MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021839	AATA	2	8	1342512	1342519	75 %	25 %	0 %	0 %	525930823
31002	NC_021839	GGA	2	6	1342546	1342551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930823
31003	NC_021839	ATT	2	6	1342554	1342559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930823
31004	NC_021839	TTC	2	6	1342599	1342604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930823
31005	NC_021839	ACT	2	6	1342636	1342641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930823
31006	NC_021839	TTC	2	6	1342667	1342672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930823
31007	NC_021839	TCT	3	9	1342693	1342701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930823
31008	NC_021839	TCG	2	6	1342712	1342717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930823
31009	NC_021839	TAG	2	6	1342720	1342725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930823
31010	NC_021839	TGA	2	6	1342733	1342738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930823
31011	NC_021839	TTC	2	6	1342785	1342790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930823
31012	NC_021839	T	6	6	1342803	1342808	0 %	100 %	0 %	0 %	525930823
31013	NC_021839	CTT	2	6	1342871	1342876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930823
31014	NC_021839	TTG	2	6	1342920	1342925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930823
31015	NC_021839	TCT	2	6	1343000	1343005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930823
31016	NC_021839	ACCT	2	8	1343008	1343015	25 %	25 %	0 %	50 %	525930824
31017	NC_021839	TTTA	2	8	1343016	1343023	25 %	75 %	0 %	0 %	525930824
31018	NC_021839	TTC	2	6	1343049	1343054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31019	NC_021839	GTTT	2	8	1343059	1343066	0 %	75 %	25 %	0 %	525930824
31020	NC_021839	ATTTT	2	10	1343080	1343089	20 %	80 %	0 %	0 %	525930824
31021	NC_021839	GTT	2	6	1343143	1343148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930824
31022	NC_021839	T	6	6	1343147	1343152	0 %	100 %	0 %	0 %	525930824
31023	NC_021839	ATT	2	6	1343169	1343174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930824
31024	NC_021839	TTC	2	6	1343193	1343198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31025	NC_021839	CTT	2	6	1343246	1343251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31026	NC_021839	T	6	6	1343266	1343271	0 %	100 %	0 %	0 %	525930824
31027	NC_021839	AGC	2	6	1343283	1343288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930824
31028	NC_021839	TCA	2	6	1343294	1343299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930824
31029	NC_021839	TCA	2	6	1343357	1343362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930824
31030	NC_021839	CTT	2	6	1343393	1343398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31031	NC_021839	CT	3	6	1343473	1343478	0 %	50 %	0 %	50 %	525930824
31032	NC_021839	CTT	2	6	1343495	1343500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31033	NC_021839	CAT	2	6	1343501	1343506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930824
31034	NC_021839	TTC	2	6	1343514	1343519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31035	NC_021839	GGC	2	6	1343563	1343568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930824
31036	NC_021839	ACGA	2	8	1343595	1343602	50 %	0 %	25 %	25 %	525930824
31037	NC_021839	CTT	2	6	1343723	1343728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31038	NC_021839	AAGC	2	8	1343763	1343770	50 %	0 %	25 %	25 %	525930824
31039	NC_021839	TCA	2	6	1343800	1343805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930824
31040	NC_021839	ACT	2	6	1343868	1343873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930824
31041	NC_021839	ACC	2	6	1343874	1343879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930824
31042	NC_021839	ACGA	2	8	1343906	1343913	50 %	0 %	25 %	25 %	525930824
31043	NC_021839	TGTA	2	8	1343924	1343931	25 %	50 %	25 %	0 %	525930824
31044	NC_021839	A	6	6	1343956	1343961	100 %	0 %	0 %	0 %	525930824
31045	NC_021839	TA	3	6	1343999	1344004	50 %	50 %	0 %	0 %	525930824
31046	NC_021839	AATA	2	8	1344005	1344012	75 %	25 %	0 %	0 %	525930824
31047	NC_021839	A	7	7	1344029	1344035	100 %	0 %	0 %	0 %	525930824
31048	NC_021839	TTC	2	6	1344222	1344227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930824
31049	NC_021839	TAA	2	6	1344296	1344301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930824
31050	NC_021839	TCCA	2	8	1344367	1344374	25 %	25 %	0 %	50 %	525930824
31051	NC_021839	T	7	7	1344405	1344411	0 %	100 %	0 %	0 %	525930825
31052	NC_021839	AC	3	6	1344439	1344444	50 %	0 %	0 %	50 %	525930825
31053	NC_021839	CGAAG	2	10	1344470	1344479	40 %	0 %	40 %	20 %	525930825
31054	NC_021839	TCA	2	6	1344517	1344522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930825
31055	NC_021839	TTC	2	6	1344599	1344604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930825
31056	NC_021839	TTA	2	6	1344643	1344648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930825
31057	NC_021839	TTC	2	6	1344677	1344682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930825
31058	NC_021839	T	6	6	1344695	1344700	0 %	100 %	0 %	0 %	525930825
31059	NC_021839	CT	3	6	1344717	1344722	0 %	50 %	0 %	50 %	525930825
31060	NC_021839	AGT	2	6	1344737	1344742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930825
