15672194
4020	NC_002662	ATT	2	6	213982	213987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672194
4021	NC_002662	TTA	2	6	214008	214013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672194
4022	NC_002662	ATT	2	6	214048	214053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672194
4023	NC_002662	T	7	7	214090	214096	0 %	100 %	0 %	0 %	15672194
4024	NC_002662	A	7	7	214141	214147	100 %	0 %	0 %	0 %	15672194
4025	NC_002662	TGT	2	6	214148	214153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672194
4026	NC_002662	ATTA	2	8	214154	214161	50 %	50 %	0 %	0 %	15672194
4027	NC_002662	TACC	2	8	214166	214173	25 %	25 %	0 %	50 %	15672194
4028	NC_002662	CCT	2	6	214187	214192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15672194
4029	NC_002662	TTG	2	6	214198	214203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672194
4030	NC_002662	TCT	2	6	214222	214227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672194
4031	NC_002662	TAT	2	6	214244	214249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672194
4032	NC_002662	TGT	2	6	214327	214332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672194
4033	NC_002662	ATC	2	6	214410	214415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672194
4034	NC_002662	GGT	2	6	214443	214448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672194
4035	NC_002662	TGA	2	6	214519	214524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672194
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4037	NC_002662	AT	3	6	214625	214630	50 %	50 %	0 %	0 %	15672194
4038	NC_002662	ATT	2	6	214683	214688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672194
4039	NC_002662	A	7	7	214742	214748	100 %	0 %	0 %	0 %	15672194
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4041	NC_002662	TTA	2	6	214780	214785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672195
4042	NC_002662	GGA	2	6	214799	214804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672195
4043	NC_002662	AAG	2	6	214832	214837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672195
4044	NC_002662	TTA	2	6	214860	214865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672195
4045	NC_002662	AAC	2	6	214870	214875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672195
4046	NC_002662	ATG	2	6	214881	214886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672195
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4049	NC_002662	A	6	6	214942	214947	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4050	NC_002662	T	6	6	214969	214974	0 %	100 %	0 %	0 %	15672195
4051	NC_002662	A	8	8	214976	214983	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4052	NC_002662	TCAT	2	8	214993	215000	25 %	50 %	0 %	25 %	15672195
4053	NC_002662	A	6	6	215007	215012	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4054	NC_002662	ATT	2	6	215031	215036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672195
4055	NC_002662	GCAAAA	2	12	215087	215098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15672195
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4057	NC_002662	A	7	7	215206	215212	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4058	NC_002662	TGCAGT	2	12	215299	215310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15672195
4059	NC_002662	TGA	2	6	215311	215316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672195
4060	NC_002662	A	6	6	215328	215333	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4061	NC_002662	GAA	2	6	215347	215352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672195
4062	NC_002662	GTC	2	6	215373	215378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672195
4063	NC_002662	A	6	6	215443	215448	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4064	NC_002662	AATT	2	8	215454	215461	50 %	50 %	0 %	0 %	15672195
4065	NC_002662	AAAG	2	8	215496	215503	75 %	0 %	25 %	0 %	15672195
4066	NC_002662	A	7	7	215511	215517	100 %	0 %	0 %	0 %	15672195
4067	NC_002662	AGC	2	6	215629	215634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672195
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4069	NC_002662	TGA	2	6	215695	215700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672195
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4071	NC_002662	AAT	2	6	215723	215728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672195
4072	NC_002662	ATT	2	6	215737	215742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672195
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4075	NC_002662	AAT	2	6	215883	215888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672195
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4094	NC_002662	ATG	2	6	216822	216827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672197
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4098	NC_002662	TAT	2	6	216986	216991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672197
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4100	NC_002662	GAA	2	6	217010	217015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672197
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4106	NC_002662	AGA	2	6	217120	217125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672197
4107	NC_002662	A	6	6	217169	217174	100 %	0 %	0 %	0 %	15672197
4108	NC_002662	TAA	2	6	217206	217211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
4109	NC_002662	TCTA	2	8	217222	217229	25 %	50 %	0 %	25 %	15672197
4110	NC_002662	ATA	2	6	217233	217238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
4111	NC_002662	AGA	2	6	217264	217269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672197
4112	NC_002662	AATC	2	8	217383	217390	50 %	25 %	0 %	25 %	15672197
4113	NC_002662	TTA	2	6	217410	217415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672197
4114	NC_002662	TAA	2	6	217425	217430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
4115	NC_002662	AATT	2	8	217437	217444	50 %	50 %	0 %	0 %	15672197
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4119	NC_002662	GACA	2	8	217509	217516	50 %	0 %	25 %	25 %	15672197
