MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_021872	GAAG	2	8	1852474	1852481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41002	NC_021872	ACA	2	6	1852573	1852578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231944
41003	NC_021872	TA	3	6	1852596	1852601	50 %	50 %	0 %	0 %	526231944
41004	NC_021872	TAA	2	6	1852606	1852611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231944
41005	NC_021872	TAA	2	6	1852667	1852672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231944
41006	NC_021872	AAC	2	6	1852744	1852749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231944
41007	NC_021872	ACT	2	6	1852773	1852778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231944
41008	NC_021872	AAATC	2	10	1852835	1852844	60 %	20 %	0 %	20 %	526231944
41009	NC_021872	TCG	2	6	1852916	1852921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231944
41010	NC_021872	TTG	2	6	1853024	1853029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231944
41011	NC_021872	TTG	2	6	1853086	1853091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231944
41012	NC_021872	ATT	2	6	1853092	1853097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231944
41013	NC_021872	TATC	2	8	1853177	1853184	25 %	50 %	0 %	25 %	526231944
41014	NC_021872	ATT	3	9	1853205	1853213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231944
41015	NC_021872	A	6	6	1853340	1853345	100 %	0 %	0 %	0 %	526231944
41016	NC_021872	AGT	2	6	1853369	1853374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231944
41017	NC_021872	GCG	2	6	1853383	1853388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231944
41018	NC_021872	AT	3	6	1853396	1853401	50 %	50 %	0 %	0 %	526231944
41019	NC_021872	CCA	2	6	1853521	1853526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231944
41020	NC_021872	A	6	6	1853539	1853544	100 %	0 %	0 %	0 %	526231944
41021	NC_021872	ATA	2	6	1853584	1853589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231944
41022	NC_021872	ACT	2	6	1853620	1853625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231944
41023	NC_021872	T	6	6	1853728	1853733	0 %	100 %	0 %	0 %	526231944
41024	NC_021872	A	6	6	1853737	1853742	100 %	0 %	0 %	0 %	526231944
41025	NC_021872	TTAG	2	8	1853833	1853840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41026	NC_021872	TGTT	2	8	1853952	1853959	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41027	NC_021872	AATT	2	8	1853961	1853968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41028	NC_021872	TTC	2	6	1853997	1854002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232604
41029	NC_021872	AAC	3	9	1854027	1854035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232604
41030	NC_021872	CAT	2	6	1854038	1854043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41031	NC_021872	TCA	2	6	1854088	1854093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41032	NC_021872	TAA	2	6	1854098	1854103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41033	NC_021872	TTTA	2	8	1854117	1854124	25 %	75 %	0 %	0 %	526232604
41034	NC_021872	TTC	2	6	1854151	1854156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232604
41035	NC_021872	AGT	2	6	1854236	1854241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232604
41036	NC_021872	TAT	2	6	1854266	1854271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41037	NC_021872	AAT	2	6	1854396	1854401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41038	NC_021872	TCA	2	6	1854406	1854411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41039	NC_021872	TAA	2	6	1854521	1854526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41040	NC_021872	ATC	2	6	1854534	1854539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41041	NC_021872	AGATT	2	10	1854566	1854575	40 %	40 %	20 %	0 %	526232604
41042	NC_021872	GAT	2	6	1854716	1854721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232604
41043	NC_021872	ATC	2	6	1854723	1854728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41044	NC_021872	A	7	7	1854804	1854810	100 %	0 %	0 %	0 %	526232604
41045	NC_021872	TCAC	2	8	1854862	1854869	25 %	25 %	0 %	50 %	526232604
41046	NC_021872	TGT	2	6	1854894	1854899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232604
41047	NC_021872	CTT	2	6	1854938	1854943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232604
41048	NC_021872	ATT	2	6	1854948	1854953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41049	NC_021872	TGT	2	6	1854977	1854982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232604
41050	NC_021872	GAA	2	6	1855009	1855014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232604
41051	NC_021872	TCG	2	6	1855058	1855063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232604
41052	NC_021872	ATC	2	6	1855069	1855074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41053	NC_021872	CAT	2	6	1855166	1855171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41054	NC_021872	TTGC	2	8	1855278	1855285	0 %	50 %	25 %	25 %	526232604
41055	NC_021872	AAGTG	2	10	1855295	1855304	40 %	20 %	40 %	0 %	526232604
41056	NC_021872	CAT	2	6	1855319	1855324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41057	NC_021872	CATAGT	2	12	1855340	1855351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526232604
41058	NC_021872	GCC	2	6	1855374	1855379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232604
41059	NC_021872	TTA	2	6	1855381	1855386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41060	NC_021872	T	6	6	1855398	1855403	0 %	100 %	0 %	0 %	526232604
41061	NC_021872	TAT	2	6	1855427	1855432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41062	NC_021872	A	6	6	1855440	1855445	100 %	0 %	0 %	0 %	526232604
41063	NC_021872	ATT	2	6	1855449	1855454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41064	NC_021872	TTA	3	9	1855489	1855497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41065	NC_021872	CAA	2	6	1855523	1855528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232604
41066	NC_021872	ATTA	2	8	1855560	1855567	50 %	50 %	0 %	0 %	526232604
41067	NC_021872	GAG	2	6	1855574	1855579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232604
