MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_021840	TTAA	2	8	2315755	2315762	50 %	50 %	0 %	0 %	525936164
53002	NC_021840	GTC	2	6	2315767	2315772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936164
53003	NC_021840	CAA	2	6	2315820	2315825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936164
53004	NC_021840	ATC	2	6	2315827	2315832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936164
53005	NC_021840	TG	3	6	2315839	2315844	0 %	50 %	50 %	0 %	525936164
53006	NC_021840	TCG	2	6	2315966	2315971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936164
53007	NC_021840	TCA	2	6	2315987	2315992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936164
53008	NC_021840	CATCA	2	10	2316040	2316049	40 %	20 %	0 %	40 %	525936164
53009	NC_021840	GAA	2	6	2316093	2316098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936164
53010	NC_021840	GAT	2	6	2316141	2316146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936164
53011	NC_021840	TGT	2	6	2316152	2316157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936164
53012	NC_021840	ATA	2	6	2316162	2316167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936164
53013	NC_021840	ATC	2	6	2316181	2316186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936164
53014	NC_021840	T	6	6	2316255	2316260	0 %	100 %	0 %	0 %	525936164
53015	NC_021840	CCT	2	6	2316265	2316270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53016	NC_021840	TGTA	2	8	2316277	2316284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53017	NC_021840	A	6	6	2316370	2316375	100 %	0 %	0 %	0 %	525936165
53018	NC_021840	AAC	2	6	2316380	2316385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936165
53019	NC_021840	AAT	2	6	2316398	2316403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936165
53020	NC_021840	T	6	6	2316403	2316408	0 %	100 %	0 %	0 %	525936165
53021	NC_021840	AGT	2	6	2316477	2316482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936165
53022	NC_021840	TG	3	6	2316504	2316509	0 %	50 %	50 %	0 %	525936165
53023	NC_021840	ACGG	2	8	2316550	2316557	25 %	0 %	50 %	25 %	525936165
53024	NC_021840	T	6	6	2316561	2316566	0 %	100 %	0 %	0 %	525936165
53025	NC_021840	TTC	2	6	2316596	2316601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936165
53026	NC_021840	TAT	2	6	2316645	2316650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53027	NC_021840	AAATT	2	10	2316675	2316684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53028	NC_021840	AGT	2	6	2316703	2316708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53029	NC_021840	CAAA	2	8	2316727	2316734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53030	NC_021840	CT	3	6	2316737	2316742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53031	NC_021840	AG	3	6	2316756	2316761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53032	NC_021840	TATT	2	8	2316769	2316776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53033	NC_021840	TTG	2	6	2316855	2316860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936166
53034	NC_021840	TGTT	2	8	2316885	2316892	0 %	75 %	25 %	0 %	525936166
53035	NC_021840	T	6	6	2316891	2316896	0 %	100 %	0 %	0 %	525936166
53036	NC_021840	TGCT	2	8	2316911	2316918	0 %	50 %	25 %	25 %	525936166
53037	NC_021840	GTTT	2	8	2316923	2316930	0 %	75 %	25 %	0 %	525936166
53038	NC_021840	GTTTT	2	10	2316949	2316958	0 %	80 %	20 %	0 %	525936166
53039	NC_021840	T	6	6	2316966	2316971	0 %	100 %	0 %	0 %	525936166
53040	NC_021840	TCT	2	6	2316979	2316984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936166
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53043	NC_021840	CGTTG	2	10	2317443	2317452	0 %	40 %	40 %	20 %	525936166
53044	NC_021840	GT	3	6	2317529	2317534	0 %	50 %	50 %	0 %	525936166
53045	NC_021840	CGTTG	2	10	2317647	2317656	0 %	40 %	40 %	20 %	525936166
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53047	NC_021840	TAGT	2	8	2317882	2317889	25 %	50 %	25 %	0 %	525936166
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53051	NC_021840	CTT	2	6	2318240	2318245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936166
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53053	NC_021840	A	6	6	2318325	2318330	100 %	0 %	0 %	0 %	525936166
53054	NC_021840	TTA	3	9	2318359	2318367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936166
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53057	NC_021840	ATG	2	6	2318537	2318542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936166
53058	NC_021840	T	6	6	2318604	2318609	0 %	100 %	0 %	0 %	525936166
53059	NC_021840	TTC	2	6	2318613	2318618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936166
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53061	NC_021840	GTA	2	6	2318788	2318793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936166
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53064	NC_021840	GTTTG	2	10	2318854	2318863	0 %	60 %	40 %	0 %	525936166
53065	NC_021840	TAC	2	6	2319069	2319074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936166
