MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_021872	TGC	2	6	1619225	1619230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36002	NC_021872	CTTTT	2	10	1619242	1619251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36003	NC_021872	TAGT	2	8	1619326	1619333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36004	NC_021872	AGAA	2	8	1619341	1619348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36005	NC_021872	CAATG	2	10	1619428	1619437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36006	NC_021872	ATT	2	6	1619444	1619449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36007	NC_021872	TTAA	2	8	1619526	1619533	50 %	50 %	0 %	0 %	526232557
36008	NC_021872	ATC	2	6	1619627	1619632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
36009	NC_021872	ATA	2	6	1619633	1619638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
36010	NC_021872	ACC	2	6	1619648	1619653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232557
36011	NC_021872	ACC	2	6	1619657	1619662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232557
36012	NC_021872	AAT	2	6	1619672	1619677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
36013	NC_021872	CTC	2	6	1619711	1619716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232557
36014	NC_021872	T	6	6	1619734	1619739	0 %	100 %	0 %	0 %	526232557
36015	NC_021872	TAA	2	6	1619807	1619812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
36016	NC_021872	CTGA	2	8	1619869	1619876	25 %	25 %	25 %	25 %	526232557
36017	NC_021872	CAT	2	6	1619908	1619913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
36018	NC_021872	TAC	3	9	1619974	1619982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
36019	NC_021872	CTG	2	6	1620137	1620142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232557
36020	NC_021872	TCT	2	6	1620165	1620170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232557
36021	NC_021872	ATA	2	6	1620198	1620203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
36022	NC_021872	AGC	2	6	1620239	1620244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232557
36023	NC_021872	TG	3	6	1620263	1620268	0 %	50 %	50 %	0 %	526232557
36024	NC_021872	AGAA	2	8	1620302	1620309	75 %	0 %	25 %	0 %	526232557
36025	NC_021872	TCA	2	6	1620315	1620320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
36026	NC_021872	GGTT	2	8	1620364	1620371	0 %	50 %	50 %	0 %	526232557
36027	NC_021872	ATTTT	2	10	1620384	1620393	20 %	80 %	0 %	0 %	526232557
36028	NC_021872	T	6	6	1620390	1620395	0 %	100 %	0 %	0 %	526232557
36029	NC_021872	ACG	2	6	1620428	1620433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232557
36030	NC_021872	ATC	2	6	1620443	1620448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
36031	NC_021872	GTT	2	6	1620500	1620505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232557
36032	NC_021872	CTG	2	6	1620538	1620543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232557
36033	NC_021872	TTC	2	6	1620647	1620652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232557
36034	NC_021872	TAA	2	6	1620707	1620712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
36035	NC_021872	TGA	2	6	1620743	1620748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232557
36036	NC_021872	ATC	2	6	1620752	1620757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
36037	NC_021872	TGG	2	6	1620789	1620794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232557
36038	NC_021872	AAT	2	6	1620811	1620816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
36039	NC_021872	CAG	2	6	1620835	1620840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232557
36040	NC_021872	A	6	6	1620868	1620873	100 %	0 %	0 %	0 %	526232557
36041	NC_021872	CATTT	2	10	1620917	1620926	20 %	60 %	0 %	20 %	526232557
36042	NC_021872	TAT	2	6	1621023	1621028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232558
36043	NC_021872	CGT	2	6	1621055	1621060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232558
36044	NC_021872	TG	3	6	1621162	1621167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36045	NC_021872	AAAG	2	8	1621195	1621202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36046	NC_021872	CAAG	2	8	1621244	1621251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36047	NC_021872	TAG	2	6	1621296	1621301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36048	NC_021872	T	6	6	1621333	1621338	0 %	100 %	0 %	0 %	526232559
36049	NC_021872	GGC	2	6	1621351	1621356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232559
36050	NC_021872	GTT	2	6	1621417	1621422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232559
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36052	NC_021872	GA	3	6	1621569	1621574	50 %	0 %	50 %	0 %	526232559
36053	NC_021872	TCA	2	6	1621588	1621593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232559
36054	NC_021872	CCA	2	6	1621634	1621639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36055	NC_021872	TGA	2	6	1621722	1621727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36056	NC_021872	TTC	2	6	1621739	1621744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36057	NC_021872	AATT	2	8	1621784	1621791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36058	NC_021872	A	7	7	1621806	1621812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36059	NC_021872	GCTT	2	8	1621925	1621932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36060	NC_021872	T	6	6	1621931	1621936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36061	NC_021872	A	8	8	1621947	1621954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36062	NC_021872	AAT	2	6	1622011	1622016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232560
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36068	NC_021872	ACT	2	6	1622365	1622370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232560
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36072	NC_021872	TTC	2	6	1622629	1622634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232560
36073	NC_021872	TCC	2	6	1622648	1622653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36074	NC_021872	TCA	3	9	1622672	1622680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231793
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36085	NC_021872	CAATC	2	10	1623018	1623027	40 %	20 %	0 %	40 %	526231793
