MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 3513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022045	T	6	6	125906	125911	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
3002	NC_022045	AGATA	2	10	125934	125943	60 %	20 %	20 %	0 %	530314013
3003	NC_022045	CTT	3	9	125972	125980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314013
3004	NC_022045	T	7	7	126005	126011	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
3005	NC_022045	TCTT	2	8	126045	126052	0 %	75 %	0 %	25 %	530314013
3006	NC_022045	AGATTC	2	12	126086	126097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530314013
3007	NC_022045	T	6	6	126170	126175	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
3008	NC_022045	GTA	2	6	126191	126196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314013
3009	NC_022045	AAT	2	6	126260	126265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314013
3010	NC_022045	T	7	7	126268	126274	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
3011	NC_022045	T	6	6	126294	126299	0 %	100 %	0 %	0 %	530314014
3012	NC_022045	GCT	2	6	126354	126359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314014
3013	NC_022045	GTT	2	6	126381	126386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314014
3014	NC_022045	AAT	2	6	126451	126456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314014
3015	NC_022045	TAGC	2	8	126552	126559	25 %	25 %	25 %	25 %	530314014
3016	NC_022045	TTA	2	6	126564	126569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
3017	NC_022045	AAT	2	6	126607	126612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314014
3018	NC_022045	T	7	7	126623	126629	0 %	100 %	0 %	0 %	530314014
3019	NC_022045	ATT	3	9	126683	126691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
3020	NC_022045	TCC	2	6	126725	126730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314014
3021	NC_022045	TAG	2	6	126760	126765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314014
3022	NC_022045	CAAT	2	8	126799	126806	50 %	25 %	0 %	25 %	530314014
3023	NC_022045	AT	3	6	126805	126810	50 %	50 %	0 %	0 %	530314014
3024	NC_022045	T	6	6	126815	126820	0 %	100 %	0 %	0 %	530314014
3025	NC_022045	TC	3	6	126934	126939	0 %	50 %	0 %	50 %	530314014
3026	NC_022045	ATT	2	6	126947	126952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
3027	NC_022045	ATA	2	6	126972	126977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314014
3028	NC_022045	TTA	2	6	127044	127049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
3029	NC_022045	CTTT	2	8	127057	127064	0 %	75 %	0 %	25 %	530314014
3030	NC_022045	ATC	2	6	127103	127108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314014
3031	NC_022045	TGC	2	6	127124	127129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314014
3032	NC_022045	TTG	2	6	127133	127138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314014
3033	NC_022045	CAA	2	6	127154	127159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314014
3034	NC_022045	AAG	2	6	127169	127174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314014
3035	NC_022045	TCC	2	6	127209	127214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_022045	TAT	2	6	127216	127221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_022045	T	6	6	127226	127231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_022045	AAG	2	6	127389	127394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_022045	ATT	2	6	127445	127450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314015
3040	NC_022045	AG	3	6	127477	127482	50 %	0 %	50 %	0 %	530314015
3041	NC_022045	ATT	2	6	127613	127618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314015
3042	NC_022045	AAAG	2	8	127754	127761	75 %	0 %	25 %	0 %	530314015
3043	NC_022045	GCC	2	6	127767	127772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530314015
3044	NC_022045	AAT	2	6	127840	127845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314015
3045	NC_022045	AT	3	6	127866	127871	50 %	50 %	0 %	0 %	530314015
3046	NC_022045	TTTCT	2	10	127908	127917	0 %	80 %	0 %	20 %	530314015
3047	NC_022045	AATA	2	8	127927	127934	75 %	25 %	0 %	0 %	530314015
3048	NC_022045	TG	3	6	127970	127975	0 %	50 %	50 %	0 %	530314015
3049	NC_022045	AGT	2	6	128041	128046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314015
3050	NC_022045	ATG	2	6	128061	128066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314015
3051	NC_022045	TTC	2	6	128125	128130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_022045	AAT	2	6	128143	128148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_022045	TAAA	2	8	128153	128160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_022045	GTGA	2	8	128212	128219	25 %	25 %	50 %	0 %	530314016
3055	NC_022045	A	8	8	128232	128239	100 %	0 %	0 %	0 %	530314016
3056	NC_022045	CAAA	2	8	128268	128275	75 %	0 %	0 %	25 %	530314016
3057	NC_022045	A	6	6	128294	128299	100 %	0 %	0 %	0 %	530314016
