MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021872	ATG	2	6	563073	563078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231122
12502	NC_021872	TTC	2	6	563121	563126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231122
12503	NC_021872	GTC	2	6	563127	563132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231122
12504	NC_021872	ACTC	2	8	563171	563178	25 %	25 %	0 %	50 %	526231122
12505	NC_021872	TGC	2	6	563194	563199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231122
12506	NC_021872	TGA	2	6	563209	563214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231122
12507	NC_021872	GGT	3	9	563219	563227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231122
12508	NC_021872	AT	3	6	563278	563283	50 %	50 %	0 %	0 %	526231122
12509	NC_021872	CTA	2	6	563286	563291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231122
12510	NC_021872	TCT	2	6	563319	563324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231122
12511	NC_021872	TGG	2	6	563392	563397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231122
12512	NC_021872	GAA	2	6	563419	563424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231122
12513	NC_021872	AGA	2	6	563584	563589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231122
12514	NC_021872	ATT	2	6	563602	563607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231122
12515	NC_021872	GCT	2	6	563675	563680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231122
12516	NC_021872	CATG	2	8	563683	563690	25 %	25 %	25 %	25 %	526231122
12517	NC_021872	ACC	2	6	563694	563699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231122
12518	NC_021872	AAG	2	6	563720	563725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231122
12519	NC_021872	AAGC	2	8	563801	563808	50 %	0 %	25 %	25 %	526231122
12520	NC_021872	GAA	2	6	563813	563818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231122
12521	NC_021872	ATG	2	6	563828	563833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_021872	GATT	2	8	563892	563899	25 %	50 %	25 %	0 %	526231123
12523	NC_021872	TGT	2	6	564017	564022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231123
12524	NC_021872	GAT	2	6	564067	564072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231123
12525	NC_021872	GC	3	6	564096	564101	0 %	0 %	50 %	50 %	526231123
12526	NC_021872	TGGT	2	8	564146	564153	0 %	50 %	50 %	0 %	526231123
12527	NC_021872	ACA	2	6	564158	564163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231123
12528	NC_021872	ATG	2	6	564190	564195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231123
12529	NC_021872	ACA	2	6	564218	564223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231123
12530	NC_021872	CGGT	2	8	564236	564243	0 %	25 %	50 %	25 %	526231123
12531	NC_021872	AAG	2	6	564265	564270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231123
12532	NC_021872	GAAT	2	8	564275	564282	50 %	25 %	25 %	0 %	526231123
12533	NC_021872	CCTA	2	8	564316	564323	25 %	25 %	0 %	50 %	526231123
12534	NC_021872	TGA	2	6	564381	564386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231123
12535	NC_021872	ATG	2	6	564443	564448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231123
12536	NC_021872	ACT	2	6	564471	564476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231123
12537	NC_021872	AAT	2	6	564514	564519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231123
12538	NC_021872	AATGC	2	10	564670	564679	40 %	20 %	20 %	20 %	526231123
12539	NC_021872	TGA	2	6	564699	564704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231123
12540	NC_021872	AGC	2	6	564747	564752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231123
12541	NC_021872	TGG	2	6	564780	564785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231123
12542	NC_021872	AAT	2	6	564800	564805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231123
12543	NC_021872	T	6	6	564805	564810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_021872	AGG	2	6	564818	564823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_021872	ACA	2	6	564826	564831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231124
12546	NC_021872	GTT	2	6	564867	564872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231124
12547	NC_021872	AAC	2	6	564953	564958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231124
12548	NC_021872	GTT	2	6	564987	564992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231124
12549	NC_021872	TGA	2	6	565079	565084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231124
12550	NC_021872	ATG	2	6	565189	565194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231124
12551	NC_021872	GTG	2	6	565264	565269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231124
12552	NC_021872	GGT	2	6	565287	565292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231124
12553	NC_021872	ATGAA	2	10	565414	565423	60 %	20 %	20 %	0 %	526231124
12554	NC_021872	GAAC	2	8	565469	565476	50 %	0 %	25 %	25 %	526231124
12555	NC_021872	AAG	2	6	565701	565706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231124
12556	NC_021872	ACT	2	6	565797	565802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231124
12557	NC_021872	TTG	2	6	565888	565893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231124
12558	NC_021872	TTC	2	6	565933	565938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231124
12559	NC_021872	ATC	2	6	565962	565967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231124
12560	NC_021872	GAA	2	6	565998	566003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231124
12561	NC_021872	GCG	2	6	566024	566029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231124
12562	NC_021872	ATG	2	6	566149	566154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231124
12563	NC_021872	AGA	2	6	566162	566167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231124
12564	NC_021872	GTT	2	6	566199	566204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231124
