MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 3513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022045	TGC	2	6	21634	21639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313915
502	NC_022045	TGC	2	6	21654	21659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313915
503	NC_022045	ATT	2	6	21690	21695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313915
504	NC_022045	TCA	2	6	21722	21727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313915
505	NC_022045	TGAAAT	2	12	21733	21744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530313915
506	NC_022045	AAG	2	6	21760	21765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313915
507	NC_022045	GAA	2	6	21792	21797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313915
508	NC_022045	GTTC	2	8	21833	21840	0 %	50 %	25 %	25 %	530313915
509	NC_022045	GTA	2	6	21958	21963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313915
510	NC_022045	TAAAA	2	10	21966	21975	80 %	20 %	0 %	0 %	530313915
511	NC_022045	TTG	2	6	22032	22037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313915
512	NC_022045	ATCGAC	2	12	22041	22052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530313915
513	NC_022045	TTG	2	6	22068	22073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313915
514	NC_022045	CAG	2	6	22179	22184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313915
515	NC_022045	CTT	2	6	22187	22192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313915
516	NC_022045	TGC	2	6	22284	22289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313915
517	NC_022045	GCT	2	6	22386	22391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313915
518	NC_022045	CT	3	6	22428	22433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_022045	CT	3	6	22435	22440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_022045	CAAA	2	8	22461	22468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_022045	A	6	6	22466	22471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022045	TCCC	2	8	22480	22487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
523	NC_022045	AGGAAA	2	12	22527	22538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022045	T	7	7	22631	22637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022045	T	6	6	22735	22740	0 %	100 %	0 %	0 %	530313916
526	NC_022045	TTG	2	6	22747	22752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313916
527	NC_022045	ACA	2	6	22763	22768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313916
528	NC_022045	T	11	11	22771	22781	0 %	100 %	0 %	0 %	530313916
529	NC_022045	TA	3	6	22818	22823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022045	TA	4	8	22866	22873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022045	TA	3	6	22906	22911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022045	T	7	7	22928	22934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022045	TA	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022045	AATT	2	8	22985	22992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022045	TAC	2	6	23016	23021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_022045	TA	3	6	23030	23035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022045	T	6	6	23053	23058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022045	TTA	2	6	23084	23089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022045	TTA	2	6	23130	23135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022045	AT	3	6	23139	23144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022045	AGG	2	6	23148	23153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022045	GA	3	6	23155	23160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022045	TA	3	6	23179	23184	50 %	50 %	0 %	0 %	530313917
544	NC_022045	GAA	2	6	23185	23190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313917
545	NC_022045	A	6	6	23194	23199	100 %	0 %	0 %	0 %	530313917
546	NC_022045	TTA	3	9	23234	23242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313917
547	NC_022045	ATT	2	6	23296	23301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313917
548	NC_022045	TAA	2	6	23316	23321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313917
549	NC_022045	A	6	6	23320	23325	100 %	0 %	0 %	0 %	530313917
550	NC_022045	ATTG	2	8	23331	23338	25 %	50 %	25 %	0 %	530313917
551	NC_022045	ATG	2	6	23384	23389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313917
552	NC_022045	GAA	2	6	23425	23430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313917
553	NC_022045	T	6	6	23514	23519	0 %	100 %	0 %	0 %	530313917
554	NC_022045	GAA	2	6	23539	23544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313917
555	NC_022045	TC	3	6	23559	23564	0 %	50 %	0 %	50 %	530313917
556	NC_022045	TGA	2	6	23586	23591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313917
557	NC_022045	ATTTT	2	10	23597	23606	20 %	80 %	0 %	0 %	530313917
558	NC_022045	TGC	2	6	23655	23660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313917
559	NC_022045	CAA	2	6	23689	23694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313917
560	NC_022045	TAG	2	6	23744	23749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313917
561	NC_022045	AAT	2	6	23778	23783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313917
562	NC_022045	TAC	2	6	23801	23806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313917
563	NC_022045	A	7	7	23809	23815	100 %	0 %	0 %	0 %	530313917
564	NC_022045	A	6	6	23828	23833	100 %	0 %	0 %	0 %	530313917
565	NC_022045	AT	3	6	23870	23875	50 %	50 %	0 %	0 %	530313917
566	NC_022045	T	6	6	24056	24061	0 %	100 %	0 %	0 %	530313917
