MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_021839	TTCGAT	2	12	1431622	1431633	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525930905
33002	NC_021839	TTTTCT	2	12	1431635	1431646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525930905
33003	NC_021839	TCT	2	6	1431698	1431703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930905
33004	NC_021839	TTG	2	6	1431728	1431733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930905
33005	NC_021839	CTG	2	6	1431744	1431749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930905
33006	NC_021839	ATT	2	6	1431788	1431793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930905
33007	NC_021839	TCT	2	6	1431835	1431840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33008	NC_021839	T	6	6	1431900	1431905	0 %	100 %	0 %	0 %	525930906
33009	NC_021839	TTC	2	6	1431927	1431932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33010	NC_021839	ATC	2	6	1431949	1431954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930906
33011	NC_021839	TTC	2	6	1432011	1432016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33012	NC_021839	CCA	2	6	1432029	1432034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930906
33013	NC_021839	CAA	2	6	1432064	1432069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930906
33014	NC_021839	CCA	2	6	1432084	1432089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930906
33015	NC_021839	CCAT	2	8	1432174	1432181	25 %	25 %	0 %	50 %	525930906
33016	NC_021839	TCT	3	9	1432201	1432209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33017	NC_021839	AAT	2	6	1432221	1432226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
33018	NC_021839	TGTAT	2	10	1432288	1432297	20 %	60 %	20 %	0 %	525930906
33019	NC_021839	GTA	2	6	1432307	1432312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930906
33020	NC_021839	TTC	2	6	1432407	1432412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33021	NC_021839	TTGC	2	8	1432426	1432433	0 %	50 %	25 %	25 %	525930906
33022	NC_021839	T	6	6	1432451	1432456	0 %	100 %	0 %	0 %	525930906
33023	NC_021839	T	6	6	1432478	1432483	0 %	100 %	0 %	0 %	525930906
33024	NC_021839	GGTT	2	8	1432508	1432515	0 %	50 %	50 %	0 %	525930906
33025	NC_021839	GAC	2	6	1432539	1432544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930906
33026	NC_021839	GTA	2	6	1432562	1432567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930906
33027	NC_021839	TGT	2	6	1432592	1432597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930906
33028	NC_021839	GCG	2	6	1432691	1432696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930906
33029	NC_021839	GC	3	6	1432732	1432737	0 %	0 %	50 %	50 %	525930906
33030	NC_021839	AAT	2	6	1432788	1432793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
33031	NC_021839	TTC	2	6	1432881	1432886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33032	NC_021839	AGT	2	6	1432978	1432983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930906
33033	NC_021839	TAA	2	6	1432994	1432999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
33034	NC_021839	TCT	2	6	1433026	1433031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33035	NC_021839	ATC	2	6	1433082	1433087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930906
33036	NC_021839	ACC	2	6	1433097	1433102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930906
33037	NC_021839	AGTT	2	8	1433142	1433149	25 %	50 %	25 %	0 %	525930906
33038	NC_021839	CGT	2	6	1433208	1433213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930906
33039	NC_021839	ATG	2	6	1433253	1433258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930906
33040	NC_021839	TCTT	2	8	1433338	1433345	0 %	75 %	0 %	25 %	525930906
33041	NC_021839	TTTG	2	8	1433378	1433385	0 %	75 %	25 %	0 %	525930906
33042	NC_021839	CTT	3	9	1433474	1433482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33043	NC_021839	TCT	2	6	1433566	1433571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33044	NC_021839	TTC	2	6	1433577	1433582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33045	NC_021839	ATA	2	6	1433637	1433642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
33046	NC_021839	GAC	2	6	1433673	1433678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930906
33047	NC_021839	ATA	2	6	1433716	1433721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
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33049	NC_021839	T	6	6	1433762	1433767	0 %	100 %	0 %	0 %	525930906
33050	NC_021839	TCT	3	9	1433773	1433781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33051	NC_021839	AAT	2	6	1433863	1433868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
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33053	NC_021839	CTT	2	6	1434053	1434058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33054	NC_021839	AAAGA	2	10	1434084	1434093	80 %	0 %	20 %	0 %	525930906
33055	NC_021839	A	6	6	1434108	1434113	100 %	0 %	0 %	0 %	525930906
33056	NC_021839	TTG	2	6	1434120	1434125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930906
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33058	NC_021839	T	7	7	1434164	1434170	0 %	100 %	0 %	0 %	525930906
33059	NC_021839	TCT	2	6	1434229	1434234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33060	NC_021839	ATA	2	6	1434247	1434252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930906
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33062	NC_021839	AGT	2	6	1434277	1434282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930906
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33064	NC_021839	TCT	2	6	1434328	1434333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930906
33065	NC_021839	AGT	2	6	1434397	1434402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930906
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33067	NC_021839	AAGA	2	8	1434429	1434436	75 %	0 %	25 %	0 %	525930906
33068	NC_021839	T	6	6	1434520	1434525	0 %	100 %	0 %	0 %	525930906
33069	NC_021839	ACA	2	6	1434526	1434531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930906
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33071	NC_021839	TTG	2	6	1434672	1434677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930906
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33076	NC_021839	TTTC	2	8	1434942	1434949	0 %	75 %	0 %	25 %	525930906
33077	NC_021839	ATTTT	2	10	1434976	1434985	20 %	80 %	0 %	0 %	525930906
33078	NC_021839	TCC	2	6	1435016	1435021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33079	NC_021839	ACT	2	6	1435043	1435048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33084	NC_021839	TCA	2	6	1435281	1435286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930907
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33086	NC_021839	TCC	2	6	1435379	1435384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525930907
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33089	NC_021839	AAT	2	6	1435538	1435543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930907
33090	NC_021839	AT	3	6	1435566	1435571	50 %	50 %	0 %	0 %	525930907
33091	NC_021839	TTC	2	6	1435643	1435648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930907
33092	NC_021839	TTCTT	2	10	1435694	1435703	0 %	80 %	0 %	20 %	525930907
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33100	NC_021839	TTC	2	6	1435904	1435909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930907
33101	NC_021839	CAT	2	6	1435936	1435941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930907
33102	NC_021839	A	6	6	1435947	1435952	100 %	0 %	0 %	0 %	525930907
33103	NC_021839	CTT	2	6	1435969	1435974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930907
33104	NC_021839	CTT	2	6	1436002	1436007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930907
33105	NC_021839	GTT	2	6	1436019	1436024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930907
33106	NC_021839	T	6	6	1436023	1436028	0 %	100 %	0 %	0 %	525930907
33107	NC_021839	GTT	2	6	1436058	1436063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930907
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33110	NC_021839	TTG	2	6	1436231	1436236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930907
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33112	NC_021839	CT	3	6	1436369	1436374	0 %	50 %	0 %	50 %	525930907
33113	NC_021839	TAG	2	6	1436380	1436385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930907
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33115	NC_021839	CATT	2	8	1436451	1436458	25 %	50 %	0 %	25 %	525930907
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