MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_021872	AAT	2	6	1555786	1555791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231762
34503	NC_021872	GGTT	2	8	1555869	1555876	0 %	50 %	50 %	0 %	526232532
34504	NC_021872	GCA	2	6	1555879	1555884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232532
34505	NC_021872	CAT	2	6	1555976	1555981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232532
34506	NC_021872	AAG	2	6	1556029	1556034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232532
34507	NC_021872	GGT	2	6	1556069	1556074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232532
34508	NC_021872	CAA	2	6	1556135	1556140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232532
34509	NC_021872	TTTG	2	8	1556179	1556186	0 %	75 %	25 %	0 %	526232532
34510	NC_021872	GCT	2	6	1556188	1556193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232532
34511	NC_021872	TAAAGT	2	12	1556261	1556272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526232532
34512	NC_021872	CTT	2	6	1556283	1556288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232532
34513	NC_021872	CGG	2	6	1556342	1556347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232532
34514	NC_021872	TAA	2	6	1556351	1556356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232532
34515	NC_021872	TGT	2	6	1556376	1556381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232532
34516	NC_021872	TGT	2	6	1556423	1556428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232533
34517	NC_021872	TAA	2	6	1556437	1556442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232533
34518	NC_021872	TTC	2	6	1556459	1556464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232533
34519	NC_021872	TTA	2	6	1556498	1556503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232533
34520	NC_021872	TCT	2	6	1556528	1556533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232533
34521	NC_021872	GCT	2	6	1556585	1556590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232533
34522	NC_021872	CGTG	2	8	1556604	1556611	0 %	25 %	50 %	25 %	526232533
34523	NC_021872	CGC	2	6	1556706	1556711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232533
34524	NC_021872	ACT	2	6	1556744	1556749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232533
34525	NC_021872	TTC	2	6	1556809	1556814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232533
34526	NC_021872	GCAT	2	8	1556825	1556832	25 %	25 %	25 %	25 %	526232533
34527	NC_021872	TCA	2	6	1556837	1556842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232533
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34529	NC_021872	T	6	6	1556907	1556912	0 %	100 %	0 %	0 %	526232533
34530	NC_021872	GCT	2	6	1556915	1556920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232533
34531	NC_021872	ATA	2	6	1556950	1556955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232533
34532	NC_021872	TGT	2	6	1556958	1556963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232533
34533	NC_021872	CAAA	2	8	1556974	1556981	75 %	0 %	0 %	25 %	526232533
34534	NC_021872	AAT	2	6	1557092	1557097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232533
34535	NC_021872	ATA	2	6	1557178	1557183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232533
34536	NC_021872	ATC	2	6	1557185	1557190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232533
34537	NC_021872	CCA	2	6	1557260	1557265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232533
34538	NC_021872	ATT	2	6	1557272	1557277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232533
34539	NC_021872	CCT	2	6	1557291	1557296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34540	NC_021872	A	6	6	1557379	1557384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34541	NC_021872	TTC	2	6	1557396	1557401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34542	NC_021872	GTG	2	6	1557428	1557433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34543	NC_021872	TTG	2	6	1557463	1557468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34544	NC_021872	CTT	2	6	1557522	1557527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34545	NC_021872	ACG	2	6	1557541	1557546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34546	NC_021872	TTA	2	6	1557557	1557562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34547	NC_021872	TC	3	6	1557636	1557641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34548	NC_021872	ATG	2	6	1557751	1557756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34549	NC_021872	CTA	2	6	1557792	1557797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34550	NC_021872	GATA	2	8	1557894	1557901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34551	NC_021872	ACG	2	6	1557928	1557933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34552	NC_021872	TCA	2	6	1558052	1558057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34553	NC_021872	AAT	2	6	1558063	1558068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34554	NC_021872	ACG	2	6	1558153	1558158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34555	NC_021872	AGC	2	6	1558261	1558266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34556	NC_021872	CTTT	2	8	1558355	1558362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34557	NC_021872	T	6	6	1558404	1558409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34558	NC_021872	TA	3	6	1558457	1558462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34559	NC_021872	AGC	2	6	1558468	1558473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34560	NC_021872	ACT	2	6	1558626	1558631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
