MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 3513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022045	TAAA	2	8	104597	104604	75 %	25 %	0 %	0 %	530313989
2502	NC_022045	T	6	6	104622	104627	0 %	100 %	0 %	0 %	530313989
2503	NC_022045	AAG	2	6	104705	104710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313989
2504	NC_022045	TTC	2	6	104725	104730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313989
2505	NC_022045	TTG	2	6	104736	104741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313989
2506	NC_022045	TAA	2	6	104782	104787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313989
2507	NC_022045	T	8	8	104819	104826	0 %	100 %	0 %	0 %	530313989
2508	NC_022045	CAT	2	6	104840	104845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313989
2509	NC_022045	GA	3	6	104853	104858	50 %	0 %	50 %	0 %	530313989
2510	NC_022045	TCCTAC	2	12	104999	105010	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	530313989
2511	NC_022045	CAA	2	6	105034	105039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313989
2512	NC_022045	GTC	2	6	105084	105089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313989
2513	NC_022045	ATC	2	6	105114	105119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313989
2514	NC_022045	CAC	2	6	105265	105270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313990
2515	NC_022045	ATAA	2	8	105298	105305	75 %	25 %	0 %	0 %	530313990
2516	NC_022045	T	6	6	105315	105320	0 %	100 %	0 %	0 %	530313990
2517	NC_022045	TCC	2	6	105322	105327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_022045	ATCT	2	8	105353	105360	25 %	50 %	0 %	25 %	530313991
2519	NC_022045	ACAA	2	8	105413	105420	75 %	0 %	0 %	25 %	530313991
2520	NC_022045	ACA	2	6	105432	105437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313991
2521	NC_022045	GTT	2	6	105480	105485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313991
2522	NC_022045	TGC	2	6	105516	105521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313991
2523	NC_022045	T	6	6	105534	105539	0 %	100 %	0 %	0 %	530313991
2524	NC_022045	CT	3	6	105544	105549	0 %	50 %	0 %	50 %	530313991
2525	NC_022045	AGC	2	6	105575	105580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313991
2526	NC_022045	TCT	2	6	105585	105590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313991
2527	NC_022045	T	6	6	105652	105657	0 %	100 %	0 %	0 %	530313991
2528	NC_022045	TGA	2	6	105660	105665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313991
2529	NC_022045	CTT	3	9	105670	105678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313991
2530	NC_022045	GTT	2	6	105691	105696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313991
2531	NC_022045	CTT	2	6	105716	105721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313991
2532	NC_022045	TTC	2	6	105830	105835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313991
2533	NC_022045	AAG	2	6	105884	105889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313991
2534	NC_022045	TCA	2	6	105894	105899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313991
2535	NC_022045	T	7	7	105935	105941	0 %	100 %	0 %	0 %	530313991
2536	NC_022045	TCT	2	6	105945	105950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313991
2537	NC_022045	CCT	2	6	105984	105989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313992
2538	NC_022045	AT	3	6	106025	106030	50 %	50 %	0 %	0 %	530313992
2539	NC_022045	T	6	6	106102	106107	0 %	100 %	0 %	0 %	530313992
2540	NC_022045	CATT	2	8	106152	106159	25 %	50 %	0 %	25 %	530313992
2541	NC_022045	AAAC	2	8	106173	106180	75 %	0 %	0 %	25 %	530313992
2542	NC_022045	T	7	7	106185	106191	0 %	100 %	0 %	0 %	530313992
2543	NC_022045	CTC	2	6	106215	106220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_022045	AT	3	6	106280	106285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_022045	GCTT	2	8	106332	106339	0 %	50 %	25 %	25 %	530313993
2546	NC_022045	CAG	2	6	106344	106349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313993
2547	NC_022045	TAAC	2	8	106362	106369	50 %	25 %	0 %	25 %	530313993
2548	NC_022045	ACA	3	9	106412	106420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313993
2549	NC_022045	AAC	2	6	106423	106428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313993
2550	NC_022045	T	7	7	106496	106502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_022045	AT	3	6	106552	106557	50 %	50 %	0 %	0 %	530313994
2552	NC_022045	ATA	2	6	106621	106626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313994
2553	NC_022045	TCACC	2	10	106658	106667	20 %	20 %	0 %	60 %	530313995
2554	NC_022045	ACA	2	6	106720	106725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313995
2555	NC_022045	CTT	2	6	106756	106761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313995
2556	NC_022045	TCC	2	6	106868	106873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313995
2557	NC_022045	TAA	2	6	106978	106983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313995
2558	NC_022045	GTT	2	6	107004	107009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313995
2559	NC_022045	CAC	2	6	107026	107031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_022045	TCT	2	6	107047	107052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313996