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36091	NC_021872	T	6	6	1623373	1623378	0 %	100 %	0 %	0 %	526231794
36092	NC_021872	TTAG	2	8	1623384	1623391	25 %	50 %	25 %	0 %	526231794
36093	NC_021872	ATG	2	6	1623394	1623399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231794
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36095	NC_021872	TAAA	2	8	1623482	1623489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36096	NC_021872	ATC	2	6	1623498	1623503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232561
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36099	NC_021872	TCAT	2	8	1623659	1623666	25 %	50 %	0 %	25 %	526232561
36100	NC_021872	GACTA	2	10	1623703	1623712	40 %	20 %	20 %	20 %	526232561
36101	NC_021872	TGA	2	6	1623941	1623946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
36102	NC_021872	TAA	2	6	1624156	1624161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232561
36103	NC_021872	TAA	2	6	1624186	1624191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232561
36104	NC_021872	GGT	2	6	1624302	1624307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232561
36105	NC_021872	GTT	2	6	1624314	1624319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232561
36106	NC_021872	AAT	2	6	1624339	1624344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232561
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36108	NC_021872	TAA	2	6	1624637	1624642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232561
36109	NC_021872	CTT	2	6	1624692	1624697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232561
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36111	NC_021872	GTA	2	6	1624724	1624729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
36112	NC_021872	GTA	2	6	1624745	1624750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
36113	NC_021872	TCACCG	2	12	1624752	1624763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526232561
36114	NC_021872	TAAC	2	8	1624815	1624822	50 %	25 %	0 %	25 %	526232561
36115	NC_021872	TTAA	2	8	1624907	1624914	50 %	50 %	0 %	0 %	526232561
36116	NC_021872	TCA	2	6	1624949	1624954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232561
36117	NC_021872	TCA	2	6	1624970	1624975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232561
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36119	NC_021872	GAG	2	6	1624992	1624997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232561
36120	NC_021872	GCT	2	6	1625010	1625015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232561
36121	NC_021872	ACCA	2	8	1625062	1625069	50 %	0 %	0 %	50 %	526232561
36122	NC_021872	CGC	2	6	1625089	1625094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232561
36123	NC_021872	ATG	2	6	1625175	1625180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
36124	NC_021872	TAA	2	6	1625290	1625295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232561
36125	NC_021872	TCAG	2	8	1625330	1625337	25 %	25 %	25 %	25 %	526232561
36126	NC_021872	CCT	2	6	1625366	1625371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36127	NC_021872	AAGAA	2	10	1625389	1625398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36128	NC_021872	TCA	2	6	1625419	1625424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36129	NC_021872	ATC	3	9	1625561	1625569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231795
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36134	NC_021872	TAA	2	6	1625734	1625739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231795
36135	NC_021872	ATA	2	6	1625773	1625778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231795
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36140	NC_021872	AAT	2	6	1625974	1625979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36142	NC_021872	GGCT	2	8	1626005	1626012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36143	NC_021872	GAA	2	6	1626080	1626085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231796
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36157	NC_021872	A	7	7	1626720	1626726	100 %	0 %	0 %	0 %	526231796
36158	NC_021872	ATGG	2	8	1626799	1626806	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36159	NC_021872	TTC	2	6	1626836	1626841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231797
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36212	NC_021872	AGT	2	6	1629617	1629622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36218	NC_021872	A	7	7	1629825	1629831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36219	NC_021872	TCA	2	6	1629914	1629919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232562
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36224	NC_021872	AG	3	6	1630221	1630226	50 %	0 %	50 %	0 %	526232562
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36228	NC_021872	TG	3	6	1630461	1630466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36229	NC_021872	TAAC	2	8	1630530	1630537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36230	NC_021872	ATC	2	6	1630562	1630567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36231	NC_021872	CGT	2	6	1630640	1630645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231800
36232	NC_021872	CTTT	2	8	1630756	1630763	0 %	75 %	0 %	25 %	526231800
36233	NC_021872	ACA	2	6	1630830	1630835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231800
36234	NC_021872	TTC	2	6	1630874	1630879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231800
36235	NC_021872	CAA	3	9	1630888	1630896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231800
36236	NC_021872	GTG	2	6	1631128	1631133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231800
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36348	NC_021872	A	6	6	1636403	1636408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36349	NC_021872	TAA	2	6	1636464	1636469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231805
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36354	NC_021872	TTGTGC	2	12	1636691	1636702	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526231805
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36385	NC_021872	AAC	2	6	1637894	1637899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231806
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