MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_021872	CAT	2	6	1393098	1393103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231633
31003	NC_021872	TTC	2	6	1393153	1393158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231633
31004	NC_021872	AAT	2	6	1393167	1393172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231633
31005	NC_021872	CTT	2	6	1393227	1393232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231633
31006	NC_021872	GGTATC	2	12	1393360	1393371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526231633
31007	NC_021872	AAAT	2	8	1393411	1393418	75 %	25 %	0 %	0 %	526231633
31008	NC_021872	AAT	2	6	1393424	1393429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231633
31009	NC_021872	TAC	2	6	1393590	1393595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31010	NC_021872	TAA	2	6	1393604	1393609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_021872	CAA	2	6	1393623	1393628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31012	NC_021872	T	6	6	1393715	1393720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31013	NC_021872	GTT	2	6	1393722	1393727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_021872	TTATTG	2	12	1393735	1393746	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_021872	TGT	2	6	1393837	1393842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231634
31016	NC_021872	TCA	2	6	1393974	1393979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231634
31017	NC_021872	TGG	2	6	1393991	1393996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231634
31018	NC_021872	CAG	2	6	1394035	1394040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231634
31019	NC_021872	GTG	2	6	1394128	1394133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231634
31020	NC_021872	TCA	2	6	1394245	1394250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231634
31021	NC_021872	TCA	2	6	1394301	1394306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231634
31022	NC_021872	AAG	2	6	1394307	1394312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231634
31023	NC_021872	CTT	2	6	1394414	1394419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231634
31024	NC_021872	GCT	2	6	1394529	1394534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231634
31025	NC_021872	CGG	2	6	1394577	1394582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231634
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31028	NC_021872	GTT	2	6	1394753	1394758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231634
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31031	NC_021872	TC	3	6	1395161	1395166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31032	NC_021872	A	7	7	1395238	1395244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_021872	TTCC	2	8	1395248	1395255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31034	NC_021872	T	7	7	1395264	1395270	0 %	100 %	0 %	0 %	526231635
31035	NC_021872	ATC	2	6	1395306	1395311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231635
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31037	NC_021872	GGCTA	2	10	1395420	1395429	20 %	20 %	40 %	20 %	526231635
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31040	NC_021872	ATC	2	6	1395544	1395549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231635
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31042	NC_021872	TTG	2	6	1395623	1395628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231635
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31044	NC_021872	T	7	7	1395665	1395671	0 %	100 %	0 %	0 %	526231635
31045	NC_021872	CGA	2	6	1395697	1395702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231635
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31052	NC_021872	GGC	2	6	1396061	1396066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231635
31053	NC_021872	GAG	2	6	1396283	1396288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_021872	TTATG	2	10	1396292	1396301	20 %	60 %	20 %	0 %	526231636
31055	NC_021872	TGC	2	6	1396346	1396351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231636
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31058	NC_021872	TTTA	2	8	1396477	1396484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31059	NC_021872	GAA	2	6	1396509	1396514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31060	NC_021872	TTC	2	6	1396524	1396529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31061	NC_021872	T	6	6	1396537	1396542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31062	NC_021872	T	6	6	1396635	1396640	0 %	100 %	0 %	0 %	526231637
31063	NC_021872	CTT	2	6	1396651	1396656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231637
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31067	NC_021872	TTG	2	6	1396804	1396809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231637
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31069	NC_021872	ATC	2	6	1397021	1397026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231637
