MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 56757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_022112	GAT	2	6	2533949	2533954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357830
49002	NC_022112	T	6	6	2534073	2534078	0 %	100 %	0 %	0 %	532357830
49003	NC_022112	TTA	2	6	2534112	2534117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49004	NC_022112	TAA	2	6	2534165	2534170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49005	NC_022112	T	6	6	2534188	2534193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49006	NC_022112	T	7	7	2534338	2534344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49007	NC_022112	GTT	2	6	2534352	2534357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49008	NC_022112	CAT	2	6	2534370	2534375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357831
49009	NC_022112	GGC	2	6	2534387	2534392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357831
49010	NC_022112	CA	3	6	2534520	2534525	50 %	0 %	0 %	50 %	532357831
49011	NC_022112	CCAC	2	8	2534611	2534618	25 %	0 %	0 %	75 %	532357831
49012	NC_022112	CAAGC	2	10	2534630	2534639	40 %	0 %	20 %	40 %	532357831
49013	NC_022112	CCG	2	6	2534649	2534654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357831
49014	NC_022112	CCAA	2	8	2534672	2534679	50 %	0 %	0 %	50 %	532357831
49015	NC_022112	AT	3	6	2534730	2534735	50 %	50 %	0 %	0 %	532357831
49016	NC_022112	ATAG	2	8	2534837	2534844	50 %	25 %	25 %	0 %	532357831
49017	NC_022112	TCC	2	6	2534899	2534904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49018	NC_022112	ATT	2	6	2534917	2534922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49019	NC_022112	TCA	2	6	2534992	2534997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49020	NC_022112	CAA	2	6	2535045	2535050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49021	NC_022112	A	6	6	2535049	2535054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49022	NC_022112	TTA	2	6	2535084	2535089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357832
49023	NC_022112	TTGGGC	2	12	2535096	2535107	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532357832
49024	NC_022112	CG	3	6	2535137	2535142	0 %	0 %	50 %	50 %	532357832
49025	NC_022112	CTG	2	6	2535148	2535153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357832
49026	NC_022112	CTTG	2	8	2535256	2535263	0 %	50 %	25 %	25 %	532357832
49027	NC_022112	GTT	2	6	2535356	2535361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357832
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49029	NC_022112	GCC	2	6	2535386	2535391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357832
49030	NC_022112	A	7	7	2535426	2535432	100 %	0 %	0 %	0 %	532357832
49031	NC_022112	CGC	2	6	2535436	2535441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357832
49032	NC_022112	GCAG	2	8	2535510	2535517	25 %	0 %	50 %	25 %	532357833
49033	NC_022112	ATTCA	2	10	2535651	2535660	40 %	40 %	0 %	20 %	532357833
49034	NC_022112	CAT	2	6	2535689	2535694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357833
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49036	NC_022112	TGT	2	6	2535757	2535762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49037	NC_022112	CCA	2	6	2535790	2535795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49038	NC_022112	GCG	2	6	2535831	2535836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357834
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49041	NC_022112	CAA	2	6	2535996	2536001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357834
49042	NC_022112	CAA	2	6	2536020	2536025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357834
49043	NC_022112	CAGC	2	8	2536051	2536058	25 %	0 %	25 %	50 %	532357834
49044	NC_022112	GAT	2	6	2536356	2536361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357834
49045	NC_022112	ATC	2	6	2536393	2536398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357834
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49050	NC_022112	GCA	3	9	2536637	2536645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357834
49051	NC_022112	CA	3	6	2536738	2536743	50 %	0 %	0 %	50 %	532357834
49052	NC_022112	GCT	2	6	2536760	2536765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357834
49053	NC_022112	T	6	6	2536841	2536846	0 %	100 %	0 %	0 %	532357834
49054	NC_022112	CTT	2	6	2536942	2536947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357835
49055	NC_022112	ATT	2	6	2537051	2537056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357835
49056	NC_022112	CGGCG	2	10	2537155	2537164	0 %	0 %	60 %	40 %	532357835
49057	NC_022112	GTT	2	6	2537173	2537178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357835
49058	NC_022112	T	7	7	2537229	2537235	0 %	100 %	0 %	0 %	532357835
49059	NC_022112	GCC	2	6	2537241	2537246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357835
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49061	NC_022112	A	6	6	2537408	2537413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49062	NC_022112	TTAA	2	8	2537451	2537458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49063	NC_022112	T	6	6	2537525	2537530	0 %	100 %	0 %	0 %	532357836
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49073	NC_022112	CTG	2	6	2537860	2537865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357836
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49087	NC_022112	TGCC	2	8	2538856	2538863	0 %	25 %	25 %	50 %	532357836
49088	NC_022112	TCC	2	6	2538977	2538982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49089	NC_022112	A	7	7	2539062	2539068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49090	NC_022112	A	7	7	2539100	2539106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49091	NC_022112	TTTCAT	2	12	2539228	2539239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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49101	NC_022112	GCT	2	6	2539787	2539792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357837
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49107	NC_022112	ATCC	2	8	2540158	2540165	25 %	25 %	0 %	50 %	532357837
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49117	NC_022112	TGG	2	6	2540427	2540432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357837
49118	NC_022112	CAA	2	6	2540454	2540459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357837
49119	NC_022112	AGC	2	6	2540482	2540487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357837
