MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021840	AGC	2	6	40	45	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021840	TGG	2	6	200	205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021840	AAG	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021840	TAGGCG	2	12	334	345	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021840	ACA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021840	AGTG	2	8	447	454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021840	GGAA	2	8	501	508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021840	AGT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021840	GAG	2	6	599	604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021840	GA	3	6	622	627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021840	GA	3	6	701	706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021840	CGG	2	6	859	864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021840	GA	3	6	957	962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021840	TAGG	2	8	1075	1082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021840	GAG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021840	TGG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021840	TAC	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021840	CCT	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021840	ATGG	2	8	1258	1265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021840	GGT	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021840	TCG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021840	CGT	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021840	GAG	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021840	AC	3	6	1632	1637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021840	GTT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021840	TG	3	6	1683	1688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021840	C	6	6	1724	1729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_021840	TTC	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021840	GAT	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021840	ATCG	2	8	1836	1843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021840	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021840	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021840	GA	3	6	1903	1908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021840	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021840	ATT	2	6	2065	2070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021840	T	7	7	2077	2083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021840	CTA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934213
38	NC_021840	GT	3	6	2297	2302	0 %	50 %	50 %	0 %	525934213
39	NC_021840	ATA	2	6	2354	2359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934213
40	NC_021840	ATT	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
41	NC_021840	TTA	2	6	2459	2464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
42	NC_021840	CAAAT	2	10	2489	2498	60 %	20 %	0 %	20 %	525934213
43	NC_021840	GAT	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934213
44	NC_021840	AAAG	2	8	2579	2586	75 %	0 %	25 %	0 %	525934213
45	NC_021840	TA	3	6	2600	2605	50 %	50 %	0 %	0 %	525934213
46	NC_021840	ATT	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
47	NC_021840	GGT	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934213
48	NC_021840	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021840	T	7	7	2729	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021840	ATTT	2	8	2736	2743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021840	TAA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021840	ATT	2	6	2883	2888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021840	CTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934214
54	NC_021840	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
55	NC_021840	A	6	6	3005	3010	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
56	NC_021840	ATT	3	9	3083	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934214
57	NC_021840	GCG	2	6	3107	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
58	NC_021840	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934214
59	NC_021840	GAATG	2	10	3184	3193	40 %	20 %	40 %	0 %	525934214
60	NC_021840	GTG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934214
61	NC_021840	GCG	2	6	3287	3292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
62	NC_021840	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
63	NC_021840	AGA	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934214
64	NC_021840	AGT	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934214
65	NC_021840	A	6	6	3393	3398	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
66	NC_021840	TAT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
67	NC_021840	TGG	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934215
68	NC_021840	TGCT	2	8	3454	3461	0 %	50 %	25 %	25 %	525934215
69	NC_021840	GCG	2	6	3465	3470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934215
70	NC_021840	TAT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
71	NC_021840	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
72	NC_021840	AAGT	2	8	3529	3536	50 %	25 %	25 %	0 %	525934215
73	NC_021840	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
74	NC_021840	ATG	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
75	NC_021840	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
76	NC_021840	AGGAT	2	10	3703	3712	40 %	20 %	40 %	0 %	525934215
77	NC_021840	CTG	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
78	NC_021840	ACG	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
79	NC_021840	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
80	NC_021840	CAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
81	NC_021840	TTG	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
82	NC_021840	ATA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934215
83	NC_021840	GAA	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
84	NC_021840	GCA	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
85	NC_021840	TTG	2	6	4276	4281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
86	NC_021840	ATT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
87	NC_021840	A	7	7	4406	4412	100 %	0 %	0 %	0 %	525934215
88	NC_021840	AATC	2	8	4421	4428	50 %	25 %	0 %	25 %	525934215
89	NC_021840	TGCT	2	8	4450	4457	0 %	50 %	25 %	25 %	525934215
90	NC_021840	AGA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
91	NC_021840	GGA	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021840	AGA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
93	NC_021840	ATG	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
94	NC_021840	ATT	2	6	4896	4901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
95	NC_021840	CTA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934216
96	NC_021840	AAC	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934216
97	NC_021840	A	6	6	5260	5265	100 %	0 %	0 %	0 %	525934216
98	NC_021840	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
99	NC_021840	GC	3	6	5370	5375	0 %	0 %	50 %	50 %	525934216
100	NC_021840	ATT	2	6	5460	5465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
101	NC_021840	TTAT	2	8	5581	5588	25 %	75 %	0 %	0 %	525934216
102	NC_021840	GGC	2	6	5636	5641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934216
103	NC_021840	ATG	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
104	NC_021840	TAG	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
105	NC_021840	ATT	2	6	5724	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
106	NC_021840	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
107	NC_021840	GAA	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
