MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34003	NC_021872	TCGC	2	8	1532450	1532457	0 %	25 %	25 %	50 %	526231752
34004	NC_021872	TCG	2	6	1532523	1532528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231752
34005	NC_021872	GTT	2	6	1532581	1532586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231752
34006	NC_021872	TGT	2	6	1532661	1532666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231752
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34008	NC_021872	GAA	2	6	1532728	1532733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231752
34009	NC_021872	TAAGAA	2	12	1532739	1532750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526231752
34010	NC_021872	GTG	2	6	1532849	1532854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231752
34011	NC_021872	CTA	2	6	1532873	1532878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231752
34012	NC_021872	ACG	2	6	1532922	1532927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231752
34013	NC_021872	AGTTGA	2	12	1532937	1532948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231752
34014	NC_021872	GAA	2	6	1532962	1532967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231752
34015	NC_021872	CAT	2	6	1533013	1533018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231752
34016	NC_021872	TTG	2	6	1533041	1533046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231752
34017	NC_021872	GCT	2	6	1533049	1533054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231752
34018	NC_021872	TGA	2	6	1533114	1533119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231752
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34021	NC_021872	CA	3	6	1533197	1533202	50 %	0 %	0 %	50 %	526231752
34022	NC_021872	CAA	2	6	1533205	1533210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231752
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34024	NC_021872	GAAG	2	8	1533282	1533289	50 %	0 %	50 %	0 %	526231752
34025	NC_021872	GAA	2	6	1533292	1533297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231752
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34031	NC_021872	TTG	2	6	1533539	1533544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231752
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34035	NC_021872	TGA	2	6	1533759	1533764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231752
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34041	NC_021872	TTCAA	2	10	1534016	1534025	40 %	40 %	0 %	20 %	526231752
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34051	NC_021872	GAA	2	6	1534306	1534311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231752
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34054	NC_021872	GCAA	2	8	1534392	1534399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34055	NC_021872	ATT	2	6	1534442	1534447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34057	NC_021872	TTA	2	6	1534501	1534506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34074	NC_021872	TAA	2	6	1535155	1535160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34095	NC_021872	T	6	6	1536024	1536029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34097	NC_021872	TTA	2	6	1536121	1536126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231755
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34102	NC_021872	CAT	2	6	1536292	1536297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231755
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34107	NC_021872	AAAG	2	8	1536395	1536402	75 %	0 %	25 %	0 %	526231755
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34116	NC_021872	CAT	2	6	1536939	1536944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231756
34117	NC_021872	TCA	2	6	1536979	1536984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231756
34118	NC_021872	T	6	6	1536989	1536994	0 %	100 %	0 %	0 %	526231756
34119	NC_021872	TAA	2	6	1537023	1537028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231756
34120	NC_021872	TAA	2	6	1537046	1537051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231756
34121	NC_021872	TTG	2	6	1537092	1537097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231756
34122	NC_021872	TTC	2	6	1537101	1537106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231756
34123	NC_021872	CGA	2	6	1537250	1537255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231756
34124	NC_021872	CCGT	2	8	1537268	1537275	0 %	25 %	25 %	50 %	526231756
34125	NC_021872	GAG	2	6	1537329	1537334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231756
34126	NC_021872	TTA	2	6	1537360	1537365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231756
34127	NC_021872	TCA	2	6	1537433	1537438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231756
34128	NC_021872	AGG	2	6	1537453	1537458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231756
