MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021840	ATGG	2	8	437033	437040	25 %	25 %	50 %	0 %	525934526
10002	NC_021840	GAT	4	12	437050	437061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934526
10003	NC_021840	TGA	2	6	437092	437097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934526
10004	NC_021840	GAA	2	6	437159	437164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934526
10005	NC_021840	CAAAT	2	10	437217	437226	60 %	20 %	0 %	20 %	525934527
10006	NC_021840	GAA	3	9	437249	437257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934527
10007	NC_021840	GACGGC	2	12	437309	437320	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525934527
10008	NC_021840	GAAA	2	8	437331	437338	75 %	0 %	25 %	0 %	525934527
10009	NC_021840	A	6	6	437346	437351	100 %	0 %	0 %	0 %	525934527
10010	NC_021840	ATT	2	6	437417	437422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934527
10011	NC_021840	TGC	3	9	437509	437517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934527
10012	NC_021840	CAG	2	6	437733	437738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934527
10013	NC_021840	GTG	2	6	437873	437878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934527
10014	NC_021840	CAAA	2	8	437935	437942	75 %	0 %	0 %	25 %	525934527
10015	NC_021840	CA	3	6	438066	438071	50 %	0 %	0 %	50 %	525934527
10016	NC_021840	CGCACT	2	12	438121	438132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525934527
10017	NC_021840	A	6	6	438149	438154	100 %	0 %	0 %	0 %	525934527
10018	NC_021840	GGC	2	6	438155	438160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934527
10019	NC_021840	GGT	2	6	438182	438187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934527
10020	NC_021840	CATT	2	8	438198	438205	25 %	50 %	0 %	25 %	525934527
10021	NC_021840	GCA	2	6	438241	438246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934527
10022	NC_021840	AGC	2	6	438346	438351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934527
10023	NC_021840	CTG	2	6	438399	438404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934527
10024	NC_021840	CGG	2	6	438454	438459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934527
10025	NC_021840	GGCAC	2	10	438467	438476	20 %	0 %	40 %	40 %	525934527
10026	NC_021840	CGG	2	6	438523	438528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934527
10027	NC_021840	ATTC	2	8	438545	438552	25 %	50 %	0 %	25 %	525934527
10028	NC_021840	TCC	2	6	438577	438582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_021840	TAT	2	6	438603	438608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934528
10030	NC_021840	AAT	2	6	438666	438671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934528
10031	NC_021840	AAT	2	6	438841	438846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934528
10032	NC_021840	AGCA	2	8	438992	438999	50 %	0 %	25 %	25 %	525934528
10033	NC_021840	CAT	2	6	439096	439101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934528
10034	NC_021840	T	6	6	439126	439131	0 %	100 %	0 %	0 %	525934528
10035	NC_021840	GCA	2	6	439243	439248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934528
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10037	NC_021840	T	6	6	439406	439411	0 %	100 %	0 %	0 %	525934528
10038	NC_021840	ATT	2	6	439455	439460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934528
10039	NC_021840	TTA	2	6	439503	439508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934528
10040	NC_021840	TGA	2	6	439529	439534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934528
10041	NC_021840	A	6	6	439576	439581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_021840	CT	3	6	439600	439605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_021840	A	6	6	439618	439623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021840	ATG	2	6	439691	439696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_021840	GAA	2	6	439702	439707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021840	AGG	2	6	439729	439734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021840	TAT	2	6	439741	439746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934529
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10049	NC_021840	TGG	2	6	439774	439779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934529
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10051	NC_021840	TTG	2	6	439803	439808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934529
10052	NC_021840	TTA	2	6	439815	439820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934529
10053	NC_021840	TAG	2	6	439857	439862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934529
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10055	NC_021840	CGT	2	6	439964	439969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934529
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10057	NC_021840	TTA	2	6	440018	440023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934529
10058	NC_021840	CAT	2	6	440065	440070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934529
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10060	NC_021840	GCGG	2	8	440090	440097	0 %	0 %	75 %	25 %	525934529
10061	NC_021840	CAG	2	6	440196	440201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934529
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10065	NC_021840	CTT	2	6	440470	440475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934529
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10072	NC_021840	AGA	2	6	440662	440667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934529
