MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_021872	CTT	2	6	1991065	1991070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232051
44003	NC_021872	TCT	2	6	1991101	1991106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232051
44004	NC_021872	TAA	2	6	1991153	1991158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232051
44005	NC_021872	AAT	2	6	1991183	1991188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232051
44006	NC_021872	AGA	2	6	1991205	1991210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232051
44007	NC_021872	TCA	3	9	1991348	1991356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232051
44008	NC_021872	CGA	2	6	1991369	1991374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232051
44009	NC_021872	CCA	2	6	1991446	1991451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232051
44010	NC_021872	ATA	2	6	1991473	1991478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232051
44011	NC_021872	GAT	2	6	1991495	1991500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232051
44012	NC_021872	GCA	3	9	1991533	1991541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232051
44013	NC_021872	A	6	6	1991583	1991588	100 %	0 %	0 %	0 %	526232051
44014	NC_021872	AGT	2	6	1991595	1991600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232051
44015	NC_021872	TCT	2	6	1991659	1991664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232051
44016	NC_021872	AT	3	6	1991719	1991724	50 %	50 %	0 %	0 %	526232051
44017	NC_021872	ATC	2	6	1991748	1991753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232051
44018	NC_021872	CTT	2	6	1991769	1991774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232051
44019	NC_021872	AATA	2	8	1991784	1991791	75 %	25 %	0 %	0 %	526232051
44020	NC_021872	TAT	2	6	1991801	1991806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232051
44021	NC_021872	TAC	2	6	1991814	1991819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232051
44022	NC_021872	A	7	7	1991836	1991842	100 %	0 %	0 %	0 %	526232051
44023	NC_021872	TTC	2	6	1991898	1991903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232051
44024	NC_021872	TCA	2	6	1991974	1991979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232051
44025	NC_021872	GTC	2	6	1991990	1991995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232051
44026	NC_021872	ACT	2	6	1992022	1992027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232051
44027	NC_021872	CGA	2	6	1992076	1992081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232051
44028	NC_021872	TTAA	2	8	1992115	1992122	50 %	50 %	0 %	0 %	526232051
44029	NC_021872	AAT	2	6	1992135	1992140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232051
44030	NC_021872	AAC	2	6	1992147	1992152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232051
44031	NC_021872	TAA	2	6	1992181	1992186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44032	NC_021872	TAG	2	6	1992193	1992198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44033	NC_021872	ATT	2	6	1992220	1992225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44034	NC_021872	CAG	2	6	1992237	1992242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44035	NC_021872	ATT	2	6	1992251	1992256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232052
44036	NC_021872	ACG	2	6	1992267	1992272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232052
44037	NC_021872	CGT	2	6	1992330	1992335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232052
44038	NC_021872	AGT	2	6	1992354	1992359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232052
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44042	NC_021872	GCT	2	6	1992514	1992519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232052
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44049	NC_021872	ACTA	2	8	1993053	1993060	50 %	25 %	0 %	25 %	526232052
44050	NC_021872	TTAA	2	8	1993066	1993073	50 %	50 %	0 %	0 %	526232052
44051	NC_021872	AAT	2	6	1993077	1993082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232052
44052	NC_021872	TAA	2	6	1993103	1993108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232052
44053	NC_021872	AGCC	2	8	1993123	1993130	25 %	0 %	25 %	50 %	526232052
44054	NC_021872	A	6	6	1993167	1993172	100 %	0 %	0 %	0 %	526232052
44055	NC_021872	AAG	2	6	1993191	1993196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232052
44056	NC_021872	GTA	2	6	1993225	1993230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232052
44057	NC_021872	A	6	6	1993276	1993281	100 %	0 %	0 %	0 %	526232052
44058	NC_021872	CAA	2	6	1993370	1993375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232052
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44060	NC_021872	A	6	6	1993433	1993438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44061	NC_021872	AATT	2	8	1993481	1993488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44062	NC_021872	TAA	2	6	1993514	1993519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232053
44063	NC_021872	TGAT	2	8	1993525	1993532	25 %	50 %	25 %	0 %	526232053
44064	NC_021872	AGC	2	6	1993534	1993539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232053
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44066	NC_021872	TGC	2	6	1993630	1993635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232053
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44070	NC_021872	TGGC	2	8	1993806	1993813	0 %	25 %	50 %	25 %	526232053
44071	NC_021872	GCC	2	6	1993822	1993827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232053
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44086	NC_021872	TTAT	2	8	1994437	1994444	25 %	75 %	0 %	0 %	526232620
44087	NC_021872	TCC	2	6	1994455	1994460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232620
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44091	NC_021872	CTG	2	6	1994592	1994597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232620
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44094	NC_021872	GAA	2	6	1994711	1994716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_021872	CAAA	2	8	1994746	1994753	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44096	NC_021872	TCT	2	6	1994811	1994816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232054
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44100	NC_021872	CCT	2	6	1995051	1995056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232054
44101	NC_021872	TTC	2	6	1995128	1995133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232054
44102	NC_021872	ATC	2	6	1995135	1995140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232054
44103	NC_021872	CCA	2	6	1995182	1995187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232054
44104	NC_021872	TTA	2	6	1995189	1995194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232054
44105	NC_021872	TCA	2	6	1995207	1995212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232054
44106	NC_021872	AAT	2	6	1995213	1995218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232054
44107	NC_021872	GTT	2	6	1995224	1995229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232054
44108	NC_021872	CCA	2	6	1995273	1995278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232054
44109	NC_021872	GCT	3	9	1995287	1995295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232054
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44111	NC_021872	TTA	2	6	1995444	1995449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232054
