MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021872	TAG	2	6	540001	540006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231099
12003	NC_021872	CTA	2	6	540036	540041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231099
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12005	NC_021872	CTT	2	6	540056	540061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231099
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12013	NC_021872	TAT	2	6	540247	540252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12015	NC_021872	AATA	2	8	540393	540400	75 %	25 %	0 %	0 %	526231100
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12041	NC_021872	TAA	2	6	541498	541503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_021872	CTT	2	6	541504	541509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_021872	TA	3	6	541512	541517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_021872	ATG	2	6	541569	541574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12116	NC_021872	ATT	2	6	544974	544979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231104
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12119	NC_021872	TGG	2	6	545057	545062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231104
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12122	NC_021872	T	6	6	545238	545243	0 %	100 %	0 %	0 %	526231104
12123	NC_021872	ATT	2	6	545310	545315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231104
12124	NC_021872	TTA	2	6	545377	545382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231104
12125	NC_021872	ATT	2	6	545385	545390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231104
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12130	NC_021872	TTG	2	6	545551	545556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231104
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12153	NC_021872	TGA	2	6	546481	546486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231105
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12158	NC_021872	TGGTT	2	10	546672	546681	0 %	60 %	40 %	0 %	526231105
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12160	NC_021872	GCT	2	6	546770	546775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231106
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12228	NC_021872	TA	3	6	549968	549973	50 %	50 %	0 %	0 %	526231109
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12230	NC_021872	CTG	2	6	550151	550156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231109
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12232	NC_021872	TCA	2	6	550294	550299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231109
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12238	NC_021872	AGT	2	6	550649	550654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231109
12239	NC_021872	C	6	6	550731	550736	0 %	0 %	0 %	100 %	526231110
12240	NC_021872	ACTT	2	8	550776	550783	25 %	50 %	0 %	25 %	526231110
12241	NC_021872	TGA	2	6	550795	550800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231110
12242	NC_021872	TGG	2	6	550823	550828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231110
12243	NC_021872	AT	3	6	550870	550875	50 %	50 %	0 %	0 %	526231110
12244	NC_021872	CAG	2	6	550947	550952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231110
12245	NC_021872	CTG	2	6	551091	551096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231110
12246	NC_021872	TTAA	2	8	551147	551154	50 %	50 %	0 %	0 %	526231110
12247	NC_021872	ATC	2	6	551310	551315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231110
12248	NC_021872	CAAG	2	8	551323	551330	50 %	0 %	25 %	25 %	526231110
12249	NC_021872	AAG	2	6	551385	551390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231110
12250	NC_021872	TAC	2	6	551406	551411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231110
12251	NC_021872	ATG	2	6	551448	551453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231110
12252	NC_021872	GAT	2	6	551470	551475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231110
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12254	NC_021872	AGC	3	9	551556	551564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231111
12255	NC_021872	TTTA	2	8	551657	551664	25 %	75 %	0 %	0 %	526231111
12256	NC_021872	GGC	2	6	551672	551677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231111
12257	NC_021872	ATTG	2	8	551691	551698	25 %	50 %	25 %	0 %	526231111
12258	NC_021872	TGC	2	6	551733	551738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231111
12259	NC_021872	GATG	2	8	551766	551773	25 %	25 %	50 %	0 %	526231111
12260	NC_021872	AAG	2	6	551812	551817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231111
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12262	NC_021872	CAAC	2	8	551881	551888	50 %	0 %	0 %	50 %	526231111
12263	NC_021872	GAA	2	6	551902	551907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231111
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12275	NC_021872	CAA	2	6	552322	552327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231111
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12279	NC_021872	ATA	2	6	552543	552548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231111
12280	NC_021872	AATAA	2	10	552592	552601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12281	NC_021872	TTTA	2	8	552631	552638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12282	NC_021872	TGT	2	6	552652	552657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12283	NC_021872	A	6	6	552672	552677	100 %	0 %	0 %	0 %	526231112
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12292	NC_021872	TATGGC	2	12	553071	553082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526231112
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12296	NC_021872	TGA	2	6	553217	553222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231112
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12311	NC_021872	GTT	2	6	553913	553918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12312	NC_021872	T	7	7	553941	553947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12313	NC_021872	GAA	2	6	553959	553964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231113
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12325	NC_021872	TGCT	2	8	554463	554470	0 %	50 %	25 %	25 %	526231113
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12329	NC_021872	T	6	6	554686	554691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12330	NC_021872	CTTA	2	8	554808	554815	25 %	50 %	0 %	25 %	526231114
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12345	NC_021872	A	7	7	555518	555524	100 %	0 %	0 %	0 %	526231114
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12357	NC_021872	TG	3	6	556260	556265	0 %	50 %	50 %	0 %	526231114
12358	NC_021872	GA	3	6	556266	556271	50 %	0 %	50 %	0 %	526231114
12359	NC_021872	GGGAT	2	10	556307	556316	20 %	20 %	60 %	0 %	526231114
12360	NC_021872	ATG	2	6	556364	556369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231114
12361	NC_021872	A	6	6	556385	556390	100 %	0 %	0 %	0 %	526231114
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12363	NC_021872	TTGG	2	8	556462	556469	0 %	50 %	50 %	0 %	526231114
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12486	NC_021872	ACA	2	6	562083	562088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231121
12487	NC_021872	ATA	2	6	562196	562201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231121
12488	NC_021872	TCG	2	6	562242	562247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231121
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12490	NC_021872	T	6	6	562271	562276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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