MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_021839	GTT	2	6	1561935	1561940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36002	NC_021839	T	7	7	1561939	1561945	0 %	100 %	0 %	0 %	525930999
36003	NC_021839	CAC	2	6	1561963	1561968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930999
36004	NC_021839	TAA	2	6	1562007	1562012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930999
36005	NC_021839	TGATTT	2	12	1562129	1562140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525930999
36006	NC_021839	GCT	2	6	1562149	1562154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930999
36007	NC_021839	ACGT	2	8	1562178	1562185	25 %	25 %	25 %	25 %	525930999
36008	NC_021839	GTT	2	6	1562207	1562212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930999
36009	NC_021839	T	6	6	1562256	1562261	0 %	100 %	0 %	0 %	525930999
36010	NC_021839	CAT	2	6	1562271	1562276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930999
36011	NC_021839	TTC	2	6	1562331	1562336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930999
36012	NC_021839	TGT	2	6	1562442	1562447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930999
36013	NC_021839	TCC	2	6	1562506	1562511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36014	NC_021839	AGA	2	6	1562564	1562569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36015	NC_021839	A	7	7	1562569	1562575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36016	NC_021839	GAT	2	6	1562602	1562607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36017	NC_021839	TA	3	6	1562635	1562640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36018	NC_021839	TTAA	2	8	1562653	1562660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36019	NC_021839	ATTT	3	12	1562704	1562715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36020	NC_021839	TAAA	2	8	1562722	1562729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36021	NC_021839	TTA	2	6	1562744	1562749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36022	NC_021839	TTA	2	6	1562765	1562770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36023	NC_021839	CA	3	6	1562777	1562782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36024	NC_021839	TGT	2	6	1562869	1562874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
36025	NC_021839	T	6	6	1562902	1562907	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
36026	NC_021839	GCC	2	6	1562917	1562922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931000
36027	NC_021839	TAC	2	6	1562977	1562982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931000
36028	NC_021839	T	7	7	1562983	1562989	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
36029	NC_021839	GTG	2	6	1563039	1563044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525931000
36030	NC_021839	AGT	2	6	1563124	1563129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931000
36031	NC_021839	T	6	6	1563214	1563219	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
36032	NC_021839	TCT	2	6	1563272	1563277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931000
36033	NC_021839	TTG	2	6	1563304	1563309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
36034	NC_021839	AGTT	2	8	1563478	1563485	25 %	50 %	25 %	0 %	525931000
36035	NC_021839	GTT	2	6	1563489	1563494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
36036	NC_021839	TCT	2	6	1563515	1563520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931000
36037	NC_021839	TGT	2	6	1563541	1563546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
36038	NC_021839	ATA	2	6	1563593	1563598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931000
36039	NC_021839	TGTT	2	8	1563619	1563626	0 %	75 %	25 %	0 %	525931000
36040	NC_021839	CAT	2	6	1563627	1563632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931000
36041	NC_021839	T	6	6	1563669	1563674	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
36042	NC_021839	ATGGC	2	10	1563728	1563737	20 %	20 %	40 %	20 %	525931000
36043	NC_021839	T	6	6	1563741	1563746	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
36044	NC_021839	CTG	2	6	1563756	1563761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931000
36045	NC_021839	TTC	2	6	1563880	1563885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931000
36046	NC_021839	TAT	2	6	1564045	1564050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931000
36047	NC_021839	T	6	6	1564172	1564177	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
36048	NC_021839	CT	3	6	1564207	1564212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36049	NC_021839	TAA	2	6	1564223	1564228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931001
36050	NC_021839	CTT	3	9	1564262	1564270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
36051	NC_021839	ATAA	2	8	1564314	1564321	75 %	25 %	0 %	0 %	525931001
36052	NC_021839	GATA	2	8	1564331	1564338	50 %	25 %	25 %	0 %	525931001
36053	NC_021839	TCT	2	6	1564390	1564395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
36054	NC_021839	CAT	2	6	1564433	1564438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931001
36055	NC_021839	ATT	2	6	1564473	1564478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931001
36056	NC_021839	TGT	2	6	1564482	1564487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
36057	NC_021839	TCT	2	6	1564489	1564494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
36058	NC_021839	T	6	6	1564508	1564513	0 %	100 %	0 %	0 %	525931001
36059	NC_021839	CAC	2	6	1564532	1564537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931001
36060	NC_021839	T	6	6	1564560	1564565	0 %	100 %	0 %	0 %	525931001
36061	NC_021839	GTT	3	9	1564573	1564581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
36062	NC_021839	TTC	2	6	1564621	1564626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
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36064	NC_021839	TTC	2	6	1564698	1564703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
36065	NC_021839	AAATC	2	10	1564718	1564727	60 %	20 %	0 %	20 %	525931001
36066	NC_021839	TTG	2	6	1564733	1564738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
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36068	NC_021839	GATA	2	8	1564767	1564774	50 %	25 %	25 %	0 %	525931001
36069	NC_021839	ATA	2	6	1564777	1564782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931001