31061	NC_021839	CAT	2	6	1344793	1344798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930825
31062	NC_021839	ACA	2	6	1344816	1344821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930825
31063	NC_021839	ACTC	2	8	1344861	1344868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31064	NC_021839	ATT	2	6	1345000	1345005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930826
31065	NC_021839	TTC	2	6	1345062	1345067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930826
31066	NC_021839	TCT	2	6	1345076	1345081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930826
31067	NC_021839	ATT	2	6	1345090	1345095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930826
31068	NC_021839	GGT	2	6	1345129	1345134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930826
31069	NC_021839	ACA	2	6	1345139	1345144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930826
31070	NC_021839	CCA	2	6	1345155	1345160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930826
31071	NC_021839	CAAA	2	8	1345179	1345186	75 %	0 %	0 %	25 %	525930826
31072	NC_021839	CTC	2	6	1345210	1345215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525930826
31073	NC_021839	A	7	7	1345225	1345231	100 %	0 %	0 %	0 %	525930826
31074	NC_021839	CG	3	6	1345236	1345241	0 %	0 %	50 %	50 %	525930826
31075	NC_021839	AAT	2	6	1345315	1345320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930826
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31079	NC_021839	CTA	2	6	1345446	1345451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930826
31080	NC_021839	TTTAA	2	10	1345593	1345602	40 %	60 %	0 %	0 %	525930827
31081	NC_021839	T	6	6	1345603	1345608	0 %	100 %	0 %	0 %	525930827
31082	NC_021839	ACA	2	6	1345626	1345631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930827
31083	NC_021839	CCA	2	6	1345722	1345727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930827
31084	NC_021839	ATA	2	6	1345746	1345751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930827
31085	NC_021839	TCG	2	6	1345756	1345761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930827
31086	NC_021839	GCT	2	6	1345803	1345808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930827
31087	NC_021839	CTA	2	6	1345870	1345875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930827
31088	NC_021839	T	8	8	1345915	1345922	0 %	100 %	0 %	0 %	525930827
31089	NC_021839	TATT	2	8	1346010	1346017	25 %	75 %	0 %	0 %	525930827
31090	NC_021839	A	6	6	1346052	1346057	100 %	0 %	0 %	0 %	525930827
31091	NC_021839	ATA	2	6	1346088	1346093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930827
31092	NC_021839	TGCT	2	8	1346100	1346107	0 %	50 %	25 %	25 %	525930827
31093	NC_021839	ACG	2	6	1346204	1346209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930827
31094	NC_021839	GTG	2	6	1346260	1346265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930827
31095	NC_021839	T	7	7	1346308	1346314	0 %	100 %	0 %	0 %	525930827
31096	NC_021839	AT	3	6	1346373	1346378	50 %	50 %	0 %	0 %	525930827
31097	NC_021839	TATT	2	8	1346395	1346402	25 %	75 %	0 %	0 %	525930828
31098	NC_021839	CGT	2	6	1346406	1346411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930828
31099	NC_021839	TCT	2	6	1346492	1346497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930828
31100	NC_021839	GTA	2	6	1346550	1346555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930828
31101	NC_021839	CGCT	2	8	1346588	1346595	0 %	25 %	25 %	50 %	525930828
31102	NC_021839	ATC	2	6	1346603	1346608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930828
31103	NC_021839	T	6	6	1346611	1346616	0 %	100 %	0 %	0 %	525930828
31104	NC_021839	ATA	2	6	1346618	1346623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930828
31105	NC_021839	TTCT	2	8	1346661	1346668	0 %	75 %	0 %	25 %	525930828
31106	NC_021839	CGA	3	9	1346717	1346725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930828
31107	NC_021839	TTTC	2	8	1346751	1346758	0 %	75 %	0 %	25 %	525930828
31108	NC_021839	ACGA	2	8	1346764	1346771	50 %	0 %	25 %	25 %	525930828
31109	NC_021839	AT	3	6	1346780	1346785	50 %	50 %	0 %	0 %	525930828
31110	NC_021839	CTT	2	6	1346835	1346840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930828
31111	NC_021839	GAC	2	6	1346919	1346924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930828
31112	NC_021839	TAAAT	2	10	1347011	1347020	60 %	40 %	0 %	0 %	525930828
31113	NC_021839	AAT	2	6	1347066	1347071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930828
31114	NC_021839	CTT	2	6	1347132	1347137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930828
31115	NC_021839	GT	4	8	1347216	1347223	0 %	50 %	50 %	0 %	525930828
31116	NC_021839	AGC	2	6	1347254	1347259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930828
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31118	NC_021839	TGTTTT	2	12	1347373	1347384	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525930828
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31227	NC_021839	T	6	6	1352200	1352205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31228	NC_021839	ATA	3	9	1352260	1352268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930832
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