MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021872	ACT	2	6	629059	629064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231172
14003	NC_021872	ATT	2	6	629088	629093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231172
14004	NC_021872	CGC	2	6	629170	629175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231172
14005	NC_021872	AAGC	2	8	629256	629263	50 %	0 %	25 %	25 %	526231172
14006	NC_021872	TGA	2	6	629282	629287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231172
14007	NC_021872	GAT	2	6	629327	629332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231172
14008	NC_021872	GAA	2	6	629388	629393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231172
14009	NC_021872	GAA	2	6	629406	629411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231172
14010	NC_021872	TTA	2	6	629443	629448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231172
14011	NC_021872	CGGC	2	8	629462	629469	0 %	0 %	50 %	50 %	526231172
14012	NC_021872	ATTG	2	8	629524	629531	25 %	50 %	25 %	0 %	526231172
14013	NC_021872	ATC	2	6	629575	629580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231173
14014	NC_021872	GAC	2	6	629611	629616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231173
14015	NC_021872	T	6	6	629774	629779	0 %	100 %	0 %	0 %	526231173
14016	NC_021872	GAG	2	6	629817	629822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231173
14017	NC_021872	A	7	7	629849	629855	100 %	0 %	0 %	0 %	526231173
14018	NC_021872	TTCAAG	2	12	629923	629934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526231173
14019	NC_021872	ATT	2	6	629980	629985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231173
14020	NC_021872	TGA	2	6	629996	630001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231173
14021	NC_021872	AAAC	2	8	630018	630025	75 %	0 %	0 %	25 %	526231173
14022	NC_021872	TGT	2	6	630041	630046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231173
14023	NC_021872	CGGT	2	8	630124	630131	0 %	25 %	50 %	25 %	526231173
14024	NC_021872	AAC	2	6	630171	630176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231173
14025	NC_021872	AGA	2	6	630227	630232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231173
14026	NC_021872	CTG	2	6	630253	630258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231173
14027	NC_021872	CTTT	2	8	630261	630268	0 %	75 %	0 %	25 %	526231173
14028	NC_021872	AGC	2	6	630323	630328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231173
14029	NC_021872	A	6	6	630330	630335	100 %	0 %	0 %	0 %	526231173
14030	NC_021872	TAGT	2	8	630355	630362	25 %	50 %	25 %	0 %	526231173
14031	NC_021872	TTC	2	6	630376	630381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231173
14032	NC_021872	CG	3	6	630450	630455	0 %	0 %	50 %	50 %	526231173
14033	NC_021872	AAC	2	6	630511	630516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231173
14034	NC_021872	TGC	2	6	630520	630525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231173
14035	NC_021872	ATC	2	6	630583	630588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231173
14036	NC_021872	A	7	7	630593	630599	100 %	0 %	0 %	0 %	526231173
14037	NC_021872	ATT	2	6	630611	630616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231173
14038	NC_021872	GGAT	2	8	630688	630695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_021872	AGT	2	6	630713	630718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231174
14040	NC_021872	TGC	2	6	630730	630735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231174
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14043	NC_021872	ATC	2	6	630776	630781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231174
14044	NC_021872	CTT	2	6	630802	630807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231174
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14046	NC_021872	GAT	2	6	630850	630855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231174
14047	NC_021872	GAAT	2	8	630856	630863	50 %	25 %	25 %	0 %	526231174
14048	NC_021872	TGA	2	6	630874	630879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231174
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14050	NC_021872	GATT	2	8	630910	630917	25 %	50 %	25 %	0 %	526231174
14051	NC_021872	CAAT	2	8	630918	630925	50 %	25 %	0 %	25 %	526231174
14052	NC_021872	TGG	2	6	630981	630986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231174
14053	NC_021872	ATA	2	6	631041	631046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231174
14054	NC_021872	CAG	2	6	631089	631094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231174
14055	NC_021872	GCT	2	6	631100	631105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231174
14056	NC_021872	TGA	2	6	631135	631140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231174
14057	NC_021872	GAA	2	6	631154	631159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231174
14058	NC_021872	TAATT	2	10	631163	631172	40 %	60 %	0 %	0 %	526231174
14059	NC_021872	T	6	6	631211	631216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_021872	GTT	2	6	631222	631227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231175
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14062	NC_021872	AATAA	2	10	631337	631346	80 %	20 %	0 %	0 %	526231175
14063	NC_021872	TGT	2	6	631444	631449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231175
14064	NC_021872	TGA	2	6	631513	631518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231175
14065	NC_021872	TGA	2	6	631561	631566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231175
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14111	NC_021872	TGG	2	6	633866	633871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14120	NC_021872	ACGA	2	8	634119	634126	50 %	0 %	25 %	25 %	526231177
14121	NC_021872	ACCAT	2	10	634156	634165	40 %	20 %	0 %	40 %	526231177
14122	NC_021872	TGA	2	6	634247	634252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231177
14123	NC_021872	GGTTTG	2	12	634255	634266	0 %	50 %	50 %	0 %	526231177
14124	NC_021872	TTA	2	6	634289	634294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231177
14125	NC_021872	ATG	2	6	634306	634311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231177
14126	NC_021872	TGA	2	6	634361	634366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231177
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14131	NC_021872	GTT	2	6	634605	634610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231177
14132	NC_021872	TTAT	2	8	634650	634657	25 %	75 %	0 %	0 %	526231177
14133	NC_021872	CAAG	2	8	634667	634674	50 %	0 %	25 %	25 %	526231177
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14140	NC_021872	TTG	2	6	635019	635024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231177
14141	NC_021872	TGA	2	6	635159	635164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231177
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14144	NC_021872	TTCA	2	8	635261	635268	25 %	50 %	0 %	25 %	526231177
14145	NC_021872	AAG	2	6	635269	635274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231177
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14152	NC_021872	GGT	2	6	635483	635488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231177
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14209	NC_021872	GAT	2	6	637931	637936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231181
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14227	NC_021872	GGA	2	6	638460	638465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231181
14228	NC_021872	AAC	2	6	638473	638478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231182
14229	NC_021872	CTG	3	9	638540	638548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231182
14230	NC_021872	ACT	2	6	638617	638622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231182
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14232	NC_021872	TGC	2	6	638753	638758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231182
14233	NC_021872	A	6	6	638775	638780	100 %	0 %	0 %	0 %	526231182
14234	NC_021872	T	6	6	638782	638787	0 %	100 %	0 %	0 %	526231182
14235	NC_021872	A	7	7	638803	638809	100 %	0 %	0 %	0 %	526231182
14236	NC_021872	GTTC	2	8	638878	638885	0 %	50 %	25 %	25 %	526231182
14237	NC_021872	ATG	2	6	638909	638914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231182
14238	NC_021872	AATT	2	8	638945	638952	50 %	50 %	0 %	0 %	526231182
14239	NC_021872	CAA	2	6	638977	638982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231182
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14241	NC_021872	A	6	6	639003	639008	100 %	0 %	0 %	0 %	526231182
14242	NC_021872	TCGC	2	8	639071	639078	0 %	25 %	25 %	50 %	526231182
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14362	NC_021872	TAAT	2	8	644514	644521	50 %	50 %	0 %	0 %	526231189
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14484	NC_021872	TGT	2	6	649557	649562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231195
14485	NC_021872	AGA	2	6	649629	649634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231195
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14487	NC_021872	TAAT	2	8	649709	649716	50 %	50 %	0 %	0 %	526231195
14488	NC_021872	AGA	2	6	649746	649751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231195
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14492	NC_021872	A	6	6	649895	649900	100 %	0 %	0 %	0 %	526231195
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