MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021872	GAA	2	6	276050	276055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230898
6003	NC_021872	GCA	2	6	276060	276065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230898
6004	NC_021872	ATT	2	6	276138	276143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
6005	NC_021872	GCT	2	6	276147	276152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230899
6006	NC_021872	ATT	2	6	276264	276269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
6007	NC_021872	TTG	2	6	276274	276279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230899
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6009	NC_021872	AAC	3	9	276340	276348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
6010	NC_021872	CTT	2	6	276384	276389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230899
6011	NC_021872	TAT	2	6	276410	276415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
6012	NC_021872	ATT	2	6	276434	276439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
6013	NC_021872	AAC	2	6	276478	276483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
6014	NC_021872	CCA	2	6	276496	276501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230899
6015	NC_021872	ATG	2	6	276553	276558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230899
6016	NC_021872	TCG	2	6	276577	276582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230899
6017	NC_021872	TAT	2	6	276708	276713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
6018	NC_021872	TGA	2	6	276782	276787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230899
6019	NC_021872	TGAT	2	8	276883	276890	25 %	50 %	25 %	0 %	526230899
6020	NC_021872	AAC	2	6	276896	276901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
6021	NC_021872	ATT	2	6	277047	277052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
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6023	NC_021872	AAG	2	6	277170	277175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230899
6024	NC_021872	GTA	2	6	277330	277335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230899
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6026	NC_021872	ATATG	2	10	277418	277427	40 %	40 %	20 %	0 %	526230899
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6029	NC_021872	TAT	2	6	277512	277517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021872	GTA	3	9	277525	277533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021872	TTA	2	6	277540	277545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021872	GGA	2	6	277552	277557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021872	TTA	2	6	277787	277792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
6034	NC_021872	TGG	2	6	277797	277802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230900
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6041	NC_021872	TGG	2	6	278092	278097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230900
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6043	NC_021872	ATT	2	6	278195	278200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
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6045	NC_021872	TAT	2	6	278224	278229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
6046	NC_021872	TGA	2	6	278233	278238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230900
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6051	NC_021872	GTT	2	6	278381	278386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230900
6052	NC_021872	AAG	2	6	278543	278548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230900
6053	NC_021872	TAA	2	6	278566	278571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021872	GGAA	2	8	278584	278591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021872	TTTC	2	8	278604	278611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_021872	AGG	2	6	278710	278715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_021872	ACA	2	6	278725	278730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230901
6058	NC_021872	A	6	6	278743	278748	100 %	0 %	0 %	0 %	526230901
6059	NC_021872	CTA	2	6	278774	278779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230901
6060	NC_021872	AGT	2	6	278818	278823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230901
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6062	NC_021872	TTC	2	6	278856	278861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230901
6063	NC_021872	TAA	2	6	278895	278900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230901
6064	NC_021872	TGA	2	6	278985	278990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230901
6065	NC_021872	CAT	2	6	279158	279163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230901
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6067	NC_021872	GCAAC	2	10	279211	279220	40 %	0 %	20 %	40 %	526230901
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6070	NC_021872	GTA	2	6	279271	279276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230901
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6072	NC_021872	CAATA	2	10	279418	279427	60 %	20 %	0 %	20 %	526230901
6073	NC_021872	AT	3	6	279459	279464	50 %	50 %	0 %	0 %	526230901
6074	NC_021872	A	6	6	279465	279470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_021872	A	6	6	279475	279480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_021872	CTT	2	6	279507	279512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_021872	CAT	2	6	279567	279572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230902
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6082	NC_021872	TTC	2	6	279721	279726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230902
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6084	NC_021872	TAAA	2	8	279778	279785	75 %	25 %	0 %	0 %	526230902
6085	NC_021872	CAT	2	6	279874	279879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230902
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6088	NC_021872	TAA	2	6	280146	280151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230902
6089	NC_021872	GC	3	6	280248	280253	0 %	0 %	50 %	50 %	526230902
6090	NC_021872	T	7	7	280258	280264	0 %	100 %	0 %	0 %	526230902
6091	NC_021872	ATCGAT	2	12	280318	280329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230902
6092	NC_021872	TAATT	2	10	280336	280345	40 %	60 %	0 %	0 %	526230902
6093	NC_021872	ATT	2	6	280349	280354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230902
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6101	NC_021872	AATAA	2	10	280800	280809	80 %	20 %	0 %	0 %	526230903
6102	NC_021872	A	6	6	280866	280871	100 %	0 %	0 %	0 %	526230903
6103	NC_021872	AT	3	6	280927	280932	50 %	50 %	0 %	0 %	526230903
6104	NC_021872	GGT	2	6	280949	280954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230903
6105	NC_021872	TCT	2	6	281032	281037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230903
6106	NC_021872	GCAT	2	8	281041	281048	25 %	25 %	25 %	25 %	526230903
6107	NC_021872	GAA	2	6	281096	281101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230903
6108	NC_021872	GATCAA	2	12	281105	281116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526230903
6109	NC_021872	AGT	2	6	281159	281164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230903
6110	NC_021872	CAC	2	6	281202	281207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230903
6111	NC_021872	TGA	2	6	281248	281253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230903
6112	NC_021872	TTA	2	6	281284	281289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230903
6113	NC_021872	TGC	2	6	281297	281302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230903
6114	NC_021872	GGA	2	6	281393	281398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230903
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6116	NC_021872	ATC	2	6	281430	281435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230903
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6122	NC_021872	TCT	2	6	281723	281728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230904
6123	NC_021872	TTA	2	6	281810	281815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230904
6124	NC_021872	TTG	2	6	281956	281961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230904
6125	NC_021872	CTG	2	6	282004	282009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230904
6126	NC_021872	CGT	2	6	282059	282064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230904
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6131	NC_021872	TCT	2	6	282395	282400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230904
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6134	NC_021872	ATA	2	6	282566	282571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_021872	TAT	2	6	282578	282583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_021872	CT	3	6	282675	282680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6137	NC_021872	AT	3	6	282715	282720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_021872	TA	3	6	282725	282730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_021872	TAGA	2	8	282760	282767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_021872	TACT	2	8	282783	282790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6141	NC_021872	TGG	2	6	282808	282813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232199
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6154	NC_021872	TGG	2	6	283693	283698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230905
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6207	NC_021872	T	6	6	285682	285687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6208	NC_021872	TAT	2	6	285689	285694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_021872	CAAT	2	8	287088	287095	50 %	25 %	0 %	25 %	526230908
6234	NC_021872	CACCGT	2	12	287109	287120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526230908
6235	NC_021872	AAC	2	6	287130	287135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230908
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6241	NC_021872	ATC	2	6	287278	287283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230908
6242	NC_021872	ATT	2	6	287291	287296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230908
6243	NC_021872	TGC	2	6	287297	287302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230908
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