3058	NC_022045	CAA	2	6	128335	128340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314016
3059	NC_022045	CATG	2	8	128356	128363	25 %	25 %	25 %	25 %	530314016
3060	NC_022045	CAA	2	6	128371	128376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314016
3061	NC_022045	TTA	2	6	128572	128577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314016
3062	NC_022045	GA	3	6	128633	128638	50 %	0 %	50 %	0 %	530314016
3063	NC_022045	ATA	2	6	128664	128669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314016
3064	NC_022045	T	6	6	128670	128675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022045	GAT	2	6	128689	128694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022045	A	6	6	128704	128709	100 %	0 %	0 %	0 %	530314017
3067	NC_022045	GTTT	2	8	128718	128725	0 %	75 %	25 %	0 %	530314017
3068	NC_022045	A	8	8	128726	128733	100 %	0 %	0 %	0 %	530314017
3069	NC_022045	TAAA	2	8	128736	128743	75 %	25 %	0 %	0 %	530314017
3070	NC_022045	GAT	2	6	128755	128760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314017
3071	NC_022045	TAG	2	6	128772	128777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314017
3072	NC_022045	ATC	2	6	128804	128809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314017
3073	NC_022045	TACTT	2	10	128842	128851	20 %	60 %	0 %	20 %	530314017
3074	NC_022045	AT	3	6	128869	128874	50 %	50 %	0 %	0 %	530314017
3075	NC_022045	TCC	2	6	128880	128885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314017
3076	NC_022045	AT	3	6	128890	128895	50 %	50 %	0 %	0 %	530314017
3077	NC_022045	CCA	2	6	128896	128901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314017
3078	NC_022045	GCA	2	6	128933	128938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314017
3079	NC_022045	TGA	2	6	128968	128973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314017
3080	NC_022045	CTT	2	6	128991	128996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314017
3081	NC_022045	TTG	2	6	128997	129002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314017
3082	NC_022045	GTA	2	6	129011	129016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314017
3083	NC_022045	TGG	2	6	129039	129044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314017
3084	NC_022045	CT	3	6	129057	129062	0 %	50 %	0 %	50 %	530314017
3085	NC_022045	ATA	2	6	129076	129081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314017
3086	NC_022045	TTATT	2	10	129117	129126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_022045	TAT	2	6	129141	129146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_022045	TAA	2	6	129182	129187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_022045	A	7	7	129246	129252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_022045	AAG	2	6	129270	129275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_022045	CTT	2	6	129294	129299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_022045	TGT	2	6	129305	129310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_022045	TCA	2	6	129323	129328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314018
3094	NC_022045	TAG	3	9	129414	129422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314018
3095	NC_022045	AATG	2	8	129498	129505	50 %	25 %	25 %	0 %	530314018
3096	NC_022045	TCG	2	6	129520	129525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314018
3097	NC_022045	CAG	2	6	129542	129547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314018
3098	NC_022045	CAT	2	6	129617	129622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314018
3099	NC_022045	CCA	2	6	129635	129640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314018
3100	NC_022045	TAT	2	6	129650	129655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314018
3101	NC_022045	TAT	2	6	129761	129766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314018
3102	NC_022045	ATA	2	6	129778	129783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314018
3103	NC_022045	GT	3	6	129784	129789	0 %	50 %	50 %	0 %	530314018
3104	NC_022045	GCA	2	6	129823	129828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314018
3105	NC_022045	TTC	2	6	129948	129953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314018
3106	NC_022045	GATA	2	8	130153	130160	50 %	25 %	25 %	0 %	530314018
3107	NC_022045	TTC	2	6	130266	130271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314018
3108	NC_022045	T	6	6	130303	130308	0 %	100 %	0 %	0 %	530314018
3109	NC_022045	CAC	2	6	130418	130423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314018
3110	NC_022045	GGA	2	6	130435	130440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314018
3111	NC_022045	ATA	2	6	130462	130467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314018
3112	NC_022045	CTT	2	6	130538	130543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314018
3113	NC_022045	T	7	7	130584	130590	0 %	100 %	0 %	0 %	530314018
