MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 1344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022051	TAT	2	6	41517	41522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022051	ATT	2	6	41552	41557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022051	CTTT	2	8	41558	41565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_022051	TTG	2	6	41598	41603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341502
1005	NC_022051	A	7	7	41669	41675	100 %	0 %	0 %	0 %	530341502
1006	NC_022051	TGTCAG	2	12	41694	41705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1007	NC_022051	ATA	2	6	41720	41725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022051	A	7	7	41746	41752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022051	T	6	6	41777	41782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022051	ACT	2	6	41788	41793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_022051	T	7	7	41803	41809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022051	CTTTT	2	10	41821	41830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_022051	GTA	2	6	41841	41846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022051	ATA	2	6	41906	41911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022051	TTGA	2	8	41922	41929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022051	TA	3	6	41947	41952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022051	CTT	2	6	41991	41996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_022051	T	7	7	42038	42044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022051	AGT	2	6	42049	42054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022051	AT	4	8	42118	42125	50 %	50 %	0 %	0 %	530341503
1021	NC_022051	ATA	2	6	42139	42144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341503
1022	NC_022051	TTTA	2	8	42265	42272	25 %	75 %	0 %	0 %	530341503
1023	NC_022051	ATT	2	6	42277	42282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022051	GAA	2	6	42295	42300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022051	GAG	2	6	42308	42313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022051	ATC	2	6	42357	42362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341504
1027	NC_022051	CTA	2	6	42377	42382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341504
1028	NC_022051	CA	3	6	42450	42455	50 %	0 %	0 %	50 %	530341504
1029	NC_022051	ATT	2	6	42489	42494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341504
1030	NC_022051	GAA	2	6	42506	42511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341504
1031	NC_022051	AT	3	6	42554	42559	50 %	50 %	0 %	0 %	530341504
1032	NC_022051	ATT	2	6	42580	42585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341504
1033	NC_022051	GGC	2	6	42653	42658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530341504
1034	NC_022051	CTTT	2	8	42664	42671	0 %	75 %	0 %	25 %	530341504
1035	NC_022051	AAT	2	6	42807	42812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341504
1036	NC_022051	TC	3	6	42942	42947	0 %	50 %	0 %	50 %	530341504
1037	NC_022051	AAAT	2	8	42970	42977	75 %	25 %	0 %	0 %	530341504
1038	NC_022051	CTT	2	6	43031	43036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_022051	TTA	2	6	43071	43076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022051	TAA	2	6	43084	43089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022051	ATA	2	6	43090	43095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022051	TACATT	2	12	43103	43114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1043	NC_022051	TAA	2	6	43144	43149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022051	ACT	2	6	43178	43183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_022051	TTA	2	6	43228	43233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022051	TAA	2	6	43258	43263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022051	TGG	2	6	43280	43285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341505
1048	NC_022051	ATA	2	6	43301	43306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341505
1049	NC_022051	AACA	2	8	43511	43518	75 %	0 %	0 %	25 %	530341505
1050	NC_022051	TTA	2	6	43660	43665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341505
1051	NC_022051	AGAAA	2	10	43683	43692	80 %	0 %	20 %	0 %	530341505
1052	NC_022051	CCA	2	6	43742	43747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341505
1053	NC_022051	TCC	2	6	43752	43757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341505
1054	NC_022051	AGG	2	6	43872	43877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341505
1055	NC_022051	T	6	6	43911	43916	0 %	100 %	0 %	0 %	530341505
1056	NC_022051	TAAAC	2	10	43929	43938	60 %	20 %	0 %	20 %	530341505
1057	NC_022051	TAA	2	6	44000	44005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341505
1058	NC_022051	A	6	6	44004	44009	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
1059	NC_022051	AGA	2	6	44022	44027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341505
1060	NC_022051	A	6	6	44045	44050	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
1061	NC_022051	AT	3	6	44055	44060	50 %	50 %	0 %	0 %	530341505
1062	NC_022051	ATA	2	6	44117	44122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341505
1063	NC_022051	A	6	6	44174	44179	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
1064	NC_022051	TGAT	2	8	44219	44226	25 %	50 %	25 %	0 %	530341505
1065	NC_022051	A	6	6	44241	44246	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
1066	NC_022051	GT	3	6	44257	44262	0 %	50 %	50 %	0 %	530341505
1067	NC_022051	AAT	2	6	44289	44294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341505
1068	NC_022051	GAT	2	6	44314	44319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341505
1069	NC_022051	TCA	2	6	44331	44336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341505
1070	NC_022051	TGA	2	6	44345	44350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341505
1071	NC_022051	GAA	2	6	44490	44495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341505
1072	NC_022051	GTG	2	6	44543	44548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341505
1073	NC_022051	AAG	2	6	44575	44580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022051	TCTT	2	8	44640	44647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_022051	T	8	8	44646	44653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022051	AAG	2	6	44712	44717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022051	ATC	2	6	44721	44726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022051	TGC	2	6	44734	44739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_022051	GAA	2	6	44769	44774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022051	A	6	6	44876	44881	100 %	0 %	0 %	0 %	530341506
1081	NC_022051	AGT	2	6	44922	44927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341506
1082	NC_022051	TGG	2	6	44956	44961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341507
1083	NC_022051	TGGA	2	8	44973	44980	25 %	25 %	50 %	0 %	530341507
1084	NC_022051	AAAG	2	8	45018	45025	75 %	0 %	25 %	0 %	530341507
1085	NC_022051	ACT	2	6	45196	45201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341508
1086	NC_022051	TCA	2	6	45291	45296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341508
1087	NC_022051	ATC	2	6	45302	45307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341508
1088	NC_022051	ATA	2	6	45318	45323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341508
1089	NC_022051	TAA	2	6	45328	45333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341508
