MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_021839	ACT	2	6	2842656	2842661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932563
65002	NC_021839	A	7	7	2842723	2842729	100 %	0 %	0 %	0 %	525932563
65003	NC_021839	A	6	6	2842764	2842769	100 %	0 %	0 %	0 %	525932563
65004	NC_021839	CAA	2	6	2842843	2842848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932563
65005	NC_021839	AGGA	2	8	2842858	2842865	50 %	0 %	50 %	0 %	525932563
65006	NC_021839	CTT	2	6	2842904	2842909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932075
65007	NC_021839	TAAA	2	8	2843010	2843017	75 %	25 %	0 %	0 %	525932075
65008	NC_021839	AAGTG	2	10	2843107	2843116	40 %	20 %	40 %	0 %	525932075
65009	NC_021839	A	7	7	2843198	2843204	100 %	0 %	0 %	0 %	525932075
65010	NC_021839	TAT	2	6	2843230	2843235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932075
65011	NC_021839	GCT	2	6	2843260	2843265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932075
65012	NC_021839	T	6	6	2843302	2843307	0 %	100 %	0 %	0 %	525932075
65013	NC_021839	AT	3	6	2843310	2843315	50 %	50 %	0 %	0 %	525932075
65014	NC_021839	A	6	6	2843349	2843354	100 %	0 %	0 %	0 %	525932075
65015	NC_021839	AGTCT	2	10	2843387	2843396	20 %	40 %	20 %	20 %	525932075
65016	NC_021839	AGG	2	6	2843450	2843455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65017	NC_021839	TGC	2	6	2843483	2843488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932076
65018	NC_021839	AGA	2	6	2843496	2843501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932076
65019	NC_021839	TTG	2	6	2843546	2843551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932076
65020	NC_021839	AGA	2	6	2843634	2843639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932076
65021	NC_021839	ACG	2	6	2843686	2843691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932076
65022	NC_021839	TTG	2	6	2843783	2843788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932076
65023	NC_021839	GCA	2	6	2843812	2843817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932076
65024	NC_021839	ACT	2	6	2843845	2843850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932076
65025	NC_021839	T	6	6	2843862	2843867	0 %	100 %	0 %	0 %	525932076
65026	NC_021839	AAT	2	6	2843904	2843909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932076
65027	NC_021839	AGG	2	6	2843927	2843932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525932076
65028	NC_021839	GAAA	2	8	2844071	2844078	75 %	0 %	25 %	0 %	525932077
65029	NC_021839	GCT	2	6	2844186	2844191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932077
65030	NC_021839	TTC	2	6	2844212	2844217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932077
65031	NC_021839	TAT	2	6	2844241	2844246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932077
65032	NC_021839	ATA	2	6	2844268	2844273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932077
65033	NC_021839	ATT	3	9	2844283	2844291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932077
65034	NC_021839	GAAA	2	8	2844378	2844385	75 %	0 %	25 %	0 %	525932077
65035	NC_021839	ATA	2	6	2844427	2844432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932077
65036	NC_021839	TAA	2	6	2844434	2844439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932077
65037	NC_021839	CTT	2	6	2844442	2844447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932077
65038	NC_021839	TGTAA	2	10	2844467	2844476	40 %	40 %	20 %	0 %	525932077
65039	NC_021839	AGG	2	6	2844483	2844488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65040	NC_021839	AGC	2	6	2844648	2844653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932078
65041	NC_021839	A	7	7	2844678	2844684	100 %	0 %	0 %	0 %	525932078
65042	NC_021839	ATA	2	6	2844742	2844747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932078
65043	NC_021839	AATTT	2	10	2844849	2844858	40 %	60 %	0 %	0 %	525932078
65044	NC_021839	GAG	2	6	2844885	2844890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525932078
65045	NC_021839	GGT	2	6	2844928	2844933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932079
65046	NC_021839	TTG	2	6	2844962	2844967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932079
65047	NC_021839	A	7	7	2844968	2844974	100 %	0 %	0 %	0 %	525932079
65048	NC_021839	AAC	2	6	2844995	2845000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932079
65049	NC_021839	AGTT	2	8	2845010	2845017	25 %	50 %	25 %	0 %	525932079
65050	NC_021839	GAA	2	6	2845083	2845088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932079
65051	NC_021839	ATTT	3	12	2845109	2845120	25 %	75 %	0 %	0 %	525932079
65052	NC_021839	TGG	2	6	2845137	2845142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932079
65053	NC_021839	TCAT	2	8	2845208	2845215	25 %	50 %	0 %	25 %	525932079
65054	NC_021839	ATT	2	6	2845222	2845227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932079
65055	NC_021839	GAAT	2	8	2845247	2845254	50 %	25 %	25 %	0 %	525932079
65056	NC_021839	GAA	2	6	2845266	2845271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932079
65057	NC_021839	GAA	2	6	2845362	2845367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932079
65058	NC_021839	ATT	2	6	2845382	2845387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932079
65059	NC_021839	AGC	2	6	2845401	2845406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932079
65060	NC_021839	TGA	2	6	2845467	2845472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932079
65061	NC_021839	A	6	6	2845544	2845549	100 %	0 %	0 %	0 %	525932079
65062	NC_021839	ACT	2	6	2845561	2845566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932079
65063	NC_021839	A	6	6	2845625	2845630	100 %	0 %	0 %	0 %	525932079
65064	NC_021839	GCT	2	6	2845646	2845651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65068	NC_021839	GTA	3	9	2845818	2845826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932080
65069	NC_021839	CCG	2	6	2845830	2845835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932080
65070	NC_021839	CCGTTA	2	12	2845848	2845859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525932080
65071	NC_021839	GCC	2	6	2845919	2845924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932080
65072	NC_021839	GGA	2	6	2845938	2845943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525932080
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65084	NC_021839	TCT	2	6	2846478	2846483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932080
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65088	NC_021839	AGT	2	6	2846711	2846716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932080
65089	NC_021839	CCG	2	6	2846733	2846738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932080
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65101	NC_021839	TTG	2	6	2847480	2847485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932080
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65104	NC_021839	TCA	2	6	2847603	2847608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932080
65105	NC_021839	T	6	6	2847646	2847651	0 %	100 %	0 %	0 %	525932080
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65107	NC_021839	GCT	3	9	2847912	2847920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932080
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65109	NC_021839	T	6	6	2848027	2848032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65110	NC_021839	ATA	2	6	2848140	2848145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65111	NC_021839	A	6	6	2848171	2848176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65112	NC_021839	AGG	2	6	2848194	2848199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65113	NC_021839	TAT	2	6	2848263	2848268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932081
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65115	NC_021839	CAA	2	6	2848336	2848341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932081
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65231	NC_021839	AG	3	6	2853500	2853505	50 %	0 %	50 %	0 %	525932086
65232	NC_021839	TTGGT	2	10	2853520	2853529	0 %	60 %	40 %	0 %	525932086
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65478	NC_021839	GGCG	2	8	2863709	2863716	0 %	0 %	75 %	25 %	525932571
65479	NC_021839	CAA	2	6	2863739	2863744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932571
65480	NC_021839	CAT	2	6	2863749	2863754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932571
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65482	NC_021839	AAC	2	6	2863932	2863937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932571
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65492	NC_021839	GCG	2	6	2864368	2864373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932092
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65499	NC_021839	GTTGCA	2	12	2864641	2864652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525932092
65500	NC_021839	GATTGC	2	12	2864703	2864714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525932092

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