3114	NC_022045	CTT	2	6	130613	130618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314018
3115	NC_022045	TCA	2	6	130642	130647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314018
3116	NC_022045	TGC	2	6	130686	130691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314018
3117	NC_022045	GAA	2	6	130702	130707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314018
3118	NC_022045	CCAT	2	8	130726	130733	25 %	25 %	0 %	50 %	530314018
3119	NC_022045	T	6	6	130739	130744	0 %	100 %	0 %	0 %	530314018
3120	NC_022045	ATA	2	6	130762	130767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314018
3121	NC_022045	TCG	2	6	130768	130773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314018
3122	NC_022045	CTT	2	6	130829	130834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314018
3123	NC_022045	TAC	2	6	130923	130928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314018
3124	NC_022045	AAT	2	6	130968	130973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314018
3125	NC_022045	CTT	2	6	131030	131035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314018
3126	NC_022045	TAAA	2	8	131036	131043	75 %	25 %	0 %	0 %	530314018
3127	NC_022045	CCA	2	6	131050	131055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314018
3128	NC_022045	ATT	3	9	131056	131064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314018
3129	NC_022045	AT	3	6	131069	131074	50 %	50 %	0 %	0 %	530314018
3130	NC_022045	TAA	2	6	131088	131093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314018
3131	NC_022045	CAA	2	6	131129	131134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314018
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3133	NC_022045	TAA	2	6	131174	131179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314018
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3149	NC_022045	TAT	2	6	131823	131828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3151	NC_022045	CTT	2	6	131896	131901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_022045	TAA	2	6	131930	131935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_022045	ATA	2	6	131972	131977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_022045	TAA	2	6	131983	131988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3173	NC_022045	AT	3	6	132779	132784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3219	NC_022045	A	6	6	134776	134781	100 %	0 %	0 %	0 %	530314023
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3230	NC_022045	AT	3	6	135343	135348	50 %	50 %	0 %	0 %	530314023
3231	NC_022045	GAA	2	6	135359	135364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314023
3232	NC_022045	AG	3	6	135444	135449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_022045	TCT	2	6	135494	135499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3236	NC_022045	CAT	2	6	136077	136082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314024
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3238	NC_022045	GAA	2	6	136147	136152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314024
3239	NC_022045	GAC	2	6	136168	136173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314024
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3241	NC_022045	CGAC	2	8	136208	136215	25 %	0 %	25 %	50 %	530314024
3242	NC_022045	TCT	2	6	136344	136349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314025
3243	NC_022045	AGA	3	9	136356	136364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314025
3244	NC_022045	GA	3	6	136368	136373	50 %	0 %	50 %	0 %	530314025
3245	NC_022045	CT	3	6	136424	136429	0 %	50 %	0 %	50 %	530314025
3246	NC_022045	TGA	2	6	136457	136462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314025
3247	NC_022045	GAA	2	6	136510	136515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314026
3248	NC_022045	CCA	2	6	136576	136581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314026
3249	NC_022045	CAA	2	6	136591	136596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314026
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3251	NC_022045	CGTG	2	8	136876	136883	0 %	25 %	50 %	25 %	530314026
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3378	NC_022045	A	6	6	142726	142731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3380	NC_022045	AAACG	2	10	142882	142891	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3494	NC_022045	AAT	2	6	148196	148201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_022045	TGTT	2	8	148227	148234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_022045	T	7	7	148236	148242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_022045	A	6	6	148285	148290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_022045	A	6	6	148313	148318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_022045	AG	3	6	148322	148327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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