MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021872	TCC	2	6	320664	320669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_021872	ATT	2	6	320674	320679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230924
7003	NC_021872	AGT	2	6	320762	320767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230924
7004	NC_021872	TTA	2	6	320772	320777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230924
7005	NC_021872	CCA	2	6	320816	320821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230924
7006	NC_021872	ACT	2	6	320829	320834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230924
7007	NC_021872	AT	3	6	320916	320921	50 %	50 %	0 %	0 %	526230924
7008	NC_021872	TGA	2	6	320927	320932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230924
7009	NC_021872	ACC	2	6	320953	320958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230924
7010	NC_021872	T	6	6	320960	320965	0 %	100 %	0 %	0 %	526230924
7011	NC_021872	AAGA	2	8	320972	320979	75 %	0 %	25 %	0 %	526230924
7012	NC_021872	AGAA	2	8	321010	321017	75 %	0 %	25 %	0 %	526230924
7013	NC_021872	GCT	2	6	321070	321075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230924
7014	NC_021872	AAT	2	6	321126	321131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230924
7015	NC_021872	AAG	2	6	321196	321201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230924
7016	NC_021872	ATG	2	6	321205	321210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230924
7017	NC_021872	AAG	2	6	321234	321239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230924
7018	NC_021872	AGG	2	6	321531	321536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230924
7019	NC_021872	ACCA	2	8	321545	321552	50 %	0 %	0 %	50 %	526230924
7020	NC_021872	GGC	2	6	321596	321601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230924
7021	NC_021872	A	6	6	321610	321615	100 %	0 %	0 %	0 %	526230924
7022	NC_021872	CAC	2	6	321616	321621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230924
7023	NC_021872	ATT	3	9	321626	321634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230924
7024	NC_021872	GAT	2	6	321646	321651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230924
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7026	NC_021872	TTG	2	6	321704	321709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230924
7027	NC_021872	AAG	2	6	321732	321737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230924
7028	NC_021872	TAAT	2	8	321751	321758	50 %	50 %	0 %	0 %	526230924
7029	NC_021872	AAG	2	6	321818	321823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230924
7030	NC_021872	AGA	2	6	321829	321834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230924
7031	NC_021872	CAAT	2	8	321882	321889	50 %	25 %	0 %	25 %	526230924
7032	NC_021872	CAT	2	6	321982	321987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230925
7033	NC_021872	AT	3	6	321986	321991	50 %	50 %	0 %	0 %	526230925
7034	NC_021872	TAT	2	6	322104	322109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230925
7035	NC_021872	ATTTG	2	10	322197	322206	20 %	60 %	20 %	0 %	526230925
7036	NC_021872	T	6	6	322314	322319	0 %	100 %	0 %	0 %	526230925
7037	NC_021872	ATT	2	6	322324	322329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230925
7038	NC_021872	AGT	2	6	322387	322392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230925
7039	NC_021872	ATT	2	6	322462	322467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230925
7040	NC_021872	GTT	2	6	322511	322516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230925
7041	NC_021872	TTC	2	6	322594	322599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230925
7042	NC_021872	AGA	2	6	322605	322610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230925
7043	NC_021872	T	6	6	322632	322637	0 %	100 %	0 %	0 %	526230925
7044	NC_021872	CAA	2	6	322746	322751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230925
7045	NC_021872	CCA	2	6	322778	322783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230925
7046	NC_021872	AGT	2	6	322787	322792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230925
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7049	NC_021872	CAA	2	6	322893	322898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230925
7050	NC_021872	T	6	6	323031	323036	0 %	100 %	0 %	0 %	526230925
7051	NC_021872	TGA	2	6	323045	323050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230925
7052	NC_021872	AAT	2	6	323104	323109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230925
7053	NC_021872	GATT	2	8	323134	323141	25 %	50 %	25 %	0 %	526230925
7054	NC_021872	GCT	2	6	323201	323206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230925
7055	NC_021872	TAA	2	6	323214	323219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230925
7056	NC_021872	TGA	2	6	323231	323236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230925
7057	NC_021872	CTG	2	6	323307	323312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230925
7058	NC_021872	GTT	2	6	323333	323338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230925
7059	NC_021872	TCA	2	6	323348	323353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230925
7060	NC_021872	TAA	2	6	323400	323405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230925
7061	NC_021872	AT	3	6	323417	323422	50 %	50 %	0 %	0 %	526230925
7062	NC_021872	TCC	2	6	323431	323436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_021872	ATA	2	6	323479	323484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230926
7064	NC_021872	TAA	2	6	323500	323505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230926
7065	NC_021872	AAG	2	6	323506	323511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230926
