MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_021839	T	6	6	1541464	1541469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35502	NC_021839	GCT	2	6	1541517	1541522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930983
35503	NC_021839	AGC	2	6	1541621	1541626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930983
35504	NC_021839	GTT	2	6	1541682	1541687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930983
35505	NC_021839	TTTC	2	8	1541760	1541767	0 %	75 %	0 %	25 %	525930983
35506	NC_021839	TCT	2	6	1541778	1541783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
35507	NC_021839	AAG	2	6	1541833	1541838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930983
35508	NC_021839	TAA	2	6	1541845	1541850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930983
35509	NC_021839	CTT	2	6	1541887	1541892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
35510	NC_021839	CA	3	6	1542023	1542028	50 %	0 %	0 %	50 %	525930983
35511	NC_021839	CCA	2	6	1542045	1542050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930983
35512	NC_021839	CAC	2	6	1542059	1542064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930983
35513	NC_021839	CCG	2	6	1542096	1542101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930983
35514	NC_021839	CG	3	6	1542187	1542192	0 %	0 %	50 %	50 %	525930983
35515	NC_021839	CTG	2	6	1542265	1542270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930983
35516	NC_021839	CTT	2	6	1542295	1542300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
35517	NC_021839	TTCT	2	8	1542332	1542339	0 %	75 %	0 %	25 %	525930983
35518	NC_021839	TAA	2	6	1542368	1542373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930983
35519	NC_021839	CCA	2	6	1542375	1542380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930983
35520	NC_021839	T	6	6	1542391	1542396	0 %	100 %	0 %	0 %	525930983
35521	NC_021839	TTTA	2	8	1542422	1542429	25 %	75 %	0 %	0 %	525930983
35522	NC_021839	T	6	6	1542494	1542499	0 %	100 %	0 %	0 %	525930983
35523	NC_021839	AGG	2	6	1542500	1542505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930983
35524	NC_021839	CTT	2	6	1542523	1542528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
35525	NC_021839	AAT	2	6	1542542	1542547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930983
35526	NC_021839	CAG	2	6	1542574	1542579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930983
35527	NC_021839	ATT	2	6	1542650	1542655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930983
35528	NC_021839	AGT	2	6	1542666	1542671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930983
35529	NC_021839	AATTA	2	10	1542722	1542731	60 %	40 %	0 %	0 %	525930983
35530	NC_021839	CTACA	2	10	1542772	1542781	40 %	20 %	0 %	40 %	525930983
35531	NC_021839	CTC	2	6	1542948	1542953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35532	NC_021839	TCA	2	6	1543019	1543024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35533	NC_021839	CGT	2	6	1543048	1543053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930984
35534	NC_021839	CAT	2	6	1543066	1543071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35535	NC_021839	AAAAT	2	10	1543094	1543103	80 %	20 %	0 %	0 %	525930984
35536	NC_021839	GTT	2	6	1543170	1543175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
35537	NC_021839	TGAT	2	8	1543241	1543248	25 %	50 %	25 %	0 %	525930984
35538	NC_021839	GTC	2	6	1543256	1543261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930984
35539	NC_021839	TTGT	2	8	1543271	1543278	0 %	75 %	25 %	0 %	525930984
35540	NC_021839	CCA	2	6	1543295	1543300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
35541	NC_021839	AAC	2	6	1543339	1543344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930984
35542	NC_021839	AT	3	6	1543361	1543366	50 %	50 %	0 %	0 %	525930984
35543	NC_021839	CAC	2	6	1543407	1543412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
35544	NC_021839	ACC	2	6	1543462	1543467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
35545	NC_021839	CAAT	2	8	1543545	1543552	50 %	25 %	0 %	25 %	525930984
35546	NC_021839	CCA	2	6	1543556	1543561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
35547	NC_021839	CAA	2	6	1543656	1543661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930984
35548	NC_021839	T	6	6	1543705	1543710	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
35549	NC_021839	TAA	2	6	1543713	1543718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930984
35550	NC_021839	CG	3	6	1543741	1543746	0 %	0 %	50 %	50 %	525930984
35551	NC_021839	TTG	2	6	1543858	1543863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
35552	NC_021839	ATC	2	6	1543897	1543902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35553	NC_021839	AT	3	6	1543928	1543933	50 %	50 %	0 %	0 %	525930984
35554	NC_021839	CTT	2	6	1543950	1543955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930984
