MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_021840	ATA	2	6	2381732	2381737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936220
54502	NC_021840	CTC	2	6	2381830	2381835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54503	NC_021840	TCT	2	6	2381851	2381856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54504	NC_021840	TGAA	2	8	2381901	2381908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54505	NC_021840	ATGA	2	8	2381946	2381953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54506	NC_021840	TG	3	6	2381963	2381968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54507	NC_021840	TGAA	2	8	2381977	2381984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54508	NC_021840	TGGA	2	8	2382024	2382031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54509	NC_021840	TAA	2	6	2382036	2382041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936221
54510	NC_021840	TTA	2	6	2382066	2382071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936221
54511	NC_021840	AGA	2	6	2382169	2382174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936221
54512	NC_021840	CGG	2	6	2382199	2382204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525936221
54513	NC_021840	ATGA	2	8	2382242	2382249	50 %	25 %	25 %	0 %	525936221
54514	NC_021840	A	6	6	2382275	2382280	100 %	0 %	0 %	0 %	525936221
54515	NC_021840	TGC	2	6	2382286	2382291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936221
54516	NC_021840	GAA	2	6	2382311	2382316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936221
54517	NC_021840	AATT	2	8	2382357	2382364	50 %	50 %	0 %	0 %	525936221
54518	NC_021840	AGT	2	6	2382391	2382396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936221
54519	NC_021840	GGC	2	6	2382458	2382463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525936221
54520	NC_021840	ATT	2	6	2382488	2382493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936221
54521	NC_021840	ACA	2	6	2382581	2382586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936221
54522	NC_021840	TGC	2	6	2382616	2382621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936221
54523	NC_021840	TGT	2	6	2382646	2382651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936221
54524	NC_021840	AGA	2	6	2382703	2382708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936221
54525	NC_021840	A	6	6	2382762	2382767	100 %	0 %	0 %	0 %	525936221
54526	NC_021840	AAT	2	6	2382772	2382777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936221
54527	NC_021840	TGG	2	6	2382894	2382899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525936222
54528	NC_021840	CAG	2	6	2382915	2382920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936222
54529	NC_021840	GAA	2	6	2383078	2383083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936222
54530	NC_021840	CCT	2	6	2383195	2383200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525936222
54531	NC_021840	AATAA	2	10	2383222	2383231	80 %	20 %	0 %	0 %	525936222
54532	NC_021840	A	8	8	2383247	2383254	100 %	0 %	0 %	0 %	525936222
54533	NC_021840	TGAT	2	8	2383265	2383272	25 %	50 %	25 %	0 %	525936222
54534	NC_021840	ACC	2	6	2383307	2383312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525936222
54535	NC_021840	CAC	2	6	2383333	2383338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525936222
54536	NC_021840	AGA	2	6	2383377	2383382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936222
54537	NC_021840	A	6	6	2383399	2383404	100 %	0 %	0 %	0 %	525936222
54538	NC_021840	GC	3	6	2383418	2383423	0 %	0 %	50 %	50 %	525936222
54539	NC_021840	TTG	2	6	2383553	2383558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936222
54540	NC_021840	GA	3	6	2383575	2383580	50 %	0 %	50 %	0 %	525936222
54541	NC_021840	TGC	2	6	2383596	2383601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936222
54542	NC_021840	GGA	2	6	2383703	2383708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936222
54543	NC_021840	TTA	2	6	2383730	2383735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936223
54544	NC_021840	AAG	2	6	2383776	2383781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936223
54545	NC_021840	ATG	2	6	2383830	2383835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936223
54546	NC_021840	AAG	2	6	2383848	2383853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936223
54547	NC_021840	TGT	2	6	2383945	2383950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936223
54548	NC_021840	GGATT	2	10	2383970	2383979	20 %	40 %	40 %	0 %	525936223
54549	NC_021840	ATG	2	6	2383980	2383985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936223
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54551	NC_021840	TGC	2	6	2384023	2384028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936223
54552	NC_021840	AGC	2	6	2384065	2384070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936223
54553	NC_021840	ATT	2	6	2384080	2384085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936223
54554	NC_021840	CAA	2	6	2384152	2384157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936223