1090	NC_022051	CTT	3	9	45380	45388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341509
1091	NC_022051	GT	3	6	45439	45444	0 %	50 %	50 %	0 %	530341509
1092	NC_022051	TCT	2	6	45454	45459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341509
1093	NC_022051	ATG	3	9	45468	45476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341509
1094	NC_022051	CAT	2	6	45507	45512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341509
1095	NC_022051	TAG	2	6	45528	45533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341509
1096	NC_022051	TAG	2	6	45537	45542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341509
1097	NC_022051	TCC	2	6	45578	45583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341458
1098	NC_022051	T	6	6	45589	45594	0 %	100 %	0 %	0 %	530341458
1099	NC_022051	AAT	2	6	45787	45792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341458
1100	NC_022051	A	6	6	45824	45829	100 %	0 %	0 %	0 %	530341458
1101	NC_022051	GAT	2	6	45834	45839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341458
1102	NC_022051	AAAG	2	8	46013	46020	75 %	0 %	25 %	0 %	530341458
1103	NC_022051	TCT	2	6	46026	46031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341458
1104	NC_022051	AATA	2	8	46035	46042	75 %	25 %	0 %	0 %	530341458
1105	NC_022051	CCA	2	6	46070	46075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341458
1106	NC_022051	ACC	2	6	46087	46092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341458
1107	NC_022051	ATC	2	6	46120	46125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341458
1108	NC_022051	ATA	2	6	46172	46177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341458
1109	NC_022051	AAC	2	6	46196	46201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341458
1110	NC_022051	CAA	2	6	46206	46211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341458
1111	NC_022051	CAA	2	6	46254	46259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341458
1112	NC_022051	AATA	2	8	46302	46309	75 %	25 %	0 %	0 %	530341458
1113	NC_022051	AAAT	2	8	46326	46333	75 %	25 %	0 %	0 %	530341458
1114	NC_022051	TC	3	6	46349	46354	0 %	50 %	0 %	50 %	530341458
1115	NC_022051	TTC	2	6	46358	46363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_022051	CCT	2	6	46364	46369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_022051	TAT	2	6	46401	46406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022051	T	7	7	46462	46468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022051	TTAAT	2	10	46504	46513	40 %	60 %	0 %	0 %	530341510
1120	NC_022051	A	7	7	46515	46521	100 %	0 %	0 %	0 %	530341510
1121	NC_022051	TAT	2	6	46534	46539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341510
1122	NC_022051	T	6	6	46539	46544	0 %	100 %	0 %	0 %	530341510
1123	NC_022051	AAT	2	6	46692	46697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341510
1124	NC_022051	CTT	2	6	46800	46805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341510
1125	NC_022051	A	6	6	46839	46844	100 %	0 %	0 %	0 %	530341510
1126	NC_022051	GAT	2	6	46892	46897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341510
1127	NC_022051	T	6	6	46926	46931	0 %	100 %	0 %	0 %	530341510
1128	NC_022051	TCA	2	6	46952	46957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341510
1129	NC_022051	T	6	6	46962	46967	0 %	100 %	0 %	0 %	530341510
1130	NC_022051	ATG	2	6	46972	46977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341510
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1132	NC_022051	TTA	2	6	47049	47054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341510
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1261	NC_022051	A	6	6	51801	51806	100 %	0 %	0 %	0 %	530341515
1262	NC_022051	ATTA	2	8	51848	51855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_022051	AGG	2	6	51857	51862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_022051	GAT	2	6	51880	51885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341516
1265	NC_022051	ATT	2	6	51911	51916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341516
1266	NC_022051	AAT	2	6	51953	51958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341516
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1270	NC_022051	TAC	2	6	52162	52167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341516
1271	NC_022051	ATC	2	6	52218	52223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341516
1272	NC_022051	GTA	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341516
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1279	NC_022051	TA	3	6	52463	52468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_022051	TAA	2	6	52531	52536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_022051	TGA	2	6	52541	52546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_022051	AAATC	2	10	52555	52564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1283	NC_022051	GAAC	2	8	52572	52579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1284	NC_022051	AG	3	6	52625	52630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1285	NC_022051	TTA	2	6	52781	52786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341517
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1291	NC_022051	T	6	6	53151	53156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1292	NC_022051	TTTG	2	8	53205	53212	0 %	75 %	25 %	0 %	530341518
1293	NC_022051	CGA	2	6	53366	53371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341518
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1295	NC_022051	TCA	2	6	53460	53465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1296	NC_022051	GAT	2	6	53500	53505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1301	NC_022051	TA	3	6	53830	53835	50 %	50 %	0 %	0 %	530341519
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1309	NC_022051	T	7	7	54034	54040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1310	NC_022051	A	7	7	54043	54049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1311	NC_022051	CCA	2	6	54076	54081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1312	NC_022051	ACT	2	6	54112	54117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1313	NC_022051	TAT	2	6	54200	54205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1314	NC_022051	ACTA	2	8	54238	54245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1315	NC_022051	ACT	2	6	54263	54268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1316	NC_022051	AAT	2	6	54291	54296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1318	NC_022051	TA	3	6	54415	54420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1319	NC_022051	ACA	2	6	54486	54491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1320	NC_022051	CAT	2	6	54595	54600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1321	NC_022051	TGT	2	6	54654	54659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1322	NC_022051	ATC	2	6	54707	54712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1323	NC_022051	AGC	2	6	54791	54796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1325	NC_022051	CGCCTG	2	12	54878	54889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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1341	NC_022051	CAA	2	6	55678	55683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1342	NC_022051	AAT	2	6	55739	55744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1343	NC_022051	TTC	2	6	55745	55750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1344	NC_022051	TAA	2	6	55762	55767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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