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10081	NC_021840	TAC	2	6	440886	440891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934529
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10086	NC_021840	AAT	2	6	441063	441068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934529
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10088	NC_021840	GTT	2	6	441111	441116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_021840	T	6	6	441127	441132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021840	A	6	6	441152	441157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_021840	CAAA	2	8	441174	441181	75 %	0 %	0 %	25 %	525934530
10092	NC_021840	A	7	7	441194	441200	100 %	0 %	0 %	0 %	525934530
10093	NC_021840	AAC	2	6	441245	441250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934530
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10105	NC_021840	ATGAA	2	10	441619	441628	60 %	20 %	20 %	0 %	525934530
10106	NC_021840	AGT	2	6	441689	441694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934530
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10108	NC_021840	AGT	2	6	441800	441805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934530
10109	NC_021840	AAG	2	6	441937	441942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934530
10110	NC_021840	GCG	2	6	441943	441948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934530
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10117	NC_021840	A	7	7	442382	442388	100 %	0 %	0 %	0 %	525934530
10118	NC_021840	GGA	2	6	442394	442399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934530
10119	NC_021840	GAAT	2	8	442406	442413	50 %	25 %	25 %	0 %	525934530
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10121	NC_021840	CCG	2	6	442464	442469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525934531
10122	NC_021840	CCG	2	6	442560	442565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525934531
10123	NC_021840	AACC	2	8	442571	442578	50 %	0 %	0 %	50 %	525934531
10124	NC_021840	AGA	2	6	442692	442697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934531
10125	NC_021840	ATGC	2	8	442705	442712	25 %	25 %	25 %	25 %	525934531
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10145	NC_021840	CTA	2	6	443642	443647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934532
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10165	NC_021840	TAT	2	6	444704	444709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10166	NC_021840	T	7	7	444722	444728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10169	NC_021840	TAGAC	2	10	444861	444870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10199	NC_021840	GTCA	2	8	445970	445977	25 %	25 %	25 %	25 %	525934533
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10224	NC_021840	GAA	2	6	446959	446964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934534
10225	NC_021840	TAC	2	6	446982	446987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934534
10226	NC_021840	TCA	2	6	447002	447007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934534
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10229	NC_021840	GGA	2	6	447106	447111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_021840	A	6	6	447134	447139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10231	NC_021840	TTG	2	6	447178	447183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934535
10232	NC_021840	ACA	2	6	447201	447206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934535
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10234	NC_021840	TTTG	2	8	447278	447285	0 %	75 %	25 %	0 %	525934535
10235	NC_021840	CTT	2	6	447298	447303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934535
10236	NC_021840	T	6	6	447439	447444	0 %	100 %	0 %	0 %	525934535
10237	NC_021840	CTT	2	6	447445	447450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934535
10238	NC_021840	TCC	2	6	447507	447512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10239	NC_021840	ATAC	2	8	447521	447528	50 %	25 %	0 %	25 %	525934536
10240	NC_021840	AAC	2	6	447551	447556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934536
10241	NC_021840	ATC	2	6	447573	447578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934536
10242	NC_021840	AG	4	8	447636	447643	50 %	0 %	50 %	0 %	525934536
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10244	NC_021840	GAAA	2	8	447795	447802	75 %	0 %	25 %	0 %	525934536
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10491	NC_021840	A	6	6	458147	458152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_021840	TA	3	6	458167	458172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_021840	A	7	7	458207	458213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10494	NC_021840	TAT	2	6	458217	458222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10495	NC_021840	CTATG	2	10	458226	458235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10496	NC_021840	AGAA	2	8	458249	458256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_021840	ATT	2	6	458292	458297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934546
10498	NC_021840	ATT	2	6	458312	458317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934546
10499	NC_021840	A	6	6	458366	458371	100 %	0 %	0 %	0 %	525934546
10500	NC_021840	TGG	3	9	458386	458394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934546

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