35555	NC_021839	T	6	6	1543954	1543959	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
35556	NC_021839	AGT	2	6	1543966	1543971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930984
35557	NC_021839	CAT	2	6	1544026	1544031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35558	NC_021839	GAA	2	6	1544059	1544064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930984
35559	NC_021839	T	6	6	1544095	1544100	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
35560	NC_021839	CAT	2	6	1544161	1544166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35561	NC_021839	GTG	2	6	1544187	1544192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930984
35562	NC_021839	TTC	2	6	1544209	1544214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930984
35563	NC_021839	GT	3	6	1544317	1544322	0 %	50 %	50 %	0 %	525930984
35564	NC_021839	GCC	2	6	1544375	1544380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930984
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35566	NC_021839	T	6	6	1544510	1544515	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
35567	NC_021839	ATG	2	6	1544560	1544565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930984
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35569	NC_021839	AATC	2	8	1544578	1544585	50 %	25 %	0 %	25 %	525930984
35570	NC_021839	GTT	2	6	1544594	1544599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
35571	NC_021839	TTTG	2	8	1544748	1544755	0 %	75 %	25 %	0 %	525930984
35572	NC_021839	CGC	2	6	1544811	1544816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930984
35573	NC_021839	CCG	2	6	1544837	1544842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930984
35574	NC_021839	CTT	2	6	1544877	1544882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930984
35575	NC_021839	CGGC	2	8	1544937	1544944	0 %	0 %	50 %	50 %	525930984
35576	NC_021839	ATT	2	6	1545010	1545015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930984
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35578	NC_021839	GAAT	2	8	1545086	1545093	50 %	25 %	25 %	0 %	525930984
35579	NC_021839	CAT	2	6	1545180	1545185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
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35582	NC_021839	CAT	2	6	1545285	1545290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
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35584	NC_021839	TCA	2	6	1545413	1545418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35585	NC_021839	CTT	2	6	1545441	1545446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930984
35586	NC_021839	TC	3	6	1545533	1545538	0 %	50 %	0 %	50 %	525930984
35587	NC_021839	CAA	2	6	1545555	1545560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930984
35588	NC_021839	ATG	3	9	1545595	1545603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930984
35589	NC_021839	AG	3	6	1545621	1545626	50 %	0 %	50 %	0 %	525930984
35590	NC_021839	CCAAT	2	10	1545635	1545644	40 %	20 %	0 %	40 %	525930984
35591	NC_021839	CAT	2	6	1545657	1545662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35592	NC_021839	T	6	6	1545696	1545701	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
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35594	NC_021839	TAAA	2	8	1545762	1545769	75 %	25 %	0 %	0 %	525930984
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35596	NC_021839	TCA	2	6	1545902	1545907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
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35599	NC_021839	GTT	2	6	1545984	1545989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
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35601	NC_021839	T	6	6	1546069	1546074	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
35602	NC_021839	TTTA	2	8	1546099	1546106	25 %	75 %	0 %	0 %	525930984
35603	NC_021839	GTT	2	6	1546134	1546139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
35604	NC_021839	T	6	6	1546138	1546143	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
35605	NC_021839	ACGGT	2	10	1546231	1546240	20 %	20 %	40 %	20 %	525930984
35606	NC_021839	GTT	2	6	1546247	1546252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
35607	NC_021839	TTC	2	6	1546255	1546260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930984
35608	NC_021839	CTT	2	6	1546290	1546295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930984
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35612	NC_021839	AAT	2	6	1546390	1546395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930984
35613	NC_021839	ATA	2	6	1546414	1546419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930984
35614	NC_021839	CAT	2	6	1546591	1546596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
35615	NC_021839	AACG	2	8	1546610	1546617	50 %	0 %	25 %	25 %	525930984
35616	NC_021839	GCCT	2	8	1546618	1546625	0 %	25 %	25 %	50 %	525930984
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