MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_021839	T	6	6	1608199	1608204	0 %	100 %	0 %	0 %	525931040
37002	NC_021839	CAT	2	6	1608228	1608233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931040
37003	NC_021839	AGT	2	6	1608283	1608288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931040
37004	NC_021839	GAT	2	6	1608304	1608309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931040
37005	NC_021839	AAAAT	2	10	1608316	1608325	80 %	20 %	0 %	0 %	525931040
37006	NC_021839	AGTT	2	8	1608343	1608350	25 %	50 %	25 %	0 %	525931040
37007	NC_021839	CTT	2	6	1608354	1608359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931040
37008	NC_021839	CTT	2	6	1608375	1608380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931040
37009	NC_021839	TGA	2	6	1608395	1608400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931040
37010	NC_021839	T	7	7	1608488	1608494	0 %	100 %	0 %	0 %	525931040
37011	NC_021839	TTC	2	6	1608529	1608534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931040
37012	NC_021839	CTA	2	6	1608642	1608647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931041
37013	NC_021839	ACA	2	6	1608662	1608667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931041
37014	NC_021839	AAT	2	6	1608718	1608723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931041
37015	NC_021839	T	6	6	1608799	1608804	0 %	100 %	0 %	0 %	525931041
37016	NC_021839	TTTG	2	8	1608984	1608991	0 %	75 %	25 %	0 %	525931041
37017	NC_021839	GAT	2	6	1609006	1609011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931041
37018	NC_021839	T	7	7	1609059	1609065	0 %	100 %	0 %	0 %	525931042
37019	NC_021839	CTA	2	6	1609074	1609079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931042
37020	NC_021839	AAT	2	6	1609088	1609093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931042
37021	NC_021839	T	6	6	1609234	1609239	0 %	100 %	0 %	0 %	525931042
37022	NC_021839	T	6	6	1609270	1609275	0 %	100 %	0 %	0 %	525931042
37023	NC_021839	GTT	2	6	1609335	1609340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931042
37024	NC_021839	TTTCG	2	10	1609369	1609378	0 %	60 %	20 %	20 %	525931042
37025	NC_021839	GCC	2	6	1609405	1609410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931042
37026	NC_021839	TGC	2	6	1609474	1609479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931042
37027	NC_021839	TAAA	2	8	1609549	1609556	75 %	25 %	0 %	0 %	525931042
37028	NC_021839	GA	3	6	1609603	1609608	50 %	0 %	50 %	0 %	525931042
37029	NC_021839	A	6	6	1609722	1609727	100 %	0 %	0 %	0 %	525931042
37030	NC_021839	TCA	2	6	1609776	1609781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931042
37031	NC_021839	TCC	2	6	1609786	1609791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37032	NC_021839	TCTAT	2	10	1609795	1609804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37033	NC_021839	ACA	2	6	1609808	1609813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37034	NC_021839	TGA	2	6	1609836	1609841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37035	NC_021839	A	7	7	1609860	1609866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37036	NC_021839	TCT	2	6	1609913	1609918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931043
37037	NC_021839	TCT	2	6	1610002	1610007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931043
37038	NC_021839	GACA	2	8	1610013	1610020	50 %	0 %	25 %	25 %	525931043
37039	NC_021839	TCT	2	6	1610047	1610052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931043
37040	NC_021839	AAC	2	6	1610061	1610066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931043
37041	NC_021839	CAA	2	6	1610081	1610086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931043
37042	NC_021839	GA	3	6	1610101	1610106	50 %	0 %	50 %	0 %	525931043
37043	NC_021839	TTC	2	6	1610112	1610117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931043
37044	NC_021839	CCT	2	6	1610132	1610137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931044
37045	NC_021839	AAG	2	6	1610188	1610193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931044
37046	NC_021839	CTT	2	6	1610247	1610252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931044
37047	NC_021839	TA	4	8	1610444	1610451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37048	NC_021839	TTTG	2	8	1610466	1610473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37049	NC_021839	T	6	6	1610481	1610486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37050	NC_021839	T	7	7	1610501	1610507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37051	NC_021839	GGT	3	9	1610559	1610567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525931045
37052	NC_021839	CAT	2	6	1610598	1610603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931045
37053	NC_021839	TGG	2	6	1610624	1610629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525931045
37054	NC_021839	GAA	2	6	1610635	1610640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931045
37055	NC_021839	GTA	2	6	1610668	1610673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931045
37056	NC_021839	T	6	6	1610733	1610738	0 %	100 %	0 %	0 %	525931045
37057	NC_021839	ATAA	2	8	1610860	1610867	75 %	25 %	0 %	0 %	525931045
37058	NC_021839	GTA	2	6	1610905	1610910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931045
37059	NC_021839	AT	3	6	1610924	1610929	50 %	50 %	0 %	0 %	525931045
37060	NC_021839	AGT	2	6	1610979	1610984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931045
37061	NC_021839	CAA	2	6	1611061	1611066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931045
37062	NC_021839	CGT	2	6	1611084	1611089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931045
37063	NC_021839	AATA	2	8	1611090	1611097	75 %	25 %	0 %	0 %	525931045
37064	NC_021839	TCT	2	6	1611161	1611166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931045
37065	NC_021839	AAT	2	6	1611175	1611180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931045
