MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_021872	GAAA	2	8	2099781	2099788	75 %	0 %	25 %	0 %	526232132
46502	NC_021872	AT	3	6	2099799	2099804	50 %	50 %	0 %	0 %	526232132
46503	NC_021872	AAG	2	6	2099828	2099833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232132
46504	NC_021872	AAC	2	6	2099895	2099900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232132
46505	NC_021872	CAA	2	6	2099911	2099916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232132
46506	NC_021872	ACG	2	6	2099927	2099932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232132
46507	NC_021872	CAA	2	6	2099966	2099971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232132
46508	NC_021872	TAA	2	6	2100111	2100116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46509	NC_021872	A	6	6	2100115	2100120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46510	NC_021872	A	6	6	2100146	2100151	100 %	0 %	0 %	0 %	526232133
46511	NC_021872	TTA	2	6	2100152	2100157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232133
46512	NC_021872	TGA	2	6	2100196	2100201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232133
46513	NC_021872	GAA	2	6	2100227	2100232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232133
46514	NC_021872	CCAG	2	8	2100307	2100314	25 %	0 %	25 %	50 %	526232133
46515	NC_021872	ATT	2	6	2100326	2100331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232133
46516	NC_021872	ATG	2	6	2100363	2100368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232133
46517	NC_021872	TGT	2	6	2100451	2100456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232133
46518	NC_021872	GCT	2	6	2100533	2100538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232133
46519	NC_021872	AAC	2	6	2100610	2100615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232133
46520	NC_021872	CCA	2	6	2100647	2100652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232133
46521	NC_021872	GGA	2	6	2100845	2100850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232133
46522	NC_021872	ATT	2	6	2100914	2100919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232133
46523	NC_021872	GAC	2	6	2100972	2100977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232133
46524	NC_021872	ACT	2	6	2100982	2100987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232133
46525	NC_021872	GATG	2	8	2101063	2101070	25 %	25 %	50 %	0 %	526232133
46526	NC_021872	CTT	2	6	2101087	2101092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232133
46527	NC_021872	ACA	2	6	2101183	2101188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46528	NC_021872	A	6	6	2101208	2101213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46529	NC_021872	TTG	2	6	2101232	2101237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46530	NC_021872	T	6	6	2101313	2101318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46531	NC_021872	CCA	2	6	2101362	2101367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232134
46532	NC_021872	TTG	2	6	2101377	2101382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232134
46533	NC_021872	CTGC	2	8	2101388	2101395	0 %	25 %	25 %	50 %	526232134
46534	NC_021872	T	6	6	2101416	2101421	0 %	100 %	0 %	0 %	526232134
46535	NC_021872	TCA	2	6	2101430	2101435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232134
46536	NC_021872	TGA	2	6	2101443	2101448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232134
46537	NC_021872	ATT	2	6	2101458	2101463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232134
46538	NC_021872	ATT	2	6	2101515	2101520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232134
46539	NC_021872	GTT	2	6	2101547	2101552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232134
46540	NC_021872	TTG	2	6	2101650	2101655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232134
46541	NC_021872	ATC	2	6	2101713	2101718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232134
46542	NC_021872	TTA	2	6	2101720	2101725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232134
46543	NC_021872	TTG	2	6	2101742	2101747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232134
46544	NC_021872	AACT	2	8	2101790	2101797	50 %	25 %	0 %	25 %	526232134
46545	NC_021872	T	6	6	2101960	2101965	0 %	100 %	0 %	0 %	526232134
46546	NC_021872	GCA	2	6	2102026	2102031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232134
46547	NC_021872	ATC	2	6	2102103	2102108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232134
46548	NC_021872	ATT	2	6	2102121	2102126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232134
46549	NC_021872	ATTC	2	8	2102129	2102136	25 %	50 %	0 %	25 %	526232134
46550	NC_021872	ACA	2	6	2102161	2102166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232134
46551	NC_021872	ATTT	2	8	2102171	2102178	25 %	75 %	0 %	0 %	526232134
46552	NC_021872	GTT	2	6	2102224	2102229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232134
46553	NC_021872	GCC	2	6	2102233	2102238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232134
46554	NC_021872	TAA	2	6	2102268	2102273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232134
46555	NC_021872	TAA	2	6	2102294	2102299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232134