34129	NC_021872	TCA	2	6	1537459	1537464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231756
34130	NC_021872	TTA	2	6	1537468	1537473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231756
34131	NC_021872	ATA	2	6	1537528	1537533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231756
34132	NC_021872	AAG	2	6	1537536	1537541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231756
34133	NC_021872	GTC	2	6	1537543	1537548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231756
34134	NC_021872	AAG	2	6	1537569	1537574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231756
34135	NC_021872	CGA	2	6	1537630	1537635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231756
34136	NC_021872	CAT	2	6	1537671	1537676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231756
34137	NC_021872	TAA	2	6	1537699	1537704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231757
34138	NC_021872	TGC	2	6	1537706	1537711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231757
34139	NC_021872	CTTT	2	8	1537772	1537779	0 %	75 %	0 %	25 %	526231757
34140	NC_021872	GTT	2	6	1537782	1537787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231757
34141	NC_021872	T	6	6	1537794	1537799	0 %	100 %	0 %	0 %	526231757
34142	NC_021872	T	7	7	1537810	1537816	0 %	100 %	0 %	0 %	526231757
34143	NC_021872	TTA	2	6	1537856	1537861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231757
34144	NC_021872	TCA	2	6	1537949	1537954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231757
34145	NC_021872	ATC	2	6	1537970	1537975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231757
34146	NC_021872	GCG	2	6	1538007	1538012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231757
34147	NC_021872	CCT	2	6	1538045	1538050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34148	NC_021872	TA	3	6	1538085	1538090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34149	NC_021872	A	7	7	1538123	1538129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34150	NC_021872	GAG	2	6	1538144	1538149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34151	NC_021872	T	6	6	1538154	1538159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34152	NC_021872	AAC	2	6	1538179	1538184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34153	NC_021872	TTGCT	2	10	1538252	1538261	0 %	60 %	20 %	20 %	526232528
34154	NC_021872	GAT	2	6	1538339	1538344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34155	NC_021872	ATA	2	6	1538380	1538385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232528
34156	NC_021872	CTT	2	6	1538426	1538431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232528
34157	NC_021872	TTG	2	6	1538462	1538467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232528
34158	NC_021872	ACC	2	6	1538471	1538476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232528
34159	NC_021872	TTGT	2	8	1538480	1538487	0 %	75 %	25 %	0 %	526232528
34160	NC_021872	ATT	2	6	1538490	1538495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232528
34161	NC_021872	ACC	2	6	1538526	1538531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232528
34162	NC_021872	TCCA	2	8	1538678	1538685	25 %	25 %	0 %	50 %	526232528
34163	NC_021872	CAT	2	6	1538714	1538719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232528
34164	NC_021872	ATC	2	6	1538802	1538807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232528
34165	NC_021872	ATA	2	6	1538841	1538846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232528
34166	NC_021872	ATA	2	6	1538901	1538906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232528
34167	NC_021872	CCA	2	6	1538914	1538919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232528
34168	NC_021872	CAT	2	6	1538936	1538941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232528
34169	NC_021872	CAT	2	6	1538993	1538998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232528
34170	NC_021872	GAT	2	6	1539029	1539034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34171	NC_021872	TGC	2	6	1539039	1539044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232528
34172	NC_021872	GAC	2	6	1539070	1539075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232528
34173	NC_021872	TTA	2	6	1539082	1539087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232528
34174	NC_021872	TAT	2	6	1539125	1539130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232528
34175	NC_021872	ACA	2	6	1539169	1539174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232528
34176	NC_021872	TTAATA	2	12	1539226	1539237	50 %	50 %	0 %	0 %	526232528
34177	NC_021872	AGT	2	6	1539281	1539286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34178	NC_021872	TAC	2	6	1539287	1539292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232528
34179	NC_021872	TAA	2	6	1539354	1539359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232528
