MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002662	CATT	2	8	263225	263232	25 %	50 %	0 %	25 %	15672246
5002	NC_002662	CGG	2	6	263245	263250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672246
5003	NC_002662	TTG	2	6	263254	263259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672246
5004	NC_002662	CTTG	2	8	263291	263298	0 %	50 %	25 %	25 %	15672246
5005	NC_002662	ATG	3	9	263316	263324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672246
5006	NC_002662	CTT	2	6	263347	263352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672246
5007	NC_002662	GTT	3	9	263391	263399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672246
5008	NC_002662	ACA	2	6	263490	263495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672246
5009	NC_002662	ATG	2	6	263536	263541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672246
5010	NC_002662	AAT	2	6	263556	263561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672246
5011	NC_002662	A	6	6	263622	263627	100 %	0 %	0 %	0 %	15672246
5012	NC_002662	TAT	3	9	263671	263679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30023985
5013	NC_002662	TAA	2	6	263753	263758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30023985
5014	NC_002662	TTGA	2	8	263838	263845	25 %	50 %	25 %	0 %	30023985
5015	NC_002662	TCA	2	6	263893	263898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023985
5016	NC_002662	TTG	2	6	263931	263936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30023985
5017	NC_002662	TGA	2	6	263951	263956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30023985
5018	NC_002662	AGC	2	6	264000	264005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30023985
5019	NC_002662	AGC	2	6	264015	264020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30023985
5020	NC_002662	AGA	2	6	264046	264051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023985
5021	NC_002662	TTG	2	6	264089	264094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30023985
5022	NC_002662	CTT	2	6	264113	264118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023985
5023	NC_002662	CAT	2	6	264206	264211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023985
5024	NC_002662	T	6	6	264279	264284	0 %	100 %	0 %	0 %	30023985
5025	NC_002662	GAA	2	6	264330	264335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023985
5026	NC_002662	T	7	7	264340	264346	0 %	100 %	0 %	0 %	30023985
5027	NC_002662	T	6	6	264415	264420	0 %	100 %	0 %	0 %	30023985
5028	NC_002662	CATAGT	2	12	264443	264454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	30023985
5029	NC_002662	ACT	2	6	264478	264483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023985
5030	NC_002662	ATC	2	6	264495	264500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023985
5031	NC_002662	TAA	2	6	264503	264508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30023985
5032	NC_002662	TTG	2	6	264647	264652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30023985
5033	NC_002662	T	6	6	264685	264690	0 %	100 %	0 %	0 %	30023985
5034	NC_002662	AGAA	2	8	265063	265070	75 %	0 %	25 %	0 %	15672248
5035	NC_002662	AGTG	2	8	265100	265107	25 %	25 %	50 %	0 %	15672248
5036	NC_002662	CCAA	2	8	265156	265163	50 %	0 %	0 %	50 %	15672248
5037	NC_002662	AGA	2	6	265189	265194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672248
5038	NC_002662	TCT	2	6	265214	265219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672248
5039	NC_002662	ATGCT	2	10	265319	265328	20 %	40 %	20 %	20 %	15672248
5040	NC_002662	GT	3	6	265334	265339	0 %	50 %	50 %	0 %	15672248
5041	NC_002662	AACG	2	8	265380	265387	50 %	0 %	25 %	25 %	15672248
5042	NC_002662	TG	3	6	265462	265467	0 %	50 %	50 %	0 %	15672248
5043	NC_002662	CAT	2	6	265746	265751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672249
5044	NC_002662	AAG	2	6	265757	265762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672249
5045	NC_002662	AAG	2	6	265778	265783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672249
5046	NC_002662	CCA	2	6	265798	265803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15672249
5047	NC_002662	AAG	2	6	265811	265816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672249
5048	NC_002662	CAAC	2	8	265817	265824	50 %	0 %	0 %	50 %	15672249
5049	NC_002662	ATT	2	6	265837	265842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672249
5050	NC_002662	AGC	2	6	265853	265858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672249
5051	NC_002662	G	6	6	265871	265876	0 %	0 %	100 %	0 %	15672249
5052	NC_002662	TGA	2	6	265884	265889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672249
5053	NC_002662	AAT	2	6	265912	265917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672249
5054	NC_002662	GTTGAA	2	12	265939	265950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672249
5055	NC_002662	GTT	2	6	266011	266016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672249
