MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_021839	TCG	2	6	1629898	1629903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932368
37502	NC_021839	AAG	2	6	1629945	1629950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932368
37503	NC_021839	T	6	6	1629956	1629961	0 %	100 %	0 %	0 %	525932368
37504	NC_021839	CTT	2	6	1630042	1630047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932368
37505	NC_021839	ATA	2	6	1630050	1630055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932368
37506	NC_021839	TTC	2	6	1630085	1630090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932368
37507	NC_021839	CTA	2	6	1630168	1630173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932368
37508	NC_021839	CACT	2	8	1630202	1630209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37509	NC_021839	ACT	2	6	1630327	1630332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931058
37510	NC_021839	TTG	2	6	1630403	1630408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931058
37511	NC_021839	TTTAC	2	10	1630443	1630452	20 %	60 %	0 %	20 %	525931058
37512	NC_021839	GCA	2	6	1630509	1630514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931058
37513	NC_021839	AAT	2	6	1630595	1630600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931058
37514	NC_021839	CCA	2	6	1630614	1630619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931058
37515	NC_021839	TTG	2	6	1630643	1630648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931058
37516	NC_021839	CTT	2	6	1630702	1630707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931058
37517	NC_021839	ATC	2	6	1630769	1630774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931058
37518	NC_021839	GTT	2	6	1630876	1630881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931058
37519	NC_021839	AAT	2	6	1630964	1630969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931058
37520	NC_021839	ATC	2	6	1630998	1631003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37521	NC_021839	TCT	2	6	1631007	1631012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37522	NC_021839	TGGT	2	8	1631063	1631070	0 %	50 %	50 %	0 %	525931059
37523	NC_021839	CAA	2	6	1631161	1631166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931059
37524	NC_021839	ATC	3	9	1631186	1631194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931059
37525	NC_021839	AGT	2	6	1631196	1631201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931059
37526	NC_021839	CTT	2	6	1631224	1631229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
37527	NC_021839	AACT	2	8	1631242	1631249	50 %	25 %	0 %	25 %	525931059
37528	NC_021839	T	6	6	1631285	1631290	0 %	100 %	0 %	0 %	525931059
37529	NC_021839	TGT	2	6	1631309	1631314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931059
37530	NC_021839	TGC	2	6	1631360	1631365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931059
37531	NC_021839	GAT	2	6	1631453	1631458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931059
37532	NC_021839	ATC	2	6	1631468	1631473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931059
37533	NC_021839	TAT	2	6	1631518	1631523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931059
37534	NC_021839	GAA	2	6	1631527	1631532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931059
37535	NC_021839	TCT	2	6	1631577	1631582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
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37538	NC_021839	TTC	2	6	1631646	1631651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
37539	NC_021839	TCA	2	6	1631715	1631720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931059
37540	NC_021839	CAA	2	6	1631722	1631727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931059
37541	NC_021839	TAC	2	6	1631837	1631842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931059
37542	NC_021839	CTA	2	6	1631857	1631862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931059
37543	NC_021839	TTC	2	6	1631903	1631908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
37544	NC_021839	GTTT	2	8	1631929	1631936	0 %	75 %	25 %	0 %	525931059
37545	NC_021839	GAT	2	6	1632013	1632018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931059
37546	NC_021839	ATTA	2	8	1632026	1632033	50 %	50 %	0 %	0 %	525931059
37547	NC_021839	ATAA	2	8	1632104	1632111	75 %	25 %	0 %	0 %	525931059
37548	NC_021839	CCA	2	6	1632126	1632131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931059
37549	NC_021839	ACA	2	6	1632138	1632143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931059
37550	NC_021839	CTT	2	6	1632148	1632153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
37551	NC_021839	T	6	6	1632178	1632183	0 %	100 %	0 %	0 %	525931059
37552	NC_021839	TGC	3	9	1632248	1632256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931059
37553	NC_021839	TTC	2	6	1632365	1632370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