41068	NC_021872	TTA	2	6	1855609	1855614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41069	NC_021872	TAA	2	6	1855670	1855675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41070	NC_021872	TCC	2	6	1855698	1855703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232604
41071	NC_021872	CTAT	2	8	1855822	1855829	25 %	50 %	0 %	25 %	526232604
41072	NC_021872	TAA	2	6	1855841	1855846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41073	NC_021872	TAA	2	6	1855874	1855879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41074	NC_021872	ATA	2	6	1855925	1855930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41075	NC_021872	AAAT	2	8	1855959	1855966	75 %	25 %	0 %	0 %	526232604
41076	NC_021872	AAT	2	6	1855973	1855978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41077	NC_021872	ATT	2	6	1855989	1855994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41078	NC_021872	CTT	2	6	1856001	1856006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232604
41079	NC_021872	ATTT	2	8	1856021	1856028	25 %	75 %	0 %	0 %	526232604
41080	NC_021872	TGG	2	6	1856034	1856039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232604
41081	NC_021872	TAC	3	9	1856046	1856054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41082	NC_021872	TCA	2	6	1856078	1856083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41083	NC_021872	ATG	2	6	1856190	1856195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232604
41084	NC_021872	TGT	2	6	1856275	1856280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232604
41085	NC_021872	TCG	2	6	1856361	1856366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232604
41086	NC_021872	TCA	2	6	1856384	1856389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41087	NC_021872	ATT	2	6	1856445	1856450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232604
41088	NC_021872	GAG	2	6	1856479	1856484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232604
41089	NC_021872	CTC	2	6	1856490	1856495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232604
41090	NC_021872	AT	3	6	1856526	1856531	50 %	50 %	0 %	0 %	526232604
41091	NC_021872	GCT	2	6	1856582	1856587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232604
41092	NC_021872	TGT	2	6	1856718	1856723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232604
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41094	NC_021872	T	7	7	1856766	1856772	0 %	100 %	0 %	0 %	526232604
41095	NC_021872	AAT	2	6	1856832	1856837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41096	NC_021872	TCT	3	9	1856869	1856877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232604
41097	NC_021872	TCA	2	6	1856884	1856889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41098	NC_021872	ACAA	2	8	1856926	1856933	75 %	0 %	0 %	25 %	526232604
41099	NC_021872	T	6	6	1856954	1856959	0 %	100 %	0 %	0 %	526232604
41100	NC_021872	TCTG	2	8	1856992	1856999	0 %	50 %	25 %	25 %	526232604
41101	NC_021872	ATC	2	6	1857102	1857107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41102	NC_021872	CTA	2	6	1857178	1857183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232604
41103	NC_021872	GGTA	2	8	1857184	1857191	25 %	25 %	50 %	0 %	526232604
41104	NC_021872	AAT	2	6	1857219	1857224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
41105	NC_021872	ACTA	2	8	1857309	1857316	50 %	25 %	0 %	25 %	526232604
41106	NC_021872	CTAT	2	8	1857457	1857464	25 %	50 %	0 %	25 %	526232604
41107	NC_021872	ATCACT	2	12	1857608	1857619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232605
41108	NC_021872	ACT	2	6	1857684	1857689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232605
41109	NC_021872	CAT	2	6	1857877	1857882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232605
41110	NC_021872	GCT	2	6	1857934	1857939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232605
41111	NC_021872	GTT	2	6	1857985	1857990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232605
41112	NC_021872	TCA	2	6	1858041	1858046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232605
41113	NC_021872	CTT	2	6	1858121	1858126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232605
41114	NC_021872	TATC	2	8	1858200	1858207	25 %	50 %	0 %	25 %	526232605
41115	NC_021872	ATC	2	6	1858277	1858282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232605
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41117	NC_021872	TCT	2	6	1858299	1858304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232605
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41188	NC_021872	CTT	2	6	1861117	1861122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232605
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41198	NC_021872	GATC	2	8	1861498	1861505	25 %	25 %	25 %	25 %	526232606
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41217	NC_021872	GT	3	6	1862310	1862315	0 %	50 %	50 %	0 %	526232607
41218	NC_021872	CTT	2	6	1862319	1862324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232607
41219	NC_021872	ATC	2	6	1862399	1862404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232607
41220	NC_021872	ATT	2	6	1862418	1862423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41221	NC_021872	TAAA	2	8	1862424	1862431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41222	NC_021872	ATC	2	6	1862455	1862460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41223	NC_021872	GTCA	2	8	1862489	1862496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41224	NC_021872	TTGTT	2	10	1862503	1862512	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41225	NC_021872	A	6	6	1862513	1862518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41226	NC_021872	AATAC	2	10	1862538	1862547	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41227	NC_021872	CAT	2	6	1862556	1862561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41228	NC_021872	A	6	6	1862582	1862587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41229	NC_021872	TAT	2	6	1862619	1862624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41230	NC_021872	TTA	2	6	1862640	1862645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41231	NC_021872	AAT	2	6	1862696	1862701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41232	NC_021872	TCA	2	6	1862732	1862737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41233	