MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_002662	AAC	2	6	2243511	2243516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674149
43502	NC_002662	A	6	6	2243522	2243527	100 %	0 %	0 %	0 %	15674149
43503	NC_002662	T	6	6	2243535	2243540	0 %	100 %	0 %	0 %	15674149
43504	NC_002662	ATG	2	6	2243594	2243599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674149
43505	NC_002662	A	6	6	2243681	2243686	100 %	0 %	0 %	0 %	15674149
43506	NC_002662	TAAT	2	8	2243705	2243712	50 %	50 %	0 %	0 %	15674149
43507	NC_002662	ATTGG	2	10	2243717	2243726	20 %	40 %	40 %	0 %	15674149
43508	NC_002662	TGC	2	6	2243751	2243756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674149
43509	NC_002662	ACAA	2	8	2243760	2243767	75 %	0 %	0 %	25 %	15674149
43510	NC_002662	TAA	2	6	2243811	2243816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674149
43511	NC_002662	TAC	2	6	2243844	2243849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674149
43512	NC_002662	GCT	2	6	2243875	2243880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674149
43513	NC_002662	A	6	6	2243947	2243952	100 %	0 %	0 %	0 %	15674149
43514	NC_002662	ATAA	2	8	2244095	2244102	75 %	25 %	0 %	0 %	15674149
43515	NC_002662	TTC	2	6	2244228	2244233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674150
43516	NC_002662	AAG	2	6	2244249	2244254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674150
43517	NC_002662	TGGT	2	8	2244288	2244295	0 %	50 %	50 %	0 %	15674150
43518	NC_002662	AAG	2	6	2244346	2244351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674150
43519	NC_002662	AAG	2	6	2244432	2244437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674150
43520	NC_002662	GCT	2	6	2244448	2244453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674150
43521	NC_002662	T	6	6	2244453	2244458	0 %	100 %	0 %	0 %	15674150
43522	NC_002662	CTT	2	6	2244587	2244592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674150
43523	NC_002662	CCA	2	6	2244693	2244698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674150
43524	NC_002662	GCA	2	6	2244781	2244786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674150
43525	NC_002662	CAT	2	6	2244797	2244802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674150
43526	NC_002662	CCA	2	6	2244928	2244933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674150
43527	NC_002662	AAC	2	6	2244945	2244950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674150
43528	NC_002662	GTT	2	6	2244963	2244968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674150
43529	NC_002662	GTT	2	6	2245009	2245014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674150
43530	NC_002662	GTTT	2	8	2245025	2245032	0 %	75 %	25 %	0 %	15674150
43531	NC_002662	CTT	2	6	2245034	2245039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674150
43532	NC_002662	T	6	6	2245050	2245055	0 %	100 %	0 %	0 %	15674150
43533	NC_002662	TTC	2	6	2245065	2245070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674150
43534	NC_002662	TGT	3	9	2245098	2245106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674150
43535	NC_002662	ATG	2	6	2245175	2245180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674150
43536	NC_002662	GTG	2	6	2245211	2245216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674150
43537	NC_002662	TTC	2	6	2245224	2245229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674150
43538	NC_002662	TGC	2	6	2245272	2245277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674150
43539	NC_002662	ACC	2	6	2245296	2245301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674150
43540	NC_002662	T	7	7	2245340	2245346	0 %	100 %	0 %	0 %	15674150
43541	NC_002662	GCT	2	6	2245348	2245353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674150
43542	NC_002662	TTC	2	6	2245371	2245376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674150
43543	NC_002662	GAGT	2	8	2245508	2245515	25 %	25 %	50 %	0 %	15674150
43544	NC_002662	ATG	2	6	2245888	2245893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674151
43545	NC_002662	TTGACC	2	12	2245910	2245921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15674151
43546	NC_002662	CAA	2	6	2245939	2245944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674151
43547	NC_002662	A	6	6	2245984	2245989	100 %	0 %	0 %	0 %	15674151
43548	NC_002662	CCA	2	6	2245990	2245995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674151
43549	NC_002662	AAG	2	6	2246018	2246023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674151
43550	NC_002662	T	7	7	2246036	2246042	0 %	100 %	0 %	0 %	15674151
43551	NC_002662	ATTG	2	8	2246047	2246054	25 %	50 %	25 %	0 %	15674151
43552	NC_002662	TTG	2	6	2246070	2246075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674151
43553	NC_002662	AGTG	2	8	2246142	2246149	25 %	25 %	50 %	0 %	15674151
43554	NC_002662	ATCAA	2	10	2246306	2246315	60 %	20 %	0 %	20 %	15674151
43555	NC_002662	A	6	6	2246328	2246333	100 %	0 %	0 %	0 %	15674151
43556	NC_002662	GCT	2	6	2246350	2246355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674151
43557	NC_002662	TTG	2	6	2246363	2246368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674151
43558	NC_002662	CTT	2	6	2246451	2246456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674152
43559	NC_002662	TGAC	2	8	2246591	2246598	25 %	25 %	25 %	25 %	15674152
43560	NC_002662	TCA	2	6	2246609	2246614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674152
43561	NC_002662	ACT	2	6	2246621	2246626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674152
43562	NC_002662	AGCCC	2	10	2246767	2246776	20 %	0 %	20 %	60 %	15674152
43563	NC_002662	GCA	3	9	2246822	2246830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674152
43564	NC_002662	CATTT	2	10	2246839	2246848	20 %	60 %	0 %	20 %	15674152
43565	NC_002662	ATT	2	6	2246860	2246865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674152
43566	NC_002662	TG	3	6	2246875	2246880	0 %	50 %	50 %	0 %	15674152
43567	NC_002662	CAG	2	6	2246925	2246930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674152
43568	NC_002662	TTG	2	6	2246940	2246945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674152
43569	NC_002662	AAT	2	6	2247111	2247116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674152
43570	NC_002662	GCT	2	6	2247155	2247160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674152
43571	NC_002662	TCT	2	6	2247164	2247169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674152
43572	NC_002662	TTA	2	6	2247536	2247541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674153