34561	NC_021872	TGC	2	6	1558644	1558649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232534
34562	NC_021872	TTG	2	6	1558725	1558730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232534
34563	NC_021872	CAT	2	6	1558757	1558762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
34564	NC_021872	T	6	6	1558837	1558842	0 %	100 %	0 %	0 %	526232534
34565	NC_021872	ACA	2	6	1558843	1558848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232534
34566	NC_021872	TTG	2	6	1558870	1558875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232534
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34568	NC_021872	GCT	2	6	1558978	1558983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232534
34569	NC_021872	TTAC	2	8	1559071	1559078	25 %	50 %	0 %	25 %	526232534
34570	NC_021872	AGT	2	6	1559103	1559108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232534
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34572	NC_021872	AAT	2	6	1559252	1559257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232534
34573	NC_021872	AGC	2	6	1559280	1559285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232534
34574	NC_021872	CAT	2	6	1559399	1559404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
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34578	NC_021872	TGAT	2	8	1559493	1559500	25 %	50 %	25 %	0 %	526232534
34579	NC_021872	TAG	2	6	1559534	1559539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232534
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34589	NC_021872	CAA	2	6	1560119	1560124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232534
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34592	NC_021872	ATA	2	6	1560186	1560191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232534
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34599	NC_021872	TAC	2	6	1560659	1560664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
34600	NC_021872	TTG	2	6	1560666	1560671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232534
34601	NC_021872	GTA	2	6	1560688	1560693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232534
34602	NC_021872	CAT	2	6	1560722	1560727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
34603	NC_021872	GAA	2	6	1560747	1560752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232534
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34605	NC_021872	TAAT	2	8	1560858	1560865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34606	NC_021872	AAGT	2	8	1560906	1560913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34607	NC_021872	T	6	6	1560936	1560941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34608	NC_021872	ATT	2	6	1560956	1560961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232535
34609	NC_021872	T	6	6	1560960	1560965	0 %	100 %	0 %	0 %	526232535
34610	NC_021872	T	6	6	1560975	1560980	0 %	100 %	0 %	0 %	526232535
34611	NC_021872	GTA	2	6	1560993	1560998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232535
34612	NC_021872	ATT	2	6	1561002	1561007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232535
34613	NC_021872	CAT	2	6	1561019	1561024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232535
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34615	NC_021872	AG	3	6	1561050	1561055	50 %	0 %	50 %	0 %	526232535
34616	NC_021872	TATT	2	8	1561060	1561067	25 %	75 %	0 %	0 %	526232535
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34974	NC_021872	AT	3	6	1574372	1574377	50 %	50 %	0 %	0 %	526232545
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34977	NC_021872	CAAG	2	8	1574460	1574467	50 %	0 %	25 %	25 %	526231763
34978	NC_021872	CAA	2	6	1574481	1574486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231763
34979	NC_021872	TAA	2	6	1574505	1574510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231763
34980	NC_021872	TAA	2	6	1574520	1574525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231763
34981	NC_021872	TTA	2	6	1574568	1574573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231763
34982	NC_021872	TA	3	6	1574572	1574577	50 %	50 %	0 %	0 %	526231763
34983	NC_021872	AATTG	2	10	1574633	1574642	40 %	40 %	20 %	0 %	526231763
34984	NC_021872	CTGTTA	2	12	1574643	1574654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526231763
34985	NC_021872	TTG	2	6	1574676	1574681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231763
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34988	NC_021872	CAT	2	6	1574848	1574853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231763
34989	NC_021872	CAT	2	6	1574868	1574873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231763
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34999	NC_021872	CTA	2	6	1575597	1575602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231763
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