46556	NC_021872	T	6	6	2102328	2102333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46557	NC_021872	AAATT	2	10	2102348	2102357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46558	NC_021872	A	6	6	2102373	2102378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46559	NC_021872	ATTTT	2	10	2102398	2102407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46560	NC_021872	ATT	2	6	2102423	2102428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46561	NC_021872	CTTGG	2	10	2102472	2102481	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46562	NC_021872	TC	3	6	2102490	2102495	0 %	50 %	0 %	50 %	526232135
46563	NC_021872	AGT	2	6	2102562	2102567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232135
46564	NC_021872	TCT	2	6	2102669	2102674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232135
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46566	NC_021872	TTA	2	6	2102906	2102911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232135
46567	NC_021872	ACA	2	6	2102912	2102917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232135
46568	NC_021872	ACC	2	6	2102930	2102935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232135
46569	NC_021872	CTG	2	6	2103018	2103023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232135
46570	NC_021872	TGC	2	6	2103029	2103034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232135
46571	NC_021872	CAT	2	6	2103081	2103086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232135
46572	NC_021872	AGCTT	2	10	2103176	2103185	20 %	40 %	20 %	20 %	526232135
46573	NC_021872	CTT	2	6	2103204	2103209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232135
46574	NC_021872	CATC	2	8	2103216	2103223	25 %	25 %	0 %	50 %	526232135
46575	NC_021872	GTC	2	6	2103380	2103385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232135
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46577	NC_021872	CTT	2	6	2103492	2103497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232135
46578	NC_021872	CTT	2	6	2103528	2103533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232135
46579	NC_021872	TCC	2	6	2103571	2103576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232135
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46583	NC_021872	GTC	2	6	2103680	2103685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46584	NC_021872	CTC	2	6	2103687	2103692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46585	NC_021872	AGCT	2	8	2103736	2103743	25 %	25 %	25 %	25 %	526232136
46586	NC_021872	GCTC	2	8	2103749	2103756	0 %	25 %	25 %	50 %	526232136
46587	NC_021872	TTC	2	6	2103757	2103762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232136
46588	NC_021872	T	6	6	2103763	2103768	0 %	100 %	0 %	0 %	526232136
46589	NC_021872	ATGT	2	8	2103782	2103789	25 %	50 %	25 %	0 %	526232136
46590	NC_021872	CTT	3	9	2103810	2103818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232136
46591	NC_021872	TTC	2	6	2103898	2103903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232136
46592	NC_021872	CAT	2	6	2103936	2103941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232136
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46594	NC_021872	CTG	2	6	2103966	2103971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232136
46595	NC_021872	TTC	2	6	2103998	2104003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232136
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46597	NC_021872	TTC	2	6	2104039	2104044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232136
46598	NC_021872	CAA	2	6	2104161	2104166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232136
46599	NC_021872	GTCCCC	2	12	2104232	2104243	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	526232136
46600	NC_021872	ATCAC	2	10	2104292	2104301	40 %	20 %	0 %	40 %	526232136
46601	NC_021872	AACT	2	8	2104318	2104325	50 %	25 %	0 %	25 %	526232136
46602	NC_021872	CTA	2	6	2104344	2104349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232136
46603	NC_021872	CAAC	2	8	2104422	2104429	50 %	0 %	0 %	50 %	526232136
46604	NC_021872	TCA	2	6	2104481	2104486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232136
46605	NC_021872	AAT	2	6	2104577	2104582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232136
46606	NC_021872	CCA	2	6	2104601	2104606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232136
46607	NC_021872	ACT	2	6	2104652	2104657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232136
46608	NC_021872	ATA	2	6	2104673	2104678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232136
46609	NC_021872	TAAT	2	8	2104716	2104723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46610	NC_021872	TGG	2	6	2104800	2104805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232137
46611	NC_021872	TGA	2	6	2104821	2104826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232137
46612	NC_021872	TTC	2	6	2104860	2104865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232137
46613	NC_021872	CACTT	2	10	2104911	2104920	20 %	40 %	0 %	40 %	526232137
46614	NC_021872	CTT	2	6	2104937	2104942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232137
46615	NC_021872	TGC	2	6	2104974	2104979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232137
46616	NC_021872	ATC	2	6	2104980	2104985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232137
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46742	NC_021872	TA	3	6	2110126	2110131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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