MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_002662	CAA	2	6	2114018	2114023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674018
41002	NC_002662	TAA	2	6	2114105	2114110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674018
41003	NC_002662	GTG	2	6	2114111	2114116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674018
41004	NC_002662	ATT	2	6	2114122	2114127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674018
41005	NC_002662	CAC	3	9	2114348	2114356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674019
41006	NC_002662	GTAA	2	8	2114442	2114449	50 %	25 %	25 %	0 %	15674019
41007	NC_002662	CAT	2	6	2114486	2114491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674019
41008	NC_002662	GAG	2	6	2114504	2114509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15674019
41009	NC_002662	CAC	2	6	2114528	2114533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674019
41010	NC_002662	TGC	2	6	2114577	2114582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674019
41011	NC_002662	GTCA	2	8	2114589	2114596	25 %	25 %	25 %	25 %	15674019
41012	NC_002662	GAA	2	6	2114633	2114638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674019
41013	NC_002662	CCAT	2	8	2114662	2114669	25 %	25 %	0 %	50 %	15674019
41014	NC_002662	CAT	2	6	2114730	2114735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674019
41015	NC_002662	TGT	2	6	2114862	2114867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674019
41016	NC_002662	AATT	2	8	2114877	2114884	50 %	50 %	0 %	0 %	15674019
41017	NC_002662	CAC	2	6	2114888	2114893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674019
41018	NC_002662	TTA	2	6	2115013	2115018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674019
41019	NC_002662	AAT	2	6	2115092	2115097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674019
41020	NC_002662	T	6	6	2115176	2115181	0 %	100 %	0 %	0 %	15674019
41021	NC_002662	TTG	2	6	2115194	2115199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674019
41022	NC_002662	CAT	2	6	2115227	2115232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674019
41023	NC_002662	TAA	2	6	2115264	2115269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674019
41024	NC_002662	TTC	2	6	2115282	2115287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674019
41025	NC_002662	GAT	2	6	2115298	2115303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674019
41026	NC_002662	ATC	2	6	2115417	2115422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674019
41027	NC_002662	GTT	2	6	2115431	2115436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674019
41028	NC_002662	GGA	3	9	2115482	2115490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15674019
41029	NC_002662	T	6	6	2115837	2115842	0 %	100 %	0 %	0 %	15674020
41030	NC_002662	GCA	2	6	2115857	2115862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674020
41031	NC_002662	AAG	2	6	2115868	2115873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674020
41032	NC_002662	CTT	2	6	2115882	2115887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674020
41033	NC_002662	CAT	2	6	2115939	2115944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674020
41034	NC_002662	ATA	2	6	2115967	2115972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674020
41035	NC_002662	GCA	2	6	2116037	2116042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674020
41036	NC_002662	AAC	2	6	2116048	2116053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674020
41037	NC_002662	GA	3	6	2116111	2116116	50 %	0 %	50 %	0 %	15674020
41038	NC_002662	ATT	2	6	2116120	2116125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674020
41039	NC_002662	ATTG	2	8	2116157	2116164	25 %	50 %	25 %	0 %	15674020
41040	NC_002662	AAGTCA	2	12	2116229	2116240	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674020
41041	NC_002662	CTT	3	9	2116308	2116316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674020
41042	NC_002662	T	6	6	2116423	2116428	0 %	100 %	0 %	0 %	15674020
41043	NC_002662	TACCA	2	10	2116441	2116450	40 %	20 %	0 %	40 %	15674020
41044	NC_002662	CTT	2	6	2116491	2116496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674020
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41046	NC_002662	ACA	2	6	2116544	2116549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674020
41047	NC_002662	T	7	7	2116575	2116581	0 %	100 %	0 %	0 %	15674020
41048	NC_002662	GCT	2	6	2116589	2116594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674020
41049	NC_002662	CAA	2	6	2116677	2116682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674020
41050	NC_002662	CAA	2	6	2116731	2116736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674020
41051	NC_002662	TCAA	2	8	2116820	2116827	50 %	25 %	0 %	25 %	15674020
41052	NC_002662	CTT	2	6	2116905	2116910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674020
41053	NC_002662	TCT	2	6	2116925	2116930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674020
41054	NC_002662	TCA	2	6	2116970	2116975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674020
41055	NC_002662	TCA	2	6	2117000	2117005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674020
41056	NC_002662	TGAT	2	8	2117063	2117070	25 %	50 %	25 %	0 %	15674020
41057	NC_002662	TCC	2	6	2117197	2117202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674020
41058	NC_002662	TATC	2	8	2117337	2117344	25 %	50 %	0 %	25 %	15674020
41059	NC_002662	TGA	2	6	2117434	2117439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674020
41060	NC_002662	ATA	2	6	2117453	2117458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674020
41061	NC_002662	GCA	2	6	2117495	2117500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674020
41062	NC_002662	CATT	2	8	2117533	2117540	25 %	50 %	0 %	25 %	15674020
41063	NC_002662	ATT	2	6	2117627	2117632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674021
41064	NC_002662	ATA	2	6	2117649	2117654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674021
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41067	NC_002662	A	7	7	2117755	2117761	100 %	0 %	0 %	0 %	15674021
