MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes EGD

Total Repeats: 66304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52004	NC_022568	CAT	2	6	2271446	2271451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898414
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52007	NC_022568	ATTTT	2	10	2271560	2271569	20 %	80 %	0 %	0 %	550898414
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52118	NC_022568	TAT	3	9	2276147	2276155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550898419
52119	NC_022568	AGA	2	6	2276157	2276162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550898419
52120	NC_022568	TTGAT	2	10	2276212	2276221	20 %	60 %	20 %	0 %	550898419
52121	NC_022568	ATG	2	6	2276226	2276231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898419
52122	NC_022568	GTC	2	6	2276241	2276246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550898419
52123	NC_022568	ATC	2	6	2276247	2276252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898419
52124	NC_022568	GAAAC	2	10	2276303	2276312	60 %	0 %	20 %	20 %	550898419
52125	NC_022568	C	6	6	2276424	2276429	0 %	0 %	0 %	100 %	550898419
52126	NC_022568	AGAA	2	8	2276562	2276569	75 %	0 %	25 %	0 %	550898419
52127	NC_022568	AGC	2	6	2276595	2276600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550898419
52128	NC_022568	AAAACT	2	12	2276602	2276613	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550898419
52129	NC_022568	TTC	2	6	2276614	2276619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898419
52130	NC_022568	CTT	2	6	2276634	2276639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52131	NC_022568	TAA	2	6	2276640	2276645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52132	NC_022568	ACT	2	6	2276648	2276653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52133	NC_022568	A	6	6	2276660	2276665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52134	NC_022568	CAA	2	6	2276747	2276752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52135	NC_022568	ATT	2	6	2276756	2276761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52136	NC_022568	T	7	7	2276760	2276766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52137	NC_022568	A	7	7	2276782	2276788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52138	NC_022568	ATA	2	6	2276815	2276820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52139	NC_022568	ATT	2	6	2276821	2276826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52140	NC_022568	ATA	2	6	2276861	2276866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898420
52141	NC_022568	ATT	3	9	2276907	2276915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550898420
52142	NC_022568	A	6	6	2276923	2276928	100 %	0 %	0 %	0 %	550898420
52143	NC_022568	TAA	2	6	2276955	2276960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898420
52144	NC_022568	T	6	6	2276968	2276973	0 %	100 %	0 %	0 %	550898420
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52147	NC_022568	TCC	2	6	2277099	2277104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52148	NC_022568	TAA	2	6	2277126	2277131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52149	NC_022568	CTT	2	6	2277160	2277165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52150	NC_022568	CA	3	6	2277190	2277195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52151	NC_022568	TTTG	2	8	2277213	2277220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52152	NC_022568	ATTT	2	8	2277223	2277230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52153	NC_022568	A	8	8	2277330	2277337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52154	NC_022568	ATT	2	6	2277349	2277354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52155	NC_022568	T	7	7	2277366	2277372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52156	NC_022568	CAT	2	6	2277444	2277449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898421
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52162	NC_022568	TGA	2	6	2277776	2277781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898421
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52179	NC_022568	T	6	6	2278502	2278507	0 %	100 %	0 %	0 %	550898421
52180	NC_022568	AC	3	6	2278527	2278532	50 %	0 %	0 %	50 %	550898421
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52186	NC_022568	CATATA	2	12	2278959	2278970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550898421
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52190	NC_022568	TCA	2	6	2279111	2279116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898421
52191	NC_022568	AT	3	6	2279122	2279127	50 %	50 %	0 %	0 %	550898421
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52193	NC_022568	TAT	2	6	2279230	2279235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52195	NC_022568	GAT	2	6	2279264	2279269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898422
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52197	NC_022568	TGC	2	6	2279278	2279283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550898422
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52201	NC_022568	A	6	6	2279456	2279461	100 %	0 %	0 %	0 %	550898422
52202	NC_022568	A	6	6	2279500	2279505	100 %	0 %	0 %	0 %	550898422
52203	NC_022568	CAAAT	2	10	2279515	2279524	60 %	20 %	0 %	20 %	550898422
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52207	NC_022568	ATA	2	6	2279602	2279607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898422
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52213	NC_022568	A	6	6	2279792	2279797	100 %	0 %	0 %	0 %	550898422
52214	NC_022568	GAT	2	6	2279820	2279825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898422
52215	NC_022568	TTG	2	6	2279905	2279910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550898422
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52221	NC_022568	TCTT	2	8	2280295	2280302	0 %	75 %	0 %	25 %	550898422
52222	NC_022568	CTTG	2	8	2280303	2280310	0 %	50 %	25 %	25 %	550898422