43573	NC_002662	GAA	2	6	2247626	2247631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674153
43574	NC_002662	CCT	2	6	2247668	2247673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674153
43575	NC_002662	GAA	2	6	2247702	2247707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674153
43576	NC_002662	CCAT	2	8	2247717	2247724	25 %	25 %	0 %	50 %	15674153
43577	NC_002662	A	6	6	2247755	2247760	100 %	0 %	0 %	0 %	15674153
43578	NC_002662	TGA	3	9	2247889	2247897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674154
43579	NC_002662	A	8	8	2247897	2247904	100 %	0 %	0 %	0 %	15674154
43580	NC_002662	TCT	2	6	2247940	2247945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674154
43581	NC_002662	TGTC	2	8	2247958	2247965	0 %	50 %	25 %	25 %	15674154
43582	NC_002662	ATT	2	6	2247972	2247977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674154
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43584	NC_002662	GCATT	2	10	2248033	2248042	20 %	40 %	20 %	20 %	15674154
43585	NC_002662	ACT	2	6	2248043	2248048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674154
43586	NC_002662	CTT	2	6	2248049	2248054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674154
43587	NC_002662	T	6	6	2248053	2248058	0 %	100 %	0 %	0 %	15674154
43588	NC_002662	ACT	2	6	2248167	2248172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674154
43589	NC_002662	TTA	2	6	2248206	2248211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674154
43590	NC_002662	TTTC	2	8	2248272	2248279	0 %	75 %	0 %	25 %	15674155
43591	NC_002662	TCTTTT	2	12	2248337	2248348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15674155
43592	NC_002662	AAC	2	6	2248351	2248356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674155
43593	NC_002662	CAA	2	6	2248374	2248379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674155
43594	NC_002662	T	6	6	2248396	2248401	0 %	100 %	0 %	0 %	15674155
43595	NC_002662	TCT	2	6	2248460	2248465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674155
43596	NC_002662	TAAT	2	8	2248701	2248708	50 %	50 %	0 %	0 %	15674155
43597	NC_002662	TCA	2	6	2248742	2248747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674155
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43599	NC_002662	TTC	2	6	2248822	2248827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674155
43600	NC_002662	GAA	2	6	2248831	2248836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674155
43601	NC_002662	CTT	2	6	2248935	2248940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674155
43602	NC_002662	CAAATT	2	12	2249010	2249021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15674155
43603	NC_002662	CAG	2	6	2249094	2249099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674155
43604	NC_002662	GAA	2	6	2249126	2249131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674155
43605	NC_002662	TCT	2	6	2249150	2249155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674155
43606	NC_002662	TCA	2	6	2249160	2249165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674155
43607	NC_002662	TGA	2	6	2249196	2249201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674155
43608	NC_002662	CTT	2	6	2249358	2249363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674155
43609	NC_002662	AGA	3	9	2249451	2249459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674155
43610	NC_002662	TTG	2	6	2249487	2249492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674155
43611	NC_002662	CTG	2	6	2249511	2249516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674155
43612	NC_002662	TTG	2	6	2249538	2249543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674155
43613	NC_002662	CATCTT	2	12	2249583	2249594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15674155
43614	NC_002662	CTT	2	6	2249619	2249624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674155
43615	NC_002662	ACAT	2	8	2249630	2249637	50 %	25 %	0 %	25 %	15674155
43616	NC_002662	CCA	2	6	2249677	2249682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674155
43617	NC_002662	TCCA	2	8	2249717	2249724	25 %	25 %	0 %	50 %	15674155
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43619	NC_002662	GTT	2	6	2249777	2249782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674155
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43840	NC_002662	AG	4	8	2268676	2268683	50 %	0 %	50 %	0 %	15674166
43841	NC_002662	T	6	6	2268732	2268737	0 %	100 %	0 %	0 %	15674166
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43843	NC_002662	CAGC	2	8	2268840	2268847	25 %	0 %	25 %	50 %	15674166
43844	NC_002662	CT	3	6	2268855	2268860	0 %	50 %	0 %	50 %	15674166
43845	NC_002662	ATTG	2	8	2268866	2268873	25 %	50 %	25 %	0 %	15674166
43846	NC_002662	GTT	2	6	2268874	2268879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674166
43847	NC_002662	TCC	2	6	2268926	2268931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674166
43848	NC_002662	CTA	2	6	2268958	2268963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674166
43849	NC_002662	CAA	2	6	2268967	2268972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674166
43850	NC_002662	A	6	6	2269061	2269066	100 %	0 %	0 %	0 %	15674166
43851	NC_002662	TGGCAT	2	12	2269075	2269086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15674166
43852	NC_002662	GCTC	2	8	2269098	2269105	0 %	25 %	25 %	50 %	15674166
43853	NC_002662	TGC	2	6	2269157	2269162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674166
43854	NC_002662	TCA	2	6	2269176	2269181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674166
43855	NC_002662	CCA	2	6	2269233	2269238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674166
43856	NC_002662	ACC	2	6	2269250	2269255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674166
43857	NC_002662	ACT	2	6	2269329	2269334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674166
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43860	NC_002662	TCT	2	6	2269488	2269493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674166
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43863	NC_002662	CTT	2	6	2269555	2269560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674166
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43971	NC_002662	AAT	2	6	2276027	2276032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674174
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43975	NC_002662	ACT	2	6	2276593	2276598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674175
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