108	NC_021840	AACCT	2	10	5838	5847	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021840	ATTT	2	8	5855	5862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021840	T	6	6	5860	5865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021840	AGA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
112	NC_021840	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
113	NC_021840	TAA	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
114	NC_021840	T	6	6	6069	6074	0 %	100 %	0 %	0 %	525934217
115	NC_021840	AG	3	6	6097	6102	50 %	0 %	50 %	0 %	525934217
116	NC_021840	AAG	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
117	NC_021840	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
118	NC_021840	GTT	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934217
119	NC_021840	AGA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
120	NC_021840	TAG	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
121	NC_021840	GAT	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
122	NC_021840	ATG	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
123	NC_021840	TTTA	2	8	6312	6319	25 %	75 %	0 %	0 %	525934217
124	NC_021840	GCT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
125	NC_021840	TAA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
126	NC_021840	ATT	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
127	NC_021840	TCG	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
128	NC_021840	AGG	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934217
129	NC_021840	AGA	2	6	6729	6734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934218
130	NC_021840	TGAA	2	8	6800	6807	50 %	25 %	25 %	0 %	525934218
131	NC_021840	AGG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934218
132	NC_021840	GAG	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
133	NC_021840	TAT	2	6	7077	7082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
134	NC_021840	GT	4	8	7127	7134	0 %	50 %	50 %	0 %	525934219
135	NC_021840	AAT	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
136	NC_021840	AAG	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
137	NC_021840	ATT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
138	NC_021840	ATA	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
139	NC_021840	ATG	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934219
140	NC_021840	CG	3	6	7468	7473	0 %	0 %	50 %	50 %	525934219
141	NC_021840	AGA	2	6	7476	7481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
142	NC_021840	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
143	NC_021840	AGG	2	6	7538	7543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
144	NC_021840	TTGT	2	8	7638	7645	0 %	75 %	25 %	0 %	525934220
145	NC_021840	ATC	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
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147	NC_021840	TTAG	2	8	7997	8004	25 %	50 %	25 %	0 %	525934220
148	NC_021840	TGG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934220
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150	NC_021840	TG	3	6	8115	8120	0 %	50 %	50 %	0 %	525934220
151	NC_021840	GCAA	2	8	8155	8162	50 %	0 %	25 %	25 %	525934220
152	NC_021840	ATGT	2	8	8183	8190	25 %	50 %	25 %	0 %	525934220
153	NC_021840	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
154	NC_021840	AAC	3	9	8262	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
155	NC_021840	CTG	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934220
156	NC_021840	TTG	2	6	8309	8314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
157	NC_021840	AATT	2	8	8439	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	525934220
158	NC_021840	GAT	2	6	8450	8455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
159	NC_021840	TG	3	6	8528	8533	0 %	50 %	50 %	0 %	525934220
160	NC_021840	A	6	6	8534	8539	100 %	0 %	0 %	0 %	525934220
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163	NC_021840	GAT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
164	NC_021840	ATT	2	6	8630	8635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934220
165	NC_021840	CAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
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168	NC_021840	AAG	2	6	8739	8744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
169	NC_021840	GGAA	2	8	8787	8794	50 %	0 %	50 %	0 %	525934220
170	NC_021840	TGCT	2	8	8796	8803	0 %	50 %	25 %	25 %	525934220
171	NC_021840	CGGA	2	8	8858	8865	25 %	0 %	50 %	25 %	525934220
172	NC_021840	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
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174	NC_021840	GCG	2	6	9005	9010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
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176	NC_021840	TGGT	2	8	9228	9235	0 %	50 %	50 %	0 %	525934220
177	NC_021840	TAG	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
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179	NC_021840	A	6	6	9401	9406	100 %	0 %	0 %	0 %	525934220
180	NC_021840	CAA	2	6	9410	9415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
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208	NC_021840	TGA	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934221
209	NC_021840	ATT	2	6	11005	11010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
210	NC_021840	GAA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
211	NC_021840	TAG	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934221
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213	NC_021840	GAG	2	6	11186	11191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_021840	AT	3	6	12500	12505	50 %	50 %	0 %	0 %	525934223
231	NC_021840	TTA	2	6	12525	12530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934223
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234	NC_021840	TCA	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934223
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243	NC_021840	AGA	2	6	13165	13170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934224
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246	NC_021840	AGA	2	6	13288	13293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934224
247	NC_021840	ACT	2	6	13304	13309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934224
248	NC_021840	CA	3	6	13349	13354	50 %	0 %	0 %	50 %	525934224
249	NC_021840	ATG	2	6	13362	13367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934224
250	NC_021840	ACA	2	6	13560	13565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934224
251	NC_021840	GATGCA	2	12	13574	13585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525934224
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255	NC_021840	TAAA	2	8	13740	13747	75 %	25 %	0 %	0 %	525934224
256	NC_021840	ATT	3	9	13796	13804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934224
257	NC_021840	GAA	2	6	13820	13825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934224
258	NC_021840	GAAAAA	2	12	13843	13854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525934224
259	NC_021840	TGG	2	6	13918	13923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934224
260	NC_021840	CTT	2	6	13925	13930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934224
261	NC_021840	AGCG	2	8	13936	13943	25 %	0 %	50 %	25 %	525934224
262	NC_021840	AGA	2	6	13954	13959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934224
263	NC_021840	AGT	2	6	13975	13980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934224
264	NC_021840	AAC	2	6	13989	13994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934224
265	NC_021840	TAG	3	9	14064	14072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934224
266	NC_021840	AAAC	2	8	14081	14088	75 %	0 %	0 %	25 %	525934224
267	NC_021840	GAATC	2	10	14113	14122	40 %	20 %	20 %	20 %	525934224
268	NC_021840	AAGC	2	8	14144	14151	50 %	0 %	25 %	25 %	525934224
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270	NC_021840	GAT	2	6	14204	14209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934224
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