12565	NC_021872	AGA	2	6	566249	566254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231124
12566	NC_021872	AGG	2	6	566257	566262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231124
12567	NC_021872	TAT	2	6	566296	566301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231125
12568	NC_021872	ATGATA	2	12	566322	566333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526231125
12569	NC_021872	CTG	2	6	566358	566363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231125
12570	NC_021872	TGC	2	6	566404	566409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231125
12571	NC_021872	TGA	2	6	566452	566457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231125
12572	NC_021872	AG	3	6	566562	566567	50 %	0 %	50 %	0 %	526231125
12573	NC_021872	GAA	2	6	566594	566599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231125
12574	NC_021872	AGA	2	6	566604	566609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231125
12575	NC_021872	TGC	2	6	566674	566679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231125
12576	NC_021872	AAT	2	6	566730	566735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_021872	TAT	2	6	566746	566751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_021872	AGC	2	6	566780	566785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_021872	G	7	7	566800	566806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_021872	GCAA	2	8	566818	566825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12581	NC_021872	T	6	6	566865	566870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_021872	TAA	2	6	566877	566882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_021872	TGATA	2	10	566893	566902	40 %	40 %	20 %	0 %	526231126
12584	NC_021872	ATA	2	6	566968	566973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231126
12585	NC_021872	T	6	6	567001	567006	0 %	100 %	0 %	0 %	526231126
12586	NC_021872	T	7	7	567033	567039	0 %	100 %	0 %	0 %	526231126
12587	NC_021872	ACC	2	6	567045	567050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231126
12588	NC_021872	GGA	2	6	567174	567179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_021872	A	6	6	567188	567193	100 %	0 %	0 %	0 %	526231127
12590	NC_021872	TTG	2	6	567194	567199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231127
12591	NC_021872	A	6	6	567246	567251	100 %	0 %	0 %	0 %	526231127
12592	NC_021872	TTA	2	6	567352	567357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231127
12593	NC_021872	ATC	2	6	567429	567434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231127
12594	NC_021872	TGG	2	6	567531	567536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231127
12595	NC_021872	ATT	2	6	567598	567603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231127
12596	NC_021872	TGA	2	6	567698	567703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231127
12597	NC_021872	GCA	2	6	567706	567711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231127
12598	NC_021872	ACA	2	6	567730	567735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231127
12599	NC_021872	TGC	2	6	567744	567749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231127
12600	NC_021872	TTG	2	6	567764	567769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231127
12601	NC_021872	ATT	2	6	567826	567831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231127
12602	NC_021872	TGT	2	6	567936	567941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231127
12603	NC_021872	ATTG	2	8	567975	567982	25 %	50 %	25 %	0 %	526231127
12604	NC_021872	GGA	2	6	567990	567995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231127
12605	NC_021872	AAG	2	6	568019	568024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231127
12606	NC_021872	AGA	2	6	568194	568199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231127
12607	NC_021872	ACG	2	6	568203	568208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231127
12608	NC_021872	AATG	2	8	568209	568216	50 %	25 %	25 %	0 %	526231127
12609	NC_021872	GCT	2	6	568309	568314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231127
12610	NC_021872	AT	3	6	568368	568373	50 %	50 %	0 %	0 %	526231127
12611	NC_021872	ACA	2	6	568407	568412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231127
12612	NC_021872	AAATT	2	10	568451	568460	60 %	40 %	0 %	0 %	526231127
12613	NC_021872	ACGA	2	8	568548	568555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12614	NC_021872	GAA	2	6	568597	568602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_021872	CAAGG	2	10	568661	568670	40 %	0 %	40 %	20 %	526231128
12616	NC_021872	CAT	2	6	568894	568899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231128
12617	NC_021872	ATT	2	6	568943	568948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231128
12618	NC_021872	TGG	3	9	568966	568974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231128
12619	NC_021872	AGC	2	6	569005	569010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231128
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12621	NC_021872	CTT	2	6	569163	569168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231128
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12987	NC_021872	GCT	2	6	584379	584384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232234
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12989	NC_021872	TTA	2	6	584446	584451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232234
12990	NC_021872	TGA	2	6	584714	584719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232234
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12994	NC_021872	GC	3	6	584996	585001	0 %	0 %	50 %	50 %	526232234
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12999	NC_021872	AAAAG	2	10	585161	585170	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13000	NC_021872	GAT	2	6	585322	585327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231143

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