37554	NC_021839	CTT	2	6	1632523	1632528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931059
37555	NC_021839	T	6	6	1632618	1632623	0 %	100 %	0 %	0 %	525931059
37556	NC_021839	TGC	2	6	1632653	1632658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931059
37557	NC_021839	AT	3	6	1632680	1632685	50 %	50 %	0 %	0 %	525931059
37558	NC_021839	TCC	2	6	1632700	1632705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37559	NC_021839	T	6	6	1632774	1632779	0 %	100 %	0 %	0 %	525931060
37560	NC_021839	GT	3	6	1632783	1632788	0 %	50 %	50 %	0 %	525931060
37561	NC_021839	CTT	4	12	1632873	1632884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931060
37562	NC_021839	TCT	2	6	1632916	1632921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931060
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37567	NC_021839	ATT	2	6	1633107	1633112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37568	NC_021839	T	6	6	1633111	1633116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37569	NC_021839	TTTA	2	8	1633127	1633134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37570	NC_021839	GTC	2	6	1633143	1633148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37571	NC_021839	CCTA	2	8	1633149	1633156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37572	NC_021839	TCC	2	6	1633190	1633195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37573	NC_021839	ATT	2	6	1633290	1633295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37574	NC_021839	TAAA	2	8	1633329	1633336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37575	NC_021839	AGG	2	6	1633356	1633361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37579	NC_021839	TAAAA	2	10	1633614	1633623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37580	NC_021839	A	7	7	1633620	1633626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37581	NC_021839	TAA	2	6	1633673	1633678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931062
37582	NC_021839	CAT	2	6	1633952	1633957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931062
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37584	NC_021839	TATCT	2	10	1634009	1634018	20 %	60 %	0 %	20 %	525931062
37585	NC_021839	TTC	2	6	1634123	1634128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931062
37586	NC_021839	AG	3	6	1634132	1634137	50 %	0 %	50 %	0 %	525931062
37587	NC_021839	CGGT	2	8	1634161	1634168	0 %	25 %	50 %	25 %	525931062
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37589	NC_021839	ATTA	2	8	1634285	1634292	50 %	50 %	0 %	0 %	525931062
37590	NC_021839	CTT	2	6	1634311	1634316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37591	NC_021839	CTA	2	6	1634352	1634357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37592	NC_021839	CGC	2	6	1634491	1634496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931063
37593	NC_021839	T	6	6	1634557	1634562	0 %	100 %	0 %	0 %	525931063
37594	NC_021839	GAAT	2	8	1634575	1634582	50 %	25 %	25 %	0 %	525931063
37595	NC_021839	ATGT	2	8	1634796	1634803	25 %	50 %	25 %	0 %	525931063
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37597	NC_021839	GTCC	2	8	1634905	1634912	0 %	25 %	25 %	50 %	525931063
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37599	NC_021839	T	6	6	1635041	1635046	0 %	100 %	0 %	0 %	525931064
37600	NC_021839	CATG	2	8	1635141	1635148	25 %	25 %	25 %	25 %	525931064
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37602	NC_021839	CTG	2	6	1635339	1635344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931064
37603	NC_021839	CTT	2	6	1635450	1635455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931064
37604	NC_021839	TCA	2	6	1635464	1635469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931064
37605	NC_021839	CAT	2	6	1635483	1635488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931064
37606	NC_021839	CTTC	2	8	1635588	1635595	0 %	50 %	0 %	50 %	525931064
37607	NC_021839	CTA	2	6	1635603	1635608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931064
37608	NC_021839	A	6	6	1635608	1635613	100 %	0 %	0 %	0 %	525931064
37609	NC_021839	CAT	2	6	1635768	1635773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931064
37610	NC_021839	CTCG	2	8	1635815	1635822	0 %	25 %	25 %	50 %	525931064
37611	NC_021839	TTCC	2	8	1635837	1635844	0 %	50 %	0 %	50 %	525931064
37612	NC_021839	TCC	2	6	1635901	1635906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37613	NC_021839	ATC	2	6	1635955	1635960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931065
37614	NC_021839	CTT	2	6	1635990	1635995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931065
37615	NC_021839	TCA	2	6	1636118	1636123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931065
37616	NC_021839	CTT	2	6	1636158	1636163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931065
37617	NC_021839	TTC	2	6	1636285	1636290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931065
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