MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002662	TCAT	2	8	188927	188934	25 %	50 %	0 %	25 %	15672165
3502	NC_002662	GAT	2	6	189025	189030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672165
3503	NC_002662	TAAA	3	12	189092	189103	75 %	25 %	0 %	0 %	15672166
3504	NC_002662	AAT	2	6	189109	189114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672166
3505	NC_002662	AG	3	6	189163	189168	50 %	0 %	50 %	0 %	15672166
3506	NC_002662	TTC	2	6	189169	189174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672166
3507	NC_002662	TAA	2	6	189187	189192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672166
3508	NC_002662	A	6	6	189345	189350	100 %	0 %	0 %	0 %	15672167
3509	NC_002662	GAT	3	9	189368	189376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672167
3510	NC_002662	AAT	3	9	189392	189400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672167
3511	NC_002662	AGTA	2	8	189480	189487	50 %	25 %	25 %	0 %	15672167
3512	NC_002662	T	6	6	189527	189532	0 %	100 %	0 %	0 %	15672167
3513	NC_002662	T	7	7	189811	189817	0 %	100 %	0 %	0 %	15672168
3514	NC_002662	ACA	2	6	189822	189827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672168
3515	NC_002662	T	7	7	189845	189851	0 %	100 %	0 %	0 %	15672168
3516	NC_002662	GCC	2	6	189883	189888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15672168
3517	NC_002662	TAA	2	6	189971	189976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672168
3518	NC_002662	TAAG	2	8	190016	190023	50 %	25 %	25 %	0 %	15672168
3519	NC_002662	ACAAT	2	10	190062	190071	60 %	20 %	0 %	20 %	15672169
3520	NC_002662	TAA	2	6	190078	190083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672169
3521	NC_002662	AAAC	2	8	190111	190118	75 %	0 %	0 %	25 %	15672169
3522	NC_002662	ATAA	2	8	190129	190136	75 %	25 %	0 %	0 %	15672169
3523	NC_002662	AACC	2	8	190170	190177	50 %	0 %	0 %	50 %	15672169
3524	NC_002662	TTG	2	6	190218	190223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672169
3525	NC_002662	GCA	2	6	190229	190234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672169
3526	NC_002662	GC	3	6	190242	190247	0 %	0 %	50 %	50 %	15672169
3527	NC_002662	GA	3	6	190267	190272	50 %	0 %	50 %	0 %	15672169
3528	NC_002662	CAG	2	6	190305	190310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672169
3529	NC_002662	AGA	2	6	190330	190335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672169
3530	NC_002662	CGA	2	6	190365	190370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672169
3531	NC_002662	CAA	2	6	190452	190457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672169
3532	NC_002662	GAAA	2	8	190579	190586	75 %	0 %	25 %	0 %	15672169
3533	NC_002662	ATG	2	6	190652	190657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672169
3534	NC_002662	T	7	7	190689	190695	0 %	100 %	0 %	0 %	15672169
3535	NC_002662	ATA	2	6	190700	190705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672169
3536	NC_002662	GA	3	6	190709	190714	50 %	0 %	50 %	0 %	15672169
3537	NC_002662	AAG	2	6	190758	190763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672169
3538	NC_002662	A	6	6	190772	190777	100 %	0 %	0 %	0 %	15672169
3539	NC_002662	ATA	2	6	190796	190801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672169
3540	NC_002662	TCG	2	6	190878	190883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672169
3541	NC_002662	AT	3	6	190994	190999	50 %	50 %	0 %	0 %	15672169
3542	NC_002662	CATT	2	8	191130	191137	25 %	50 %	0 %	25 %	15672169
3543	NC_002662	AGA	2	6	191172	191177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672169
3544	NC_002662	CAT	2	6	191178	191183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672169
3545	NC_002662	GCT	2	6	191198	191203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672169
3546	NC_002662	AAATA	2	10	191223	191232	80 %	20 %	0 %	0 %	15672169
3547	NC_002662	ACCA	2	8	191234	191241	50 %	0 %	0 %	50 %	15672169
3548	NC_002662	TAA	2	6	191283	191288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672169
3549	NC_002662	TCGAT	2	10	191294	191303	20 %	40 %	20 %	20 %	15672169
3550	NC_002662	GTT	2	6	191454	191459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672169
3551	NC_002662	TAA	2	6	191530	191535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672169
3552	NC_002662	AAC	2	6	191674	191679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672169
3553	NC_002662	AAC	2	6	191716	191721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672169
3554	NC_002662	T	8	8	191760	191767	0 %	100 %	0 %	0 %	15672169
3555	NC_002662	GGT	2	6	191897	191902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672169
3556	NC_002662	CT	3	6	191917	191922	0 %	50 %	0 %	50 %	15672169
3557	NC_002662	TCA	2	6	191933	191938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672169
3558	NC_002662	AG	3	6	191954	191959	50 %	0 %	50 %	0 %	15672169
3559	NC_002662	AGT	2	6	192113	192118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672169
3560	NC_002662	ATT	2	6	192122	192127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672169
3561	NC_002662	T	6	6	192257	192262	0 %	100 %	0 %	0 %	30023978
3562	NC_002662	AG	4	8	192282	192289	50 %	0 %	50 %	0 %	30023978
3563	NC_002662	GTG	2	6	192326	192331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30023978