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31083	NC_021872	GGT	2	6	1397881	1397886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231638
31084	NC_021872	ATG	2	6	1397901	1397906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231638
31085	NC_021872	TG	3	6	1397917	1397922	0 %	50 %	50 %	0 %	526231638
31086	NC_021872	CAT	2	6	1397926	1397931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231638
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31088	NC_021872	TAG	2	6	1398001	1398006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231638
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31091	NC_021872	TTCCT	2	10	1398049	1398058	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31092	NC_021872	TTC	2	6	1398101	1398106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231639
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31099	NC_021872	A	6	6	1398519	1398524	100 %	0 %	0 %	0 %	526231640
31100	NC_021872	AAT	2	6	1398591	1398596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231640
31101	NC_021872	A	6	6	1398665	1398670	100 %	0 %	0 %	0 %	526231640
31102	NC_021872	TA	3	6	1398684	1398689	50 %	50 %	0 %	0 %	526231640
31103	NC_021872	AT	3	6	1398735	1398740	50 %	50 %	0 %	0 %	526231640
31104	NC_021872	ACT	2	6	1398759	1398764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231640
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31106	NC_021872	TAC	2	6	1398838	1398843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231640
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31110	NC_021872	ACA	2	6	1398994	1398999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231641
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31113	NC_021872	TTC	2	6	1399043	1399048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231641
31114	NC_021872	T	7	7	1399094	1399100	0 %	100 %	0 %	0 %	526231641
31115	NC_021872	ATA	2	6	1399112	1399117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231641
31116	NC_021872	CCG	2	6	1399119	1399124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231641
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31118	NC_021872	ATCAA	2	10	1399176	1399185	60 %	20 %	0 %	20 %	526231641
31119	NC_021872	CAT	2	6	1399210	1399215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231641
31120	NC_021872	TCG	2	6	1399242	1399247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231641
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31130	NC_021872	T	7	7	1399614	1399620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31131	NC_021872	ATAA	2	8	1399627	1399634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31132	NC_021872	ATGTA	2	10	1399684	1399693	40 %	40 %	20 %	0 %	526231642
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31136	NC_021872	TTTA	2	8	1399843	1399850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31137	NC_021872	TTAT	2	8	1399857	1399864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31138	NC_021872	TTC	2	6	1399897	1399902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31139	NC_021872	TAGT	2	8	1399954	1399961	25 %	50 %	25 %	0 %	526231643
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31188	NC_021872	GAA	2	6	1402148	1402153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31230	NC_021872	GAC	2	6	1404110	1404115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231644
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31232	NC_021872	AAT	2	6	1404219	1404224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231644
31233	NC_021872	TCAGT	2	10	1404288	1404297	20 %	40 %	20 %	20 %	526231644
31234	NC_021872	TAC	2	6	1404327	1404332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231644
31235	NC_021872	A	6	6	1404384	1404389	100 %	0 %	0 %	0 %	526231644
31236	NC_021872	GTA	2	6	1404420	1404425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231644
31237	NC_021872	AAAG	2	8	1404479	1404486	75 %	0 %	25 %	0 %	526231644
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31239	NC_021872	GTA	2	6	1404592	1404597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231644
31240	NC_021872	TTG	2	6	1404604	1404609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231644
31241	NC_021872	TGA	2	6	1404643	1404648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231644
31242	NC_021872	CTA	2	6	1404649	1404654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231644
31243	NC_021872	CTG	2	6	1404658	1404663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231644
31244	NC_021872	CTA	2	6	1404697	1404702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231644
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31247	NC_021872	AAGA	2	8	1404846	1404853	75 %	0 %	25 %	0 %	526231644
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31249	NC_021872	A	7	7	1405053	1405059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31250	NC_021872	T	7	7	1405066	1405072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31251	NC_021872	TA	3	6	1405104	1405109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31252	NC_021872	A	6	6	1405109	1405114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31253	NC_021872	TTA	2	6	1405149	1405154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231645