54555	NC_021840	AAG	2	6	2384163	2384168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936223
54556	NC_021840	AGA	2	6	2384173	2384178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936223
54557	NC_021840	TAA	2	6	2384296	2384301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936223
54558	NC_021840	TTA	2	6	2384391	2384396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936223
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54560	NC_021840	AAG	2	6	2384496	2384501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936223
54561	NC_021840	CAA	2	6	2384582	2384587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936223
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54563	NC_021840	AT	3	6	2384797	2384802	50 %	50 %	0 %	0 %	525936223
54564	NC_021840	TTG	2	6	2384844	2384849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936223
54565	NC_021840	TGG	2	6	2384869	2384874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525936223
54566	NC_021840	TTG	2	6	2384895	2384900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936223
54567	NC_021840	TTAA	2	8	2384930	2384937	50 %	50 %	0 %	0 %	525936223
54568	NC_021840	AGT	2	6	2384980	2384985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936223
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54571	NC_021840	ATG	2	6	2385137	2385142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936223
54572	NC_021840	TAA	2	6	2385166	2385171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936223
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54574	NC_021840	TA	3	6	2385179	2385184	50 %	50 %	0 %	0 %	525936223
54575	NC_021840	GCA	2	6	2385239	2385244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936223
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54577	NC_021840	ACC	2	6	2385265	2385270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525936223
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54579	NC_021840	TAAC	2	8	2385339	2385346	50 %	25 %	0 %	25 %	525936223
54580	NC_021840	TTCA	2	8	2385361	2385368	25 %	50 %	0 %	25 %	525936223
54581	NC_021840	GTA	2	6	2385455	2385460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936223
54582	NC_021840	GGA	2	6	2385494	2385499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936223
54583	NC_021840	TAT	2	6	2385538	2385543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936223
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54585	NC_021840	ATT	2	6	2385671	2385676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54586	NC_021840	GAAGT	2	10	2385697	2385706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54587	NC_021840	AATT	2	8	2385735	2385742	50 %	50 %	0 %	0 %	525936224
54588	NC_021840	AAGA	2	8	2385748	2385755	75 %	0 %	25 %	0 %	525936224
54589	NC_021840	AAC	2	6	2385774	2385779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936224
54590	NC_021840	ACC	2	6	2385834	2385839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525936224
54591	NC_021840	AAC	3	9	2385883	2385891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936224
54592	NC_021840	T	6	6	2385895	2385900	0 %	100 %	0 %	0 %	525936224
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54594	NC_021840	CCTTT	2	10	2385945	2385954	0 %	60 %	0 %	40 %	525936224
54595	NC_021840	TTA	2	6	2386019	2386024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936224
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54599	NC_021840	CAG	2	6	2386195	2386200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937011
54600	NC_021840	TGGT	2	8	2386207	2386214	0 %	50 %	50 %	0 %	525937011
54601	NC_021840	T	6	6	2386261	2386266	0 %	100 %	0 %	0 %	525937011
54602	NC_021840	ATT	2	6	2386307	2386312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937011
54603	NC_021840	TTA	2	6	2386363	2386368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937011
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54605	NC_021840	GA	3	6	2386547	2386552	50 %	0 %	50 %	0 %	525937011
54606	NC_021840	TAAA	2	8	2386573	2386580	75 %	25 %	0 %	0 %	525937011
54607	NC_021840	CTA	2	6	2386585	2386590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937011
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54609	NC_021840	TAAA	2	8	2386648	2386655	75 %	25 %	0 %	0 %	525937012
54610	NC_021840	TTC	3	9	2386730	2386738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937012
54611	NC_021840	ATA	2	6	2386768	2386773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937012
54612	NC_021840	CAT	2	6	2386798	2386803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937012
54613	NC_021840	TA	4	8	2386837	2386844	50 %	50 %	0 %	0 %	525937012
54614	NC_021840	AAT	2	6	2386850	2386855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937012
54615	NC_021840	T	6	6	2386858	2386863	0 %	100 %	0 %	0 %	525937012
54616	NC_021840	TCT	2	6	2386910	2386915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937012
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54618	NC_021840	TTC	2	6	2386969	2386974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937012
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