49120	NC_022112	CAC	2	6	2540581	2540586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357837
49121	NC_022112	AG	3	6	2540605	2540610	50 %	0 %	50 %	0 %	532357837
49122	NC_022112	TAAT	2	8	2540658	2540665	50 %	50 %	0 %	0 %	532357837
49123	NC_022112	TTC	2	6	2540676	2540681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49124	NC_022112	ATT	2	6	2540718	2540723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357838
49125	NC_022112	GAT	2	6	2540727	2540732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357838
49126	NC_022112	GCA	2	6	2540741	2540746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357838
49127	NC_022112	TCA	2	6	2540747	2540752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357838
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49130	NC_022112	T	6	6	2540874	2540879	0 %	100 %	0 %	0 %	532357838
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49136	NC_022112	ATA	2	6	2541308	2541313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357838
49137	NC_022112	ATCT	2	8	2541331	2541338	25 %	50 %	0 %	25 %	532357838
49138	NC_022112	GCA	2	6	2541360	2541365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357838
49139	NC_022112	ATC	2	6	2541467	2541472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357838
49140	NC_022112	GGCAT	2	10	2541530	2541539	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49141	NC_022112	TTAAGA	2	12	2541543	2541554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532357839
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49143	NC_022112	TCTA	2	8	2541841	2541848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49144	NC_022112	ATG	2	6	2541863	2541868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357840
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49147	NC_022112	CGA	2	6	2542005	2542010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357840
49148	NC_022112	T	6	6	2542090	2542095	0 %	100 %	0 %	0 %	532357840
49149	NC_022112	CAG	2	6	2542139	2542144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357840
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49151	NC_022112	GGCC	2	8	2542351	2542358	0 %	0 %	50 %	50 %	532357840
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49153	NC_022112	GCA	2	6	2542492	2542497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357840
49154	NC_022112	CCAA	2	8	2542551	2542558	50 %	0 %	0 %	50 %	532357841
49155	NC_022112	CAAA	2	8	2542587	2542594	75 %	0 %	0 %	25 %	532357841
49156	NC_022112	AAG	2	6	2542613	2542618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357841
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49171	NC_022112	CA	3	6	2543416	2543421	50 %	0 %	0 %	50 %	532357842
49172	NC_022112	TTG	2	6	2543449	2543454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357842
49173	NC_022112	TGATCC	2	12	2543457	2543468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532357842
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49180	NC_022112	TGA	2	6	2543776	2543781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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49182	NC_022112	A	7	7	2543867	2543873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49183	NC_022112	CCA	2	6	2543874	2543879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49184	NC_022112	T	6	6	2543905	2543910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49185	NC_022112	GGT	2	6	2543992	2543997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49186	NC_022112	CAA	3	9	2544006	2544014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49187	NC_022112	TA	3	6	2544039	2544044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49188	NC_022112	A	7	7	2544063	2544069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49189	NC_022112	CTT	2	6	2544114	2544119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357843
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49193	NC_022112	ACA	2	6	2544395	2544400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49194	NC_022112	TCAA	3	12	2544440	2544451	50 %	25 %	0 %	25 %	532357844
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49201	NC_022112	GAT	2	6	2544722	2544727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357844
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49218	NC_022112	TTC	2	6	2545668	2545673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357844
49219	NC_022112	CCG	2	6	2545674	2545679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357844
49220	NC_022112	T	6	6	2545690	2545695	0 %	100 %	0 %	0 %	532357844
49221	NC_022112	CAA	2	6	2545799	2545804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49222	NC_022112	TCA	2	6	2545807	2545812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49223	NC_022112	A	6	6	2545848	2545853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49224	NC_022112	AGCG	2	8	2545976	2545983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49225	NC_022112	AGCG	2	8	2546100	2546107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49226	NC_022112	A	6	6	2546272	2546277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49227	NC_022112	CTG	2	6	2546352	2546357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357845
49228	NC_022112	TGAA	2	8	2546360	2546367	50 %	25 %	25 %	0 %	532357845
49229	NC_022112	AAT	2	6	2546375	2546380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357845
49230	NC_022112	GAA	2	6	2546434	2546439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357845
49231	NC_022112	TTC	2	6	2546444	2546449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357845
49232	NC_022112	AAT	2	6	2546458	2546463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357845
49233	NC_022112	ACGATG	2	12	2546551	2546562	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532357845
49234	NC_022112	GGAAT	2	10	2546808	2546817	40 %	20 %	40 %	0 %	532357845
49235	NC_022112	CAA	2	6	2546911	2546916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357845
49236	NC_022112	TAG	2	6	2546984	2546989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357845
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49238	NC_022112	TCT	2	6	2547270	2547275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357845
49239	NC_022112	TAC	2	6	2547336	2547341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357845