41068	NC_002662	GA	3	6	2117772	2117777	50 %	0 %	50 %	0 %	15674021
41069	NC_002662	AATT	2	8	2117812	2117819	50 %	50 %	0 %	0 %	15674021
41070	NC_002662	TTA	2	6	2118050	2118055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674021
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41072	NC_002662	CAA	2	6	2118349	2118354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723236
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41086	NC_002662	TCA	2	6	2119112	2119117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161723236
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41088	NC_002662	GTT	2	6	2119223	2119228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161723236
41089	NC_002662	ATC	2	6	2119354	2119359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161723236
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41092	NC_002662	TG	3	6	2119454	2119459	0 %	50 %	50 %	0 %	161723236
41093	NC_002662	CTTT	2	8	2119491	2119498	0 %	75 %	0 %	25 %	161723236
41094	NC_002662	T	6	6	2119566	2119571	0 %	100 %	0 %	0 %	161723236
41095	NC_002662	TG	3	6	2119836	2119841	0 %	50 %	50 %	0 %	15674023
41096	NC_002662	AGC	2	6	2119847	2119852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674023
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41099	NC_002662	TCC	2	6	2120001	2120006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674023
41100	NC_002662	AGG	2	6	2120039	2120044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15674023
41101	NC_002662	TGC	3	9	2120057	2120065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674023
41102	NC_002662	TG	3	6	2120163	2120168	0 %	50 %	50 %	0 %	15674023
41103	NC_002662	TTA	2	6	2120232	2120237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674023
41104	NC_002662	CTG	2	6	2120285	2120290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674023
41105	NC_002662	TCA	2	6	2120331	2120336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674023
41106	NC_002662	CTT	2	6	2120358	2120363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674023
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41108	NC_002662	T	7	7	2120747	2120753	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41109	NC_002662	TTC	2	6	2120785	2120790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674024
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41113	NC_002662	TTC	2	6	2120977	2120982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674024
41114	NC_002662	GA	3	6	2121021	2121026	50 %	0 %	50 %	0 %	15674024
41115	NC_002662	AAT	2	6	2121065	2121070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674024
41116	NC_002662	ATAA	2	8	2121116	2121123	75 %	25 %	0 %	0 %	15674024
41117	NC_002662	ATC	2	6	2121262	2121267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674024
41118	NC_002662	T	6	6	2121297	2121302	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41119	NC_002662	TTC	2	6	2121310	2121315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674024
41120	NC_002662	TCT	2	6	2121323	2121328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674024
41121	NC_002662	T	6	6	2121328	2121333	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41122	NC_002662	ACG	2	6	2121334	2121339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674024
41123	NC_002662	CAC	2	6	2121424	2121429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674024
41124	NC_002662	TTC	2	6	2121448	2121453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674024
41125	NC_002662	GTG	2	6	2121468	2121473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674024
41126	NC_002662	TAC	2	6	2121531	2121536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674024
41127	NC_002662	AGTA	2	8	2121569	2121576	50 %	25 %	25 %	0 %	15674024
41128	NC_002662	T	6	6	2121583	2121588	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41129	NC_002662	AAG	2	6	2121614	2121619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674024
41130	NC_002662	TCA	2	6	2121710	2121715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674024
41131	NC_002662	TAAG	2	8	2121746	2121753	50 %	25 %	25 %	0 %	15674024
41132	NC_002662	T	6	6	2121787	2121792	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41133	NC_002662	AGAA	2	8	2121799	2121806	75 %	0 %	25 %	0 %	15674024
41134	NC_002662	TCA	2	6	2121845	2121850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674024
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41137	NC_002662	GAAG	2	8	2122009	2122016	50 %	0 %	50 %	0 %	15674024
41138	NC_002662	CCA	2	6	2122019	2122024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674024
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41141	NC_002662	CTAT	2	8	2122523	2122530	25 %	50 %	0 %	25 %	15674024
41142	NC_002662	CAA	2	6	2122582	2122587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674024
41143	NC_002662	ACA	2	6	2122619	2122624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674024
41144	NC_002662	TC	3	6	2122644	2122649	0 %	50 %	0 %	50 %	15674024
41145	NC_002662	TTG	2	6	2122663	2122668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674024
41146	NC_002662	T	6	6	2122720	2122725	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41147	NC_002662	GTT	2	6	2122761	2122766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674024
41148	NC_002662	TTGA	2	8	2122768	2122775	25 %	50 %	25 %	0 %	15674024
41149	NC_002662	ATT	2	6	2122789	2122794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674024
41150	NC_002662	AAT	2	6	2122809	2122814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674024
41151	NC_002662	AAT	2	6	2122926	2122931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674024
41152	NC_002662	CTT	2	6	2122992	2122997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674024
41153	NC_002662	AT	3	6	2123039	2123044	50 %	50 %	0 %	0 %	15674024
41154	NC_002662	AAAAG	2	10	2123087	2123096	80 %	0 %	20 %	0 %	15674024
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41158	NC_002662	TAA	2	6	2123214	2123219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674024