3564	NC_002662	GCG	2	6	192384	192389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30023978
3565	NC_002662	ACGA	2	8	192417	192424	50 %	0 %	25 %	25 %	30023978
3566	NC_002662	TTC	2	6	192480	192485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023978
3567	NC_002662	TCA	2	6	192535	192540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023978
3568	NC_002662	T	7	7	192584	192590	0 %	100 %	0 %	0 %	30023978
3569	NC_002662	AAT	2	6	192636	192641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30023978
3570	NC_002662	ATA	2	6	192651	192656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30023978
3571	NC_002662	GAAAAA	2	12	193032	193043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15672171
3572	NC_002662	TGA	2	6	193121	193126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672171
3573	NC_002662	ATGTTG	2	12	193147	193158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15672171
3574	NC_002662	GTG	2	6	193162	193167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672171
3575	NC_002662	ATCA	2	8	193195	193202	50 %	25 %	0 %	25 %	15672171
3576	NC_002662	GTTC	2	8	193293	193300	0 %	50 %	25 %	25 %	15672171
3577	NC_002662	GTT	2	6	193619	193624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30023979
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3579	NC_002662	T	6	6	193698	193703	0 %	100 %	0 %	0 %	30023979
3580	NC_002662	CTT	2	6	193706	193711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
3581	NC_002662	TCA	2	6	193744	193749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023979
3582	NC_002662	CAT	2	6	193778	193783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023979
3583	NC_002662	ACA	2	6	193801	193806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30023979
3584	NC_002662	TGT	2	6	193881	193886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30023979
3585	NC_002662	AAG	2	6	193908	193913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023979
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3588	NC_002662	TTA	2	6	194071	194076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30023979
3589	NC_002662	TCT	2	6	194128	194133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
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3592	NC_002662	CAG	2	6	194213	194218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30023979
3593	NC_002662	T	6	6	194241	194246	0 %	100 %	0 %	0 %	30023979
3594	NC_002662	AGAAGT	2	12	194247	194258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	30023979
3595	NC_002662	TTG	2	6	194267	194272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30023979
3596	NC_002662	CTT	2	6	194279	194284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
3597	NC_002662	AACTTT	2	12	194322	194333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	30023979
3598	NC_002662	CTT	2	6	194357	194362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
3599	NC_002662	TCT	2	6	194380	194385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
3600	NC_002662	TCA	3	9	194413	194421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023979
3601	NC_002662	ACA	2	6	194422	194427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30023979
3602	NC_002662	AAACC	2	10	194678	194687	60 %	0 %	0 %	40 %	30023979
3603	NC_002662	ACC	2	6	194691	194696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30023979
3604	NC_002662	CAA	2	6	194702	194707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30023979
3605	NC_002662	CTT	2	6	194714	194719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
3606	NC_002662	T	6	6	194757	194762	0 %	100 %	0 %	0 %	30023979
3607	NC_002662	TGC	2	6	194775	194780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30023979
3608	NC_002662	CAT	2	6	194798	194803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023979
3609	NC_002662	CAG	2	6	194834	194839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30023979
3610	NC_002662	CAC	2	6	194840	194845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30023979
3611	NC_002662	TTC	2	6	194946	194951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023979
3612	NC_002662	AAG	2	6	195027	195032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023979
3613	NC_002662	TGTT	2	8	195122	195129	0 %	75 %	25 %	0 %	30023979
3614	NC_002662	GTTC	2	8	195185	195192	0 %	50 %	25 %	25 %	30023979
3615	NC_002662	GCT	2	6	195205	195210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30023979
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3617	NC_002662	T	6	6	195351	195356	0 %	100 %	0 %	0 %	15672173
3618	NC_002662	ACA	2	6	195390	195395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672173
3619	NC_002662	CAG	2	6	195421	195426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672173
3620	NC_002662	CAG	2	6	195490	195495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672173
3621	NC_002662	GTTG	2	8	195589	195596	0 %	50 %	50 %	0 %	15672173
3622	NC_002662	CTG	2	6	195909	195914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672174
3623	NC_002662	TTC	2	6	195920	195925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672174
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