MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002662	TTGTA	2	10	53962	53971	20 %	60 %	20 %	0 %	15672035
1002	NC_002662	CAT	2	6	54031	54036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672035
1003	NC_002662	TAA	2	6	54037	54042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672035
1004	NC_002662	CAT	2	6	54074	54079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672035
1005	NC_002662	AAG	2	6	54231	54236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672035
1006	NC_002662	A	6	6	54298	54303	100 %	0 %	0 %	0 %	15672035
1007	NC_002662	CTT	2	6	54334	54339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672035
1008	NC_002662	TTA	2	6	54375	54380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672035
1009	NC_002662	ATTA	2	8	54404	54411	50 %	50 %	0 %	0 %	15672035
1010	NC_002662	TGT	2	6	54442	54447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672035
1011	NC_002662	TTTATA	2	12	54452	54463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672035
1012	NC_002662	ATA	2	6	54528	54533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672035
1013	NC_002662	TAT	2	6	54538	54543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672035
1014	NC_002662	TCT	2	6	54607	54612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672035
1015	NC_002662	GA	3	6	54615	54620	50 %	0 %	50 %	0 %	15672035
1016	NC_002662	TC	4	8	54624	54631	0 %	50 %	0 %	50 %	15672035
1017	NC_002662	TTG	2	6	54635	54640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672035
1018	NC_002662	GAC	2	6	54649	54654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672035
1019	NC_002662	GCTTC	2	10	54763	54772	0 %	40 %	20 %	40 %	15672036
1020	NC_002662	AAG	2	6	54773	54778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672036
1021	NC_002662	T	6	6	54788	54793	0 %	100 %	0 %	0 %	15672036
1022	NC_002662	AAGTTC	2	12	54796	54807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15672036
1023	NC_002662	TTTC	2	8	54825	54832	0 %	75 %	0 %	25 %	15672036
1024	NC_002662	TTC	2	6	54904	54909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672036
1025	NC_002662	CTT	2	6	54912	54917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672036
1026	NC_002662	CTT	2	6	54966	54971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672036
1027	NC_002662	TCT	2	6	55036	55041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672036
1028	NC_002662	ATA	2	6	55046	55051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672036
1029	NC_002662	TAA	2	6	55197	55202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672037
1030	NC_002662	CAA	2	6	55212	55217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672037
1031	NC_002662	CGGCTG	2	12	55233	55244	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15672037
1032	NC_002662	AGGG	2	8	55279	55286	25 %	0 %	75 %	0 %	15672037
1033	NC_002662	CGG	2	6	55290	55295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672037
1034	NC_002662	TCG	2	6	55333	55338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672037
1035	NC_002662	TAA	2	6	55362	55367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672037
1036	NC_002662	ATA	2	6	55388	55393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672037
1037	NC_002662	GATAAT	2	12	55595	55606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15672038
1038	NC_002662	AGTC	2	8	55665	55672	25 %	25 %	25 %	25 %	15672038
1039	NC_002662	TTG	2	6	55702	55707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672038
1040	NC_002662	GAA	2	6	55722	55727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672038
1041	NC_002662	TTG	2	6	55750	55755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672038
1042	NC_002662	TGAG	2	8	55792	55799	25 %	25 %	50 %	0 %	15672038
1043	NC_002662	CTC	2	6	55846	55851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15672038
1044	NC_002662	ACT	2	6	55863	55868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672038
1045	NC_002662	AAGGTA	2	12	55873	55884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15672038
1046	NC_002662	GCA	2	6	55890	55895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672038
1047	NC_002662	TAT	2	6	55897	55902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672038
1048	NC_002662	A	6	6	55912	55917	100 %	0 %	0 %	0 %	15672038
1049	NC_002662	TTA	2	6	55942	55947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672038
1050	NC_002662	TTA	2	6	55967	55972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672038
1051	NC_002662	ATCAA	2	10	56005	56014	60 %	20 %	0 %	20 %	15672038
1052	NC_002662	ACT	2	6	56098	56103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672038
1053	NC_002662	A	7	7	56595	56601	100 %	0 %	0 %	0 %	15672039
1054	NC_002662	TTA	2	6	56678	56683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672039
1055	NC_002662	AAT	2	6	56755	56760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672039
1056	NC_002662	A	6	6	56827	56832	100 %	0 %	0 %	0 %	15672039
1057	NC_002662	GCA	2	6	56848	56853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672039
1058	NC_002662	TGA	2	6	56928	56933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672039
1059	NC_002662	ATTA	2	8	56973	56980	50 %	50 %	0 %	0 %	15672039
1060	NC_002662	TGA	2	6	57195	57200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672039
1061	NC_002662	GGATT	2	10	57317	57326	20 %	40 %	40 %	0 %	15672039
1062	NC_002662	ATT	2	6	57358	57363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672039
1063	NC_002662	ATG	2	6	57443	57448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672039
1064	NC_002662	A	6	6	57460	57465	100 %	0 %	0 %	0 %	15672039
1065	NC_002662	CGT	2	6	57478	57483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672039
1066	NC_002662	ATTAT	2	10	57485	57494	40 %	60 %	0 %	0 %	15672039
1067	NC_002662	ATT	2	6	57523	57528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672039
1068	NC_002662	ATTC	2	8	57584	57591	25 %	50 %	0 %	25 %	15672039