5056	NC_002662	ACA	2	6	266020	266025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672249
5057	NC_002662	ATGAA	2	10	266030	266039	60 %	20 %	20 %	0 %	15672249
5058	NC_002662	ATT	2	6	266063	266068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672249
5059	NC_002662	TTG	2	6	266090	266095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672249
5060	NC_002662	ATCA	2	8	266111	266118	50 %	25 %	0 %	25 %	15672249
5061	NC_002662	CAG	2	6	266123	266128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672249
5062	NC_002662	AC	3	6	266259	266264	50 %	0 %	0 %	50 %	15672250
5063	NC_002662	GAA	2	6	266324	266329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672250
5064	NC_002662	AGC	2	6	266347	266352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672250
5065	NC_002662	GAA	2	6	266402	266407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672250
5066	NC_002662	ACA	2	6	266462	266467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672250
5067	NC_002662	AAC	2	6	266485	266490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672250
5068	NC_002662	A	6	6	266525	266530	100 %	0 %	0 %	0 %	15672250
5069	NC_002662	TCAT	2	8	266559	266566	25 %	50 %	0 %	25 %	15672250
5070	NC_002662	CCAC	2	8	266683	266690	25 %	0 %	0 %	75 %	15672250
5071	NC_002662	TTG	2	6	266705	266710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672250
5072	NC_002662	CAG	2	6	266730	266735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672250
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5075	NC_002662	ACA	2	6	266796	266801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672250
5076	NC_002662	ACA	2	6	266883	266888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672250
5077	NC_002662	TTTGAT	2	12	266990	267001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15672250
5078	NC_002662	TGA	2	6	267067	267072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672250
5079	NC_002662	ATG	2	6	267248	267253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672251
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5085	NC_002662	AAG	2	6	267486	267491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672251
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5093	NC_002662	AGA	2	6	267926	267931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672252
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5097	NC_002662	ATT	2	6	268149	268154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672252
5098	NC_002662	ATC	2	6	268184	268189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672252
5099	NC_002662	A	6	6	268263	268268	100 %	0 %	0 %	0 %	15672252
5100	NC_002662	CT	3	6	268291	268296	0 %	50 %	0 %	50 %	15672252
5101	NC_002662	CAG	2	6	268324	268329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672252
5102	NC_002662	TTTAG	2	10	268353	268362	20 %	60 %	20 %	0 %	15672252
5103	NC_002662	GAA	2	6	268371	268376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672252
5104	NC_002662	A	6	6	268382	268387	100 %	0 %	0 %	0 %	15672252
5105	NC_002662	A	6	6	268397	268402	100 %	0 %	0 %	0 %	15672252
5106	NC_002662	TGC	2	6	268453	268458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672253
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5108	NC_002662	ATT	2	6	268551	268556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672253
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5111	NC_002662	ACA	2	6	268622	268627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672253
5112	NC_002662	A	7	7	268699	268705	100 %	0 %	0 %	0 %	15672253
5113	NC_002662	GAAT	2	8	268706	268713	50 %	25 %	25 %	0 %	15672253
5114	NC_002662	ATTT	2	8	268748	268755	25 %	75 %	0 %	0 %	15672254
5115	NC_002662	AAC	2	6	268870	268875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672254
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5118	NC_002662	GAA	2	6	268958	268963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672254
5119	NC_002662	TTGAG	2	10	269033	269042	20 %	40 %	40 %	0 %	15672254
5120	NC_002662	TCG	2	6	269046	269051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672254
5121	NC_002662	AG	3	6	269065	269070	50 %	0 %	50 %	0 %	15672254
5122	NC_002662	TCG	2	6	269103	269108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672254
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5124	NC_002662	GAA	2	6	269174	269179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672254
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5496	NC_002662	AGAA	2	8	290501	290508	75 %	0 %	25 %	0 %	15672272
5497	NC_002662	CAG	2	6	290554	290559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672272
5498	NC_002662	GAG	2	6	290617	290622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672272
5499	NC_002662	ACA	2	6	290628	290633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672272
5500	NC_002662	TGAG	2	8	290654	290661	25 %	25 %	50 %	0 %	15672272

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