52223	NC_022568	TAGTAA	2	12	2280330	2280341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52224	NC_022568	AAT	2	6	2280373	2280378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52225	NC_022568	ATT	3	9	2280405	2280413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52226	NC_022568	A	6	6	2280456	2280461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52227	NC_022568	AAT	2	6	2280501	2280506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52228	NC_022568	TCA	2	6	2280646	2280651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898423
52229	NC_022568	TATT	2	8	2280652	2280659	25 %	75 %	0 %	0 %	550898423
52230	NC_022568	ATA	2	6	2280681	2280686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898423
52231	NC_022568	ATC	2	6	2280795	2280800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898423
52232	NC_022568	CTT	2	6	2280812	2280817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898423
52233	NC_022568	AGT	2	6	2280844	2280849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898423
52234	NC_022568	T	6	6	2280857	2280862	0 %	100 %	0 %	0 %	550898423
52235	NC_022568	CCA	2	6	2280919	2280924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550898423
52236	NC_022568	GA	3	6	2280998	2281003	50 %	0 %	50 %	0 %	550898423
52237	NC_022568	CTT	2	6	2281007	2281012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898423
52238	NC_022568	CATC	2	8	2281025	2281032	25 %	25 %	0 %	50 %	550898423
52239	NC_022568	TTC	2	6	2281047	2281052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898423
52240	NC_022568	TCT	2	6	2281078	2281083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898423
52241	NC_022568	CTTC	2	8	2281177	2281184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52242	NC_022568	ACC	2	6	2281253	2281258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52243	NC_022568	ATCTT	2	10	2281285	2281294	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52244	NC_022568	A	6	6	2281307	2281312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52245	NC_022568	A	7	7	2281338	2281344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52246	NC_022568	T	6	6	2281406	2281411	0 %	100 %	0 %	0 %	550898424
52247	NC_022568	TACG	2	8	2281429	2281436	25 %	25 %	25 %	25 %	550898424
52248	NC_022568	TCA	2	6	2281498	2281503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898424
52249	NC_022568	TAA	2	6	2281521	2281526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898424
52250	NC_022568	GTT	2	6	2281556	2281561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550898424
52251	NC_022568	AAT	2	6	2281620	2281625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898424
52252	NC_022568	GAA	2	6	2281652	2281657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550898424
52253	NC_022568	A	6	6	2281691	2281696	100 %	0 %	0 %	0 %	550898424
52254	NC_022568	TTTC	2	8	2281699	2281706	0 %	75 %	0 %	25 %	550898424
52255	NC_022568	TTC	2	6	2281725	2281730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898424
52256	NC_022568	TCAT	2	8	2281822	2281829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52257	NC_022568	TTTC	2	8	2281932	2281939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52258	NC_022568	CTA	2	6	2281987	2281992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52259	NC_022568	A	7	7	2282019	2282025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52260	NC_022568	T	6	6	2282030	2282035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52261	NC_022568	AATTTT	2	12	2282052	2282063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52262	NC_022568	A	6	6	2282067	2282072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52263	NC_022568	TGAT	2	8	2282092	2282099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52264	NC_022568	GCA	2	6	2282116	2282121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550898425
52265	NC_022568	CAG	2	6	2282126	2282131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550898425
52266	NC_022568	CTT	4	12	2282162	2282173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898425
52267	NC_022568	CTA	2	6	2282375	2282380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898425
52268	NC_022568	T	7	7	2282464	2282470	0 %	100 %	0 %	0 %	550898425
52269	NC_022568	TAA	2	6	2282487	2282492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898425
52270	NC_022568	TAC	2	6	2282496	2282501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898425
52271	NC_022568	GATA	2	8	2282511	2282518	50 %	25 %	25 %	0 %	550898425
52272	NC_022568	AAT	2	6	2282547	2282552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898425
52273	NC_022568	ACGTTG	2	12	2282592	2282603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550898425
52274	NC_022568	CCG	2	6	2282605	2282610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550898425
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52276	NC_022568	GAATAC	2	12	2282717	2282728	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550898425
52277	NC_022568	ACG	2	6	2282805	2282810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550898425
52278	NC_022568	CGTG	2	8	2282839	2282846	0 %	25 %	50 %	25 %	550898425
52279	NC_022568	CCA	2	6	2282875	2282880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550898425
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52282	NC_022568	TAA	2	6	2283051	2283056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898425
52283	NC_022568	TCTACC	2	12	2283078	2283089	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	550898426
52284	NC_022568	GGC	2	6	2283142	2283147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550898426
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52288	NC_022568	TATT	2	8	2283270	2283277	25 %	75 %	0 %	0 %	550898426
52289	NC_022568	GCA	2	6	2283282	2283287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550898426
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52293	NC_022568	TAAT	2	8	2283382	2283389	50 %	50 %	0 %	0 %	550898426
52294	NC_022568	TGT	2	6	2283405	2283410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550898426
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52297	NC_022568	ACC	2	6	2283455	2283460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550898426
