MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_021840	AGA	2	6	2402343	2402348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937042
55002	NC_021840	GAA	2	6	2402367	2402372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937042
55003	NC_021840	ATT	2	6	2402419	2402424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937042
55004	NC_021840	A	6	6	2402623	2402628	100 %	0 %	0 %	0 %	525937043
55005	NC_021840	GT	3	6	2402636	2402641	0 %	50 %	50 %	0 %	525937043
55006	NC_021840	GAA	2	6	2402659	2402664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937043
55007	NC_021840	TAA	2	6	2402669	2402674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937043
55008	NC_021840	ACC	2	6	2402679	2402684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937043
55009	NC_021840	ACAA	2	8	2402751	2402758	75 %	0 %	0 %	25 %	525937043
55010	NC_021840	TAAA	2	8	2402765	2402772	75 %	25 %	0 %	0 %	525937043
55011	NC_021840	A	6	6	2402784	2402789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55012	NC_021840	T	7	7	2402830	2402836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55013	NC_021840	AATT	2	8	2402870	2402877	50 %	50 %	0 %	0 %	525937044
55014	NC_021840	A	6	6	2402930	2402935	100 %	0 %	0 %	0 %	525937044
55015	NC_021840	A	6	6	2403002	2403007	100 %	0 %	0 %	0 %	525937044
55016	NC_021840	TAT	2	6	2403030	2403035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937044
55017	NC_021840	TGGA	2	8	2403061	2403068	25 %	25 %	50 %	0 %	525937044
55018	NC_021840	CAC	2	6	2403086	2403091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937044
55019	NC_021840	AG	3	6	2403124	2403129	50 %	0 %	50 %	0 %	525937044
55020	NC_021840	A	6	6	2403149	2403154	100 %	0 %	0 %	0 %	525937044
55021	NC_021840	A	6	6	2403277	2403282	100 %	0 %	0 %	0 %	525937044
55022	NC_021840	TTA	2	6	2403289	2403294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937044
55023	NC_021840	A	7	7	2403302	2403308	100 %	0 %	0 %	0 %	525937044
55024	NC_021840	TTTATC	2	12	2403309	2403320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525937044
55025	NC_021840	CGA	2	6	2403330	2403335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937044
55026	NC_021840	GAG	2	6	2403377	2403382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937044
55027	NC_021840	A	6	6	2403386	2403391	100 %	0 %	0 %	0 %	525937044
55028	NC_021840	ACA	3	9	2403393	2403401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937044
55029	NC_021840	TA	3	6	2403461	2403466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55030	NC_021840	GAT	2	6	2403478	2403483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55031	NC_021840	AAAAT	2	10	2403488	2403497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55032	NC_021840	GCG	2	6	2403559	2403564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55033	NC_021840	GTTT	2	8	2403584	2403591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55034	NC_021840	AAG	2	6	2403622	2403627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55035	NC_021840	T	6	6	2403670	2403675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55036	NC_021840	ATA	2	6	2403687	2403692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55037	NC_021840	GA	3	6	2403708	2403713	50 %	0 %	50 %	0 %	525937045
55038	NC_021840	AAG	2	6	2403749	2403754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937045
55039	NC_021840	GAACAA	2	12	2403784	2403795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525937045
55040	NC_021840	ATT	2	6	2403881	2403886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937045
55041	NC_021840	CAT	2	6	2403900	2403905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937045
55042	NC_021840	ATA	2	6	2403923	2403928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937045
55043	NC_021840	AAAC	2	8	2403940	2403947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55044	NC_021840	GGT	2	6	2403959	2403964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55045	NC_021840	AGTG	2	8	2403968	2403975	25 %	25 %	50 %	0 %	525936233
55046	NC_021840	GGAAAT	2	12	2404091	2404102	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525936233
55047	NC_021840	AGA	2	6	2404104	2404109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936233
55048	NC_021840	TGC	2	6	2404206	2404211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936233
55049	NC_021840	GAT	2	6	2404267	2404272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936233
55050	NC_021840	GATA	2	8	2404275	2404282	50 %	25 %	25 %	0 %	525936233
55051	NC_021840	TTA	2	6	2404283	2404288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936233
55052	NC_021840	ATG	2	6	2404291	2404296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936233
55053	NC_021840	CAA	2	6	2404300	2404305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936233
55054	NC_021840	ATACAA	2	12	2404333	2404344	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525936233
55055	NC_021840	CGC	2	6	2404347	2404352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525936233
55056	NC_021840	TAT	2	6	2404353	2404358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936233
55057	NC_021840	T	6	6	2404485	2404490	0 %	100 %	0 %	0 %	525936233
55058	NC_021840	TGA	2	6	2404554	2404559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936233
55059	NC_021840	ATT	2	6	2404591	2404596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936233
