MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021839	TGG	2	6	547170	547175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930110
12502	NC_021839	TAT	2	6	547240	547245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930110
12503	NC_021839	ATA	2	6	547272	547277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930110
12504	NC_021839	A	6	6	547280	547285	100 %	0 %	0 %	0 %	525930110
12505	NC_021839	ACC	2	6	547353	547358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930110
12506	NC_021839	GA	3	6	547373	547378	50 %	0 %	50 %	0 %	525930110
12507	NC_021839	T	6	6	547396	547401	0 %	100 %	0 %	0 %	525930110
12508	NC_021839	ATT	2	6	547409	547414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930110
12509	NC_021839	AGG	2	6	547458	547463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_021839	AAT	2	6	547467	547472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930111
12511	NC_021839	AGA	2	6	547526	547531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930111
12512	NC_021839	CAA	2	6	547585	547590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930111
12513	NC_021839	TGCT	2	8	547631	547638	0 %	50 %	25 %	25 %	525930111
12514	NC_021839	ATT	2	6	547693	547698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930111
12515	NC_021839	ATT	2	6	547729	547734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930111
12516	NC_021839	GTTT	2	8	547736	547743	0 %	75 %	25 %	0 %	525930111
12517	NC_021839	A	6	6	547760	547765	100 %	0 %	0 %	0 %	525930111
12518	NC_021839	A	8	8	547773	547780	100 %	0 %	0 %	0 %	525930111
12519	NC_021839	GTT	2	6	547801	547806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930111
12520	NC_021839	AAC	2	6	547832	547837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930111
12521	NC_021839	AAT	2	6	547906	547911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930111
12522	NC_021839	GAT	2	6	547930	547935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930111
12523	NC_021839	T	7	7	547935	547941	0 %	100 %	0 %	0 %	525930111
12524	NC_021839	AAT	2	6	547942	547947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930111
12525	NC_021839	TGA	2	6	547962	547967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930111
12526	NC_021839	ATT	2	6	548071	548076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930111
12527	NC_021839	A	6	6	548117	548122	100 %	0 %	0 %	0 %	525930111
12528	NC_021839	TAC	2	6	548133	548138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_021839	TATT	2	8	548156	548163	25 %	75 %	0 %	0 %	525930112
12530	NC_021839	AAT	2	6	548346	548351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930112
12531	NC_021839	AAAT	2	8	548365	548372	75 %	25 %	0 %	0 %	525930112
12532	NC_021839	CCA	2	6	548397	548402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930112
12533	NC_021839	GTA	2	6	548418	548423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930112
12534	NC_021839	AGG	2	6	548451	548456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930112
12535	NC_021839	CCA	2	6	548472	548477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930112
12536	NC_021839	GTT	2	6	548503	548508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930112
12537	NC_021839	GC	3	6	548517	548522	0 %	0 %	50 %	50 %	525930112
12538	NC_021839	AGA	2	6	548606	548611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930112
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12540	NC_021839	CTAC	2	8	548658	548665	25 %	25 %	0 %	50 %	525930112
12541	NC_021839	CAC	2	6	548677	548682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930112
12542	NC_021839	TGC	2	6	548744	548749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930112
12543	NC_021839	ATC	2	6	548772	548777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930112
12544	NC_021839	CTT	2	6	548779	548784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930112
12545	NC_021839	AAC	2	6	548810	548815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930112
12546	NC_021839	AGC	2	6	548819	548824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930112
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12548	NC_021839	GAC	2	6	548930	548935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930112
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12551	NC_021839	TAG	2	6	549076	549081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930112
12552	NC_021839	TAT	2	6	549103	549108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930112
12553	NC_021839	CTT	2	6	549112	549117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930112
12554	NC_021839	T	6	6	549148	549153	0 %	100 %	0 %	0 %	525930112
12555	NC_021839	TCC	2	6	549158	549163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_021839	T	6	6	549199	549204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_021839	AGA	2	6	549263	549268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_021839	T	6	6	549301	549306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_021839	ATTG	2	8	549341	549348	25 %	50 %	25 %	0 %	525930113
12560	NC_021839	CAT	2	6	549355	549360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930113
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12562	NC_021839	A	7	7	549410	549416	100 %	0 %	0 %	0 %	525930113
12563	NC_021839	ATG	2	6	549421	549426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930113
12564	NC_021839	CTGA	2	8	549441	549448	25 %	25 %	25 %	25 %	525930113
12565	NC_021839	GCT	2	6	549483	549488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930113
12566	NC_021839	GGTA	2	8	549626	549633	25 %	25 %	50 %	0 %	525930113
12567	NC_021839	A	6	6	549781	549786	100 %	0 %	0 %	0 %	525930113
12568	NC_021839	GGGAAG	2	12	549883	549894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930113
12569	NC_021839	TGGC	2	8	549907	549914	0 %	25 %	50 %	25 %	525930113
12570	NC_021839	TGG	2	6	549929	549934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930113
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12573	NC_021839	AATT	2	8	550036	550043	50 %	50 %	0 %	0 %	525930113
12574	NC_021839	A	6	6	550055	550060	100 %	0 %	0 %	0 %	525930113
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12582	NC_021839	TTTA	2	8	550372	550379	25 %	75 %	0 %	0 %	525930114
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12587	NC_021839	CTT	2	6	550658	550663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_021839	T	6	6	550662	550667	0 %	100 %	0 %	0 %	525930115
12589	NC_021839	AAATG	2	10	550673	550682	60 %	20 %	20 %	0 %	525930115
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12596	NC_021839	TTCC	2	8	550929	550936	0 %	50 %	0 %	50 %	525930115
12597	NC_021839	TCG	2	6	551004	551009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930115
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12602	NC_021839	CTTG	2	8	551169	551176	0 %	50 %	25 %	25 %	525930115
12603	NC_021839	CGC	2	6	551182	551187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930115
12604	NC_021839	TTC	2	6	551257	551262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930115
12605	NC_021839	TATG	2	8	551286	551293	25 %	50 %	25 %	0 %	525930115
12606	NC_021839	CGC	2	6	551310	551315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930115
12607	NC_021839	ATT	2	6	551332	551337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930115
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12609	NC_021839	TGT	2	6	551473	551478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930115
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12612	NC_021839	TA	3	6	551560	551565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_021839	TAA	2	6	551652	551657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_021839	AGG	2	6	551676	551681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_021839	TGAC	2	8	551716	551723	25 %	25 %	25 %	25 %	525930116
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12992	NC_021839	TAAT	2	8	568458	568465	50 %	50 %	0 %	0 %	525930127
12993	NC_021839	A	6	6	568533	568538	100 %	0 %	0 %	0 %	525930127
12994	NC_021839	ACTCA	2	10	568581	568590	40 %	20 %	0 %	40 %	525930127
12995	NC_021839	AC	3	6	568611	568616	50 %	0 %	0 %	50 %	525930127
12996	NC_021839	CAA	2	6	568620	568625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930127
12997	NC_021839	ACA	2	6	568652	568657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930127
12998	NC_021839	CAGTGA	2	12	568710	568721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525930127
12999	NC_021839	GT	3	6	568854	568859	0 %	50 %	50 %	0 %	525930127
13000	NC_021839	CGG	2	6	568863	568868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930127

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