2561	NC_022045	AATG	2	8	107057	107064	50 %	25 %	25 %	0 %	530313996
2562	NC_022045	GAA	2	6	107078	107083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313996
2563	NC_022045	A	7	7	107113	107119	100 %	0 %	0 %	0 %	530313996
2564	NC_022045	AAT	2	6	107172	107177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313996
2565	NC_022045	TAA	2	6	107228	107233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313996
2566	NC_022045	AAG	2	6	107368	107373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313996
2567	NC_022045	TACT	2	8	107395	107402	25 %	50 %	0 %	25 %	530313996
2568	NC_022045	AG	3	6	107446	107451	50 %	0 %	50 %	0 %	530313996
2569	NC_022045	TTTTC	2	10	107453	107462	0 %	80 %	0 %	20 %	530313996
2570	NC_022045	A	6	6	107567	107572	100 %	0 %	0 %	0 %	530313996
2571	NC_022045	A	7	7	107586	107592	100 %	0 %	0 %	0 %	530313996
2572	NC_022045	TAA	2	6	107598	107603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313996
2573	NC_022045	CT	3	6	107666	107671	0 %	50 %	0 %	50 %	530313996
2574	NC_022045	TTAA	2	8	107683	107690	50 %	50 %	0 %	0 %	530313996
2575	NC_022045	TTC	2	6	107703	107708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313996
2576	NC_022045	GGT	2	6	107722	107727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313996
2577	NC_022045	T	7	7	107761	107767	0 %	100 %	0 %	0 %	530313996
2578	NC_022045	TTC	2	6	107805	107810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313996
2579	NC_022045	CTT	2	6	107822	107827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313996
2580	NC_022045	AAG	2	6	107876	107881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313997
2581	NC_022045	A	6	6	107929	107934	100 %	0 %	0 %	0 %	530313997
2582	NC_022045	TGC	2	6	107973	107978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313997
2583	NC_022045	CAA	2	6	107989	107994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313997
2584	NC_022045	A	7	7	108068	108074	100 %	0 %	0 %	0 %	530313997
2585	NC_022045	TAT	2	6	108097	108102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313997
2586	NC_022045	ACAT	2	8	108174	108181	50 %	25 %	0 %	25 %	530313997
2587	NC_022045	ATCTT	2	10	108189	108198	20 %	60 %	0 %	20 %	530313997
2588	NC_022045	TCC	2	6	108285	108290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313997
2589	NC_022045	TCT	2	6	108345	108350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313997
2590	NC_022045	TAA	2	6	108440	108445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313997
2591	NC_022045	GCT	2	6	108465	108470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313997
2592	NC_022045	CCA	2	6	108494	108499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313997
2593	NC_022045	ATA	2	6	108561	108566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313997
2594	NC_022045	TCA	2	6	108615	108620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313997
2595	NC_022045	CCT	2	6	108655	108660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_022045	T	6	6	108660	108665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_022045	CAT	2	6	108679	108684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313998
2598	NC_022045	TTA	2	6	108721	108726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313998
2599	NC_022045	TTC	2	6	108765	108770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313998
2600	NC_022045	GTTT	2	8	108820	108827	0 %	75 %	25 %	0 %	530313998
2601	NC_022045	TCA	2	6	108967	108972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313998
2602	NC_022045	GCATTT	2	12	109018	109029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530313998
2603	NC_022045	GCA	2	6	109076	109081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313998
2604	NC_022045	TCAC	2	8	109108	109115	25 %	25 %	0 %	50 %	530313998
2605	NC_022045	GAT	2	6	109116	109121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2606	NC_022045	TTG	2	6	109146	109151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313998
2607	NC_022045	TAA	2	6	109185	109190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313998
2608	NC_022045	ATG	2	6	109252	109257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2609	NC_022045	TTGC	2	8	109349	109356	0 %	50 %	25 %	25 %	530313998
2610	NC_022045	CTGC	2	8	109361	109368	0 %	25 %	25 %	50 %	530313998
2611	NC_022045	TTCA	2	8	109413	109420	25 %	50 %	0 %	25 %	530313998
2612	NC_022045	GTA	2	6	109537	109542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2613	NC_022045	GAT	2	6	109575	109580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2614	NC_022045	TGA	2	6	109583	109588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2615	NC_022045	TAA	2	6	109643	109648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313998
2616	NC_022045	TTCCG	2	10	109653	109662	0 %	40 %	20 %	40 %	530313998
2617	NC_022045	ATG	2	6	109708	109713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2618	NC_022045	CCA	2	6	109721	109726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313998
2619	NC_022045	TCAA	2	8	109744	109751	50 %	25 %	0 %	25 %	530313998
2620	NC_022045	CAG	2	6	109781	109786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313998