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31259	NC_021872	TAG	2	6	1405558	1405563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31353	NC_021872	CTT	3	9	1409579	1409587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231649
31354	NC_021872	GAT	2	6	1409697	1409702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231649
31355	NC_021872	CAT	2	6	1409750	1409755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231649
31356	NC_021872	AAG	2	6	1409761	1409766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231649
31357	NC_021872	CTT	2	6	1409930	1409935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231649
31358	NC_021872	CAC	2	6	1409948	1409953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231649
31359	NC_021872	TTC	3	9	1409970	1409978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231649
31360	NC_021872	GGT	2	6	1410005	1410010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231649
31361	NC_021872	ACT	2	6	1410037	1410042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231649
31362	NC_021872	CAA	2	6	1410047	1410052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231649
31363	NC_021872	T	6	6	1410058	1410063	0 %	100 %	0 %	0 %	526231649
31364	NC_021872	TGATA	2	10	1410172	1410181	40 %	40 %	20 %	0 %	526231649
31365	NC_021872	TTTCA	2	10	1410183	1410192	20 %	60 %	0 %	20 %	526231649
31366	NC_021872	CAT	2	6	1410230	1410235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231650
31367	NC_021872	GTCCAA	2	12	1410293	1410304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526231650
31368	NC_021872	TTC	2	6	1410321	1410326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231650
31369	NC_021872	GTTT	2	8	1410397	1410404	0 %	75 %	25 %	0 %	526231650
31370	NC_021872	CAA	2	6	1410578	1410583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231650
31371	NC_021872	TGG	2	6	1410598	1410603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231650
31372	NC_021872	CAT	2	6	1410623	1410628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231650
31373	NC_021872	ATC	2	6	1410661	1410666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231650
31374	NC_021872	CTT	2	6	1410824	1410829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231650
31375	NC_021872	ACAA	2	8	1410871	1410878	75 %	0 %	0 %	25 %	526231650
31376	NC_021872	GCT	2	6	1410967	1410972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231650
31377	NC_021872	GGC	2	6	1410987	1410992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231650
31378	NC_021872	TTC	2	6	1411014	1411019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231650
31379	NC_021872	TTC	2	6	1411077	1411082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231650
31380	NC_021872	GAA	2	6	1411106	1411111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231650
31381	NC_021872	CTT	2	6	1411128	1411133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231650
31382	NC_021872	CTT	2	6	1411202	1411207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231650
31383	NC_021872	TC	3	6	1411226	1411231	0 %	50 %	0 %	50 %	526231650
31384	NC_021872	A	6	6	1411260	1411265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31385	NC_021872	ACC	2	6	1411300	1411305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31386	NC_021872	AC	3	6	1411328	1411333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31387	NC_021872	AAT	2	6	1411337	1411342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31388	NC_021872	CT	3	6	1411439	1411444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31389	NC_021872	CTA	2	6	1411460	1411465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31390	NC_021872	TCA	2	6	1411470	1411475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31391	NC_021872	ATC	2	6	1411507	1411512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31392	NC_021872	CATG	2	8	1411553	1411560	25 %	25 %	25 %	25 %	526231651
31393	NC_021872	AAT	2	6	1411608	1411613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231651
31394	NC_021872	TTC	2	6	1411669	1411674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231651
31395	NC_021872	AGT	2	6	1411754	1411759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231651
31396	NC_021872	TTTC	2	8	1411783	1411790	0 %	75 %	0 %	25 %	526231651
31397	NC_021872	ACGT	2	8	1411803	1411810	25 %	25 %	25 %	25 %	526231651
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31399	NC_021872	CTA	2	6	1411857	1411862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231651
31400	NC_021872	GTT	2	6	1411900	1411905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231652
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31403	NC_021872	CTTTT	2	10	1412064	1412073	0 %	80 %	0 %	20 %	526231652
31404	NC_021872	T	6	6	1412070	1412075	0 %	100 %	0 %	0 %	526231652
31405	NC_021872	GTC	2	6	1412155	1412160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231652