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7067	NC_021872	AAT	2	6	323566	323571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230926
7068	NC_021872	TC	3	6	323590	323595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_021872	ATTA	2	8	323637	323644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021872	A	6	6	323698	323703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021872	TTTA	2	8	323789	323796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021872	ATGAC	2	10	323806	323815	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7073	NC_021872	ATG	2	6	323817	323822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_021872	AAG	2	6	323844	323849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021872	GAT	2	6	323910	323915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230927
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7077	NC_021872	GAAT	2	8	324264	324271	50 %	25 %	25 %	0 %	526230927
7078	NC_021872	CAT	2	6	324298	324303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230928
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7081	NC_021872	GATT	2	8	324412	324419	25 %	50 %	25 %	0 %	526230928
7082	NC_021872	TGC	2	6	324560	324565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230928
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7085	NC_021872	AAGC	2	8	324720	324727	50 %	0 %	25 %	25 %	526230928
7086	NC_021872	GCT	2	6	324734	324739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230928
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7088	NC_021872	CTG	2	6	324787	324792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230928
7089	NC_021872	TGA	2	6	324800	324805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
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7092	NC_021872	TGA	2	6	324857	324862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
7093	NC_021872	TCA	2	6	325026	325031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230928
7094	NC_021872	TA	3	6	325086	325091	50 %	50 %	0 %	0 %	526230928
7095	NC_021872	GTAT	2	8	325209	325216	25 %	50 %	25 %	0 %	526230928
7096	NC_021872	ATG	2	6	325224	325229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
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7102	NC_021872	TTG	2	6	325653	325658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230929
7103	NC_021872	TACG	2	8	325666	325673	25 %	25 %	25 %	25 %	526230929
7104	NC_021872	TGC	2	6	325769	325774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230929
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7106	NC_021872	AAAT	2	8	325784	325791	75 %	25 %	0 %	0 %	526230929
7107	NC_021872	ATTAA	2	10	325829	325838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_021872	AG	3	6	325862	325867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_021872	ATA	2	6	325883	325888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_021872	T	6	6	325958	325963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_021872	AGG	2	6	325971	325976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7124	NC_021872	AAT	2	6	326496	326501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230930
7125	NC_021872	TCTTGT	2	12	326502	326513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	526230930
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7370	NC_021872	A	7	7	337362	337368	100 %	0 %	0 %	0 %	526230939
7371	NC_021872	A	6	6	337578	337583	100 %	0 %	0 %	0 %	526230939
7372	NC_021872	GTC	2	6	337681	337686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230939
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7382	NC_021872	TTAA	2	8	338413	338420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7383	NC_021872	GTA	2	6	338448	338453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7384	NC_021872	TAT	2	6	338456	338461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7385	NC_021872	TAA	2	6	338462	338467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7475	NC_021872	GCT	2	6	342551	342556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230943
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7479	NC_021872	A	6	6	342867	342872	100 %	0 %	0 %	0 %	526230944
7480	NC_021872	AAG	2	6	342885	342890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230944
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7487	NC_021872	TAA	2	6	343258	343263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230944
7488	NC_021872	CTAT	2	8	343290	343297	25 %	50 %	0 %	25 %	526230944
7489	NC_021872	CCA	2	6	343348	343353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230944
7490	NC_021872	ATC	2	6	343364	343369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230944
7491	NC_021872	GAT	2	6	343391	343396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230944
7492	NC_021872	TGG	2	6	343441	343446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230944
7493	NC_021872	TCAC	2	8	343467	343474	25 %	25 %	0 %	50 %	526230944
7494	NC_021872	TTGATA	2	12	343485	343496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526230944
7495	NC_021872	TGG	2	6	343543	343548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230944
7496	NC_021872	TGC	2	6	343639	343644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230944
7497	NC_021872	GCA	2	6	343694	343699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230944
7498	NC_021872	GTT	2	6	343706	343711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230944
7499	NC_021872	GAT	2	6	343715	343720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230944
7500	NC_021872	TTAC	2	8	343728	343735	25 %	50 %	0 %	25 %	526230944

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