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49248	NC_022112	AAT	2	6	2547957	2547962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49250	NC_022112	ATAA	2	8	2548116	2548123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49251	NC_022112	GTC	2	6	2548199	2548204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357846
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49272	NC_022112	TA	3	6	2549338	2549343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49273	NC_022112	CA	3	6	2549429	2549434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49274	NC_022112	A	7	7	2549434	2549440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49275	NC_022112	TCA	3	9	2549500	2549508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357847
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49303	NC_022112	TATAA	2	10	2550789	2550798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49304	NC_022112	AGAA	2	8	2550813	2550820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49305	NC_022112	ACA	2	6	2550838	2550843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357849
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49332	NC_022112	CGA	2	6	2552542	2552547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357850
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49339	NC_022112	TGA	2	6	2553017	2553022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357850
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49341	NC_022112	TCAGC	2	10	2553087	2553096	20 %	20 %	20 %	40 %	532357851
49342	NC_022112	A	7	7	2553178	2553184	100 %	0 %	0 %	0 %	532357851
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49348	NC_022112	T	6	6	2553521	2553526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49349	NC_022112	T	7	7	2553665	2553671	0 %	100 %	0 %	0 %	532357852
49350	NC_022112	TTG	2	6	2553723	2553728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357852
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49353	NC_022112	GGC	2	6	2553832	2553837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357852
49354	NC_022112	TCAT	2	8	2553845	2553852	25 %	50 %	0 %	25 %	532357852
49355	NC_022112	TA	3	6	2553871	2553876	50 %	50 %	0 %	0 %	532357852
49356	NC_022112	TTG	2	6	2553888	2553893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357852
49357	NC_022112	TGC	2	6	2553905	2553910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357852
49358	NC_022112	TC	3	6	2553949	2553954	0 %	50 %	0 %	50 %	532357852
49359	NC_022112	T	6	6	2553963	2553968	0 %	100 %	0 %	0 %	532357852
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49364	NC_022112	T	6	6	2554192	2554197	0 %	100 %	0 %	0 %	532357852
49365	NC_022112	CTT	2	6	2554287	2554292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357852
49366	NC_022112	ACC	2	6	2554305	2554310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357852
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49368	NC_022112	TGGC	2	8	2554432	2554439	0 %	25 %	50 %	25 %	532357852
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49372	NC_022112	GATTGC	2	12	2554568	2554579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532357852
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49381	NC_022112	AAT	2	6	2555137	2555142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49382	NC_022112	TAG	2	6	2555188	2555193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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49407	NC_022112	TTGC	2	8	2556444	2556451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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49432	NC_022112	ATT	2	6	2557967	2557972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49434	NC_022112	ATTT	2	8	2558029	2558036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49457	NC_022112	GCGA	2	8	2559109	2559116	25 %	0 %	50 %	25 %	532357856
49458	NC_022112	CAA	2	6	2559120	2559125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357856
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49461	NC_022112	TCA	2	6	2559210	2559215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357856
49462	NC_022112	CCA	2	6	2559219	2559224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357856
49463	NC_022112	TCT	2	6	2559225	2559230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357856
49464	NC_022112	A	6	6	2559277	2559282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49465	NC_022112	ATC	2	6	2559333	2559338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49466	NC_022112	ATCTA	2	10	2559362	2559371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49467	NC_022112	AATG	2	8	2559420	2559427	50 %	25 %	25 %	0 %	532357857
49468	NC_022112	GCTT	2	8	2559442	2559449	0 %	50 %	25 %	25 %	532357857
49469	NC_022112	TTTCG	2	10	2559490	2559499	0 %	60 %	20 %	20 %	532357857
49470	NC_022112	TTG	2	6	2559649	2559654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357857
49471	NC_022112	TCA	2	6	2559662	2559667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357857
49472	NC_022112	TGC	2	6	2559690	2559695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357857
49473	NC_022112	TTTG	2	8	2559797	2559804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49474	NC_022112	AGT	2	6	2559810	2559815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49475	NC_022112	CAAA	2	8	2559831	2559838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49476	NC_022112	CAG	2	6	2559853	2559858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49477	NC_022112	CAAT	2	8	2559892	2559899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49478	NC_022112	ATG	2	6	2559982	2559987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49479	NC_022112	TAAA	2	8	2559992	2559999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49480	NC_022112	A	6	6	2559997	2560002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49481	NC_022112	T	6	6	2560027	2560032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49482	NC_022112	AAC	2	6	2560059	2560064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357858
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49484	NC_022112	AGTC	2	8	2560174	2560181	25 %	25 %	25 %	25 %	532357858
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49499	NC_022112	CAT	2	6	2560837	2560842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357858
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