MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_021839	AAC	2	6	2010549	2010554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931394
46003	NC_021839	TTGA	2	8	2010660	2010667	25 %	50 %	25 %	0 %	525931394
46004	NC_021839	AAT	2	6	2010696	2010701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931394
46005	NC_021839	CT	3	6	2010714	2010719	0 %	50 %	0 %	50 %	525931394
46006	NC_021839	ATA	2	6	2010756	2010761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931394
46007	NC_021839	GCG	2	6	2010834	2010839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525931394
46008	NC_021839	TTTCG	2	10	2010840	2010849	0 %	60 %	20 %	20 %	525931394
46009	NC_021839	GTT	2	6	2010850	2010855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931394
46010	NC_021839	CTT	2	6	2010865	2010870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931394
46011	NC_021839	AAT	2	6	2010943	2010948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931394
46012	NC_021839	CCA	2	6	2010952	2010957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931394
46013	NC_021839	AAT	2	6	2011039	2011044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931394
46014	NC_021839	CAG	2	6	2011085	2011090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931394
46015	NC_021839	T	6	6	2011100	2011105	0 %	100 %	0 %	0 %	525931394
46016	NC_021839	CTT	2	6	2011127	2011132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931394
46017	NC_021839	TAA	2	6	2011155	2011160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931394
46018	NC_021839	CA	3	6	2011192	2011197	50 %	0 %	0 %	50 %	525931394
46019	NC_021839	CT	3	6	2011222	2011227	0 %	50 %	0 %	50 %	525931394
46020	NC_021839	CTA	2	6	2011229	2011234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931394
46021	NC_021839	CAT	2	6	2011244	2011249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931394
46022	NC_021839	AAG	3	9	2011266	2011274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931394
46023	NC_021839	CAC	2	6	2011301	2011306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931394
46024	NC_021839	AAC	2	6	2011350	2011355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931394
46025	NC_021839	TTC	2	6	2011417	2011422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931394
46026	NC_021839	TTTTG	2	10	2011444	2011453	0 %	80 %	20 %	0 %	525931394
46027	NC_021839	TTACA	2	10	2011511	2011520	40 %	40 %	0 %	20 %	525931394
46028	NC_021839	TTC	2	6	2011530	2011535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931394
46029	NC_021839	TTA	2	6	2011567	2011572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931394
46030	NC_021839	TCA	2	6	2011723	2011728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46031	NC_021839	TAT	2	6	2011739	2011744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46032	NC_021839	T	7	7	2011773	2011779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46033	NC_021839	ATAC	2	8	2011804	2011811	50 %	25 %	0 %	25 %	525931395
46034	NC_021839	TCA	2	6	2011849	2011854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931395
46035	NC_021839	AAT	2	6	2011864	2011869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931395
46036	NC_021839	TAC	2	6	2011895	2011900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931395
46037	NC_021839	A	7	7	2011992	2011998	100 %	0 %	0 %	0 %	525931395
46038	NC_021839	TAA	2	6	2012022	2012027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931395
46039	NC_021839	TTC	2	6	2012040	2012045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931395
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46042	NC_021839	GTAT	2	8	2012139	2012146	25 %	50 %	25 %	0 %	525931395
46043	NC_021839	T	6	6	2012225	2012230	0 %	100 %	0 %	0 %	525931395
46044	NC_021839	TTC	2	6	2012323	2012328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931395
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46047	NC_021839	ATATT	2	10	2012479	2012488	40 %	60 %	0 %	0 %	525931395
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46050	NC_021839	TAA	2	6	2012594	2012599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931395
46051	NC_021839	CCG	2	6	2012603	2012608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931395
46052	NC_021839	ATA	3	9	2012647	2012655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931395
46053	NC_021839	CAA	2	6	2012672	2012677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931395
46054	NC_021839	ATT	2	6	2012682	2012687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931395
46055	NC_021839	TAG	2	6	2012724	2012729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931395
46056	NC_021839	ATA	2	6	2012806	2012811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931395
46057	NC_021839	TTAC	2	8	2012839	2012846	25 %	50 %	0 %	25 %	525931395
46058	NC_021839	ATTC	2	8	2012915	2012922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46059	NC_021839	TC	3	6	2012921	2012926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46060	NC_021839	AAC	2	6	2012937	2012942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46061	NC_021839	GTT	2	6	2012956	2012961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46063	NC_021839	A	6	6	2012991	2012996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46064	NC_021839	TC	3	6	2013015	2013020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46065	NC_021839	T	6	6	2013028	2013033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46066	NC_021839	CTG	2	6	2013063	2013068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931396
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46071	NC_021839	CAAA	2	8	2013357	2013364	75 %	0 %	0 %	25 %	525931396
46072	NC_021839	CAG	2	6	2013369	2013374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931396
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46083	NC_021839	TC	3	6	2013847	2013852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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46086	NC_021839	TTG	2	6	2013913	2013918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46087	NC_021839	TAG	3	9	2013947	2013955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46090	NC_021839	TTTA	2	8	2014029	2014036	25 %	75 %	0 %	0 %	525932400
46091	NC_021839	CTT	2	6	2014039	2014044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932400
46092	NC_021839	A	6	6	2014049	2014054	100 %	0 %	0 %	0 %	525932400
46093	NC_021839	GATTAC	2	12	2014065	2014076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525932400
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46101	NC_021839	AGA	2	6	2014467	2014472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932400
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46103	NC_021839	ATT	2	6	2014519	2014524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932400
46104	NC_021839	TAT	2	6	2014566	2014571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46105	NC_021839	CTT	2	6	2014576	2014581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46106	NC_021839	TAA	2	6	2014622	2014627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46107	NC_021839	GT	3	6	2014643	2014648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46108	NC_021839	ATGA	2	8	2014654	2014661	50 %	25 %	25 %	0 %	525931397
46109	NC_021839	TCA	2	6	2014761	2014766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931397
46110	NC_021839	ATT	2	6	2014792	2014797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931397
46111	NC_021839	GGC	2	6	2014855	2014860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525931397
46112	NC_021839	TTAT	2	8	2014897	2014904	25 %	75 %	0 %	0 %	525931397
46113	NC_021839	TTG	2	6	2014922	2014927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931397
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46115	NC_021839	T	8	8	2015035	2015042	0 %	100 %	0 %	0 %	525931398
46116	NC_021839	T	7	7	2015059	2015065	0 %	100 %	0 %	0 %	525931398
46117	NC_021839	AAG	2	6	2015066	2015071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931398
46118	NC_021839	AACA	2	8	2015089	2015096	75 %	0 %	0 %	25 %	525931398
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46500	NC_021839	TAAAA	2	10	2032492	2032501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

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