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41161	NC_002662	AAT	2	6	2123286	2123291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674024
41162	NC_002662	TAT	2	6	2123304	2123309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674024
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41164	NC_002662	T	6	6	2123465	2123470	0 %	100 %	0 %	0 %	15674024
41165	NC_002662	GGT	2	6	2123508	2123513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674024
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41177	NC_002662	TTC	2	6	2124104	2124109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
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41181	NC_002662	CCT	2	6	2124337	2124342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674025
41182	NC_002662	TAC	2	6	2124445	2124450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
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41184	NC_002662	GAAT	2	8	2124624	2124631	50 %	25 %	25 %	0 %	15674025
41185	NC_002662	T	6	6	2124658	2124663	0 %	100 %	0 %	0 %	15674025
41186	NC_002662	CT	3	6	2124711	2124716	0 %	50 %	0 %	50 %	15674025
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41193	NC_002662	ATT	2	6	2125007	2125012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674025
41194	NC_002662	ATT	2	6	2125082	2125087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674025
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41200	NC_002662	TTTCAT	2	12	2125321	2125332	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15674025
41201	NC_002662	CAA	2	6	2125369	2125374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674025
41202	NC_002662	TCA	2	6	2125410	2125415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
41203	NC_002662	ATT	2	6	2125475	2125480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674025
41204	NC_002662	TCA	2	6	2125512	2125517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
41205	NC_002662	TCT	2	6	2125566	2125571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
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41207	NC_002662	TAT	2	6	2125703	2125708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674025
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41210	NC_002662	TCGT	2	8	2125842	2125849	0 %	50 %	25 %	25 %	15674025
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41212	NC_002662	AT	3	6	2126006	2126011	50 %	50 %	0 %	0 %	15674025
41213	NC_002662	TTC	2	6	2126054	2126059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
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41215	NC_002662	GAT	2	6	2126145	2126150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674025
41216	NC_002662	CTT	2	6	2126160	2126165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
41217	NC_002662	AGC	2	6	2126175	2126180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674025
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41219	NC_002662	TAT	2	6	2126281	2126286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674025
41220	NC_002662	TAC	2	6	2126293	2126298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
41221	NC_002662	CGT	2	6	2126312	2126317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674025
41222	NC_002662	CATT	2	8	2126323	2126330	25 %	50 %	0 %	25 %	15674025
41223	NC_002662	AAT	2	6	2126338	2126343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674025
41224	NC_002662	ATC	2	6	2126354	2126359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
41225	NC_002662	CTT	2	6	2126398	2126403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
41226	NC_002662	TCT	2	6	2126481	2126486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
41227	NC_002662	AATC	2	8	2126549	2126556	50 %	25 %	0 %	25 %	15674025
41228	NC_002662	T	6	6	2126601	2126606	0 %	100 %	0 %	0 %	15674025
41229	NC_002662	AAT	2	6	2126608	2126613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674025
41230	NC_002662	CTT	3	9	2126686	2126694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674025
41231	NC_002662	CAT	2	6	2126710	2126715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
41232	NC_002662	CCA	2	6	2126820	2126825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674025
41233	NC_002662	ATA	2	6	2126840	2126845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674025
41234	NC_002662	TCA	2	6	2126971	2126976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
41235	NC_002662	ATC	2	6	2126979	2126984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674025
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41237	NC_002662	TGA	2	6	2127110	2127115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674025
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41358	NC_002662	TTG	2	6	2132948	2132953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674029
41359	NC_002662	TGGT	2	8	2132983	2132990	0 %	50 %	50 %	0 %	15674029
41360	NC_002662	TTTAT	2	10	2132995	2133004	20 %	80 %	0 %	0 %	15674029
41361	NC_002662	ATT	2	6	2133100	2133105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674029
41362	NC_002662	TCT	2	6	2133106	2133111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674029
41363	NC_002662	TCC	2	6	2133165	2133170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674029
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41370	NC_002662	T	6	6	2133408	2133413	0 %	100 %	0 %	0 %	15674029
41371	NC_002662	CATG	2	8	2133438	2133445	25 %	25 %	25 %	25 %	15674029
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41374	NC_002662	A	8	8	2133596	2133603	100 %	0 %	0 %	0 %	15674029
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41468	NC_002662	A	6	6	2138587	2138592	100 %	0 %	0 %	0 %	15674033
41469	NC_002662	A	6	6	2138614	2138619	100 %	0 %	0 %	0 %	15674033
41470	NC_002662	GCT	2	6	2138656	2138661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674033
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41473	NC_002662	TTG	2	6	2138808	2138813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674034
41474	NC_002662	TGA	2	6	2138883	2138888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674034
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