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53068	NC_021840	TCC	2	6	2319175	2319180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53069	NC_021840	T	7	7	2319184	2319190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53070	NC_021840	ATT	2	6	2319205	2319210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53071	NC_021840	CAA	3	9	2319233	2319241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53072	NC_021840	AATT	2	8	2319242	2319249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53073	NC_021840	AGT	2	6	2319256	2319261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_021840	TTA	2	6	2319313	2319318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53075	NC_021840	T	7	7	2319326	2319332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53076	NC_021840	TTC	2	6	2319429	2319434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53077	NC_021840	AGAC	2	8	2319438	2319445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53078	NC_021840	AT	4	8	2319465	2319472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53079	NC_021840	TAT	2	6	2319499	2319504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937008
53080	NC_021840	TTTG	2	8	2319525	2319532	0 %	75 %	25 %	0 %	525937008
53081	NC_021840	AT	3	6	2319537	2319542	50 %	50 %	0 %	0 %	525937008
53082	NC_021840	GAA	2	6	2319550	2319555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937008
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53084	NC_021840	TGG	2	6	2319634	2319639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53085	NC_021840	TG	3	6	2319666	2319671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53086	NC_021840	GCAT	2	8	2319714	2319721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53087	NC_021840	TGG	2	6	2319782	2319787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53088	NC_021840	TG	3	6	2319814	2319819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53089	NC_021840	GCAT	2	8	2319862	2319869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53090	NC_021840	CAAA	2	8	2319904	2319911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53091	NC_021840	GC	3	6	2319979	2319984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53092	NC_021840	ACT	2	6	2320066	2320071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53093	NC_021840	AT	3	6	2320107	2320112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53094	NC_021840	T	7	7	2320192	2320198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53095	NC_021840	AAT	2	6	2320214	2320219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53096	NC_021840	TGG	2	6	2320372	2320377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525936167
53097	NC_021840	CCG	2	6	2320398	2320403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525936167
53098	NC_021840	GACC	2	8	2320532	2320539	25 %	0 %	25 %	50 %	525936167
53099	NC_021840	AGG	2	6	2320569	2320574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53100	NC_021840	AAT	2	6	2320611	2320616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936168
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53102	NC_021840	CGA	2	6	2320714	2320719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936168
53103	NC_021840	GTTT	2	8	2320720	2320727	0 %	75 %	25 %	0 %	525936168
53104	NC_021840	CAG	2	6	2320762	2320767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936168
53105	NC_021840	AT	4	8	2320783	2320790	50 %	50 %	0 %	0 %	525936168
53106	NC_021840	A	6	6	2320823	2320828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53107	NC_021840	TTA	2	6	2320860	2320865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936169
53108	NC_021840	A	7	7	2320869	2320875	100 %	0 %	0 %	0 %	525936169
53109	NC_021840	GT	3	6	2320886	2320891	0 %	50 %	50 %	0 %	525936169
53110	NC_021840	TAA	2	6	2320949	2320954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936169
53111	NC_021840	GC	3	6	2320969	2320974	0 %	0 %	50 %	50 %	525936169
53112	NC_021840	ATC	2	6	2321028	2321033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936169
53113	NC_021840	CTT	2	6	2321074	2321079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936169
53114	NC_021840	TTC	2	6	2321085	2321090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936169
53115	NC_021840	GCT	2	6	2321095	2321100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936169
53116	NC_021840	AAT	2	6	2321114	2321119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936169
53117	NC_021840	ATG	2	6	2321173	2321178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936169
53118	NC_021840	ACC	2	6	2321268	2321273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525936169
53119	NC_021840	CTG	2	6	2321279	2321284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936169
53120	NC_021840	TCA	2	6	2321305	2321310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936169
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53122	NC_021840	CTA	2	6	2321441	2321446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936169
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53457	NC_021840	A	7	7	2334505	2334511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53458	NC_021840	AACTT	2	10	2334519	2334528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53459	NC_021840	A	6	6	2334552	2334557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53460	NC_021840	GAA	2	6	2334569	2334574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53462	NC_021840	A	6	6	2334593	2334598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53463	NC_021840	ATAA	2	8	2334697	2334704	75 %	25 %	0 %	0 %	525936183
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53481	NC_021840	AGTA	2	8	2335519	2335526	50 %	25 %	25 %	0 %	525936183
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