44112	NC_021872	CAAT	2	8	1995478	1995485	50 %	25 %	0 %	25 %	526232054
44113	NC_021872	TCA	2	6	1995495	1995500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232054
44114	NC_021872	ATT	2	6	1995611	1995616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232054
44115	NC_021872	CTT	2	6	1995695	1995700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232054
44116	NC_021872	ATA	2	6	1995704	1995709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232054
44117	NC_021872	TCA	3	9	1995828	1995836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232054
44118	NC_021872	TTC	2	6	1995962	1995967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232054
44119	NC_021872	ATT	2	6	1995984	1995989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232054
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44122	NC_021872	CAT	2	6	1996120	1996125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232054
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44133	NC_021872	CTT	2	6	1996445	1996450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232054
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44227	NC_021872	TA	3	6	2000670	2000675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44229	NC_021872	T	6	6	2000719	2000724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44230	NC_021872	TAT	2	6	2000814	2000819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44231	NC_021872	ATT	2	6	2000860	2000865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232059
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44233	NC_021872	TTC	2	6	2001002	2001007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232059
44234	NC_021872	TTG	2	6	2001017	2001022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232059
44235	NC_021872	TCAT	2	8	2001027	2001034	25 %	50 %	0 %	25 %	526232059
44236	NC_021872	CAGC	2	8	2001058	2001065	25 %	0 %	25 %	50 %	526232622
44237	NC_021872	ATC	2	6	2001082	2001087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232622
44238	NC_021872	CTC	2	6	2001091	2001096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232622
44239	NC_021872	TTG	2	6	2001097	2001102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232622
44240	NC_021872	ATA	2	6	2001117	2001122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232622
44241	NC_021872	TTG	2	6	2001139	2001144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232622
44242	NC_021872	AATA	2	8	2001253	2001260	75 %	25 %	0 %	0 %	526232622
44243	NC_021872	CTT	2	6	2001273	2001278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232622
44244	NC_021872	TGG	2	6	2001310	2001315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232622
44245	NC_021872	CGT	2	6	2001427	2001432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232622
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44248	NC_021872	TCA	3	9	2001638	2001646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232622
44249	NC_021872	TCA	2	6	2001717	2001722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232622
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44254	NC_021872	ATA	2	6	2002045	2002050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232060
44255	NC_021872	CTT	2	6	2002055	2002060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44256	NC_021872	TAAT	2	8	2002063	2002070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44257	NC_021872	GTA	2	6	2002140	2002145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232061
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44259	NC_021872	GTA	2	6	2002177	2002182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232061
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44264	NC_021872	GCT	2	6	2002415	2002420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232061
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44266	NC_021872	CAA	2	6	2002469	2002474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232061
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44285	NC_021872	TGAT	2	8	2003116	2003123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44286	NC_021872	CTTC	2	8	2003131	2003138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44287	NC_021872	AAT	2	6	2003155	2003160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232623
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44313	NC_021872	TAT	2	6	2004338	2004343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44321	NC_021872	T	6	6	2004716	2004721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44322	NC_021872	A	6	6	2004725	2004730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44323	NC_021872	AG	3	6	2004733	2004738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44324	NC_021872	A	7	7	2004744	2004750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44325	NC_021872	T	6	6	2004757	2004762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44326	NC_021872	CT	3	6	2004768	2004773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44327	NC_021872	TGA	2	6	2004790	2004795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44328	NC_021872	TTA	2	6	2004833	2004838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44331	NC_021872	TGC	2	6	2004888	2004893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232063
44332	NC_021872	TCA	2	6	2004976	2004981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232063
44333	NC_021872	CTG	2	6	2005031	2005036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232063
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44339	NC_021872	TTTC	2	8	2005313	2005320	0 %	75 %	0 %	25 %	526232063
44340	NC_021872	TTG	2	6	2005326	2005331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232063
44341	NC_021872	AATT	2	8	2005479	2005486	50 %	50 %	0 %	0 %	526232063
44342	NC_021872	CCA	2	6	2005487	2005492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232063
44343	NC_021872	TGT	2	6	2005513	2005518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232063
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44345	NC_021872	TGT	2	6	2005543	2005548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232063
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44349	NC_021872	ATG	2	6	2005735	2005740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232063
44350	NC_021872	CCG	2	6	2005766	2005771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232063
44351	NC_021872	CATC	2	8	2005776	2005783	25 %	25 %	0 %	50 %	526232063
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44353	NC_021872	TAA	3	9	2005869	2005877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232063
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44355	NC_021872	TTA	2	6	2005919	2005924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232063
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44358	NC_021872	AATT	2	8	2006098	2006105	50 %	50 %	0 %	0 %	526232064
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44465	NC_021872	AAGT	2	8	2012252	2012259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44467	NC_021872	A	6	6	2012381	2012386	100 %	0 %	0 %	0 %	526232624
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44491	NC_021872	AT	5	10	2013519	2013528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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