31406	NC_021872	ATA	2	6	1412169	1412174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231652
31407	NC_021872	T	7	7	1412228	1412234	0 %	100 %	0 %	0 %	526231652
31408	NC_021872	TGA	2	6	1412290	1412295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231652
31409	NC_021872	GCTG	2	8	1412326	1412333	0 %	25 %	50 %	25 %	526231652
31410	NC_021872	CATT	2	8	1412380	1412387	25 %	50 %	0 %	25 %	526231652
31411	NC_021872	T	6	6	1412386	1412391	0 %	100 %	0 %	0 %	526231652
31412	NC_021872	TAT	2	6	1412417	1412422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31413	NC_021872	TTAAT	2	10	1412459	1412468	40 %	60 %	0 %	0 %	526231653
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31419	NC_021872	ATC	2	6	1412710	1412715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231653
31420	NC_021872	GAAC	2	8	1412774	1412781	50 %	0 %	25 %	25 %	526231653
31421	NC_021872	CTG	2	6	1412802	1412807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
31422	NC_021872	ACT	3	9	1412819	1412827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231653
31423	NC_021872	CTG	2	6	1412847	1412852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
31424	NC_021872	CTG	2	6	1412925	1412930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
31425	NC_021872	CAA	2	6	1412955	1412960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231653
31426	NC_021872	GCG	2	6	1412976	1412981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231653
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31429	NC_021872	CGT	2	6	1413167	1413172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
31430	NC_021872	T	6	6	1413175	1413180	0 %	100 %	0 %	0 %	526231653
31431	NC_021872	CTT	2	6	1413190	1413195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231653
31432	NC_021872	CTT	2	6	1413256	1413261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31433	NC_021872	TTAA	2	8	1413263	1413270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31434	NC_021872	TGT	2	6	1413286	1413291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31435	NC_021872	TTA	2	6	1413299	1413304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31436	NC_021872	TAA	3	9	1413307	1413315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31437	NC_021872	ATC	2	6	1413349	1413354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231654
31438	NC_021872	CAA	2	6	1413414	1413419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231654
31439	NC_021872	ATG	2	6	1413451	1413456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231654
31440	NC_021872	ATC	2	6	1413561	1413566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231654
31441	NC_021872	GAAG	2	8	1413567	1413574	50 %	0 %	50 %	0 %	526231654
31442	NC_021872	CAT	2	6	1413588	1413593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231654
31443	NC_021872	AATTC	2	10	1413632	1413641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31444	NC_021872	TAAT	2	8	1413672	1413679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31445	NC_021872	AAT	2	6	1413707	1413712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31446	NC_021872	AAACGA	2	12	1413716	1413727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526231655
31447	NC_021872	CTG	2	6	1413758	1413763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
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31451	NC_021872	TAGC	2	8	1413861	1413868	25 %	25 %	25 %	25 %	526231655
31452	NC_021872	ATT	2	6	1413896	1413901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231655
31453	NC_021872	A	6	6	1413956	1413961	100 %	0 %	0 %	0 %	526231655
31454	NC_021872	AGC	2	6	1414030	1414035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231655
31455	NC_021872	GAA	2	6	1414046	1414051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231655
31456	NC_021872	GGC	2	6	1414054	1414059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231655
31457	NC_021872	CAA	2	6	1414067	1414072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231655
31458	NC_021872	ATG	2	6	1414073	1414078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231655
31459	NC_021872	AAC	2	6	1414094	1414099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231655
31460	NC_021872	GCC	2	6	1414157	1414162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231655
31461	NC_021872	TGC	2	6	1414168	1414173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
31462	NC_021872	CTTT	2	8	1414206	1414213	0 %	75 %	0 %	25 %	526231655
31463	NC_021872	TAT	2	6	1414237	1414242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231655
31464	NC_021872	TGC	2	6	1414270	1414275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
31465	NC_021872	AGA	2	6	1414314	1414319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231655
31466	NC_021872	GCT	2	6	1414331	1414336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
31467	NC_021872	CTT	2	6	1414360	1414365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231655
31468	NC_021872	CTT	2	6	1414377	1414382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231655
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