1069	NC_002662	ATT	2	6	57631	57636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672039
1070	NC_002662	CTTAT	2	10	57678	57687	20 %	60 %	0 %	20 %	15672039
1071	NC_002662	AGCA	2	8	57710	57717	50 %	0 %	25 %	25 %	15672039
1072	NC_002662	A	6	6	57745	57750	100 %	0 %	0 %	0 %	15672039
1073	NC_002662	T	6	6	57960	57965	0 %	100 %	0 %	0 %	15672040
1074	NC_002662	TCA	2	6	58114	58119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672040
1075	NC_002662	CTT	2	6	58129	58134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672040
1076	NC_002662	TTC	2	6	58273	58278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672040
1077	NC_002662	TGA	2	6	58388	58393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672040
1078	NC_002662	ACG	2	6	58400	58405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672040
1079	NC_002662	ATTT	2	8	58428	58435	25 %	75 %	0 %	0 %	15672040
1080	NC_002662	A	7	7	58473	58479	100 %	0 %	0 %	0 %	15672040
1081	NC_002662	ATG	2	6	58534	58539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672040
1082	NC_002662	A	6	6	58566	58571	100 %	0 %	0 %	0 %	15672040
1083	NC_002662	AAAT	2	8	58608	58615	75 %	25 %	0 %	0 %	15672040
1084	NC_002662	TTA	2	6	58968	58973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672041
1085	NC_002662	CTT	2	6	59156	59161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672041
1086	NC_002662	TCAT	2	8	59197	59204	25 %	50 %	0 %	25 %	15672041
1087	NC_002662	GCA	2	6	59224	59229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672041
1088	NC_002662	GTT	2	6	59305	59310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672041
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1090	NC_002662	CGT	2	6	59348	59353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672041
1091	NC_002662	GCA	4	12	59371	59382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672041
1092	NC_002662	AAG	2	6	59396	59401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672041
1093	NC_002662	GAGC	2	8	59408	59415	25 %	0 %	50 %	25 %	15672041
1094	NC_002662	TCAA	2	8	59485	59492	50 %	25 %	0 %	25 %	15672041
1095	NC_002662	GTCA	2	8	59499	59506	25 %	25 %	25 %	25 %	15672041
1096	NC_002662	GTT	2	6	59520	59525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672041
1097	NC_002662	GAC	2	6	59549	59554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672041
1098	NC_002662	AGTA	2	8	59569	59576	50 %	25 %	25 %	0 %	15672041
1099	NC_002662	CAG	2	6	59684	59689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672041
1100	NC_002662	CAA	2	6	59759	59764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672041
1101	NC_002662	CCA	2	6	59797	59802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15672041
1102	NC_002662	CTC	2	6	59819	59824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15672041
1103	NC_002662	CAA	2	6	59828	59833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672041
1104	NC_002662	AAT	2	6	59883	59888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672041
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1106	NC_002662	AAG	2	6	59906	59911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672041
1107	NC_002662	CAT	2	6	59948	59953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672041
1108	NC_002662	TCT	2	6	59977	59982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672041
1109	NC_002662	TATTG	2	10	59994	60003	20 %	60 %	20 %	0 %	15672041
1110	NC_002662	T	6	6	60048	60053	0 %	100 %	0 %	0 %	15672041
1111	NC_002662	ACC	2	6	60069	60074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15672041
1112	NC_002662	TTTAA	2	10	60127	60136	40 %	60 %	0 %	0 %	15672041
1113	NC_002662	TCC	2	6	60178	60183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15672041
1114	NC_002662	ATG	2	6	60198	60203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672041
1115	NC_002662	AAAC	2	8	60247	60254	75 %	0 %	0 %	25 %	15672041
1116	NC_002662	CCA	2	6	60256	60261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15672041
1117	NC_002662	AAT	2	6	60276	60281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672041
1118	NC_002662	T	6	6	60288	60293	0 %	100 %	0 %	0 %	15672041
1119	NC_002662	ACC	2	6	60327	60332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15672041
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1122	NC_002662	ATA	2	6	60388	60393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672041
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1124	NC_002662	ATCA	2	8	60661	60668	50 %	25 %	0 %	25 %	15672042
1125	NC_002662	ACA	2	6	60710	60715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672042
1126	NC_002662	TTG	2	6	60843	60848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672042
1127	NC_002662	TTG	2	6	60859	60864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672042
1128	NC_002662	AGT	2	6	61075	61080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672042
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1241	NC_002662	TC	3	6	66827	66832	0 %	50 %	0 %	50 %	15672047
1242	NC_002662	AATTA	2	10	66833	66842	60 %	40 %	0 %	0 %	15672047
1243	NC_002662	TGT	2	6	66856	66861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672047
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1252	NC_002662	ATT	2	6	67263	67268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672048
1253	NC_002662	GACTT	2	10	67292	67301	20 %	40 %	20 %	20 %	15672048
1254	NC_002662	ACG	2	6	67393	67398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672048
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1388	NC_002662	TCT	2	6	73733	73738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672054
1389	NC_002662	CAT	2	6	73740	73745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672054
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1497	NC_002662	TCAA	2	8	80356	80363	50 %	25 %	0 %	25 %	15672059
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