36070	NC_021839	GTT	2	6	1564809	1564814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
36071	NC_021839	TTA	2	6	1564825	1564830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931001
36072	NC_021839	TACT	2	8	1564850	1564857	25 %	50 %	0 %	25 %	525931001
36073	NC_021839	TTC	2	6	1564869	1564874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
36074	NC_021839	A	7	7	1564894	1564900	100 %	0 %	0 %	0 %	525931001
36075	NC_021839	ATT	2	6	1564930	1564935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931001
36076	NC_021839	ATC	2	6	1564936	1564941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931001
36077	NC_021839	TAT	2	6	1565006	1565011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36078	NC_021839	AAT	2	6	1565045	1565050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36079	NC_021839	A	7	7	1565095	1565101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36080	NC_021839	TGT	2	6	1565188	1565193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931002
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36082	NC_021839	TTAA	2	8	1565245	1565252	50 %	50 %	0 %	0 %	525931002
36083	NC_021839	ATCTT	2	10	1565254	1565263	20 %	60 %	0 %	20 %	525931002
36084	NC_021839	ATAA	2	8	1565295	1565302	75 %	25 %	0 %	0 %	525931002
36085	NC_021839	T	6	6	1565373	1565378	0 %	100 %	0 %	0 %	525931002
36086	NC_021839	ATA	2	6	1565383	1565388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
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36088	NC_021839	T	6	6	1565429	1565434	0 %	100 %	0 %	0 %	525931002
36089	NC_021839	CCA	2	6	1565440	1565445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931002
36090	NC_021839	TACTTT	2	12	1565511	1565522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525931002
36091	NC_021839	ATA	2	6	1565562	1565567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
36092	NC_021839	TAA	2	6	1565648	1565653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
36093	NC_021839	GCT	2	6	1565701	1565706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931002
36094	NC_021839	TAA	2	6	1565825	1565830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
36095	NC_021839	GCT	2	6	1565857	1565862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931002
36096	NC_021839	ATCGA	2	10	1565871	1565880	40 %	20 %	20 %	20 %	525931002
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36101	NC_021839	TGCT	2	8	1565958	1565965	0 %	50 %	25 %	25 %	525931002
36102	NC_021839	TGA	2	6	1565999	1566004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931002
36103	NC_021839	GTT	2	6	1566084	1566089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36104	NC_021839	AAAAG	2	10	1566091	1566100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36105	NC_021839	TAA	2	6	1566152	1566157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36106	NC_021839	AGC	2	6	1566165	1566170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36107	NC_021839	TCT	2	6	1566215	1566220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931003
36108	NC_021839	TAA	2	6	1566223	1566228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931003
36109	NC_021839	TTA	2	6	1566230	1566235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931003
36110	NC_021839	TGG	2	6	1566241	1566246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525931003
36111	NC_021839	TTGC	2	8	1566249	1566256	0 %	50 %	25 %	25 %	525931003
36112	NC_021839	TAC	2	6	1566415	1566420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931003
36113	NC_021839	CCA	2	6	1566434	1566439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931003
36114	NC_021839	T	6	6	1566463	1566468	0 %	100 %	0 %	0 %	525931003
36115	NC_021839	AGA	2	6	1566478	1566483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931003
36116	NC_021839	TTAAT	2	10	1566501	1566510	40 %	60 %	0 %	0 %	525931003
36117	NC_021839	A	6	6	1566646	1566651	100 %	0 %	0 %	0 %	525931003
36118	NC_021839	CAT	2	6	1566687	1566692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931003
36119	NC_021839	TCA	2	6	1566782	1566787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931003
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36121	NC_021839	CTA	2	6	1566798	1566803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931003
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36223	NC_021839	T	7	7	1570640	1570646	0 %	100 %	0 %	0 %	525931006
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36228	NC_021839	CAT	2	6	1570831	1570836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931007
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36234	NC_021839	T	6	6	1571020	1571025	0 %	100 %	0 %	0 %	525931007
36235	NC_021839	AATG	2	8	1571092	1571099	50 %	25 %	25 %	0 %	525931007
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36474	NC_021839	CAT	2	6	1581352	1581357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931016
36475	NC_021839	TTC	2	6	1581516	1581521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931016
36476	NC_021839	CTT	2	6	1581844	1581849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931016
36477	NC_021839	CAG	2	6	1581946	1581951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931016
36478	NC_021839	CGC	2	6	1581955	1581960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931016
36479	NC_021839	AAT	2	6	1582065	1582070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931016
36480	NC_021839	CA	4	8	1582100	1582107	50 %	0 %	0 %	50 %	525931016
36481	NC_021839	ACT	2	6	1582220	1582225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931016
36482	NC_021839	CCA	2	6	1582239	1582244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931016
36483	NC_021839	T	6	6	1582295	1582300	0 %	100 %	0 %	0 %	525931016
36484	NC_021839	CTC	2	6	1582381	1582386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36490	NC_021839	TCA	2	6	1582578	1582583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931017
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36497	NC_021839	TGA	2	6	1582873	1582878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931017
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36499	NC_021839	AAAT	2	8	1583058	1583065	75 %	25 %	0 %	0 %	525931017
36500	NC_021839	TCA	2	6	1583127	1583132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931017

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