567	NC_022045	TTG	2	6	24104	24109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313917
568	NC_022045	A	8	8	24207	24214	100 %	0 %	0 %	0 %	530313918
569	NC_022045	TTA	2	6	24263	24268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313918
570	NC_022045	TAA	2	6	24283	24288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313918
571	NC_022045	TTA	2	6	24332	24337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313918
572	NC_022045	ACA	2	6	24370	24375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313918
573	NC_022045	ATCA	2	8	24511	24518	50 %	25 %	0 %	25 %	530313875
574	NC_022045	GCAT	2	8	24527	24534	25 %	25 %	25 %	25 %	530313875
575	NC_022045	GCT	2	6	24585	24590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313875
576	NC_022045	CAT	2	6	24687	24692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313875
577	NC_022045	T	7	7	24764	24770	0 %	100 %	0 %	0 %	530313875
578	NC_022045	ATGA	2	8	24820	24827	50 %	25 %	25 %	0 %	530313875
579	NC_022045	TGA	2	6	24842	24847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313875
580	NC_022045	CTT	2	6	24867	24872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313875
581	NC_022045	TAG	2	6	25010	25015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313875
582	NC_022045	GCT	2	6	25017	25022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313875
583	NC_022045	T	6	6	25043	25048	0 %	100 %	0 %	0 %	530313875
584	NC_022045	AGG	2	6	25053	25058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530313875
585	NC_022045	AAG	2	6	25249	25254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313875
586	NC_022045	T	6	6	25319	25324	0 %	100 %	0 %	0 %	530313875
587	NC_022045	T	6	6	25351	25356	0 %	100 %	0 %	0 %	530313875
588	NC_022045	TCG	2	6	25382	25387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313875
589	NC_022045	ATAGA	2	10	25388	25397	60 %	20 %	20 %	0 %	530313875
590	NC_022045	GAAG	2	8	25425	25432	50 %	0 %	50 %	0 %	530313875
591	NC_022045	TGC	2	6	25570	25575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313875
592	NC_022045	TCC	2	6	25585	25590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313875
593	NC_022045	GAC	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313875
594	NC_022045	A	6	6	25619	25624	100 %	0 %	0 %	0 %	530313875
595	NC_022045	A	6	6	25669	25674	100 %	0 %	0 %	0 %	530313875
596	NC_022045	TC	3	6	25796	25801	0 %	50 %	0 %	50 %	530313919
597	NC_022045	CTAC	2	8	25849	25856	25 %	25 %	0 %	50 %	530313919
598	NC_022045	TCT	2	6	25885	25890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313919
599	NC_022045	TGC	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313919
600	NC_022045	TTC	2	6	25956	25961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313919
601	NC_022045	TGC	2	6	25966	25971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313919
602	NC_022045	GTT	2	6	26006	26011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313919
603	NC_022045	CTCGAT	2	12	26054	26065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530313919
604	NC_022045	CCT	2	6	26081	26086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_022045	CAA	2	6	26088	26093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022045	ACAA	2	8	26125	26132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_022045	TA	3	6	26155	26160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022045	AAT	2	6	26178	26183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022045	TTA	2	6	26201	26206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022045	CAAA	2	8	26215	26222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_022045	A	6	6	26220	26225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022045	TCAG	2	8	26248	26255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_022045	AT	3	6	26288	26293	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
614	NC_022045	T	6	6	26303	26308	0 %	100 %	0 %	0 %	530313920
615	NC_022045	TTC	2	6	26313	26318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
616	NC_022045	TTC	2	6	26358	26363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
617	NC_022045	AAT	2	6	26391	26396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313920
618	NC_022045	CTT	2	6	26406	26411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
619	NC_022045	CTT	2	6	26423	26428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
620	NC_022045	GTT	2	6	26436	26441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313920
621	NC_022045	CTT	2	6	26513	26518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
622	NC_022045	CT	3	6	26647	26652	0 %	50 %	0 %	50 %	530313920
623	NC_022045	TA	3	6	26711	26716	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
624	NC_022045	TAA	2	6	26726	26731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313920
625	NC_022045	GTC	2	6	26740	26745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313920
626	NC_022045	TCT	2	6	26786	26791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
627	NC_022045	T	6	6	26818	26823	0 %	100 %	0 %	0 %	530313920
628	NC_022045	ATTCC	2	10	26852	26861	20 %	40 %	0 %	40 %	530313920
629	NC_022045	TA	3	6	26933	26938	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
630	NC_022045	TCT	2	6	27024	27029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
631	NC_022045	ATTC	2	8	27032	27039	25 %	50 %	0 %	25 %	530313920
632	NC_022045	TCA	2	6	27043	27048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_022045	TA	3	6	27060	27065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022045	ATTT	2	8	27079	27086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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