52298	NC_022568	ACA	2	6	2283495	2283500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550898426
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52300	NC_022568	T	7	7	2283538	2283544	0 %	100 %	0 %	0 %	550898426
52301	NC_022568	TGT	2	6	2283599	2283604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550898426
52302	NC_022568	AAC	2	6	2283656	2283661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550898426
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52305	NC_022568	T	6	6	2283781	2283786	0 %	100 %	0 %	0 %	550898426
52306	NC_022568	TAA	2	6	2283793	2283798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898426
52307	NC_022568	ATG	2	6	2283841	2283846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898426
52308	NC_022568	T	6	6	2283889	2283894	0 %	100 %	0 %	0 %	550898426
52309	NC_022568	TAAA	2	8	2283934	2283941	75 %	25 %	0 %	0 %	550898426
52310	NC_022568	CAA	2	6	2284030	2284035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550898426
52311	NC_022568	TA	3	6	2284054	2284059	50 %	50 %	0 %	0 %	550898426
52312	NC_022568	TG	3	6	2284103	2284108	0 %	50 %	50 %	0 %	550898426
52313	NC_022568	CT	3	6	2284161	2284166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52314	NC_022568	ATG	2	6	2284232	2284237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898427
52315	NC_022568	AT	3	6	2284268	2284273	50 %	50 %	0 %	0 %	550898427
52316	NC_022568	CAT	2	6	2284299	2284304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898427
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52318	NC_022568	ATG	2	6	2284400	2284405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898427
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52320	NC_022568	ATA	2	6	2284577	2284582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898427
52321	NC_022568	CAT	2	6	2284609	2284614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898427
52322	NC_022568	GCT	2	6	2284745	2284750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550898427
52323	NC_022568	ACA	2	6	2284751	2284756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550898427
52324	NC_022568	AAT	2	6	2284759	2284764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898427
52325	NC_022568	AGTA	2	8	2284836	2284843	50 %	25 %	25 %	0 %	550898427
52326	NC_022568	ATT	2	6	2284855	2284860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550898427
52327	NC_022568	TCT	2	6	2284880	2284885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550898427
52328	NC_022568	CCA	2	6	2284886	2284891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550898427
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52332	NC_022568	CAA	2	6	2285019	2285024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550898427
52333	NC_022568	ATA	3	9	2285030	2285038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898427
52334	NC_022568	TACGAA	2	12	2285082	2285093	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550898427
52335	NC_022568	GCTG	2	8	2285162	2285169	0 %	25 %	50 %	25 %	550898427
52336	NC_022568	TCTT	2	8	2285173	2285180	0 %	75 %	0 %	25 %	550898427
52337	NC_022568	ATT	2	6	2285201	2285206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550898427
52338	NC_022568	AC	3	6	2285219	2285224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52339	NC_022568	ATCA	2	8	2285235	2285242	50 %	25 %	0 %	25 %	550898428
52340	NC_022568	ATA	2	6	2285311	2285316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898428
52341	NC_022568	TTTG	2	8	2285329	2285336	0 %	75 %	25 %	0 %	550898428
52342	NC_022568	AGA	2	6	2285340	2285345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550898428
52343	NC_022568	TCA	2	6	2285405	2285410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898428
52344	NC_022568	CTA	2	6	2285491	2285496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898428
52345	NC_022568	TAT	2	6	2285882	2285887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550898428
52346	NC_022568	GGAA	2	8	2285894	2285901	50 %	0 %	50 %	0 %	550898428
52347	NC_022568	TCAT	2	8	2285980	2285987	25 %	50 %	0 %	25 %	550898428
52348	NC_022568	ATG	2	6	2286076	2286081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898428
52349	NC_022568	AT	3	6	2286097	2286102	50 %	50 %	0 %	0 %	550898428
52350	NC_022568	ATCT	2	8	2286130	2286137	25 %	50 %	0 %	25 %	550898428
52351	NC_022568	TAAT	2	8	2286154	2286161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52352	NC_022568	AT	3	6	2286160	2286165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52353	NC_022568	A	7	7	2286166	2286172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52354	NC_022568	TTAG	2	8	2286247	2286254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52355	NC_022568	A	7	7	2286256	2286262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52356	NC_022568	AGA	2	6	2286289	2286294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52357	NC_022568	ATC	2	6	2286336	2286341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52358	NC_022568	GA	3	6	2286350	2286355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52359	NC_022568	CT	4	8	2286371	2286378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52360	NC_022568	TTTA	2	8	2286409	2286416	25 %	75 %	0 %	0 %	550898429
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52473	NC_022568	AT	3	6	2291170	2291175	50 %	50 %	0 %	0 %	550898433
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52476	NC_022568	TG	3	6	2291316	2291321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52477	NC_022568	T	6	6	2291359	2291364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52478	NC_022568	A	7	7	2291369	2291375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52481	NC_022568	AAT	2	6	2291572	2291577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550898434
52482	NC_022568	TAG	2	6	2291655	2291660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550898434
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52484	NC_022568	TCA	2	6	2291723	2291728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550898434
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