55060	NC_021840	ATA	2	6	2404607	2404612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936233
55061	NC_021840	TTA	2	6	2404631	2404636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936233
55062	NC_021840	TAC	2	6	2404653	2404658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936233
55063	NC_021840	TAA	2	6	2404665	2404670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936233
55064	NC_021840	AGG	2	6	2404689	2404694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936233
55065	NC_021840	TGA	2	6	2404717	2404722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936234
55066	NC_021840	ACA	2	6	2404741	2404746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936234
55067	NC_021840	ACT	2	6	2404817	2404822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936234
55068	NC_021840	TCTAT	2	10	2404848	2404857	20 %	60 %	0 %	20 %	525936234
55069	NC_021840	TGC	2	6	2404882	2404887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936234
55070	NC_021840	ATGG	2	8	2404919	2404926	25 %	25 %	50 %	0 %	525936234
55071	NC_021840	TGGATT	2	12	2404930	2404941	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525936234
55072	NC_021840	ACG	2	6	2404977	2404982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936234
55073	NC_021840	TAT	2	6	2405033	2405038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936234
55074	NC_021840	GAA	2	6	2405138	2405143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936234
55075	NC_021840	TGAAT	2	10	2405188	2405197	40 %	40 %	20 %	0 %	525936234
55076	NC_021840	ATC	2	6	2405211	2405216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936234
55077	NC_021840	GGC	2	6	2405265	2405270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525936234
55078	NC_021840	AGA	2	6	2405302	2405307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936234
55079	NC_021840	AT	3	6	2405321	2405326	50 %	50 %	0 %	0 %	525936234
55080	NC_021840	CTC	2	6	2405341	2405346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525936234
55081	NC_021840	TGGTA	2	10	2405366	2405375	20 %	40 %	40 %	0 %	525936234
55082	NC_021840	TAT	2	6	2405395	2405400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936234
55083	NC_021840	T	6	6	2405468	2405473	0 %	100 %	0 %	0 %	525936234
55084	NC_021840	GGA	2	6	2405480	2405485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936234
55085	NC_021840	CAA	2	6	2405486	2405491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936234
55086	NC_021840	TAT	2	6	2405576	2405581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936234
55087	NC_021840	ATTC	2	8	2405644	2405651	25 %	50 %	0 %	25 %	525936234
55088	NC_021840	CCTG	2	8	2405705	2405712	0 %	25 %	25 %	50 %	525936234
55089	NC_021840	GAA	2	6	2405726	2405731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936234
55090	NC_021840	ACA	2	6	2405766	2405771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936234
55091	NC_021840	ATG	2	6	2405778	2405783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936234
55092	NC_021840	TTG	2	6	2405859	2405864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936234
55093	NC_021840	AAC	2	6	2405865	2405870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936234
55094	NC_021840	GTAT	2	8	2405913	2405920	25 %	50 %	25 %	0 %	525936234
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55099	NC_021840	TTA	2	6	2406068	2406073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937046
55100	NC_021840	GTT	3	9	2406256	2406264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937046
55101	NC_021840	TA	3	6	2406274	2406279	50 %	50 %	0 %	0 %	525937046
55102	NC_021840	AAG	2	6	2406353	2406358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937046
55103	NC_021840	TTG	2	6	2406398	2406403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937046
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55106	NC_021840	TAT	2	6	2406571	2406576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937046
55107	NC_021840	AAGG	2	8	2406610	2406617	50 %	0 %	50 %	0 %	525937046
55108	NC_021840	A	6	6	2406619	2406624	100 %	0 %	0 %	0 %	525937046
55109	NC_021840	TTA	2	6	2406653	2406658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937046
55110	NC_021840	ACT	2	6	2406676	2406681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937046
55111	NC_021840	GA	3	6	2406694	2406699	50 %	0 %	50 %	0 %	525937046
55112	NC_021840	CA	3	6	2406727	2406732	50 %	0 %	0 %	50 %	525937046
55113	NC_021840	TAA	2	6	2406791	2406796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937046
55114	NC_021840	ATA	2	6	2406797	2406802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937046
55115	NC_021840	ATT	2	6	2406866	2406871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937046
55116	NC_021840	GA	3	6	2406914	2406919	50 %	0 %	50 %	0 %	525937046
55117	NC_021840	AAACAA	2	12	2406920	2406931	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525937046
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55241	NC_021840	GGA	2	6	2412065	2412070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937054
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55474	NC_021840	TAA	2	6	2422412	2422417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937064
55475	NC_021840	A	8	8	2422430	2422437	100 %	0 %	0 %	0 %	525937064
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