2621	NC_022045	GTA	2	6	109799	109804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313998
2622	NC_022045	CTT	2	6	109814	109819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313998
2623	NC_022045	T	6	6	109855	109860	0 %	100 %	0 %	0 %	530313998
2624	NC_022045	TTGC	2	8	109925	109932	0 %	50 %	25 %	25 %	530313998
2625	NC_022045	CTT	2	6	109937	109942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313999
2626	NC_022045	TCC	2	6	109944	109949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313999
2627	NC_022045	CAT	2	6	109996	110001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313999
2628	NC_022045	AAT	2	6	110053	110058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313999
2629	NC_022045	T	6	6	110097	110102	0 %	100 %	0 %	0 %	530313999
2630	NC_022045	AAT	2	6	110106	110111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313999
2631	NC_022045	ACA	2	6	110229	110234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313999
2632	NC_022045	ATA	2	6	110304	110309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313999
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2634	NC_022045	TCCA	2	8	110378	110385	25 %	25 %	0 %	50 %	530314000
2635	NC_022045	TACA	2	8	110472	110479	50 %	25 %	0 %	25 %	530314000
2636	NC_022045	TCGTA	2	10	110555	110564	20 %	40 %	20 %	20 %	530314000
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2650	NC_022045	T	6	6	111186	111191	0 %	100 %	0 %	0 %	530314000
2651	NC_022045	TTC	2	6	111208	111213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314000
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2656	NC_022045	T	7	7	111516	111522	0 %	100 %	0 %	0 %	530314000
2657	NC_022045	TCG	2	6	111583	111588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314000
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2686	NC_022045	TGC	2	6	112978	112983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314001
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2700	NC_022045	CGT	2	6	113770	113775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314001
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2703	NC_022045	GGTGC	2	10	113843	113852	0 %	20 %	60 %	20 %	530314001
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2721	NC_022045	CTTC	2	8	114723	114730	0 %	50 %	0 %	50 %	530314002
2722	NC_022045	ATA	2	6	114865	114870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314002
2723	NC_022045	GATCGA	2	12	114916	114927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530314002
2724	NC_022045	GCT	2	6	114947	114952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314002
2725	NC_022045	T	6	6	115003	115008	0 %	100 %	0 %	0 %	530314002
2726	NC_022045	CTTG	2	8	115011	115018	0 %	50 %	25 %	25 %	530314002
2727	NC_022045	TGCG	2	8	115024	115031	0 %	25 %	50 %	25 %	530314002
2728	NC_022045	CCA	2	6	115074	115079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314002
2729	NC_022045	T	7	7	115083	115089	0 %	100 %	0 %	0 %	530314002
2730	NC_022045	ACT	2	6	115099	115104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314002
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2732	NC_022045	AAT	2	6	115155	115160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314002
2733	NC_022045	CCG	2	6	115182	115187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530314002
2734	NC_022045	A	6	6	115188	115193	100 %	0 %	0 %	0 %	530314002
2735	NC_022045	CTG	2	6	115227	115232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314002
2736	NC_022045	GTGC	2	8	115290	115297	0 %	25 %	50 %	25 %	530314002
2737	NC_022045	ACG	2	6	115351	115356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314003
2738	NC_022045	CGT	2	6	115368	115373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314003
2739	NC_022045	CAG	2	6	115412	115417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314003
2740	NC_022045	CGT	2	6	115419	115424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314003
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2742	NC_022045	GATT	2	8	115450	115457	25 %	50 %	25 %	0 %	530314003
2743	NC_022045	AAT	2	6	115466	115471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314003
2744	NC_022045	TTC	2	6	115492	115497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314003
2745	NC_022045	GGCT	2	8	115554	115561	0 %	25 %	50 %	25 %	530314003
2746	NC_022045	TCG	2	6	115625	115630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314003
2747	NC_022045	TGT	2	6	115644	115649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314003
2748	NC_022045	CCT	2	6	115663	115668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314003
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2995	NC_022045	ATA	2	6	125802	125807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_022045	A	6	6	125807	125812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_022045	TTTA	2	8	125813	125820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_022045	TAAT	2	8	125822	125829	50 %	50 %	0 %	0 %	530314013
2999	NC_022045	TCA	2	6	125865	125870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314013
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