37066	NC_021839	AT	3	6	1611236	1611241	50 %	50 %	0 %	0 %	525931045
37067	NC_021839	AGCA	2	8	1611250	1611257	50 %	0 %	25 %	25 %	525931045
37068	NC_021839	CGC	2	6	1611262	1611267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931045
37069	NC_021839	A	6	6	1611308	1611313	100 %	0 %	0 %	0 %	525931045
37070	NC_021839	ATAA	2	8	1611331	1611338	75 %	25 %	0 %	0 %	525931045
37071	NC_021839	GCT	2	6	1611371	1611376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931045
37072	NC_021839	TAT	2	6	1611450	1611455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931045
37073	NC_021839	T	7	7	1611465	1611471	0 %	100 %	0 %	0 %	525931045
37074	NC_021839	AGCA	2	8	1611477	1611484	50 %	0 %	25 %	25 %	525931045
37075	NC_021839	AAT	2	6	1611531	1611536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931045
37076	NC_021839	TTTC	2	8	1611634	1611641	0 %	75 %	0 %	25 %	525931045
37077	NC_021839	A	6	6	1611646	1611651	100 %	0 %	0 %	0 %	525931045
37078	NC_021839	TTTG	2	8	1611719	1611726	0 %	75 %	25 %	0 %	525931045
37079	NC_021839	TCA	2	6	1611770	1611775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931045
37080	NC_021839	TAA	2	6	1611860	1611865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931045
37081	NC_021839	TTC	2	6	1611869	1611874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931045
37082	NC_021839	T	6	6	1611886	1611891	0 %	100 %	0 %	0 %	525931045
37083	NC_021839	GGTTT	2	10	1611961	1611970	0 %	60 %	40 %	0 %	525931045
37084	NC_021839	T	6	6	1611968	1611973	0 %	100 %	0 %	0 %	525931045
37085	NC_021839	T	7	7	1611981	1611987	0 %	100 %	0 %	0 %	525931045
37086	NC_021839	ATTA	2	8	1611994	1612001	50 %	50 %	0 %	0 %	525931045
37087	NC_021839	GCCAT	2	10	1612072	1612081	20 %	20 %	20 %	40 %	525931045
37088	NC_021839	TTC	2	6	1612102	1612107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931045
37089	NC_021839	TCT	2	6	1612109	1612114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931045
37090	NC_021839	AAT	2	6	1612126	1612131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931045
37091	NC_021839	GTA	2	6	1612261	1612266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932367
37092	NC_021839	ACT	2	6	1612313	1612318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932367
37093	NC_021839	GAAG	2	8	1612335	1612342	50 %	0 %	50 %	0 %	525932367
37094	NC_021839	GTT	2	6	1612362	1612367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932367
37095	NC_021839	TCC	2	6	1612442	1612447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932367
37096	NC_021839	AGT	2	6	1612460	1612465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932367
37097	NC_021839	TCC	2	6	1612466	1612471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932367
37098	NC_021839	CCA	2	6	1612491	1612496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932367
37099	NC_021839	GCATCC	2	12	1612506	1612517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
37100	NC_021839	GTT	2	6	1612755	1612760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932367
37101	NC_021839	TC	3	6	1612890	1612895	0 %	50 %	0 %	50 %	525932367
37102	NC_021839	TCGGCA	2	12	1612911	1612922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525932367
37103	NC_021839	TCCGCA	2	12	1612923	1612934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
37104	NC_021839	GCATCC	2	12	1612944	1612955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
37105	NC_021839	GCATCG	2	12	1612956	1612967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525932367
37106	NC_021839	GCATCG	2	12	1613028	1613039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525932367
37107	NC_021839	TCCGCA	3	18	1613043	1613060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
37108	NC_021839	TCAGCA	2	12	1613061	1613072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37109	NC_021839	GCATCA	5	30	1613190	1613219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37110	NC_021839	TCCGCA	2	12	1613259	1613270	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
37111	NC_021839	TCAGCA	3	18	1613307	1613324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37112	NC_021839	GCATCA	3	18	1613340	1613357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37113	NC_021839	GCGTCA	2	12	1613412	1613423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525932367
37114	NC_021839	GCATCA	2	12	1613424	1613435	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37115	NC_021839	GCATCA	3	18	1613562	1613579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37116	NC_021839	GCATCA	4	24	1613604	1613627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37117	NC_021839	TCAGCA	2	12	1613649	1613660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37118	NC_021839	GCGTCA	2	12	1613664	1613675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525932367
37119	NC_021839	GCATCA	3	18	1613676	1613693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932367
37120	NC_021839	GCGTCG	2	12	1613706	1613717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525932367
37121	NC_021839	GCGTCA	2	12	1613748	1613759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525932367
37122	NC_021839	GCGTCG	2	12	1613796	1613807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525932367
37123	NC_021839	GCATCC	3	18	1613808	1613825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
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37125	NC_021839	GCATCC	3	18	1613856	1613873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525932367
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37225	NC_021839	AAGG	2	8	1617929	1617936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37226	NC_021839	A	6	6	1617950	1617955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37471	NC_021839	TAAT	2	8	1628591	1628598	50 %	50 %	0 %	0 %	525931057
37472	NC_021839	TTC	2	6	1628668	1628673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931057
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