4120	NC_002662	CAAT	2	8	217524	217531	50 %	25 %	0 %	25 %	15672197
4121	NC_002662	TAA	2	6	217539	217544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
4122	NC_002662	TA	3	6	217632	217637	50 %	50 %	0 %	0 %	15672197
4123	NC_002662	ATT	2	6	217639	217644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672197
4124	NC_002662	TCTT	2	8	217662	217669	0 %	75 %	0 %	25 %	15672197
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4126	NC_002662	ACT	2	6	217722	217727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672198
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4152	NC_002662	A	6	6	218845	218850	100 %	0 %	0 %	0 %	15672199
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4249	NC_002662	GAG	2	6	224342	224347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672204
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4251	NC_002662	T	6	6	224446	224451	0 %	100 %	0 %	0 %	15672204
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4374	NC_002662	TAC	2	6	231630	231635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672214
4375	NC_002662	TGG	2	6	231648	231653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672214
4376	NC_002662	AGC	2	6	231663	231668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672214
4377	NC_002662	CTGACC	2	12	231722	231733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15672214
4378	NC_002662	GAA	3	9	231784	231792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672214
4379	NC_002662	TTG	2	6	231800	231805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672214
4380	NC_002662	GCA	2	6	231841	231846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672214
4381	NC_002662	AAG	2	6	231851	231856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672214
4382	NC_002662	CAA	2	6	231875	231880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672214
4383	NC_002662	GATGAC	2	12	231967	231978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15672214
4384	NC_002662	A	6	6	232105	232110	100 %	0 %	0 %	0 %	15672215
4385	NC_002662	ATT	3	9	232121	232129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672215
4386	NC_002662	CTGC	2	8	232156	232163	0 %	25 %	25 %	50 %	15672215
4387	NC_002662	CAA	2	6	232199	232204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672215
4388	NC_002662	AAG	2	6	232217	232222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672215
4389	NC_002662	TGA	2	6	232394	232399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672215
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4392	NC_002662	GATTT	2	10	232469	232478	20 %	60 %	20 %	0 %	15672215
4393	NC_002662	CATT	2	8	232527	232534	25 %	50 %	0 %	25 %	15672215
4394	NC_002662	TGA	2	6	232545	232550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672215
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4396	NC_002662	AAC	2	6	232680	232685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672215
4397	NC_002662	GA	3	6	232702	232707	50 %	0 %	50 %	0 %	15672215
4398	NC_002662	GAA	2	6	232721	232726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672215
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4400	NC_002662	ATCA	2	8	232794	232801	50 %	25 %	0 %	25 %	15672216
4401	NC_002662	CCA	2	6	232827	232832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15672216
4402	NC_002662	ATTGA	2	10	232854	232863	40 %	40 %	20 %	0 %	15672216
4403	NC_002662	CAAA	2	8	232875	232882	75 %	0 %	0 %	25 %	15672216
4404	NC_002662	TTG	2	6	232891	232896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672216
4405	NC_002662	GGCTT	2	10	232932	232941	0 %	40 %	40 %	20 %	15672216
4406	NC_002662	GAT	2	6	233169	233174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672216
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4408	NC_002662	AGAA	2	8	233214	233221	75 %	0 %	25 %	0 %	15672216
4409	NC_002662	GCG	2	6	233262	233267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672216
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4412	NC_002662	TAAA	2	8	233372	233379	75 %	25 %	0 %	0 %	15672216
4413	NC_002662	ATTT	2	8	233405	233412	25 %	75 %	0 %	0 %	15672217
4414	NC_002662	TGA	2	6	233517	233522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672217
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4454	NC_002662	AAAAT	2	10	235866	235875	80 %	20 %	0 %	0 %	15672220
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4479	NC_002662	CTAGT	2	10	237132	237141	20 %	40 %	20 %	20 %	15672221
4480	NC_002662	GAC	2	6	237262	237267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672222
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4483	NC_002662	ACGTAA	2	12	237381	237392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15672222
4484	NC_002662	A	6	6	237391	237396	100 %	0 %	0 %	0 %	15672222
4485	NC_002662	TCA	2	6	237642	237647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672223
4486	NC_002662	TGA	2	6	237722	237727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672223
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4489	NC_002662	TCA	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672223
4490	NC_002662	CAAG	2	8	237900	237907	50 %	0 %	25 %	25 %	15672223
4491	NC_002662	GAAG	2	8	237924	237931	50 %	0 %	50 %	0 %	15672223
4492	NC_002662	AGTTCA	2	12	237963	237974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15672223
4493	NC_002662	TCA	2	6	238023	238028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672223
4494	NC_002662	GCCA	2	8	238107	238114	25 %	0 %	25 %	50 %	15672223
4495	NC_002662	GTCC	2	8	238183	238190	0 %	25 %	25 %	50 %	15672223
4496	NC_002662	GAT	2	6	238197	238202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672223
4497	NC_002662	AAC	2	6	238224	238229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672223
4498	NC_002662	ACA	2	6	238308	238313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672223
4499	NC_002662	ACGG	2	8	238344	238351	25 %	0 %	50 %	25 %	15672223
4500	NC_002662	AAAG	2	8	238494	238501	75 %	0 %	25 %	0 %	15672223

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