MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021872	GTTT	2	8	184225	184232	0 %	75 %	25 %	0 %	526232182
4002	NC_021872	ATG	2	6	184243	184248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232182
4003	NC_021872	A	7	7	184337	184343	100 %	0 %	0 %	0 %	526232182
4004	NC_021872	GCG	2	6	184369	184374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232182
4005	NC_021872	ATT	2	6	184418	184423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232182
4006	NC_021872	TGC	2	6	184439	184444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232182
4007	NC_021872	AGT	2	6	184460	184465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232182
4008	NC_021872	T	6	6	184537	184542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021872	T	6	6	184544	184549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021872	A	6	6	184613	184618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021872	GAG	2	6	184644	184649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021872	ATT	2	6	184835	184840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230833
4013	NC_021872	AGC	2	6	184855	184860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230833
4014	NC_021872	C	6	6	184890	184895	0 %	0 %	0 %	100 %	526230833
4015	NC_021872	ACT	2	6	184991	184996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230833
4016	NC_021872	TTA	2	6	185030	185035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230833
4017	NC_021872	CAA	3	9	185072	185080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230833
4018	NC_021872	ATC	2	6	185081	185086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230833
4019	NC_021872	AAAG	2	8	185117	185124	75 %	0 %	25 %	0 %	526230833
4020	NC_021872	ATT	2	6	185172	185177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230834
4021	NC_021872	GGT	2	6	185178	185183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230834
4022	NC_021872	GAT	2	6	185198	185203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230834
4023	NC_021872	TTA	2	6	185236	185241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230834
4024	NC_021872	TGA	2	6	185282	185287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230834
4025	NC_021872	AACT	2	8	185426	185433	50 %	25 %	0 %	25 %	526230834
4026	NC_021872	CAGG	2	8	185481	185488	25 %	0 %	50 %	25 %	526230834
4027	NC_021872	CAG	2	6	185563	185568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230834
4028	NC_021872	AAG	2	6	185608	185613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230834
4029	NC_021872	TAA	2	6	185621	185626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230834
4030	NC_021872	ATG	2	6	185776	185781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230834
4031	NC_021872	TCT	2	6	185817	185822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230834
4032	NC_021872	ACA	2	6	185828	185833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230834
4033	NC_021872	A	6	6	185842	185847	100 %	0 %	0 %	0 %	526230834
4034	NC_021872	GAT	2	6	185913	185918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230834
4035	NC_021872	GA	3	6	185920	185925	50 %	0 %	50 %	0 %	526230834
4036	NC_021872	ATT	2	6	185968	185973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230834
4037	NC_021872	CCAT	2	8	186004	186011	25 %	25 %	0 %	50 %	526230834
4038	NC_021872	GGT	2	6	186062	186067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230834
4039	NC_021872	ACA	2	6	186107	186112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230834
4040	NC_021872	TGA	2	6	186203	186208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230834
4041	NC_021872	ATA	2	6	186294	186299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021872	A	6	6	186307	186312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021872	AG	3	6	186314	186319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021872	TGA	2	6	186330	186335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230835
4045	NC_021872	TGC	2	6	186415	186420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230835
4046	NC_021872	TGA	2	6	186421	186426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230835
4047	NC_021872	CAG	2	6	186453	186458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230835
4048	NC_021872	CAT	2	6	186530	186535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230835
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4050	NC_021872	CAA	2	6	186771	186776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230835
4051	NC_021872	GCT	2	6	186791	186796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230835
4052	NC_021872	GGT	2	6	186798	186803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230835
4053	NC_021872	TAA	2	6	186820	186825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230835
4054	NC_021872	TGC	2	6	186841	186846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230835
4055	NC_021872	TTG	2	6	186909	186914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230835
4056	NC_021872	A	6	6	186929	186934	100 %	0 %	0 %	0 %	526230835
4057	NC_021872	CA	3	6	186961	186966	50 %	0 %	0 %	50 %	526230835
4058	NC_021872	TTC	2	6	186969	186974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230835
4059	NC_021872	AT	3	6	186994	186999	50 %	50 %	0 %	0 %	526230835
4060	NC_021872	GAA	2	6	187031	187036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230835
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4062	NC_021872	AACG	2	8	187062	187069	50 %	0 %	25 %	25 %	526230835
4063	NC_021872	GAA	2	6	187085	187090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230835
4064	NC_021872	TCT	2	6	187115	187120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230835
4065	NC_021872	GCG	2	6	187303	187308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230835
4066	NC_021872	GAA	3	9	187354	187362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230835
4067	NC_021872	AGC	2	6	187438	187443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230835