34180	NC_021872	ACTTA	2	10	1539402	1539411	40 %	40 %	0 %	20 %	526232528
34181	NC_021872	GAC	2	6	1539476	1539481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232528
34182	NC_021872	TAAA	2	8	1539521	1539528	75 %	25 %	0 %	0 %	526232528
34183	NC_021872	TAAGG	2	10	1539533	1539542	40 %	20 %	40 %	0 %	526232528
34184	NC_021872	CTG	2	6	1539546	1539551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232528
34185	NC_021872	AACTA	2	10	1539552	1539561	60 %	20 %	0 %	20 %	526232528
34186	NC_021872	CCAT	2	8	1539572	1539579	25 %	25 %	0 %	50 %	526232528
34187	NC_021872	TGA	2	6	1539654	1539659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34188	NC_021872	CTG	2	6	1539704	1539709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232528
34189	NC_021872	TGA	2	6	1539733	1539738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34190	NC_021872	ATA	2	6	1539889	1539894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232528
34191	NC_021872	AGCC	2	8	1539982	1539989	25 %	0 %	25 %	50 %	526232528
34192	NC_021872	TTC	2	6	1540016	1540021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232528
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34194	NC_021872	TAG	2	6	1540061	1540066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34195	NC_021872	CATT	2	8	1540154	1540161	25 %	50 %	0 %	25 %	526232528
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34197	NC_021872	CAAA	2	8	1540244	1540251	75 %	0 %	0 %	25 %	526232528
34198	NC_021872	AAG	2	6	1540255	1540260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232528
34199	NC_021872	TGA	2	6	1540261	1540266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34200	NC_021872	GCCA	2	8	1540295	1540302	25 %	0 %	25 %	50 %	526232528
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34202	NC_021872	GT	3	6	1540393	1540398	0 %	50 %	50 %	0 %	526232528
34203	NC_021872	AAC	2	6	1540434	1540439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232528
34204	NC_021872	AGC	2	6	1540509	1540514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232528
34205	NC_021872	ATT	2	6	1540557	1540562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232528
34206	NC_021872	TGT	2	6	1540593	1540598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232528
34207	NC_021872	TCA	2	6	1540630	1540635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232528
34208	NC_021872	TTGC	2	8	1540649	1540656	0 %	50 %	25 %	25 %	526232528
34209	NC_021872	TGA	2	6	1540726	1540731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232528
34210	NC_021872	TTA	2	6	1540756	1540761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232528
34211	NC_021872	AGCA	2	8	1540803	1540810	50 %	0 %	25 %	25 %	526232528
34212	NC_021872	CAA	2	6	1540862	1540867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232528
34213	NC_021872	T	6	6	1540872	1540877	0 %	100 %	0 %	0 %	526232528
34214	NC_021872	TA	3	6	1540886	1540891	50 %	50 %	0 %	0 %	526232528
34215	NC_021872	T	6	6	1540902	1540907	0 %	100 %	0 %	0 %	526232528
34216	NC_021872	AAAC	2	8	1540939	1540946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34217	NC_021872	ATTAC	2	10	1541023	1541032	40 %	40 %	0 %	20 %	526232529
34218	NC_021872	TGG	2	6	1541067	1541072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232529
34219	NC_021872	TTA	2	6	1541092	1541097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232529
34220	NC_021872	TAG	2	6	1541143	1541148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232529
34221	NC_021872	CCA	2	6	1541281	1541286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232529
34222	NC_021872	GAA	2	6	1541341	1541346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232529
34223	NC_021872	AGCACC	2	12	1541421	1541432	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526232529
34224	NC_021872	CAG	2	6	1541477	1541482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232529
34225	NC_021872	CAACC	2	10	1541513	1541522	40 %	0 %	0 %	60 %	526232529
34226	NC_021872	CAG	2	6	1541573	1541578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232529
34227	NC_021872	TTGG	2	8	1541681	1541688	0 %	50 %	50 %	0 %	526232529
34228	NC_021872	GACT	2	8	1541804	1541811	25 %	25 %	25 %	25 %	526232529
34229	NC_021872	ATT	2	6	1541871	1541876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232529
34230	NC_021872	TTA	2	6	1541902	1541907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232529
34231	NC_021872	CTT	2	6	1541933	1541938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232529
34232	NC_021872	CTTA	2	8	1541958	1541965	25 %	50 %	0 %	25 %	526232529
34233	NC_021872	TGA	2	6	1541986	1541991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232529
34234	NC_021872	ATC	2	6	1541998	1542003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232529
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