MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021872	ATTG	2	8	519013	519020	25 %	50 %	25 %	0 %	526231091
11502	NC_021872	GGT	5	15	519044	519058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231091
11503	NC_021872	ATC	2	6	519068	519073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231091
11504	NC_021872	ATT	2	6	519164	519169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231091
11505	NC_021872	GAAG	2	8	519262	519269	50 %	0 %	50 %	0 %	526231091
11506	NC_021872	TGC	2	6	519277	519282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231091
11507	NC_021872	GTA	2	6	519285	519290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231091
11508	NC_021872	TTG	2	6	519321	519326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231091
11509	NC_021872	ATTA	2	8	519349	519356	50 %	50 %	0 %	0 %	526231091
11510	NC_021872	TGA	2	6	519373	519378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231091
11511	NC_021872	AGA	2	6	519424	519429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_021872	GCAA	2	8	519474	519481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_021872	TTG	2	6	519523	519528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_021872	TAACT	2	10	519555	519564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11515	NC_021872	CTT	2	6	519582	519587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_021872	T	6	6	519586	519591	0 %	100 %	0 %	0 %	526231092
11517	NC_021872	T	6	6	519605	519610	0 %	100 %	0 %	0 %	526231092
11518	NC_021872	CAT	2	6	519680	519685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231092
11519	NC_021872	TTG	2	6	519715	519720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231092
11520	NC_021872	AT	3	6	519768	519773	50 %	50 %	0 %	0 %	526231092
11521	NC_021872	ATT	2	6	519782	519787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231092
11522	NC_021872	AGCT	2	8	519788	519795	25 %	25 %	25 %	25 %	526231092
11523	NC_021872	ATA	2	6	519910	519915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11524	NC_021872	TAA	2	6	519928	519933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11525	NC_021872	TTG	2	6	519985	519990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231092
11526	NC_021872	ATA	2	6	520071	520076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11527	NC_021872	TAA	2	6	520105	520110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11528	NC_021872	TCG	2	6	520118	520123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231092
11529	NC_021872	TGG	2	6	520124	520129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231092
11530	NC_021872	ATG	2	6	520158	520163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231092
11531	NC_021872	TAA	2	6	520337	520342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11532	NC_021872	AAT	2	6	520349	520354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11533	NC_021872	ACT	2	6	520403	520408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231092
11534	NC_021872	TAA	2	6	520465	520470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231092
11535	NC_021872	T	6	6	520490	520495	0 %	100 %	0 %	0 %	526231092
11536	NC_021872	TATTT	2	10	520532	520541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_021872	TACCA	2	10	520542	520551	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11538	NC_021872	GAT	2	6	520612	520617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231093
11539	NC_021872	ATA	2	6	520678	520683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231093
11540	NC_021872	GCTG	2	8	520691	520698	0 %	25 %	50 %	25 %	526231093
11541	NC_021872	CAG	2	6	520755	520760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231093
11542	NC_021872	TAA	2	6	520808	520813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231093
11543	NC_021872	ATA	2	6	520840	520845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231093
11544	NC_021872	GCT	2	6	520883	520888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_021872	CAG	2	6	521067	521072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_021872	CTT	2	6	521127	521132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_021872	ATT	2	6	521215	521220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_021872	AAT	2	6	521233	521238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_021872	TAA	2	6	521251	521256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_021872	TAA	2	6	521269	521274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_021872	CTT	2	6	521284	521289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_021872	A	6	6	521325	521330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021872	ATT	2	6	521344	521349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_021872	T	6	6	521355	521360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_021872	TTG	2	6	521366	521371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_021872	AAG	2	6	521430	521435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_021872	ATT	2	6	521463	521468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231094
11558	NC_021872	TGG	2	6	521496	521501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231094
11559	NC_021872	TTC	2	6	521502	521507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231094
11560	NC_021872	CGG	2	6	521524	521529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231094
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11562	NC_021872	TGG	2	6	521579	521584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231094
11563	NC_021872	TAA	2	6	521696	521701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231094
11564	NC_021872	ACG	2	6	521724	521729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231094
11565	NC_021872	GGAT	2	8	521776	521783	25 %	25 %	50 %	0 %	526231094
11566	NC_021872	AAT	2	6	521809	521814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231094
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11569	NC_021872	GTT	3	9	521846	521854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232217
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11571	NC_021872	TGA	2	6	521983	521988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232217
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11573	NC_021872	GTT	2	6	522086	522091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232217
11574	NC_021872	TAT	2	6	522140	522145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231095
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11577	NC_021872	ATTA	2	8	522216	522223	50 %	50 %	0 %	0 %	526231095
11578	NC_021872	TAT	3	9	522231	522239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231095
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11580	NC_021872	GAT	2	6	522360	522365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231095
11581	NC_021872	TGC	2	6	522393	522398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231095
11582	NC_021872	GAAGA	2	10	522436	522445	60 %	0 %	40 %	0 %	526231095
11583	NC_021872	A	6	6	522673	522678	100 %	0 %	0 %	0 %	526231095
11584	NC_021872	TGT	2	6	522690	522695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231095
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11589	NC_021872	TTG	2	6	522902	522907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231095
11590	NC_021872	ATT	3	9	522927	522935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231095
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11593	NC_021872	TTC	2	6	523055	523060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231095
11594	NC_021872	AAG	2	6	523061	523066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231095
11595	NC_021872	TGT	2	6	523083	523088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231095
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11598	NC_021872	GCT	2	6	523171	523176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231095
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11601	NC_021872	GTGC	2	8	523291	523298	0 %	25 %	50 %	25 %	526231095
11602	NC_021872	TTG	2	6	523322	523327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231095
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11605	NC_021872	A	6	6	523482	523487	100 %	0 %	0 %	0 %	526231095
11606	NC_021872	TGA	2	6	523569	523574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231095
11607	NC_021872	CAA	2	6	523624	523629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231095
11608	NC_021872	TTG	2	6	523667	523672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231095
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11612	NC_021872	GAG	2	6	523790	523795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231095
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11614	NC_021872	AATTA	2	10	523836	523845	60 %	40 %	0 %	0 %	526231095
11615	NC_021872	TCT	2	6	523850	523855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231095
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11619	NC_021872	TAAA	2	8	523994	524001	75 %	25 %	0 %	0 %	526231095
11620	NC_021872	TGT	2	6	524022	524027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231095
11621	NC_021872	CTT	2	6	524075	524080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11623	NC_021872	ATG	2	6	524134	524139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11996	NC_021872	GCT	2	6	539864	539869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231099
11997	NC_021872	TGA	2	6	539885	539890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231099
11998	NC_021872	GTTA	2	8	539933	539940	25 %	50 %	25 %	0 %	526231099
11999	NC_021872	TTG	2	6	539962	539967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231099
12000	NC_021872	TATT	2	8	539974	539981	25 %	75 %	0 %	0 %	526231099

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