4068	NC_021872	TGATT	2	10	187447	187456	20 %	60 %	20 %	0 %	526230835
4069	NC_021872	ATTCC	2	10	187490	187499	20 %	40 %	0 %	40 %	526230835
4070	NC_021872	GAT	2	6	187514	187519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230835
4071	NC_021872	CAA	2	6	187521	187526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230835
4072	NC_021872	AGA	2	6	187546	187551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230835
4073	NC_021872	TGA	2	6	187594	187599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230835
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4075	NC_021872	TG	3	6	187679	187684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021872	GTA	2	6	187731	187736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021872	GAAG	2	8	187786	187793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021872	AAG	2	6	187822	187827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021872	AACT	2	8	187843	187850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_021872	ACT	2	6	187883	187888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_021872	TAG	2	6	188054	188059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021872	AAC	2	6	188146	188151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230836
4083	NC_021872	GTA	2	6	188206	188211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230836
4084	NC_021872	AAGGTA	2	12	188224	188235	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526230836
4085	NC_021872	GCA	2	6	188316	188321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230836
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4089	NC_021872	ATA	2	6	188554	188559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230836
4090	NC_021872	AGT	2	6	188606	188611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230836
4091	NC_021872	TGA	2	6	188689	188694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230836
4092	NC_021872	CAA	2	6	188706	188711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230836
4093	NC_021872	TGA	2	6	188717	188722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230836
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4096	NC_021872	ATCT	2	8	188844	188851	25 %	50 %	0 %	25 %	526230836
4097	NC_021872	CAC	2	6	188886	188891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230836
4098	NC_021872	GAT	2	6	188907	188912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230836
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4100	NC_021872	AAAG	2	8	189119	189126	75 %	0 %	25 %	0 %	526230836
4101	NC_021872	TTA	2	6	189135	189140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230836
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4103	NC_021872	TAC	2	6	189216	189221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230836
4104	NC_021872	AACT	2	8	189232	189239	50 %	25 %	0 %	25 %	526230836
4105	NC_021872	GAA	2	6	189305	189310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230836
4106	NC_021872	TAAC	2	8	189325	189332	50 %	25 %	0 %	25 %	526230836
4107	NC_021872	CA	3	6	189406	189411	50 %	0 %	0 %	50 %	526230836
4108	NC_021872	CTAA	2	8	189432	189439	50 %	25 %	0 %	25 %	526230836
4109	NC_021872	AAC	2	6	189451	189456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230836
4110	NC_021872	TCAAT	2	10	189489	189498	40 %	40 %	0 %	20 %	526230836
4111	NC_021872	CCG	2	6	189516	189521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_021872	CGTA	2	8	189532	189539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_021872	GGT	2	6	189541	189546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021872	TTG	2	6	189684	189689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021872	AATT	2	8	189703	189710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021872	AAAT	2	8	189722	189729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021872	GGCAA	2	10	189782	189791	40 %	0 %	40 %	20 %	526230837
4118	NC_021872	AGT	2	6	189829	189834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230837
4119	NC_021872	A	6	6	189865	189870	100 %	0 %	0 %	0 %	526230837
4120	NC_021872	GGTAAG	2	12	189887	189898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	526230837
4121	NC_021872	TTC	2	6	189913	189918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230837
4122	NC_021872	TTA	2	6	189963	189968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230837
4123	NC_021872	A	7	7	189997	190003	100 %	0 %	0 %	0 %	526230837
4124	NC_021872	CTTC	2	8	190091	190098	0 %	50 %	0 %	50 %	526230837
4125	NC_021872	ACTT	2	8	190233	190240	25 %	50 %	0 %	25 %	526230837
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4248	NC_021872	CAT	2	6	197184	197189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230844
4249	NC_021872	AGC	2	6	197209	197214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230844
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4251	NC_021872	ACAG	2	8	197272	197279	50 %	0 %	25 %	25 %	526230844
4252	NC_021872	AAG	2	6	197426	197431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230844
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4266	NC_021872	CAAAT	2	10	197935	197944	60 %	20 %	0 %	20 %	526230844
4267	NC_021872	ATG	2	6	197961	197966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
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4269	NC_021872	TGA	2	6	198049	198054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
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4272	NC_021872	AGG	2	6	198243	198248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_021872	GAA	2	6	198313	198318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230845
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4312	NC_021872	T	6	6	200364	200369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4314	NC_021872	TAA	2	6	200441	200446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4368	NC_021872	CCATT	2	10	202511	202520	20 %	40 %	0 %	40 %	526230848
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