NC_021872	TAA	2	6	1862742	1862747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41234	NC_021872	AT	3	6	1862799	1862804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41235	NC_021872	A	6	6	1862877	1862882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41236	NC_021872	GAT	2	6	1862928	1862933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41237	NC_021872	TAC	2	6	1863058	1863063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41238	NC_021872	AGT	2	6	1863107	1863112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41239	NC_021872	AAG	2	6	1863118	1863123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41240	NC_021872	A	7	7	1863166	1863172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41241	NC_021872	AGA	2	6	1863211	1863216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41244	NC_021872	TAT	3	9	1863283	1863291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41245	NC_021872	TTA	2	6	1863331	1863336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41354	NC_021872	AT	3	6	1868811	1868816	50 %	50 %	0 %	0 %	526231948
41355	NC_021872	TGA	2	6	1868836	1868841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231948
41356	NC_021872	GCT	2	6	1868866	1868871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231948
41357	NC_021872	CAT	2	6	1868926	1868931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231948
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41359	NC_021872	CGT	2	6	1869041	1869046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231948
41360	NC_021872	TGA	2	6	1869060	1869065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231948
41361	NC_021872	GTC	2	6	1869096	1869101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231948
41362	NC_021872	CCG	2	6	1869169	1869174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231948
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41378	NC_021872	ATTA	2	8	1869842	1869849	50 %	50 %	0 %	0 %	526231948
41379	NC_021872	CAT	2	6	1869854	1869859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231948
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41383	NC_021872	A	7	7	1870031	1870037	100 %	0 %	0 %	0 %	526231948
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41387	NC_021872	ATT	2	6	1870113	1870118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231948
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41389	NC_021872	ACTA	2	8	1870130	1870137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41390	NC_021872	ATTTT	2	10	1870156	1870165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41391	NC_021872	TTAA	2	8	1870248	1870255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41392	NC_021872	A	6	6	1870283	1870288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41413	NC_021872	T	6	6	1871184	1871189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41414	NC_021872	T	6	6	1871201	1871206	0 %	100 %	0 %	0 %	526231950
41415	NC_021872	TACT	2	8	1871210	1871217	25 %	50 %	0 %	25 %	526231950
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41422	NC_021872	TATTG	2	10	1871556	1871565	20 %	60 %	20 %	0 %	526231950
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41426	NC_021872	TAG	2	6	1871693	1871698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231950
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41442	NC_021872	AATC	2	8	1872620	1872627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41443	NC_021872	CCTA	2	8	1872637	1872644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41444	NC_021872	ATT	2	6	1872657	1872662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231951
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41446	NC_021872	ATCGT	2	10	1872740	1872749	20 %	40 %	20 %	20 %	526231951
41447	NC_021872	ATTTTG	2	12	1872772	1872783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	526231951
41448	NC_021872	TCA	2	6	1872831	1872836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231951
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41451	NC_021872	AT	3	6	1873001	1873006	50 %	50 %	0 %	0 %	526231951
41452	NC_021872	TCC	2	6	1873060	1873065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231951
41453	NC_021872	TCG	2	6	1873155	1873160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231951
41454	NC_021872	AT	4	8	1873177	1873184	50 %	50 %	0 %	0 %	526231951
41455	NC_021872	CATC	2	8	1873233	1873240	25 %	25 %	0 %	50 %	526231951
41456	NC_021872	CTA	2	6	1873242	1873247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231951
41457	NC_021872	GCA	2	6	1873283	1873288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231951
41458	NC_021872	ATC	2	6	1873351	1873356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231951
41459	NC_021872	TCA	2	6	1873373	1873378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231951
41460	NC_021872	CTT	2	6	1873434	1873439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231951
41461	NC_021872	CTT	2	6	1873485	1873490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231951
41462	NC_021872	GACA	2	8	1873567	1873574	50 %	0 %	25 %	25 %	526231951
41463	NC_021872	AGC	2	6	1873582	1873587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231951
41464	NC_021872	TTG	2	6	1873597	1873602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231951
41465	NC_021872	TGC	2	6	1873623	1873628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231951
41466	NC_021872	CTT	2	6	1873658	1873663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231951
41467	NC_021872	AAT	2	6	1873675	1873680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231951
41468	NC_021872	CAT	2	6	1873710	1873715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231951
41469	NC_021872	T	6	6	1873740	1873745	0 %	100 %	0 %	0 %	526231951
41470	NC_021872	CTT	2	6	1873937	1873942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231951
41471	NC_021872	ATA	3	9	1873985	1873993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231951
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41473	NC_021872	TTC	2	6	1874026	1874031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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